研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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NATURE BIOTECHNOLOGY
2023 Sep 11
HeonSeokKim,SusanMGr...
Direct measurement of engineered cancer mutations and their transcriptional phenotypes in single cells.
NATURE BIOTECHNOLOGY
基因组测序研究已经确定了广泛肿瘤类型中大量癌症突变,但是确定这些突变的表型影响仍然是一个挑战。本文中,我们开发了一种名为TISCC-seq的高通量、多重单细胞技术,使用CRISPR碱基编辑酶工程预先设计的突变,并直接在单个细胞中描绘其基因型,并确定每个突变的转录表型。目标基因转录的长读测序鉴定了工程突变,同时使用短读测序分析相同细胞集合的转录组剖析。通过整合,我们确定了基因型和表达表型的细胞分辨率的突变。使用细胞系,我们对超过100个TP53突变的基因表达影响进行工程和评估。基于单细胞基因表达,我们将这些突变分为具有功能显著表型的突变。© 2023. 作者。
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NATURE MEDICINE
2023 Sep 11
YuehanWang,CécileMRo...
Subsequent female breast cancer risk associated with anthracycline chemotherapy for childhood cancer.
NATURE MEDICINE
顺铂类化疗与女性儿童癌症幸存者后续乳腺癌(SBC)风险增加有关,但当前的证据不足以支持对接受顺铂类化疗的幸存者进行早期乳腺癌筛查建议。本研究中,我们整合了来自六个成熟的研究中的17,903名幸存者的个体病人数据,其中782人(4.4%)发展为SBC,并分析了个体顺铂类药物在发展SBC过程中的剂量依赖效应以及与胸部放疗的相互作用。观察到了多柔比星的剂量依赖性SBC风险增加(每100mg/m2:危险比(HR)= 1.24,95%可信区间(CI):1.18-1.31),相比不使用多柔比星治疗的幸存者,对累积多柔比星剂量≥ 200 mg/m2的幸存者而言,风险增加了两倍以上(200-299 mg/m2,HR = 2.50;300-399 mg/m2,HR = 2.33;≥ 400 mg/m2,HR = 2.78)。丹纳比星的关联性没有统计学意义。依托蓝霉素与SBC风险增加相关(是/否,HR = 3.25,95% CI:1.59-6.63)。对于接受或不接受胸部放疗的患者而言,每100mg/m2多柔比星的HR分别为1.11(95% CI:1.02-1.21)和1.26(95% CI:1.17-1.36)。我们的发现支持早期开始进行SBC监测对于接受了≥ 200 mg/m2多柔比星累积剂量的幸存者来说可能是合理的,并且应考虑将其纳入SBC监测指南以及幸存者和未来治疗方案中。© 2023. 作者。
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NATURE GENETICS
2023 Sep 11
CarolineJWatson,Jami...
Mutation rates and fitness consequences of mosaic chromosomal alterations in blood.
NATURE GENETICS
细胞质体染色体异常(mCAs)在癌症中很常见,可在诊断前几十年就出现。对这些事件发生的速率和功能后果的定量理解可以提高癌症风险预测并增进对体细胞进化的理解。我们利用约50万名英国生物库(UK Biobank)参与者的血液样品来估计mCA克隆大小,并评估获得的增益、缺失和等位失配性丧失的突变率和适应度后果。大多数mCAs具有适中到高的适应度效应,但发生率较低,比等效的单核苷酸变体要少十倍以上。其中值得注意的例外是X和Y的细胞质体丢失,我们估计其突变率比常染色体mCAs高约1000倍。尽管大多数mCAs随年龄增加而增加的方式与恒定的增长速率一致,但某些mCAs表现出不同行为,这表明它们的适应度可能依赖于遗传变异、外部因素或适应度效应分布。©2023。作者。
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NATURE CELL BIOLOGY
2023 Sep
SangkyeongEom,Jongji...
Widespread 8-oxoguanine modifications of miRNA seeds differentially regulate redox-dependent cancer development.
NATURE CELL BIOLOGY
氧化应激通过改变基因表达促进肿瘤发生。其中一种伴随的修饰物8-氧鸟嘌呤(o8G)可以通过 o8G•A 碱基配对改变 RNA-RNA 相互作用,但其调控作用仍然不清楚。基于测序中特征为 o8G 诱导的鸟嘌呤到胸腺嘧啶(o8G > T)变异,我们在肿瘤微小RNA中发现了广泛的位置特异性 o8G,其首选氧化于以序列模式聚集的 5' 端种子区域(2-8 位置),并与低级别胶质瘤和肝细胞肝癌患者有临床关联。我们验证了在 miR-124 的位置 4 上的 o8G(4o8G-miR-124)和 4o8G-let-7 可以抑制低级别胶质瘤,而 3o8G-miR-122 和 4o8G-let-7 可以促进肝细胞肝癌的恶性化,通过将靶转录组重定向到致癌的调控途径。由促进肿瘤的 3o8G-miR-122 逐步发生到抑制肿瘤的 2,3o8G-miR-122 的氧化过程发生,并且在小鼠肝脏中特异性调节有效地减轻了二乙基亚硝胺诱导的肝癌发生。这些发现为由氧化还原改变重编程的 microRNA 功能的表转录o8G 调控提供了资源和见解,暗示其在癌症治疗中的控制。© 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Limited.
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Sep 11
AndreaPlaikner,Kathr...
Fertility sparing therapy in women with lymph node negative cervical cancer >2cm - oncologic and fertility outcomes of neoadjuvant chemotherapy followed by radical vaginal trachelectomy.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
简单或根治性子宫颈切除术对于诊断为≤2cm宫颈癌的患者被接受作为保存生育能力的治疗方法。对于较大肿瘤的患者,保存生育概念被认为是实验性的。我们的研究旨在介绍经腹腔镜盆腔淋巴结清扫术结合新辅助化疗和随后的阴式根治性子宫颈切除术的肿瘤学和生育结局。这些手术是在柏林自由大学查奇瑞特大学和汉堡阿斯克利皮奥斯医院这两家医疗中心中,于2006年2月至2020年6月间,在诊断为直径大于2cm的宫颈癌患者中进行的。我们回顾性分析了根据国际妇产科联合会(FIGO)2018年分类系统评估为IB2、IB3或IIA1期的宫颈癌患者的人口统计学、组织学、生育和随访数据。这些患者在2006年2月至2020年6月期间,在柏林自由大学查奇瑞特大学和汉堡阿斯克利皮奥斯医院接受盆腔淋巴结清扫术、新辅助化疗和阴式根治性子宫颈切除术。共有31名患者(平均年龄29.5岁,范围为26-40岁)在淋巴结明确无肿瘤的情况下接受新辅助化疗后进行了阴式根治性子宫颈切除术。其中26名患者(84%)为无产妇。在这31名患者中,初始肿瘤分期为FIGO 2018年IB2期的27例、IB3期的3例和IIA1期的1例。淋巴结清扫术在除一例(岛屿式)外的所有患者中均已完成,盆腔淋巴结数目的中位数为33个(范围为11-47个)。新辅助化疗方案包括17例患者接受紫杉醇、异环化石蜡和顺铂两个疗程;8例患者接受紫杉醇、异环化石蜡和顺铂三个疗程;4例患者接受紫杉醇和顺铂两个疗程;1例患者接受顺铂单独一个疗程;1例患者接受紫杉醇和顺铂两个疗程,随后接受紫杉醇、异环化石蜡和顺铂两个疗程。17个标本(55%)中存在组织学上确定为残余肿瘤。新辅助化疗后残余肿瘤的中位数大小为12mm(范围为1-60mm)。27例患者(87%)的生育能力得以保留;其中2例患者在阴式根治性子宫颈切除术后接受了辅助化放疗,因为存在高危组织学特征;另外2例患者在新辅助化疗后接受了根治性子宫切除术并接受辅助化放疗。在18例患者(67%)寻求生育的情况下,有13例(72%)成功怀孕。共有10名妇女诞下12个活产儿,胎儿体重中位数为2490克(范围为1640-3560克),并出现5例流产。在中位随访时间为94.5个月(范围为6-183个月)后,发现3例疾病复发(11.1%),1例患者(3.7%)死于疾病。对于寻求生育的宫颈癌>2cm患者,经新辅助化疗后进行根治性子宫颈切除术可以提供健康婴儿的怀孕机会,在出院时的健康婴儿怀孕比率为10/18名患者(55%)。相比于文献报道中直径不超过2cm的宫颈癌患者接受根治性子宫颈切除术,这种保存生育策略与更高的复发和死亡率有关。© IGCS and ESGO 2023. 未经商业复用。请查看权利和权限。由BMJ出版。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Sep 11
RhiannaRachaelRomany...
The role of three-dimensional in vitro models in modelling the inflammatory microenvironment associated with obesity in breast cancer.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
肥胖是绝经后妇女乳腺癌的确定危险因素。然而,肥胖如何对乳腺癌产生影响的潜在生物学机制尚不清楚。炎性脂肪微环境是乳腺癌进展的核心,已被证明有利于乳腺癌细胞生长并降低抗癌治疗的有效性。因此,深入理解肥胖乳腺癌患者中的炎性微环境至关重要。三维(3D)体外模型是增进我们对脂肪微环境内复杂相互作用的理解的关键工具。本综述讨论了用于重现乳腺肿瘤微环境的一些方法,包括各种共培养和3D体外模型。我们考虑这些模型系统如何有助于乳腺癌研究的理解,特别关注炎性肿瘤微环境的作用。本综述旨在就这些模型系统在乳腺癌研究中的应用前景提供洞察和未来发展方向。© 2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature 的一部分。
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LUNG CANCER
2023 Sep 03
DuoduoHan,YiqunZhu,A...
Association of telomere length with risk of lung cancer: A large prospective cohort study from the UK Biobank.
LUNG CANCER
白细胞端粒长度(LTL)与多种疾病,包括癌症有关。然而,有关LTL与肺癌风险之间的关联的研究结果在以前的观察性研究中是不确定和不一致的。本前瞻性队列研究包括来自英国生物样本库的425,146名年龄为37-73岁的参与者的数据。定量聚合酶链反应(qPCR)用于测量基线DNA样本中的LTL。采用多元Cox比例风险模型评估LTL与肺癌风险之间的关系。单位长度范围(IQR)增加的LTL与肺癌风险的增加呈正相关(风险比[Hazard ratio, HR]为1.09 [95%可信区间(CI)1.03-1.16])。最高LTL五分位数的参与者与最低五分位数的参与者相比,患肺癌的风险约增加25%(HR为1.25 [95%CI 1.09-1.45])。单位IQR增加的LTL与肺癌风险的关系在组织学亚型腺癌(HR 1.30 [95% CI 1.18-1.43])、女性性别(HR 1.16 [95% CI 1.06-1.26])、非吸烟者(HR 1.45 [95% CI 1.23-1.71])和有高遗传风险的肺癌个体(HR 1.18 [95% CI 1.03-1.34])中更为显著。令人惊讶的是,每个IQR增加的LTL与非吸烟者中的肺腺癌(HR 1.56 [95% CI 1.24-1.96])和鳞状细胞癌(HR 2.01 [95% CI 1.13-3.56])的风险都有所增加。较长的LTL与肺癌的风险增加有关,尤其是对于非吸烟者中的腺癌和鳞状细胞癌。结果提示LTL作为无创生物标志物有潜力用于肺癌的早期筛查,尤其适用于通常被忽视的非吸烟者。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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JOURNAL OF SCIENCE AND MEDICINE IN SPORT
2023 Aug 21
CarlaMalveiro,InêsRC...
Effects of exercise training on cancer patients undergoing neoadjuvant treatment: A systematic review.
JOURNAL OF SCIENCE AND MEDICINE IN SPORT
本系统综述旨在分析不同运动方案对不同类型癌症患者在新辅助治疗期间的身体素质(心肺适能、肌肉力量和体成分)、生活质量、癌相关疲劳和睡眠质量的影响。系统综述使用四个电子数据库进行了全面的文献搜索:PubMed、Scopus、Web of Science和Cochrane Library(截至2022年10月19日的发表文章)。在所有数据库中,搜索了关于癌症患者在新辅助治疗期间评估运动效果的随机对照试验、准实验研究和前后研究。排除的文章包括多组分干预,如运动加饮食或行为疗法,以及在辅助治疗或幸存期进行的研究。使用物理治疗证据数据库(PEDro)量表评估了每项研究的方法论质量。本综述纳入了27项涉及999名癌症患者的试验。这些干预措施针对的癌症类型包括直肠癌(n=11)、乳腺癌(n=5)、胰腺癌(n=4)、食管癌(n=3)、胃食管癌(n=2)、前列腺癌(n=1)和白血病(n=1)。在包含的研究中,14项采用了混合运动方案,11项采用了有氧运动,2项分别采用了有氧运动和抗阻训练。虽然许多研究缺乏组间分析,但运动干预似乎改善了心肺适能、肌肉力量、体成分和生活质量。尽管证据有限,但在新辅助治疗期间应用运动干预显示出增强心肺适能、肌肉力量、体成分和整体生活质量方面的潜力。然而,对运动对癌相关疲劳和睡眠质量的影响仍然存在证据不足的情况。有关高质量随机对照试验的进一步研究是必要的。版权所有©2023年作者,由Elsevier Ltd.出版。保留所有权利。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF PHARMACEUTICS
2023 Sep 09
ChenyuZhang,HonglanZ...
Design, synthesis and bioactivity investigation of peptide-camptothecin conjugates as anticancer agents with a potential to overcome drug resistance.
INTERNATIONAL JOURNAL OF PHARMACEUTICS
坎普托西林(CPT)是一种源自于幸松-t毛楸的天然植物生物碱,具有强大的抗癌活性。然而,由于其水溶性低和肿瘤选择性有限等缺点,其持续利用受到了阻碍。阳离子型抗癌肽(CAPs)一般在水中溶解性较好,并且对恶性细胞具有良好的选择性。在前期研究中,我们报道了一种名为KM8-Aib的CAP,它显示出明显的选择性抗癌效果。因此,假设将KM8-Aib与CPT结合可能是改善CPT缺陷的一种可行方法。我们合成了一系列肽-CPT结合物,并进行了生物评价。在这些化合物中,Kb-CC07对一组包括耐药细胞在内的癌细胞株表现出最高的选择性活性,其IC50值在0.11-1.01 μM范围内,比CPT好1.9-22.6倍,并且具有宽阔的治疗指数124.5(对比CPT的治疗指数是5.3)。与CPT相比,Kb-CC07的水溶性也提高了约100倍。进一步的研究揭示了Kb-CC07能够有效穿透细胞膜,将更多的CPT分子传递到癌细胞内,克服了由肿瘤表面外流药物转运体引起的耐药性。体内实验证明,与CPT相比,Kb-CC07具有优异的抗肿瘤增殖活性(5 μmol·kg-1时,对应的肿瘤生长抑制率分别为98.2%和37.5%)。此外,Kb-CC07促使CPT在肿瘤组织中的积累,而对正常器官产生有限的毒性。总之,将治疗药物与CAPs结合可能是克服抗癌药物缺陷的一种潜在策略。此外,建议进一步深入研究Kb-CC07,作为一种有前景的抗癌候选药物。© 2023版权归Elsevier B.V.所有。
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INTERNATIONAL IMMUNOPHARMACOLOGY
2023 Sep 09
DongxingCao,KeyuQian...
Thymopentin ameliorates experimental colitis via inhibiting neutrophil extracellular traps.
INTERNATIONAL IMMUNOPHARMACOLOGY
克罗恩病(CD)的长期预后仍然不理想。因此,我们评估了胸腺五肽(TP5)对2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)诱导结肠炎小鼠模型的治疗效果,并分析了其对中性粒细胞外细胞陷阱(NETs)的影响。通过免疫染色和酶联免疫吸附法评估NET标志物,包括髓过氧化物酶(MPO)、中性粒细胞弹力蛋白酶(NE)、柠檬酰化组蛋白H3(CitH3)、肽酰精氨酸脱互异化酶IV(PAD4)和双链DNA(dsDNA)。通过体外评估NET形成。使用新清蛋白3,特定NET激动剂,来逆转TP5对TNBS诱导结肠炎的影响。用RNA-seq研究TP5的作用机制.TP5改善了TNBS组体重下降(P < 0.001),疾病活动指数(DAI)(P = 0.05),结肠萎缩(P = 0.04),以及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-1β、IL-6和中性粒细胞水平的升高。TNBS组MPO、NE、CitH3、PAD4、dsDNA和MPO-DNA水平增加(P < 0.001),在TP5治疗后减少(P = 0.01, P < 0.001, P < 0.001, P < 0.001, P = 0.02 和 P = 0.02)。组织CitH3水平与DAI和TNF-α水平呈正相关(P < 0.05)。此外,在体外刺激凋亡素12-肉豆蔻酸13-乙酯诱导的NET形成在对照组、TNBS+生理盐水组和TNBS+TP5组中分别增加了1.8倍、2.8倍和2.3倍。新清蛋白3显著逆转了TP5的效果。RNA-seq揭示了TP5效果的潜在途径.TP5通过抑制NETs有效缓解了实验CD模型的结肠炎。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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