大约三分之一的乳腺癌幸存者存在持续的认知问题和客观认知障碍。慢性炎症和肠道通透性（即"漏肠"）是导致认知下降的两个风险因素，并且还可加剧与认知下降相关的抑郁情绪。本研究旨在测试乳腺癌幸存者中伴有高水平炎症或肠道通透性的抑郁情绪是否预测主观和客观认知功能水平较低。我们合并了四个乳腺癌幸存者研究的数据（n=613），其中一些研究进行了多次测量，共计1015次研究访问。所有参与者均进行了血液采集以获得基线的脂多糖结合蛋白测量值-肠道通透性的一种衡量，同时还获得了三种炎症标志物的测量值，这些标志物被整合成了一个炎症指数：C-反应蛋白、白细胞介素-6和肿瘤坏死因子-α。参与者根据流行病学调查抑郁量表（CES-D）报告抑郁症状，并使用二元变量来指示临床上显著的抑郁症状（CES-D ≥ 16）。Kohli（749次观察）和乳腺癌预防试验（591次观察）量表评估主观认知功能。客观认知功能测试包括追踪测试、霍普金斯口头学习测试、康纳持续性能力测试、n-back测试、FAS测试和命名动物测试（239-246次观察）。在调整教育程度、年龄、BMI、癌症治疗类型、治疗之后时间、研究访问和疲劳的基础上，伴有增强炎症或肠道通透性的临床上显著抑郁症状的女性报告的注意力较差，记忆稍差。然而，客观认知测量方面的较差表现并不特定于与炎症相关的抑郁症。相反，有一些证据表明，无论有无炎症，抑郁幸存者在口头流畅性、注意力、口头学习和记忆、工作记忆以及视空间搜索方面都存在困难。独立地看，炎症和肠道通透性不太一致地预测主观或客观认知功能。乳腺癌幸存者如果伴有临床上显著的抑郁症状，无论是伴有增强炎症还是肠道通透性，其可能会感觉到认知困难较大，尽管与炎症相关的抑郁引起的客观认知缺陷可能不专门特定于炎症或"漏肠"相关的抑郁症。

亚甲基蓝是皮肤下发生的一种罕见的恶性黑色素瘤。亚甲基蓝是一种指甲下的黑素瘤，属于肢端黑素瘤类型。亚甲基蓝是一种侵袭性较强的皮肤黑素瘤，在亚洲患者中最为常见。最近的研究表明，亚甲基蓝和肢端黑素瘤可能具有不同的分子特征。黑色素瘤的治疗依赖于临床和分子数据的分析。因此，亚甲基蓝在临床和分子特征的建立中尤为重要，尤其是在转移过程中。为了确定亚甲基蓝的突变特征并将其与肢端黑素瘤进行比较，我们对亚甲基蓝和肢端黑素瘤患者的原发和转移性肿瘤进行了下一代测序。指甲下位置比肢端位置更能作为独立的预后因子，对于整体生存有更好的预测（p = 0.001）。亚甲基蓝中最常见的基因型为三倍野生型（75%），其主要驱动基因为GNAQ（58%）和KIT（25%）突变，而肢端黑素瘤患者则有BRAF（28.6%）和RAF（14.3%）等分子型突变。亚甲基蓝中单核苷酸变异（SNVs）比肢端黑素瘤更常见，而拷贝数改变（CNAs）则更常见于转移性肢端黑素瘤。亚甲基蓝和肢端黑素瘤患者的转移性肿瘤均表现出CNAs的增加（分别为43%和80%），但SNVs没有明显增加。CNAs在转移过程中的数量有所增加。与肢端黑素瘤相比，亚甲基蓝具有独特的临床和分子特征。

目标：宫颈癌在发展中国家的女性中居死因之首。保证最佳医疗指导下的早期鉴别和治疗，是减少宫颈癌后遗症的最重要程序。通过观察宫颈抹片图像是检测此类恶性肿瘤的最佳方法之一。对于自动检测宫颈癌，现有数据集中经常存在缺失值，这可能严重影响机器学习模型的性能。方法：为解决这些挑战，本研究提出了一个自动化系统，通过SMOTE特征高效处理缺失值以实现高精度的宫颈癌预测。所提出的系统采用了叠加集成投票分类器模型，结合三个机器学习模型以及KNN填充和SMOTE上采样特征来处理缺失值。结果：在使用KNN填充的SMOTE特征下，所提出的模型实现了99.99%的准确度、99.99%的精确度、99.99%的召回率和99.99%的F1得分。本研究比较了所提出模型在四种情况下与多个其他机器学习算法的性能：删除缺失值、使用KNN插补、使用SMOTE特征以及使用KNN填充的SMOTE特征。本研究验证了所提出模型在检测宫颈癌数据收集中缺失值和类别不平衡问题上的有效性，并可以帮助医务人员及时发现和为宫颈癌患者提供更好的护理。

在患有内分泌耐药性转移性乳腺癌(MBC)的患者中，雌激素受体基因(ESR1)，其转录调控因子以及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路的突变情况较为集中。我们在本研究中综合了全基因组测序和RNA测序数据，这些数据来自101名ER阳性/HER2阴性MBC患者的同一样本，在开始新一线MBC治疗之前进行了肿瘤活检( CPCT-02研究，NCT01855477 )，以分析之前与内分泌耐药性相关的DNA突变的下游效应，从而更好地了解相关机制。我们使用ESR1靶基因的表达进行了分层聚类。比较了被识别出的聚类之间的DNA水平的基因组改变、基因表达水平以及最后一次治疗。分层聚类显示出两个明显的簇，一个以ESR1和其靶基因表达增加为特征。该簇中的样本中ESR1突变和FGFR1及TSPYL扩增的情况显著增多。另一个簇的患者ESR1和其靶基因的表达水平相对较低，与ER阴性样本相当，并且在活检前更常接受内分泌治疗作为最后一次治疗。MAPK通路中的NF1和ESR1转录调控因子的基因分布均匀。总之，RNA测序确定了一个具有明显ESR1及其下游靶点表达的患者亚群，可能仍然受益于靶向ER的药物。在另一个亚群中ER表达较低，这可能部分解释了最近接受内分泌治疗导致ER活性仍然被阻断，这表明在解读转录组数据时需要考虑活检与内分泌治疗的时间关系。

人类醛脱氢酶超家族（hALDHs）是由19种同功酶组成的，对多种生理和生物合成过程至关重要，并通过NAD(P)依赖的氧化反应将多种内源性和外源性醛底物氧化为相应的羧酸以实现有机体的解毒作用。在过去的几十年里，ALDHs成为研究的对象，因为发现它们在不同癌症类型中的差异表达模式与癌变或促进细胞存活有关。本文试图在癌症病理学和化疗抵抗方面，全面综述hALDHs的多样功能和3D结构，特别关注结构特征与酶功能影响之间的关联。此外，我们还提供了用于癌症治疗的实验或临床设置中的hALDHs抑制剂的最新概述。总体而言，本综述旨在从结构角度提供对ALDHs在癌症病理学和治疗中的影响更好的理解。

尽管对CRC异质性的表征得到了改进，临床实践中仍缺乏适当的风险分层工具。该研究旨在阐明与不同转移路线相关的原发肿瘤转录组特征。通过转录组mRNA测序、基因集富集分析(GSEA)和免疫组化对从CRC患者中获取到的仅限于肝脏转移(CRC-Liver)或腹膜转移(CRC-Peritoneum)的原发肿瘤标本进行分析。我们进一步评估了我们的标志在COAD-TCGA独立队列中的临床病理学关联和预后价值。我们发现CRC-Liver组和CRC-Peritoneum组之间一致性分子亚型分布显著不同。基于61个基因的转录组特征能够区分肝脏和腹膜转移路线。GSEA显示CRC-Peritoneum样本中免疫应答和上皮浸润途径的表达较高，而CRC-Liver样本中增殖和代谢途径被激活。我们标志中三个显著差异表达基因(ACE2、CLDN18和DUSP4)在免疫组织化学表达中得到验证，证实了RNA-Seq结果的生物学相关性。COAD-TCGA的体外分析结果显示了CRC-Peritoneum标志与负预后因子以及较差的总体生存和无病生存相关。CRC原发肿瘤向肝脏和腹膜转移表现出明显不同的转录组特征。在临床实践中引入该标志有助于鉴别IV期CRC的新治疗靶点，并为II-III期CRC定义个体化的随访方案。

头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）是全球最常见的癌症之一，每年导致数十万人死亡。不幸的是，多数患者在晚期被诊断，只有一部分对治疗有良好的反应。为填补该空白，我们提出了一项回顾性的计算模拟研究，以揭示导致HNSCC发展的基因-miRNA相互作用。此外，通过识别拓扑生物标志物作为设计新药的来源。为了实现这一目标，我们全面重新评估了患者和对照组的基因和miRNA基因型，采用蛋白质相互作用（PPI）和二部图miRNA靶标网络。细胞骨架重塑、细胞外基质（ECM）、免疫系统、蛋白酶解和能量代谢已被确定为参与HNSCC发病机制的主要功能模块。值得注意的是，我们的研究结果显示了一个协同的分子作用景观，激活细胞周期和增殖促进基因的同时，失活那些抑制基因。在这种情况下，诸如VEGFA、EMP1、PPL、KRAS、MET、TP53、MMPs和HOXs等基因，以及mir-6728和mir-99a等miRNA，被确定为推动HNSCC肿瘤发生的关键因子。尽管这些HNSCC亚型具有异质性，以及存在依赖背景关系的相关研究的局限性，但与先前发表的研究结果的重叠是令人鼓舞的。因此，它支持进一步研究与HNSCC相关的关键分子，无论是已有关联还是未有关联的。

真菌样白斑病(MF)和塞扎里综合征(SS)是原发性皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)中最常见的类型。增殖细胞核抗原(PCNA)在癌细胞的细胞表面上表达(csPCNA)，而在正常细胞上没有表达。它通过与自然杀伤(NK)细胞相互作用，通过与NK抑制性受体NKp44结合，起到免疫检查点配体的作用，从而抑制NK的细胞毒性。建立了一种单克隆抗体(mAb14)来检测癌细胞上的csPCNA，并阻断其与NKp44的相互作用。本研究使用免疫染色、成像流式细胞术、流式细胞术、细胞分选、细胞周期分析、酶联免疫吸附试验和NK细胞细胞毒试验，分析了三种CTCL细胞系和来自SS患者和健康供体的外周血单个核细胞(PBMCs)中的csPCNA，与核PCNA(nPCNA)的单克隆抗体PC10进行比较。mAb14成功地检测到与G2/M期相关的存活CTCL细胞系膜上和细胞质中的PCNA。在塞扎里综合征的PBMCs中，csPCNA表达在具有非典型形态的淋巴瘤细胞上，而在正常细胞上没有表达。此外，在来自健康供体的PBMCs上也没有表达。在外周血中NK细胞(pNK)与CTCL细胞系共培养中，mAb14增加了IFN-γ的分泌，表明pNK活性的重新激活。然而，mAb14没有增强pNK细胞对CTCL细胞系的细胞毒活性。mAb14检测到的csPCNA的独特表达提示，csPCNA和mAb14可能分别作为SS和可能的其他CTCL变异的潜在生物标志物和工具。

高血管生成是胶质母细胞瘤（GBM）的典型特征，是最具侵略性的脑肿瘤。我们已经报道了脱氢醛酸脱氢酶1A3（ALDH1A3）在GBM患者的增殖血管中的表达。我们假设ALDH1A3可能在GBM中起到促血管生成的作用。两种GBM细胞系被逆转录病毒转导分别为ALDH1A3（ox）和空载体（ev）。在间接和直接共培养内皮细胞（ECs）与oxGBM细胞（oxGBMs）以及体内血管生成模型中研究了血管生成表型。在oxGBMs中进行血管生成阵列分析。RT2-PCR、Western blot和双免疫荧光染色用于确认从阵列中鉴定的靶点的表达。在ECs的间接和直接共培养以及体内观察到显著活化的血管生成表型。ALDH1A3过表达（oxALDH1A3）导致PAI-1和IL-8 mRNA和蛋白质的显著上调，并随之增加了这两种蛋白质的释放。此外，oxALDH1A3诱导的血管生成通过PAI-1和IL-8受体CXCR1/2的特定抑制剂治疗被废弃。本研究将ALDH1A3定义为一种新的血管生成促进剂。GBM细胞中的oxALDH1A3通过来源上调的PAI-1和IL-8刺激ECs的血管生成，提示ALDH1A3-PAI-1/IL-8作为未来GBM抗血管生成疗法的新型信号传导。

本研究旨在比较阿特珠单抗联合贝伐单抗（Ate/Bev）疗法与经动脉化疗栓塞联合放射治疗（TACE + RT）在未发生转移的门静脉癌栓（PVTT）肝细胞肝癌（HCC）患者的治疗结果。在2016年6月至2022年10月期间，我们连续纳入了855名PVTT患者。排除758名患者后，分析了97名患者（Ate/Bev组37例，TACE + RT组60例）。两组在基线特征上无显著差异，并且具有相似的客观缓解和疾病控制率。然而，与TACE + RT组相比，Ate/Bev组的一年生存率显著较高（p = 0.041），在HCC负担重的患者中一直如此。与此同时，在单叶内肝内HCC患者中，两组之间的临床结果相当。在Cox回归分析中，Ate/Bev治疗被证实是更好的一年生存的重要因素（p = 0.049）。最后，在倾向评分匹配中，Ate/Bev组显示出比TACE + RT组更好的一年生存（p = 0.02）和无进展生存期（p = 0.01）。总之，与TACE + RT治疗相比，Ate/Bev治疗在具有PVTT的HCC患者中显示出更好的临床结果。同时，在单叶内肝内HCC患者中，TACE + RT也可以作为Ate/Bev疗法的一种替代治疗选择。