已有研究报道，肿瘤衍生的细胞外囊泡（EVs）含有包括DNA在内的核酸。几项研究已经突出了EV衍生的DNA（evDNA）作为循环生物标志物的潜力，甚至证明了在灵敏度方面，evDNA可以超越游离DNA（cfDNA）。在此，我们评估了EVs作为晚期胰腺癌患者肿瘤衍生DNA的潜在来源。分析了经DNase处理和未经处理的EV样本中的evDNA，以确定DNA主要位于EV内部还是外部（表面结合）。为了评估方法对结果的影响，我们使用了四种不同的小型EV分离方法以及差速离心法来分离大型EVs。我们的结果表明，与从相同血浆体积中分离的cfDNA相比，EV中的DNA含量明显较少（p <0.001）。大部分检测到的evDNA也位于囊泡的外部。此外，EV中肿瘤来源DNA的比例与cfDNA中的相似。总之，我们的结果表明，在至少晚期胰腺癌患者中，作为肿瘤来源DNA的一种来源，evDNA的定量并不能为cfDNA所获取的信息增添任何内容。版权：© 2023 Lapin等人。本文是根据创作共用许可证分发的开放获取文章，只要原作者和来源被指明，就可以在任何媒体中自由使用、分发和再现。

生物合成基因簇（BGCs）是存在于各种生物体内用于产生特异代谢物（SMs）的一组连续基因的子集。这些SMs正成为生产多种药物，包括抗菌和抗癌剂的基石。天然产物（NPs）在增强ESKAPE病原体（Enterococcus faecium、Staphylococcus aureus、Klebsiella pneumoniae、Acinetobacter baumannii、Pseudomonas aeruginosa和Enterobacter spp.）的毒力方面也起着关键作用，这些病原体代表了全球的健康威胁。我们的目标是对属于埃及临床环境中的三个不同ESKAPE致病物种的66株菌株进行BGCs的测序和计算分析：21株A. baumannii、28株K. pneumoniae和17株P. aeruginosa菌株。使用QIAamp DNA Mini试剂盒提取DNA，并使用Illumina NextSeq 550进行全基因组测序。序列经fastp质量过滤，用Unicycler进行组装。使用antiSMASH、BAGEL、GECCO和PRISM检测BGCs，并使用Clinker进行比对。在P. aeruginosa中检测到最高数量的BGCs（590个），其次是K. pneumoniae（146个），A. baumannii菌株数量最少（133个）。P. aeruginosa分离株主要共享非核糖体肽合成酶（NRPS）类型，K. pneumoniae分离株主要共享核糖体合成和翻译后修饰的肽类（RiPP-like）类型，而A. baumannii分离株主要共享铁载体类型。大多数分离株携带非核糖体肽（NRP）BGCs，少数K. pneumoniae分离株编码多酮类BGCs。Sactipeptides和bottromycin BGCs是最常检测到的RiPP簇。我们假设每个物种的BGC特征赋予其毒力。未来的实验将把已检测到的簇与其物种联系起来，并确定编码的SMs是否会产生并导致其毒力。重要性：我们的研究分析了来自Acinetobacter baumannii、Klebsiella pneumoniae和Pseudomonas aeruginosa菌株的66个ESKAPE病原体分离物组装中存在的生物合成基因簇（BGCs）。我们报告了它们的测序和组装，然后使用多种生物信息学工具对其BGCs进行了分析。然后，我们重点讨论了每个物种中最丰富的BGC类型，并讨论了它们在每个物种毒力中的潜在作用。这项研究对于进一步建立其在毒力、可能的抗菌效果以及编码的特异代谢物（SMs）的表征方面的实验工作至关重要。该研究强调了研究“有害”BGCs的重要性，以及理解这些物种的致病性和毒力的重要性，以及如果SMs被用作抗菌剂可能带来的好处。这可能是埃及的首项类似研究，将为了解来自埃及的ESKAPE病原体的BGCs提供光明。

携带致癌基因的外显子循环DNA的存在与癌症发生和患者生存率下降强烈相关。肿瘤活检和体外癌细胞系常被用作研究外显子循环DNA在癌症中的作用的模型。然而，外显子循环DNA在癌细胞系的体外增殖中经常丢失，这对于利用癌细胞系模型进行研究的可重复性提出了质疑。在这里，我们对七个癌细胞系（MCA3D，PDV，HaCa4，CarC，MIA-PaCa-2，AsPC-1，PC-3）进行了外显子循环DNA变异的综合分析。我们比较了每个细胞系的三重复样本中独特外显子循环DNA的含量，发现独特外显子循环DNA的数量对每个细胞系是特异性的，而外显子循环DNA序列内容在三重复样本中存在显著变异（约0-1%的外显子循环DNA坐标相似性）。在PC-3细胞系中，我们发现大的携带MYC的外显子循环DNA在NCI细胞系分离物中存在高拷贝数，而在ATCC分离物中不存在。综上所述，这些结果揭示了癌细胞系中外显子循环DNA的序列内容是高度可变的。这凸显了在使用之前测试癌细胞系的重要性，并且为那些希望研究外显子循环DNA在癌症中作用的细胞系中进行亚克隆富集，以获取相对纯净的细胞群体。© 2023作者。由Research Network of Computational and Structural Biotechnology代表Elsevier B.V.出版。

多形核中性粒细胞（PMNs）是炎症反应中的主要效应细胞，在甲状腺癌（TC）中扮演多种角色。PMNs包含并释放大量介质，包括颗粒酶（例如髓过氧化物酶（MPO），蛋白质-3（PTX3）和基质金属蛋白酶-9（MMP-9）），以及中性粒细胞外陷阱（NETs）。本研究旨在评估NETs和中性粒细胞来源的介质作为可能的TC患者生物标志物。招募了20例分化型甲状腺癌（DTC）患者，26例去分化型甲状腺癌（De-DTC）患者，26例多结节性甲状腺肿（MNG）患者和22例健康对照组（HCs）。通过酶联免疫吸附法（ELISA）测定了游离DNA（dsDNA），核小体，精氨酸化组蛋白H3（CitH3）和MPO-DNA复合物的血清浓度作为NET生物标志物。通过ELISA测量了MPO，PTX3，MMP-9，CXCL8和粒细胞单核细胞集落刺激因子（GM-CSF）等中性粒细胞相关介质的血清水平。与HCs相比，De-DTC患者的四种NET生物标志物的血清水平均增加。CitH3血清水平在De-DTC和DTC患者中有选择性增加，与HCs和MNG患者相比。MPO-DNA复合物和核小体仅在De-DTC患者中有选择性增加，与HCs和MNG患者相比。此外，MPO-DNA复合物在De-DTC患者中相对于DTC患者也有选择性增加。与HCs相比，MPO循环水平在De-DTC患者亚组中有选择性增加。与HCs相比，DTC和De-DTC患者的PTX3，MMP-9和GM-CSF循环水平均增加。核小体与dsDNA，CitH3，MPO和CXCL8呈正相关。MPO-DNA复合物与dsDNA，CitH3，CXCL8，MPO和核小体水平呈正相关。此外，四种NET生物标志物中的三种（即dsDNA，核小体和MPO-DNA复合物）在老年患者中相对于年轻患者增加，在诊断时有转移性疾病的患者中相对于无转移的患者增加。男性的核小体比女性高。MPO-DNA复合物，核小体，在某种程度上CitH3水平似乎与进展性甲状腺癌的恶性程度相关。此外，与MNG和HCs相比，TC患者的PMN相关介质（MPO，PTX3，GM-CSF）的血清浓度增加。Copyright © 2023 Modestino，Cristinziano，Poto，Ventrici，Trocchia，Ferrari，Fallahi，Paparo，Marone，Antonelli，Varricchi和Galdiero。

胸腺上皮肿瘤（TETs）是一种罕见的恶性肿瘤，临床表现多样。这类患者发生自身免疫副肿瘤时的高发率要求在使用COVID-19疫苗时谨慎。此外，TETs通常与严重免疫缺陷相关，这使得预测疫苗免疫效果变得困难。因此，我们旨在评估TET患者对COVID-19疫苗的免疫反应。我们进行了一项前瞻性研究，招募了接受SARS-Cov-2 mRNA完整疫苗接种（两剂加上BNT162b2 6个月后的加强剂）的患者。所有患者在接受第一剂疫苗之前入组，并在接种周期内进行跟踪观察，持续至加强剂接种后的6个月，以便i)评估体液和细胞反应，ii)确定有效免疫的生物标志物，并iii)评估疫苗的安全性。在完整疫苗接种周期结束时，27（61.4％）例患者表现出体液和38（86.4％）例患者表现出细胞反应（受刺激细胞释放的γ干扰素），并显示出激活的TH1和TH17细胞增加，尤其在加强剂接种后显著。基线时的B和T淋巴细胞数量分别预测了体液和细胞反应。没有肿瘤病灶证据的患者比有病灶证据的患者更有可能产生体液反应。此外，免疫相关紊乱（75％）的患者比例，在整个疫苗接种周期内未发生变化，尤其是仇氏综合征（47.7％）和重症肌无力（29.5％）。总体而言，44例入组患者中，在观察期内有19例（43.2％）患上了COVID-19；没有患者需要住院或氧气支持，并且没有发生死亡病例。SARS-Cov-2 mRNA疫苗决定了TET患者的免疫反应，尤其是在加强剂接种后，以及没有肿瘤病灶证据的患者。对B和T淋巴细胞的初步分析可能有助于确定那些实现有效体液和细胞反应概率较低的患者，因此可能需要被动免疫。该疫苗能够预防严重的COVID-19感染，且安全可靠。版权所有 © 2023 Cernera, Gelzo, De Placido, Ottaviano, Pietroluongo, Raia, Scalia, Tortora, Castaldo, Formisano, Palmieri and Giuliano.

膀胱癌是一种常见的恶性肿瘤，治疗选择有限，尤其对于对卡介苗不敏感的患者。幸福壹™（nadofaragene firadenovec）作为第一种用于泌尿系统恶性肿瘤的基因治疗药物，获得了干扰素-α（IFNα）基因治疗的批准，提供了一种有希望的替代方案。本文回顾了导致幸福壹™的研究和里程碑，以及其开发和批准的过程。由于可以直接进入膀胱并且尿液和组织样本可供监测，膀胱癌非常适合基因治疗。早期的挑战包括有效地跨过膀胱上皮进行基因转移，最初通过调节科萨奇病毒/腺病毒受体（CAR）的表达，最终通过使用Syn3破坏膀胱上皮屏障来克服这一问题。幸福壹™是一种改良的腺病毒载体，携带IFNα基因。临床试验显示有希望的结果，具有高响应率和可控的不良事件。目前的研究重点包括改进患者选择、确定预测响应的生物标志物、探索增强转染效率的替代载体，以及开发针对耐药机制的联合策略。幸福壹™的批准标志着基因治疗在膀胱癌领域取得了重要的里程碑，未来的发展有望进一步提高其疗效和影响力。版权所有 © 2023 Martini, Tholomier, Mokkapati 和 Dinney。

寻找生物标志物以鉴定免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的理想候选人是基础性工作。本研究中，我们分析外周血CD3+HLADR+细胞（激活的T细胞）作为ICI治疗的一种新型生物标志物，并研究其与某些肠道微生物种类的关联，以指示个体的治疗效果。我们对进行固体恶性肿瘤的70名患者进行了外周单个核细胞血细胞（PBMCs）的流式细胞术分析，以量化循环CD3+细胞上的HLA-DR。我们对37名患者的粪便样本进行了16s-rRNA测序，以评估肠道菌群的相对丰度。治疗开始前，CD3+HLADR+细胞的频率较高的患者显示出明显降低的肿瘤反应和总生存期（OS），较差的反应，并且在受到ICI治疗后经历了较少的毒副作用。因此，CD3+HLADR+细胞频率高于18.55%的患者，其中位OS仅为132天，而低于该值的患者为569天。治疗期间CD3+HLADR+细胞计数逐渐增加的患者，其OS明显改善。一个由CD3+HLADR+细胞和中性粒细胞-淋巴细胞比值（NLR）组成的免疫标志评分，在治疗前和治疗期间都具有高度显著的预测OS能力。当与Burkholderiales目的相对丰度和Bacteroides vulgatus菌种的相对丰度结合时，两种免疫-微生物评分显示出了有希望的预测和预后能力。我们确定了CD3+HLADR+细胞的频率和动态作为易于获取的预后标志物，用于预测对ICI的治疗结果，并研究其与调节免疫的肠道菌群物种的关联。包括CD3+HLADR+细胞、NLR和Burkholderiales目或Bacteroides vulgatus菌种相对丰度的两个前所未有的免疫-微生物评分能够准确预测对免疫检查点阻断的OS。版权所有 © 2023 Gorgulho, Roderburg, Beier, Bokemeyer, Brümmendorf, Luedde and Loosen.

T淋巴细胞（T细胞）是我们免疫系统中的重要细胞亚群，负责细胞介导的适应性免疫应答和免疫稳态的维持。T细胞功能异常导致感染持续存在、免疫监视能力下降、癌症生长无法抑制以及自身免疫疾病的发生。离子通道在调节T细胞信号传导和细胞功能中发挥关键作用，但通常被忽视和研究不足。目前对免疫细胞中离子通道的"通道组"（channelome）及离子通道之间的相互作用了解甚少。本综述旨在总结关于离子通道对T细胞功能和疾病的影响的发表数据。离子通道在健康和疾病中的重要性以及由于它们位于细胞质膜表面而易于接触，使其成为优秀的药物靶点。版权所有©2023 Manolios, Papaemmanouil和Adams。

通过生物信息学预测，我们发现GTF2I和FAT1在甲状腺癌（TC）中被下调。此外，Pearson相关系数显示，GTF2I的表达与FAT1的表达呈正相关。因此，在本研究中，我们选择了它们，评估了骨髓间充质干细胞衍生的外泌体（BMSDs-EVs）富集的GTF2I对TC中上皮-间充质转化（EMT）和干细胞性维持的影响。我们验证了GTF2I和FAT1在TC细胞系中的低表达。人工过表达的GTF2I和FAT1增强了TC细胞的恶性表型、EMT和干细胞性维持。机制研究显示，GTF2I结合到FAT1的启动子区域，并因此上调了其表达。MSC-EVs可以将GTF2I转运到TPC-1细胞中，GTF2I通过增加FAT1的表达并促进FAT1介导的CDK4/FOXM1的下调，抑制了TC的恶性表型、EMT和干细胞性维持。体内实验证实了沉默GTF2I加速裸鼠中肿瘤的生长。综上所述，我们的研究结果表明，通过MSC-EVs传递的GTF2I通过FAT1/CDK4/FOXM1轴发挥抗肿瘤效应，并且可能作为TC治疗的有希望的生物标志物。© 2023. 高等教育出版社。

整个疾病模型 (WDM) 是大规模的、系统级的模型，可以评估整个护理路径上的多个决策问题。尽管这种类型的模型作为进行经济分析的平台可以提供几个优势，但现有 WDM 的可用性和质量尚不清楚。本系统综述旨在确定现有的 WDM，探讨它们覆盖的疾病领域，对这些模型的质量进行批判性评估，并提供未来研究的建议。于2023年7月23日在多个数据库上进行电子搜索 (MEDLINE、EMBASE、NHS经济评估数据库和医疗技术评估数据库)。两位独立的审稿人选择了包含在内的研究。采用国家健康与护理卓越研究所 (NICE) 对经济评估的评估检查表对研究质量进行评估。对模型特征进行了描述性总结。共鉴定出44个 WDM，其中32个于2010年之后开发。现有 WDM 主要涵盖的疾病领域有心脏病、癌症、获得性免疫缺陷综合症和代谢性疾病。包含的 WDM 的质量普遍较低。常见的限制包括未考虑干预的不良事件 (AEs) 的危害和成本，缺乏概率敏感性分析 (PSA) 和报道不完整。从2010年以来，WDM 的数量有所增加。然而，它们的质量普遍较低，这意味着在重新使用之前可能需要进行重大修改，例如，建模干预的不良事件和纳入PSA。需要报告足够的WDM细节，以便于未来的重复使用/调整。版权所有：©2023 Jin等。本文是一个开放获取文章，根据创作共用许可协议发布，允许在任何媒介中进行任意使用、分发和复制，但必须保留原始作者和出处的署名。