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BIOINFORMATICS
2023 Sep 12

BrianJohnson,YuboShu...
cloneRate: fast estimation of single-cell clonal dynamics using coalescent theory.
BIOINFORMATICS
虽然进化医学的方法显示出潜力,但由于实验限制和身体系统的动态性,衡量进化本身是困难的。在癌症进化中,连续观察克隆结构是不可能的,而从多个时间点获取纵向样本也很少见。单细胞水平上越来越多的可用DNA测序数据集能够利用突变历史重建过去的进化,从而更好地了解可检测疾病之前的动力学。对于从这些数据集中量化克隆生长动力学的准确、快速和易于使用的方法有一个未满足的需求。我们基于共同演化理论推导了一种估计克隆净增长率的方法,可以使用重建的系统发育树或共享突变数量。我们应用和验证了我们估计克隆净增长率的分析方法,消除了以前方法中使用复杂模拟的需要。当应用于造血数据时,我们表明我们的估计可能具有广泛的应用,以改善机制理解和预后能力。与具有单个或未知驱动突变的克隆相比,具有多个驱动因子的克隆具有显著增长率的增加(中位数为0.94与0.25每年,p = 1.6×10-6)。此外,根据最适克隆的生长速率对患有骨髓增殖性肿瘤(MPN)的患者进行分层显示,较高的生长速率与更短的MPN诊断时间相关(中位数为13.9与26.4个月; p = 0.0026)。我们开发了一个公开可用的R软件包cloneRate来实现我们的方法(软件包网站:https://bdj34.github.io/cloneRate/)。源代码:https://github.com/bdj34/cloneRate/。补充材料可在Bioinformatics在线获得。©2023年作者。由牛津大学出版社出版。
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Best Pract Res Cl Ob
2023 Sep 11

PierluigiBonomo,Juli...
Shedding light on the management of acute radiation dermatitis: insight from the MASCC Oncodermatology study group.
Best Pract Res Cl Ob
本文重点介绍了一系列有关急性放射性皮炎的预防和治疗的近期发表研究稿件。这些荟萃分析为多国癌症支持护理协会(MASCC)肿瘤皮肤学研究组更新的临床实践指南提供了额外的证据,用于急性放射性皮炎的预防和治疗。这些文集阐明了关于急性放射性皮炎的当前可用证据,突出了已有知识、有效治疗方法以及未来临床试验的拟议领域。总体而言,在从1946年至2023年1月对文献进行初步系统回顾的基础上,共检索并纳入了51个随机对照试验,进行了定量分析。有关各种治疗干预的临床影响的讨论包括:使用止汗剂和除臭剂、屏障膜和敷料、天然和其他剂、光生物调节治疗、局部皮质类固醇、局部非类固醇类剂、皮肤卫生和洗涤,以及StrataXRT和乳腺癌患者中的Mepitel膜。荟萃分析的全面性及其相关发现有助于减少急性放射性皮炎治疗中的不一致性,并促进全球临床实践中采用的治疗干预的一致性。© 2023. 作者(们),根据Springer Nature下的德国Springer-Verlag GmbH独家许可。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Sep 12

NahlaHHassaneen,Shab...
Ameliorative effects of camel milk and silymarin upon aflatoxin B1 induced hepatic injury in rats.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
黄曲霉毒素B1(AFB1)对人类和动物健康构成重大风险,因为它污染了食物、饲料和谷物。这些危险的影响可以通过使用天然组分来减轻。本研究的目的是考察骆驼乳和水飞蓟素补充对大鼠中由黄曲霉毒素B1诱导的肝损伤的改善效果。通过测量白细胞和分类计数、血清生化指标和肝组织中肿瘤坏死因子(TNF-α)、抗氧化基因(NAD(P)H喹喔酮醌氧还蛋白还原酶1(NQO1))和碱基切除修复基因(APE1和OGG1)的基因表达,以及肝组织的病理学变化来评估这种改善。我们使用60只成熟的雄性雪鼠进行了本研究;这些大鼠被分成六组(每组十只)。对照组(无任何处理)通过灌胃给予生理盐水。骆驼乳组每日给予1毫升骆驼乳/公斤体重。水飞蓟素组每日给予1毫升水飞蓟素悬浮液溶液,剂量为20毫克水飞蓟素/公斤体重。黄曲霉素组每日给予含有1.4毫克黄曲霉素/千克饲料的黄曲霉素污染饮食,并给予生理盐水。骆驼乳+黄曲霉素组在同一时间内给予相同的骆驼乳口服剂量和黄曲霉素污染饮食。水飞蓟素+黄曲霉素组在同一时间内给予相同的水飞蓟素口服剂量和黄曲霉素污染饮食。所得数据表明黄曲霉毒素B1对白细胞计数、AST和ALT活性、血清蛋白、铁蛋白、甲胎蛋白、癌胚抗原、肝组织病理学和所研究基因的表达有害影响。然而,这些有害影响可以通过骆驼乳和水飞蓟素补充减轻。因此,我们可以得出结论:饮用骆驼乳和水飞蓟素可以减轻AFB1对大鼠血液学、AST和ALT活性、血清蛋白、铁蛋白、甲胎蛋白、癌胚抗原、肝组织病理学和基因表达的负面影响。©2023. Springer Nature Limited.
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Sep 06

ShingoKasamatsu,Taku...
Untargeted polysulfide omics analysis of alternations in polysulfide production during the germination of broccoli sprouts.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
高度摄入花椰菜(Brassica oleracea var. italica)与心脑血管疾病、神经系统疾病、糖尿病和癌症的发病风险降低相关。花椰菜富含多种植物化学物质,包括硫醇苷和异硫氰酸酯。此外,最近报道哺乳动物(包括人类)体内花椰菜能够内源性产生多硫化物(如半胱氨酸乙二硫酸酯和谷胱甘肽乙二硫酸酯),这些生物活性物质具有强大的抗氧化作用和重要的氧化还原信号调节作用。然而,对花椰菜内源性多硫化物含量以及萌发对多硫化物含量和组成的影响的研究很少。在本研究中,我们通过液相色谱-电喷雾离子化-串联质谱分析,进行了无靶标多硫酸物质组学分析和定量靶向多硫化物代谢组学分析,研究了花椰菜在发芽过程中的多硫酸物质生物合成变化。我们还进行了2,2-二苯基-1-哌啶肼自由基清除试验,以确定多硫化物的抗氧化性能。结果表明,花椰菜嫩芽中的总多硫酸物质明显增加,CysS2H和半胱氨酸三硫酸酯是主要的有机多硫化物代谢产物。此外,我们确定了新型硫辣葱素(SFN)与CysS2H和GS2H结合形成的衍生物在花椰菜嫩芽中内源性合成,而新型与CysS2H结合的硫辣葱素展现出比硫辣葱素和半胱氨酸更强的自由基清除能力。这些结果表明,花椰菜嫩芽中多硫化物的丰富程度对其促进健康的特性起到了重要贡献。我们的研究结果对于开发花椰菜嫩芽健康促进效应的新药物靶点具有重要的生物学意义。版权所有© 2023 作者。由Elsevier B.V.发表,版权所有。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Sep 12

KaixuYu,YingChen,LuZ...
Cancer-Erythrocyte Membrane-Mimicking Fe3O4 Nanoparticles and DHJS for Ferroptosis/Immunotherapy Synergism in Tumors.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
铁死亡(Ferroptosis)的特征是铁积累和脂质过氧化。然而,临床剂量的Fe3O4纳米颗粒不能有效引起肿瘤中的铁死亡,其机制尚未完全理解。在本研究中,我们利用RNA-seq数据发现,肿瘤细胞可以通过上调Nrf-2表达来反馈激活抗氧化系统,从而避免由Fe3O4纳米颗粒引起的铁死亡。我们还发现,当DHJS(一种用于ROS产生的探针)与Fe3O4纳米颗粒协同作用时,可以拮抗Nrf-2的表达,从而在肿瘤细胞中诱导铁死亡。基于这些发现,我们创建了一种PLGA载荷的Fe3O4和DHJS伪装的仿生混合细胞膜,用于治疗骨肉瘤。这种混合细胞膜赋予了核心纳米颗粒延长的血液循环寿命和增强的同源靶向能力。此外,纳米颗粒中的DHJS和Fe3O4能够协同诱导肿瘤细胞的致命铁死亡,同时在肿瘤中诱导巨噬细胞M1极化以及CD8(+)T细胞和树突状细胞的浸润。总之,本研究为Fe3O4纳米颗粒引发铁死亡提供了新的机制洞察和实用策略。与此同时,合成的仿生纳米颗粒对骨肉瘤展示了协同的铁死亡/免疫治疗效应。
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ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
2023 Sep 12

LynnHakki,AsamaKhan,...
Lymph Node Metastases and Associated Recurrence-Free Survival in Microsatellite Stable and Unstable Colon Cancer.
ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
相对于微卫星稳定 (MSS) 结肠癌,微卫星不稳定 (MSI) 结肠癌中的淋巴结转移预测因子及其与复发的关联尚不明确。对2015年至2021年间行手术的非转移性结肠癌患者进行了淋巴结转移预测因子(LNMs)及其与无复发生存 (RFS) 的关联评估。共纳入了1466例患者进行分析,其中361例 (25 %) 为MSI。与MSS相比,MSI 与早期阶段、N1或N2病例中较少的LNMs以及更少的高风险特征有关。与T3-T4 MSS 患者相比,T3-T4 MSI 患者的LNM 的优势比 (OR) 为0.52 (95% 置信区间 [CI],0.38-0.71),T1-T2 MSS 患者为0.27 (95% CI ,0.38-0.71),T1-T2 MSI 患者为0.15 (95% CI ,0.08-0.26)。在两个组中,LNMs 与 T 分类、患者年龄以及静脉、淋巴或神经浸润有关。在MSS患者中,LNMs 还与患者性别和组织学分级有关。与MSS患者相比,MSI 患者在N0和N1疾病中的3年RFS更好。然而,在N2疾病中,MSI患者的3年RFS率低于MSS患者 (风险比为 19.75 vs 4.49)。在MSI结肠癌中,LNMs 的发生率较MSS低50%,但与LNMs 相关的因素与MSS结肠癌相似。传统上与早期阶段MSI 结肠癌相关的良好预后在出现四个或更多 LNMs 后消失。这些发现应该考虑到临床医生在选择最适当的MSI结肠癌治疗方案时。© 2023. Society of Surgical Oncology.
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ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
2023 Sep 12

NishaParmeshwar,Cath...
Nipple-Sparing Mastectomies in Patients over the Age of 60 Years: Factors Associated with Surgical Outcomes.
ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
年长患者进行乳头保留乳房切除术(NSM)的效果尚未得到很好的描述。本研究的目的是评估60岁以上患者的NSM效果。本研究进行了一项单一机构的回顾性队列研究,纳入了2004年1月至2022年1月期间60岁以上的NSM患者。收集了人口统计学、术中和术后变量。我们识别出136名女性患者进行了共计200例NSM手术,平均年龄为65.2岁,平均身体质量指数为25。大多数患者(56%)患有浸润性乳腺癌,15%的患者需要新辅助化疗,17.5%在NSM前接受了放疗。总共91%的患者立即进行了组织扩张器的置入。感染率为19%,其中11.5%的患者在随访期内需要拆除扩张器。在二项Logistic回归分析中,先前的放疗使任何并发症的发生几率增加了2.9倍(OR 2.93,CI 1.30-6.58,p = 0.009),感染几率增加了5.7倍(OR 5.70,CI 1.95-16.66,p = 0.001),但其他协变量包括年龄、合并症、先前化疗以及侵袭性疾病的存在与并发症的发生没有明显关联。糖尿病使创口破裂的发生几率特别增加了9.0倍(OR 8.97,CI 2.01-39.92,p = 0.004)。在平均3.4年的随访期内,局部复发率为3%。我们的数据支持60岁以上患者进行NSM手术,并符合标准照顾下的可接受效果。局部再发率在0-5%的范围内,并且仅有糖尿病和先前的放疗与重建并发症有关。因此,在适当的情况下,应提供NSM手术,以实现肿瘤学和重建目标。© 2023年。外科肿瘤学会。
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Alzheimers & Dementia
2023 Sep 12

ElizabethPirraglia,L...
Lower mortality risk in APOE4 carriers with normal cognitive ageing.
Alzheimers & Dementia
异常认知衰老,包括痴呆症,在老龄人群中为健康和社会系统带来严重挑战。因此,表征与异常认知衰老相关的因素并制定必要的预防措施具有重要意义。载脂蛋白E基因 (APOE4) 的ε4等位基因已被广泛认可为晚发性阿尔茨海默病的遗传风险因素。APOE4携带者也更容易患心血管疾病,该疾病与认知功能损害的风险增加有关。另一方面,已发现APOE4与多种常见类型的癌症——这是一种主要的与年龄相关的疾病和导致死亡的主要原因——的发病风险降低有关。我们通过竞争风险模型首次研究了APOE4对认知衰退和死亡的相反影响,考虑到两种死亡方式:具有高量与低量经尸体解剖评估的阿尔茨海默病病理学。我们观察到,在具有低量阿尔茨海默型病理学的死亡人群中,APOE4与死亡风险降低有关;而在具有高量阿尔茨海默型病理学的死亡人群中,APOE4与死亡风险增加有关,而后者是认知功能损害的主要风险因素。文中还讨论了异常认知衰老的可能预防措施。© 2023. Springer Nature Limited.
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Alzheimers & Dementia
2023 Sep 10

ShuaiZhang,FangbingL...
A 4.7-kDa polysaccharide from Panax ginseng suppresses Aβ pathology via mitophagy activation in cross-species Alzheimer's disease models.
Alzheimers & Dementia
阿尔茨海默病(AD)是一种随年龄而发展的神经系统疾病。据推测,淀粉样蛋白-β(Aβ)聚集可能是阿尔茨海默病的关键发病过程。从人参(Panax ginseng C.A. Meyer)中分离出的人参多糖(Ginseng polysaccharides, GP)是主要的活性成分,可能作为神经保护剂对阿尔茨海默病患者有潜在的益处。然而,GP对Aβ病理和AD症状的影响仍不清楚。本研究中,我们纯化了一种名为GP4的4.7-kDa GP,并对其进行了基本的物理化学表征。然后,我们使用跨物种AD模型评估了GP4预防Aβ聚集的生物学效果,包括经Aftin-5处理的SH-SY5Y细胞和脑器官样体以及过表达全长人源性Aβ42肽的转基因秀丽隐杆线虫。这些分析最终表明,GP4能够在体内和体外抑制Aβ的积累,并且早期干预GP4足以减轻秀丽隐杆线虫AD模型中与Aβ42相关的衰老表型和记忆损失。此外,神经炎症在人类细胞和脑器官样体中明显下调。从机制学角度来看,我们发现GP4抑制Aβ聚集的能力与其促进神经元线粒体自噬活性有关。这一发现为进一步开发GP4作为治疗AD候选药物提供了坚实的理论基础。版权所有 © 2023. Elsevier Masson SAS出版。
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PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
2023 Sep 12

EmreCiydem,TugbaSinm...
Qualitative evaluation of the life experiences of spouses of prostate cancer patients receiving androgen deprivation therapy.
PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
本研究旨在定性评估其配偶接受雄激素剥夺疗法的女性的生活经验。研究采用了常见现象学设计的目的样本,共有15名女性。数据按照Colaizzi的现象学分析步骤进行评估。参与者的观点被归类为七个主题:失去和悲伤、身体困难、社会经济困难、心理困难、关系变化、优势和利益。研究发现,接受ADT治疗的丈夫的妻子们经历了悲伤反应和身体、社会经济及心理困难。心理困难包括照顾负担、医院压力、性生活和倦怠感。观察到患者及其配偶经历了一些积极和消极的关系变化。对健康服务的满意度和抗逆力是女性配偶适应治疗过程的促进因素。研究还确定,在适应疾病和治疗过程时,参与者有一些需求,如家庭支持、经济支持、减少媒体的负面表述、提高医疗专业人员的沟通技巧。此外,他们发现与创伤后成长有关的一些好处。泌尿肿瘤护士可以提供旨在改善接受ADT治疗的丈夫妻子的福祉的服务,并利用泌尿肿瘤护理的知识和经验造福患者和照护者。©2023年作者,授权给德国斯普林格自然出版集团旗下的斯普林格出版有限公司。
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