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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 18

ChenjunHuang,XiaoXia...
HPV-16 E6 mutation and viral integration related host DNA methylation implicate the development and progression of cervical cancer.
Epigenetics & Chromatin
HPV-16 感染和病毒-宿主整合是宫颈癌 (CC) 最重要的危险因素。本研究的目的是开发一种新的分子策略,整合病毒和宿主基因组变异来识别和监测 CC。从公共数据库收集了总共 312 个甲基化和 538 个 RNA-seq 数据集,以识别差异甲基化和表达的基因。使用 ViMIC 数据库分析 HPV 相关病毒整合位点 (VIS)。 2020年9月至2021年8月,对多中心队列回顾性收集的70例HPV-16阳性病例进行HPV-16 E6深度测序和基于PCR的宿主基因(ASTN1、DLX1、ITGA4、RXFP3、SOX17、ZNF671)甲基化检测。在携带 HPV D32E 的 C-33A 细胞系中进行 RNAseq 和表达验证 (NNF671)。采用Lasso和Logistic回归算法构建CC诊断模型。CC患者的平均甲基化水平与肿瘤分期(p = 0.0077)和HPV亚型(p < 0.001)等病理特征呈正相关。 ZNF671 被鉴定为 CC 特异性甲基化标记,具有令人印象深刻的 93% 灵敏度。 HPV-16 D32E 突变和 HPV-16 整合均下调 ZNF671 表达。最后,通过整合 ZNF671 甲基化水平和 HPV E6 突变特征,开发了 CC 诊断列线图,得出了 0.997 的异常 AUC(95% CI:0.934-1.000)。我们的研究表明,HPV 病毒突变与宿主基因表观遗传改变密切相关。抄送。病毒和宿主遗传信息的整合可能是 CC 筛查的一种新的有前景的策略。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Aug 18

ChuanpuHu,AnnaGKondi...
Visual predictive check of longitudinal models and dropout.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
视觉预测检查(VPC)通常用于评估药理学模型。然而,如果结果较差的患者提前退出,他们的表现可能会受到阻碍,这在临床试验中经常发生,尤其是在肿瘤学领域。虽然文献中已经出现了解释辍学的方法,但它们在假设、灵活性和性能方面各不相同,而且它们之间的差异尚未得到广泛理解。本手稿旨在阐明哪些方法可用于处理具有 dropout 的 VPC 以及何时处理,以及使用置信区间的信息更丰富的 VPC 方法。此外,我们建议根据观测数据而不是模拟数据构建置信区间。在 VPC 中纳入 dropout 的理论框架得到开发并应用,提出两种方法:完全方法和条件方法。完整方法是使用参数事件时间模型来实现的,而条件方法是使用参数模型和 Cox 比例风险 (CPH) 模型来实现的。这些方法的实际性能通过对纳武单抗和多西他赛两项癌症临床试验数据的肿瘤生长动力学(TGD)建模的应用进行了说明,其中对患者进行随访直至疾病进展。该数据集由 855 名受试者的 3504 个肿瘤大小测量值组成,由 TGD 模型描述。受试者的退出通过 Weibull 或 CPH 模型来描述。模拟数据集还用于进一步说明 VPC 方法的属性。结果表明,与不调整 drop 的简单方法相比,更熟悉的完整方法可能无法为 TGD 模型评估提供有意义的改进,并且可能优于使用 Weibull 模型或 Cox 比例风险模型的条件方法。总体而言,包括 VPC 中的置信区间应该可以改善解释,条件方法被证明在发生丢失时更普遍适用,非参数方法可以提供额外的稳健性。© 2024。作者,获得 Springer Science Business 的独家许可Media, LLC,隶属于施普林格自然。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jun 01

NNAbTalib,MNisha,RRa...
Preliminary studies on the effect of excretory secretory (ES) Ascaris lumbricoides antigens on colorectal cell line viability.
Cellular & Molecular Immunology
蠕虫寄生虫是一组来自不同分类科的复杂后生动物。活体寄生虫从表面分泌的排泄分泌(ES)副产物似乎可以调节宿主对蠕虫感染的免疫反应。本研究旨在探讨来自蠕虫寄生虫的 ES 抗原对结直肠细胞活力的影响。用无菌 PBS 冲洗后,将线虫在磷酸盐缓冲盐水 (PBS x1) 中于 37°C 培养 24 小时。使用研钵和研杵,使用 PBS 将蠕虫剧烈压碎。提取获得的排泄性分泌(ES)抗原,使用0.22 µM过滤器过滤,并保存在-20°C下以供进一步测定。对于 LCMS,使用 Agilent ZORBAX Eclipse Plus C18 快速分离 HT 分析 100 µl 提取物。使用 CRC 细胞系 HCT 116 提取 ES 抗原(10 µg/ml 和 20 µg/ml)用于细胞活力研究。细胞活力和 MTT 测定按照 MTT 试剂盒中提到的方案进行。液相色谱和质谱(LCMS)数据表明ES抗原含有代谢化合物,即脂肪酸、氨基醇、吲哚、甾醇、糖苷和鞘氨醇。对于蛔虫 LCMS 分析,检测到大约 405 个代谢峰。其中,通过数据库检测到了 58 种化合物,同时检测到的几种化合物具有抗癌特性。 MTT测定表明,暴露24小时和48小时后,与对照组相比,所有处理的细胞均表现出细胞活力下降。初步研究表明,来自蛔虫的ES抗原具有一定的降低HCT116 CRC细胞系细胞活力的能力。需要进一步的研究来检查 ES 抗原对 CRC 细胞系的细胞周期停滞和凋亡作用。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 18

Chia-LingHsieh,AnhDu...
L1CAM mediates neuroendocrine phenotype acquisition in prostate cancer cells.
Cellular & Molecular Immunology
表现出神经内分泌 (NE) 分化的一种特定类型的前列腺癌 (PC) 被称为 NEPC。 NEPC 对雄激素剥夺治疗几乎没有反应,并且与转移性去势抵抗性 PC (CRPC) 的发展有关,后者的预后极差。我们对 NEPC 中的遗传驱动因素和激活途径的了解有限,这阻碍了精准医学方法。 L1 细胞粘附分子 (L1CAM) 已知在转移性癌症(包括 CRPC)中发挥致癌作用。然而,L1CAM 对 NEPC 进展的影响仍然难以捉摸。使用 PC 队列和患者来源的异种移植模型的公共基因表达数据库研究了 L1CAM 表达水平。在不同的 PC 细胞中进行 L1CAM 敲除以研究体外细胞功能。 CRPC细胞系CWR22Rv1的亚系是在长期暴露于阿比特龙诱导NE分化后建立的。在肿瘤球形成条件下培养雄激素受体阴性细胞系PC3以丰富癌症干性特征。在 PC 细胞上测试了几种氧化应激诱导剂,以观察 L1CAM 介导的基因表达和细胞死亡。与 CRPC 或腺癌肿瘤相比,NEPC 中的 L1CAM 表达显着高。 L1CAM 还与 NE 标志物表达相关,并与基因表达数据库中腺癌向 NEPC 的进展以及具有 NE 分化的 CRPC 细胞相关。在癌症干性富集下,L1CAM 还促进 PC3 细胞中的癌症干性和 NE 表型。 L1CAM 也被鉴定为活性氧诱导基因,通过该基因 L1CAM 可以抵消电离辐射引发的 CRPC 细胞死亡。我们的结果揭示了 L1CAM 在 PC 中 NE 表型获得中的新作用,有助于 NE 分化相关CRPC 的治疗耐药性。© 2024 Wiley periodicals LLC。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 18

EpiphaneKSilli,Zhenj...
Design optimization of Fucoidan-coating Cationic Liposomes for enhance Gemcitabine delivery.
Cellular & Molecular Immunology
由于癌症化疗药物面临的障碍,科学家们将吉西他滨 (GEM) 装入脂质体等纳米载体中,该载体以其无毒特性和靶向能力而闻名。含有 GEM 的脂质体纳米结构被岩藻依聚糖 (FU) 包覆,因为它具有针对癌细胞的抗肿瘤特性。由此在最佳条件下采用薄膜水合法制备了四种不同的阳离子脂质体制剂:DOTAP(制剂A); DPPC/DOTAP(4:1 摩尔比,配方 B)、DPPC/DMPC/DOTAP(4:1:1 摩尔比,配方 C)和 DPPC/DMPC/DOTAP/DSPE-mPEG2000(4:1:1:0.1 摩尔比)比例,配方D)。研究人员对它们进行了研究,以确定能够有效包埋 GEM 并在脂质体表面成功涂覆 FU 的脂质组合物。然后评估其他定性特征,例如粒径、多分散指数、zeta 电位、稳定性和体外药物释放。配方 C 具有最佳的 GEM 包封效率 (EE),但在涂有 FU 时会形成聚集体,产生不均匀的大尺寸颗粒,因此不适合有效递送。配方 A 和 B 的情况相同。只有配方 D 通过成功包覆来自三种不同藻类的 FU,表现出良好的 GEM-EE (> 80%) 和亲和力。就储存稳定性和药物释放研究而言,涂有 FU 的聚乙二醇化制剂 D 被证明是设计最佳药物递送系统的一种有前途的方法。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media 的独家许可, LLC,施普林格自然集团的一部分。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 18

ConsolatoMSergi
Pediatric cancer-pathology and microenvironment influence: a perspective into osteosarcoma and non-osteogenic mesenchymal malignant neoplasms.
Cellular & Molecular Immunology
儿童癌症仍然是 1-14 岁儿童疾病相关死亡的主要原因。一些风险因素已被最终确定,包括接触农药、高剂量辐射和特定的遗传综合征,但大多数事件的病因仍不清楚。肿瘤微环境(TME)包括基质细胞、脉管系统、成纤维细胞、脂肪细胞和不同的免疫细胞亚群。 TME 在癌发生、癌症形成、进展、传播和治疗耐药性中发挥着至关重要的作用。此外,自噬似乎是 TME 的重要调节因子并控制肿瘤免疫。自噬是一种进化上保守的细胞内过程。它能够利用溶酶体介导的途径降解和回收长寿命的大分子或受损的细胞器。自噬在复杂的肿瘤性 TME 中的多方面作用可能取决于具体情况。自噬可能通过消除不健康的细胞内成分和蛋白质、调节免疫细胞的抗原呈递以及支持抗癌免疫反应,在早期肿瘤发生过程中发挥肿瘤抑制机制的作用。另一方面,自噬失调可能通过促进基因组损伤和不稳定而导致肿瘤进展。这种观点提供了一系列影响 TME 特征和转移过程的调节物质。骨和软组织肉瘤中的间充质细胞及其信号通路比儿童和青少年的上皮细胞发挥着更重要的作用。 TME 在儿科恶性肿瘤中的研究基本上仍是未知的,这个独特的集合可能有助于囊括该领域的新颖进展。© 2024。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 18

MateusJoséDutra,Isab...
Effects of artemisinin and cisplatin on the malignant progression of oral leukoplakia. In vitro and in vivo study.
Cellular & Molecular Immunology
化学预防可以治疗潜在的恶性病变(PML)。我们的目的是使用口腔白斑 (OL) 和口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 细胞系,在体外评估青蒿素 (ART) 和顺铂 (CSP) 是否与细胞凋亡和免疫原性细胞死亡 (ICD) 相关,以及这些化合物是否可以预防体内 OL 进展。用 ART、CSP 和 ART CSP 处理正常角质形成细胞 (HaCat)、发育不良口腔细胞 (DOK) 和口腔鳞状细胞癌 (SCC-180) 细胞系,分析细胞毒性、基因毒性、细胞迁移和与细胞凋亡和 ICD 相关的蛋白质表达增加。此外,41 只小鼠使用 4NQO 诱导 OL,接受 ART 和 CSP 处理,并对它们的舌头进行组织学分析。在体外,CSP 和 CSP ART 显示出剂量依赖性细胞毒性并减少 SCC-180 迁移。没有任何治疗具有遗传毒性,也没有诱导与细胞凋亡和 ICD 相关的蛋白质表达; CSP 显着降低了 SCC-180 中高迁移率组 box-1 (HMGB-1) 蛋白的表达。在体内,ART 和 CSP 治疗延迟了 OL 的进展;然而,到了第 16 周,只有 CSP 阻止了向 OSCC 的进展。与 ICD 和细胞凋亡相关的蛋白质表达并未随着治疗而增加,并且 CSP 被证明可以减少 SCC-180 中的免疫原性途径,同时减少细胞迁移。 ART并不能阻止OL体内的恶性进展;尽管有明显的不利影响,CSP 仍然做到了。© 2024。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 18

JianqiYang,ErxunDai,...
Effects of different nutritional support methods on nutritional status and immune function in patients undergoing radiotherapy for head and neck cancer.
Cellular & Molecular Immunology
本研究旨在分析不同营养支持方式对头颈癌(HNC)放疗患者营养状况和免疫功能的影响。HNC患者分为对照(营养咨询和常规膳食指导)、肠外营养(PN)(在对照组之上的PN支持)、肠内营养(EN)(在对照组之上的EN支持)和EN PN(EN结合PN和常规饮食指导)组。经过营养评估后,四组均接受放疗和营养支持。比较两组患者的体重指数(BMI)、血清白蛋白(ALB)、前白蛋白(PA)、转铁蛋白(TRF)、血红蛋白(Hb)、CD3、CD4、CD8、CD4/CD8、自然杀伤细胞(NK)和生活质量。四组放疗前及放疗后剂量照射完成。评估并记录放疗第2周、第4周及放疗结束时的不良反应发生情况。四组放疗期间均出现一定程度的营养不良,其中EN PN组营养不良程度最低。放疗剂量照射完成后(T1),PN、EN和EN PN组的BMI(21.42 ± 1.62、21.40 ± 1.68、22.98 ± 1.87 vs. 20.18 ± 1.32)、血清ALB(31.59 ± )有所改善3.49, 32.24 ± 4.23 , 37.58 ± 3.23 对比 26.67 ± 3.03), PA (182.63 ± 13.57, 183.43 ± 14.19, 201.59 ± 10.53 对比 165.36 ± 20.13), TRF(162.46±±24.34、157.36±±18.58、182.36±±20.37 与 137.56±±23.19)和 Hb(128.54 ± 9.21、125.36 ± 10.23、140.26 ± 7.23 与 103.24 ± 9.47)水平,较高的 CD3(63.59 ± 2.88、63.25 ± 3.17) , 66.54 ± 1.32 与 59.36 ± 3.24), CD4 (39.92 ± 3.16, 39.87 ± 3.23、43.36 ± 2.87对比37.12 ± 4.29)、CD4/CD8(1.80 ± 0.06、1.78 ± 0.06、2.07 ± 0.03对比1.54 ± 0.10) 和 NK 细胞 (33.87 ± 3.62, 33.26 ± 3.59, 36.82 ± 3.19 vs. 27.36 ± 4.21) 水平,降低 CD8 (22.18 ± 1.07、22.36 ± 1.04、20.46 ± 1.09 vs. 24.09 ± 1.21) 水平,并改善生活质量 (79.97 ± ) 7.96、80.13 ± 7.98、91.78 ± 7.38 71.53±±11.70)与对照组相比,EN PN组的效果最显着(所有P < 0.05)。放疗期间,放疗不良反应发生率随时间延长而增加(P < 0.05)。PN与EN单独或联合使用,可改善HNC放疗患者的营养状况、免疫功能和生活质量,PN联合应用使用 EN 具有最佳改善效果。© 2024。作者,获得 Federación de Sociedades Españolas de Oncología (FESEO) 的独家许可。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 18

YichengLiu,XiaobingY...
A comprehensive analysis of TRP-related gene signature, and immune infiltration in patients with colorectal cancer.
Cellular & Molecular Immunology
瞬时受体电位(TRP)通道参与肿瘤的发生和进展。然而,它们在结直肠癌(CRC)中的作用仍不清楚,本研究旨在探讨TRP相关基因在CRC中的作用。数据来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库,并对GSE14333和GSE14333进行分析。 GSE38832 数据集用于评估预后并标记 TRP 相关基因 (TRG)。随后,进行聚类分析和免疫浸润分析来探索相关的TRG。利用人结肠癌细胞对关键TRGs基因和蛋白表达进行体外验证。与正常组织相比,CRC中8个TRGs显着上调,11个TRGs下调。 TRPA1被确定为保护性预后因素,而TRPM5(HR = 1.349)、TRPV4(HR = 1.289)和TRPV3(HR = 1.442)被确定为预后危险因素。受试者工作特征 (ROC) 曲线和 Kaplan-Meier (KM) 分析得出了相似的结果。此外,TRPA1 的较低表达以及 TRPV4 和 TRPM5 的较高表达与患者预后呈负相关,实验验证证实了 CRC 细胞系中 TRPA1 的表达不足和 TRPV4 和 TRPM5 的过度表达。本研究确定了 CRC 中 TRP 通道相关的预后,提供了一种对 CRC 预后进行分层的新颖方法。© 2024。作者。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 18

ShilpaRao,AditiGoyal...
MAPK pathway alterations in polymorphous low-grade neuroepithelial tumor of the young: diagnostic considerations.
Brain Structure & Function
青少年多形性低度神经上皮肿瘤(PLNTY)是最近公认的一种肿瘤类型,具有惰性行为,具有特征性成像和组织分子特征。我们描述了 3 年时间内诊断为提示 PLNTY 的低级别胶质瘤的 15 例病例的临床、影像学和组织分子特征。 使用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交来评估分子改变。这些肿瘤主要见于儿童(5-65 岁)。大多数患者有癫痫病史。影像学显示皮质-皮质下边界清楚的实性囊性肿瘤,伴有瘤内钙化。组织病理学显示,这是一种低度肿瘤,其中含有少突胶质细胞样细胞和 CD34 免疫阳性的星形胶质细胞。 BRAF p.V600E 突变和 FGFR2 断裂各在 6 例中观察到,而 3 例则显示 FGFR3 断裂。 FGFR2 断裂阳性 PNLTY 仅见于儿童。除两名患者死亡外,大多数病例术后均无癫痫发作。对于有癫痫病史的年轻患者,PLNTY 需要被视为实性囊性肿瘤的主要鉴别诊断。特征性临床特征、放射学、组织形态学(OLIG2、GFAP 和 CD34 的 IHC 组)与 PLNTY 中的 MAPK 改变之一相关(BRAF p.V600E、FGFR2/3 基因重排)。在资源有限的情况下,这个有限的小组可能足以进行相关诊断。© 2024。作者,获得日本脑肿瘤病理学会的独家许可。
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