肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

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肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

EsteePMLau,SamFaber,...

Topical antibiotics prophylaxis for infections of indwelling pleural/peritoneal catheters (TAP-IPC): A pilot study.

留置胸腔导管（IPC）和留置腹膜导管（IPeC）在恶性胸腔和腹腔积液处理中有明确的角色，但导管相关感染仍然是主要的关注点。局部麻黄霉素预防已被证明可以减少腹膜透析导管感染。本研究旨在评估IPC与麻黄霉素的相容性，并评估在IPC或IPeC患者中，局部麻黄霉素预防的可行性、耐受性和依从性。（一）三种麻黄霉素制剂每周三次涂在IPC的一部分上，并在不同时间间隔下使用扫描电子显微镜（SEM）进行检查。（二）对被安装IPC或IPeC的连续患者，在每次引流/换药后应用局部麻黄霉素预防于导管出口部位（至少每周两次），并进行为期6个月的随访。（一）未发现应用麻黄霉素长达6个月导致可见的导管结构损伤。（二）在48名患者中插入了50根留置导管，其中41例为恶性胸腔积液，9例为腹腔积液。中位随访时间为121天（中位数，IQR 19-181天）。所有患者对麻黄霉素耐受良好，只有一名患者报告了短期局部疼痛。依从性良好，按计划投药中的989次中，有95.8％按时给予。六例患者发生了导管相关的胸腔感染（n=3）、同时性腹腔/局部感染（n=1）和皮肤/道路感染（n=2），感染菌种包括链球菌米蒂斯（伴有芽孢杆菌或厌氧菌）、金黄色葡萄球菌、克雷伯氏肺炎杆菌和绿脓杆菌。这项首次对IPC或IPeC相关感染进行长期预防的研究发现，局部麻黄霉素预防可行且耐受良好。其疗效值得进行未来的随机研究。 © 2023年作者。《呼吸学》由澳大利亚约翰·威利和儿子有限公司出版，代表亚太呼吸学会。

PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES

Changes in the gut microbial profile during long-term androgen deprivation therapy for prostate cancer.

PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES

近期研究突出了雄激素剥夺疗法（ADT）与前列腺癌肠道微生物群落的关联。然而，长期ADT的影响仍需进一步探讨。为了检验从短期（中位数为7个月）和中期（中位数为18个月）到长期ADT（>33个月）期间肠道微生物组的变化，对56个粪便样本的16S rRNA数据进行了重新分析。此外，还采用了双样本Mendelian随机化方法，探究了特定微生物特征与前列腺癌以及睾酮水平之间的关系。与短期和中期ADT组相比，长期ADT组的α和β多样性发生了显著变化。特别是，类别杆菌属和荷尔德曼氏菌属的相对丰度在长期ADT组中显著降低，而机会主义细菌（Erysipelatoclostridium）和Ruminococcus gnavus的相对丰度在ADT期间增加。此外，双样本Mendelian随机化分析显示出基因预测的大肠杆菌属、Ruminococcaceae UCG002/011和Defluviitaleacea-UCG-011与睾酮水平呈负相关。综上所述，前列腺癌患者长期使用ADT与肠道微生物群落的不良变化有关，其中包括与睾酮合成和机会主义细菌相关的类别的增加。这些变化可能与疾病进展和长期ADT的副作用有关，但需要进一步的纵向研究来验证这种关系。© 2023年 Springer Nature Limited 授权作者刊登。

PLoS Computational Biology

ZihengDuan,YiDai,Ahy...

iHerd: an integrative hierarchical graph representation learning framework to quantify network changes and prioritize risk genes in disease.

PLoS Computational Biology

细胞内的不同基因形成复杂网络，以执行关键的细胞功能，而这一过程中的网络变化有可能引起下游转录组扰动和表型变异。因此，开发高效且易于解释的方法来量化网络变化并在不同条件下确定驱动基因至关重要。我们提出了一种分层图表示学习方法，称为iHerd。给定一组网络，iHerd首先以数据驱动的方式分层生成一系列粗化的子图，表示不同分辨率下（例如信号通路级别）的网络模块。然后，通过高效的图嵌入方法依次学习所有分层级别的低维节点表示。最后，iHerd通过其图对齐模块将单独的基因嵌入映射到相同的潜在空间，计算出驱动基因优先级的重连接指数。为了证明其有效性，我们将iHerd应用于肿瘤与正常基因调控网络的重连分析和细胞类型特异性基因调控网络的分析，使用了大脑单细胞多组学数据。我们展示了iHerd在不同疾病中可以有效地确定新的和众所周知的风险基因。与现有模型不同，iHerd的图粗化用于分层学习，使我们能够成功地将网络驱动基因分类为早期分歧基因（EDGs）和晚期分歧基因（LDGs），强调在信号通路级别跨越和内部具有广泛网络变化的基因。这种独特的驱动基因分类方法可以为我们提供更深入的分子见解。代码可在 https://github.com/aicb-ZhangLabs/iHerd 免费获取。所有其他相关数据均包含在手稿及其支持信息文件中。版权：© 2023 Duan等。本文是一篇在署名条件下以创作共享许可协议发布的开放获取文章，允许在任何媒体中自由使用、分发和再制，前提是保留原作者和出处的来源。

PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

OlabodeOmotoso,JohnO...

Addressing cancer care inequities in sub-Saharan Africa: current challenges and proposed solutions.

PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

癌症是全球重要的公共卫生挑战，在非洲每天就有近2000人丧生。如果没有足够的措施，死亡率很可能会增加。非洲癌症护理的主要挑战是公平和优先级，因为癌症在卫生保健领域的政策制定者和战略利益相关者中没有得到足够的关注。这种忽视影响了癌症护理的三个主要层面：预防、诊断和治疗/管理。为了促进癌症护理的公平，解决公平和优先级问题至关重要，以确保每个人都有平等的机会进行癌症预防、早期检测、适当的护理和后续治疗。通过现有的文献，我们提供非洲当前癌症护理状况的概述和缩小差距的建议。我们强调了几个导致非洲癌症护理不公平的因素，包括对癌症研究的不足资金、癌症教育或认知不足、筛查或诊断设施不足、缺乏组织良好且有效的癌症登记系统和医疗保健、专业医疗人员短缺、筛查、疫苗接种和治疗的高成本、技术能力不足、疫苗反应不良和/或患者癌症筛查晚期就诊。我们还提出了解决这些阻碍实现癌症护理公平的建议。我们的建议分为国家层面的举措和以能力为基础的举措，包括通过医疗专业人员在每次医院就诊时进行癌症健康宣传和宣传，鼓励筛查和疫苗接种，确保区域和国家癌症登记处的运作，改善医疗保健预算，用于人员、设备和设施，通过专业培训建立专业知识，为癌症研究提供资金，为癌症护理提供保险覆盖，并实施移动卫生技术进行远程医疗诊断。整体解决癌症公平性的挑战将提高癌症患者的长期生存机会，降低已经处于风险中的群体的风险因素，并确保大陆上对癌症护理的公平访问。本研究确定了非洲国家在癌症护理公平方面的现状，概述了当前的限制，并提供了能够在实现癌症护理公平方面产生最大差异的建议。© 2023 BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

Parasites & Vectors

SimoneParn,GabrielaL...

Inhibition of carbonic anhydrase using aspirin is a novel method to block schistosomiasis infection of the parasitic trematode, Schistosoma mansoni, in the intermediate snail host, Biomphalaria glabrata.

Parasites & Vectors

血吸虫病是全球主要的公共卫生问题。尽管普鲁安星（praziquantel）目前是唯一用于治疗血吸虫病的选择，但缺乏可靠的诊断和预后工具突显了对新药靶点的鉴定和表征的需求。最近，我们通过在NCBI（国家生物技术信息中心）进行的BLAST搜索，从中发现了意指人类CAXIV的B. glabrata同源物（登录号XP_013075832.1），其氨基酸序列相似度为37%。碳酸酐酶（CAs）是能催化CO2/HCO3水合/脱水的金属酶。这些酶与许多生理过程相关，并且其在肿瘤发生中的作用已被广泛提及。碳酸酐酶造成了有利于癌细胞存活、转移和生长的酸性细胞外环境。在本研究中，我们调查了CA抑制在接触到S. mansoni毛蚴的B. glabrata蜗牛中的作用。我们分析了易感和抗性蜗牛的幼体，以及S. mansoni暴露与否的情况下，B. glabrata CA编码转录物的表达。我们的结果显示，在易感蜗牛（BBO2）中，CA mRNA编码转录物的表达在早期和长期感染过程中被上调，而抗性BS-90蜗牛中没有这种现象。值得注意的是，水杨酸钠（aspirin的一种形式）在感染后抑制了CA的表达。寄生虫与癌症之间的研究越来越多地表明，吸血蛭虫和癌细胞在增殖、存活和逃避宿主免疫机制方面具有相似性。在这里，我们展示了这个模型系统是了解CA在癌细胞转移和增殖中作用的一个潜在新途径。进一步的研究需要探索CA作为其他引起血吸虫病的寄生虫（包括日本血吸虫和血吸虫）感染的生物标志物的潜力。版权 © 2023 Elsevier Inc. 发布。

Parasites & Vectors

XingruWang,JianweiLi...

Approaches of laparoscopic anatomical liver resection of segment 8 for hepatocellular carcinoma: A retrospective cohort study of short-term results at multiple centers in China.

Parasites & Vectors

腹腔镜解剖性肝8段切除术（LALR-S8）对于解剖学腹腔镜段切除术来说仍然是一个挑战。目前关于LALR-S8的绝大多数报道都是使用一种外科方法的病例系列，缺乏关于使用不同方法确定间段平面的多中心数据。本研究旨在阐明三种不同方法用于肝细胞癌（HCC）的LALR-S8的短期结果，重点是间段平面确定，并反映目前我国多个中心使用不同方法的实践情况。回顾性分析了中国七家领先中心122例接受LALR-S8治疗HCC的临床队列数据。根据Glissonean血管束技术的方法总结并规范了所有方法的手术程序。评估并比较了三种方法的术后短期结果和肿瘤学结果。使用了三种方法：腹腔镜超声引导的吲哚青（ICG）荧光阳性染色法（11/122, 9.02%），肝静脉引导法（99/122, 81.15%）和Glissonean ICG荧光阴性染色法（12/122, 9.83%）。根据Clavien-Dindo（CD）分类，有7例（5.73%）患者出现并发症，≥IIIa级并发症发生率为2.46%。组间（切缘大于1mm）的R0切除率和切缘宽度没有统计学差异。在标准化外科技术和适当的外科方法下，LALR-S8对于治疗HCC是安全和可行的。三种报道的方法在术后短期肿瘤学结果方面具有可比性，而肝静脉引导法最常用。版权 © 2023作者。由Wolters Kluwer Health，Inc.发表。

Parasites & Vectors

VerenavonBülow,Marya...

Schistosoma mansoni-induced oxidative stress triggers hepatocellular proliferation.

Parasites & Vectors

血吸虫病是感染人数超过2.5亿的最突出的寄生虫引起的传染病之一。血吸虫病毒引起肝脏代谢耗竭和强烈的氧化还原不平衡，导致实质损伤，并可能增加患癌症的风险。我们研究了氧化应激是否会在血吸虫感染时引发肝细胞增殖。我们在血吸虫感染的仓鼠肝脏中通过转录水平和蛋白水平分析了细胞周期、复制应激响应和增殖，并通过机械性增益和功能丧失实验在人肝癌细胞中验证了核心结果。主要结果在血吸虫感染人体肝活检中得到验证。血吸虫感染引起了DNA复制和细胞周期检查点环素的授权因子，与仓鼠肝细胞中的DNA损伤反应同时进行。此外，即使是没有卵效应的单性感染，作为一种慢性炎症过程的反映，也导致了几个细胞周期标记物的适度活化。血吸虫可溶性卵抗原诱导人肝癌细胞的增殖，该增殖可以通过还原型谷胱甘肽消除。我们的数据表明，血吸虫卵引发的氧化应激会触发肝细胞增殖。版权所有© 2023，由Elsevier Inc.发表。保留所有权利。

XuelinYao,HanyuanLiu...

Circular RNA EIF3I promotes papillary thyroid cancer progression by interacting with AUF1 to increase Cyclin D1 production.

循环RNA（circRNA）通过多种生物学功能在调控人类癌症的发展中发挥重要作用。然而，循环eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I（circEIF3I）在乳头状甲状腺癌（PTC）中的作用机制尚不完全清楚。在本研究中，我们发现hsa_circ_0011385（被称为circEIF3I）在PTC细胞中优先定位于细胞质，并且比其线性同源物EIF3I更加稳定。功能增加和失去功能的研究表明，circEIF3I通过促进细胞增殖、细胞周期、细胞迁移和侵袭等体外过程以及PTC细胞增殖的体内过程来促进PTC的进展。在机制上，circEIF3I与PTC细胞细胞质中的AU-rich element（ARE）RNA结合因子1（AUF1）相互作用，从而降低Cyclin D1 mRNA的降解并增加Cyclin D1蛋白的产生，最终导致PTC的进展。综上所述，我们的结果表明了circEIF3I在PTC进展中的重要作用，并支持其作为潜在治疗靶点的重要性。© 2023. 作者以独占许可授予 Springer Nature Limited.

Nature Protocols

NazerRajoub,Charline...

A workflow for the development of template-assisted membrane crystallization downstream processing for monoclonal antibody purification.

Nature Protocols

单克隆抗体（mAbs）是常用的生物制剂，用于治疗风湿性关节炎、多发性硬化症、COVID-19和各种癌症等疾病。它们是在中国仓鼠卵巢细胞系中生产的，并通过一系列基于色谱的复杂且昂贵的步骤进行纯化，这些步骤是批量操作的，且严重依赖蛋白A树脂。传统程序的主要缺点是吸附介质成本高，色谱柱再生时需要大量使用化学品，对环境造成了负担。我们已经表明，传统的蛋白A色谱可以用单一结晶步骤替代，并且可以使用模板辅助膜结晶过程，在连续流中实现克级生产。模板嵌入在膜中（例如，多孔聚偏氟乙烯和聚乙烯醇聚合的层），用作结晶的成核剂。mAbs是柔性蛋白质，很难结晶，因此确定结晶的最佳条件可能具有挑战性。本协议的目的是建立一种系统性和灵活的方法，以设计一个强大、经济和可持续的mAb纯化平台，至少能够替代传统色谱纯化平台中的蛋白A亲和阶段。该程序提供了建立分离的最佳参数（结晶条件、模板选择、膜选择）和分析和表征方法的详细信息。© 2023年 Springer Nature Limited.

Nature Protocols

BrianCoughlin,Willia...

Modified Neuropixels probes for recording human neurophysiology in the operating room.

Nature Protocols

Neuropixels是一种基于硅的电生理记录探针，具有高通道数和记录位密度。这些探针提供了一个一站式平台，用于以单细胞分辨率和超出当前临床批准设备能力的尺度测量神经活动。我们的团队在癫痫或肿瘤切除手术和帕金森病患者深部脑刺激电极植入期间首次使用这些探针。在这里，我们提供了对使用Neuropixels作为研究工具研究人类神经生理学的能力和挑战的更好理解，希望这些信息能够为未来将Neuropixels探针作为研究设备获得监管批准的努力提供参考。在围手术期操作中，主要关注的是设备的初始无菌性、手术过程中的无菌区域维持、可用于去噪（如有必要）的多种参考和接地方案、避免在插入前意外接触硅探针，以及获取高质量的动作电位和局部场电位记录。研究团队确保设备完全运作，并与手术团队协调合作，消除可能对敏感硬件记录的信号产生重大影响的电气噪声来源。在使用设备前进行设备和人体临床研究培训，以及在手术室工作，最大限度地提高了团队内部和团队之间的有效沟通，确保了高质量的记录并尽量减少手术时间。围手术期的操作需要约4小时，整个协议需要数周时间。©2023，Springer Nature Limited。