α-胎儿蛋白(AFP)在肝移植后预测肝细胞癌(HCC)的复发，但仍然是一个不完美的生物标记物。 DCP (去γ-羧基凝血酶原)和AFP-L3 (与适合红豆凝集素结合的AFP)在预测HCC复发方面的作用仍未完全明确。 AFP-L3和DCP可以识别出高风险的移植后HCC复发患者，并作为肝移植排除标准，推迟移植直到患者接受额外的降低风险的移植前局部区域疗法。 本前瞻性队列研究包括2017年至2022年间接受LT(符合米兰标准或术前下标)的连续HCC患者。获取术前AFP、AFP-L3和DCP测量数据。主要终点是生物标记物预测HCC复发的无病生存能力。 本队列共包括285例患者，中位年龄为67岁(IQR 63-71)。在LT时，中位生物标记物值分别为AFP 5.0 ng/mL (IQR 3.0-12.1)，AFP-L3 6.7% (0.5-13.2)，DCP 1.0 ng/mL (0.3-2.8)。大多数(94.7%)患者在LT前接受术前局部区域疗法(LRT)。在中位LT后的3.1年的随访中，18例(6.3%)患者出现HCC复发。 AFP-L3和DCP的C-统计量分别为0.81和0.86，而AFP为0.74，前两者优于AFP。AFP-L3 ≥15%和DCP ≥7.5的双生物标记物组合预测了61.1%的HCC复发，而在265名未达到此阈值的患者中，只有7例(2.6%)复发。术后3年Kaplan-Meier复发生存率为双阳性生物标记物患者为43.7%，其余患者为97.0% (p<0.001)。 AFP-L3 ≥15%和DCP ≥7.5的双阳性强烈预测了LT后的HCC复发。该模型可以优化LT的选择标准，并识别高风险的HCC患者，在生物标记物下降之前将LT推迟。版权所有 © 2023年欧洲肝脏研究协会。由Elsevier B.V.出版。保留所有权利。

维持癌症患者的运动能力，从而维持患者自主生活能力具有重要性，但关于其主要影响因素了解甚少。我们旨在确定各种类型癌症患者运动能力的影响因素，这些患者已经接受了癌症治疗或即将开始此类治疗。通过运用6分钟步行测试（6-MWT），对253例连续患者进行了运动能力评估，这些患者多数患有晚期癌症。所有患者均接受了超声心动图检查、体格检查、静息心电图、手握力（HGS）测量以及实验室评估。根据6-MWT中值距离（459 m）将患者分为两组。较低运动能力的患者年龄较大，HGS和血红蛋白水平明显较低，高敏感（hs）肌钙蛋白T和NT-proBNP水平较高（均p < 0.05）。尽管这一组患者的合并症负担显著增加，但性别、体重指数、肿瘤类型或消瘦等方面未发现差异（均p > 0.2）。通过多元逻辑回归分析，我们发现贫血存在（奥斯比比（OR）为6.172，95%置信区间（CI）为1.401-27.201，p = 0.016）以及hs肌钙蛋白T增加（OR为3.077，95%CI为1.202-5.301，p = 0.019）仍然是预测运动能力受损的独立因素。HGS增加与运动能力降低风险减少相关（OR为0.896，95%CI为0.813-0.987，p = 0.026）。筛查具有高hs肌钙蛋白水平和降低HGS的患者可能有助于识别癌症治疗期间运动能力降低的风险患者。© 2023. Springer Nature Limited.

在富含葡萄糖条件下，碳水化合物应答元件结合蛋白（ChoRE）结合蛋白（ChREBP）及其结合伴侣Max样蛋白X（MLX）介导了脂肪合成基因的转录。葡萄糖和脂质代谢的失调经常发生在癌症中，包括肝细胞癌（HCC）。然而，目前尚不清楚葡萄糖诱导的脂质合成程序是否在HCC发展中起作用。在这里，我们展示了MLX表达在HCC标本中升高，而MLX表达的下调抑制了HCC细胞的增殖。在小鼠中，肝特异性的Mlx敲除导致脂质合成基因表达和循环中脂质水平的显著下降。有趣的是，在没有Mlx的情况下，多种HCC模型（如二硝基胺（DEN）处理和肿瘤基因的水力注射（AKT / RAS或CTNNB1 / RAS））的肿瘤发展被强烈阻断。然而，高脂饮食可以在Mlx缺陷肝脏中部分恢复肿瘤发生，表明脂质合成在HCC发展中起关键作用。此外，通过腺相关病毒实现肝特异性表达一个显性负性MLX（dnMLX）有效地阻断了小鼠的肿瘤发生。因此，葡萄糖诱导的脂质合成程序在HCC的发展中是必需的，并且ChREBP：MLX转录因子可以作为癌症治疗的潜在靶点。© 2023年，作者，独家授权于Springer Nature Limited。

据少数研究显示，对乳腺癌患者进行评估以寻找多柔比星诱导心脏毒性的潜在生物标志物。然而，与乳腺癌患者多柔比星诱导心脏毒性相关的关键免疫相关转录标记尚未得到深入研究。我们使用了GSE40447、GSE76314和TCGA BRCA队列来进行本研究。然后，我们采用多种生物信息学方法来确定关键的免疫相关转录标记及其与乳腺癌患者多柔比星诱导心脏毒性的关联。我们发现乳腺癌患者多柔比星诱导心力衰竭时有255个上调基因和286个下调基因。我们发现，在合并乳腺癌和多柔比星诱导心脏毒性的患者中，有58个免疫相关基因升高（如CPA3、VSIG4、GATA2、RFX2、IL3RA和LRP1），有60个基因显著抑制（如MS4A1、FCRL1、CD200、FCRLA、FCRL2和CD79A）。此外，我们还发现，这些免疫相关差异表达基因（DEGs）与KEGG通路的富集显著相关，包括B细胞受体信号通路、原发性免疫缺陷、趋化因子信号通路、造血细胞系分化、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、MAPK信号通路、黏附斑、扩张型心肌病、细胞黏附分子等。此外，我们还发现多柔比星诱导的免疫相关基因在蛋白质相互作用和基因簇中起到了重要作用。这些与生存相关的免疫相关基因，如IFIT5、XCL1、SPIB、BTLA、MS4A1、CD19、TCL1A、CD83、CD200、FCRLA、CD79A、BIRC3和IGF2R，与乳腺癌患者的生存预后显著相关，并在乳腺癌和心衰患者中显示了诊断效能。分子对接揭示了这些与生存相关基因与多柔比星之间可观的结合亲和力。最后，我们验证了乳腺癌患者派生心肌细胞中免疫相关基因的表达水平，并发现RAD9A、HSPA1B、GATA2、IGF2R、CD200、ERCC8和BCL11A基因的表达一致受到调节。我们的研究结果为理解乳腺癌患者多柔比星引起的心脏毒性的机制和发病机理提供了基础，并预测了与多柔比星的免疫相关潜在生物标志物的相互作用。© 2023. 作者们。

SNHG1是SNHG家族的重要成员之一。这个家族由一组宿主基因组成，可以进行小核糖核酸的加工，并发挥重要的生物功能。在致癌作用方面，SNHG1的表达在各种癌症中增加，具有巨大的应用前景，可以用于恶性肿瘤的诊断、治疗和预后。在本综述中，我们总结了SNHG1在各种癌症发展中的作用和分子机制。此外，我们在文章中强调了SNHG1在癌症中的临床意义。预计这个分子将成为癌症诊断、预后和治疗的新标记。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

新辅助放疗被用作结直肠癌（CRC）的标准治疗方法。然而，放射治疗抗性往往导致治疗失败。识别放疗耐药基因将为联合治疗和预后标记提供新的靶点。通过对对放疗敏感或耐药的CRC患者的高通量筛选和组织阵列分析，我们鉴定出了一个强效耐药基因SUMO特异性蛋白酶5（SENP5）。然后，通过CCK8、克隆形成、彗星实验、免疫荧光和流式细胞术分析细胞凋亡和细胞周期，研究了SENP5对放射敏感性的影响。结合共免疫沉淀实验，利用SUMO蛋白质组学质谱分析鉴定了SENP5的靶标。利用病人来源的器官样本（PDO）和异种移植（PDX）模型探讨了临床应用的可能性。通过高通量筛选和CRC患者组织阵列分析，我们确认了SENP5作为一个强效耐药基因。高SENP5表达的患者显示出对放射治疗的增加耐药性。体外和体内实验证明，SENP5的沉默显著增加了CRC细胞的放射敏感性。进一步证明SENP5在同源重组（HR）依赖性DNA损伤修复中至关重要。通过SUMO质谱分析，我们确定了H2AZ作为SENP5的去SUMO化底物，并描绘了H2AZ在HR修复和癌症耐药中的SUMO化平衡。使用PDO和PDX模型，我们发现靶向SENP5显著增加了放疗的疗效。我们的发现揭示了SENP5在HR介导的DNA损伤修复和癌症耐药中的新角色，可作为癌症放疗的强效预后标记和干预靶点。© 2023年。意大利国家癌症研究所“Regina Elena”。

在转移性黑色素瘤患者中，寻找反应标记物对指导治疗策略至关重要。本研究为了更好地探索中性粒细胞/淋巴细胞比值（NLR）作为潜在的反应生物标记物的角色和时机，对未切除/转移性黑色素瘤（IIIb期-IV期）患者进行了回顾性研究，这些患者接受了抗PD-1治疗。通过转录基因分析，探讨了NLR与炎症-免疫介质的关系以及免疫治疗期间NLR升高的潜在负面影响。结果证实了以前的发现，即高基线NLR与预后较差和血清乳酸脱氢酶（LDH）水平较高相关，不考虑脑转移的存在。转录组分析显示，高基线NLR与特征基因CCNA1、LDHA和IL18R1相关，这些基因与炎症和肿瘤发生相关。相反，低基线NLR与CD3、SH2D1A、ZAP70和CD45RA相关的标记，与免疫激活有关。与NLR正相关的基因（CD39（ENTPD1）、PTEN、MYD88、MMP9和LDH）参与免疫抑制、炎症和肿瘤促进活性进程。CD39表达的增加与TGFβ2正相关，TGFβ2是N2中性粒细胞的一个标记，具有免疫抑制活性。这些结果表明，NLR增加与中性粒细胞群体增加、极化到N2表型有关，这个过程可能是NLR具有负面预后作用的基础。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

逆转录的基因副本（逆转录复制体）已成为进化创新的重要来源。微小RNA（miRNA）是小而高度保守的RNA分子，其作为基因表达后转录的关键调节因子。miRNA的起源和后续演化已开始研究但尚未完全阐明。在本研究中，我们对通过逆转录复制的mRNA序列（逆转录的miR）的miRNA起源进行了全面的调查。我们鉴定出了17个起源于mRNA逆转录复制体的逆转录的miR。其中4个逆转录的miR具有在逆转录复制体序列内的新生起源，而13个逆转录的miRNA位于外显子区域并与宿主mRNA一起复制。我们发现逆转录的miR是灵长类特有的，包括五个在所有灵长类中保守的逆转录的miR和两个仅人类特有的miR。所有的逆转录的miR都有表达，具有预测和实验证实的目标基因，除了miR-10527。值得注意的是，逆转录的miR的目标基因参与关键的生物过程，如代谢过程、细胞信号传导和中枢神经系统神经递质的调节。此外，我们发现这些逆转录的miR通过靶向关键的癌症基因在癌症中发挥潜在的致癌作用，并在多种癌症类型中过度表达，包括肝细胞癌和胃腺癌。我们的发现表明mRNA逆转录是灵长类中产生新miRNA（逆转录的miR）的关键机制。这些逆转录的miR表达，保守，并具有重要细胞功能的目标基因，在癌症中起着重要作用。 © 2023 BioMed Central Ltd., Springer Nature的一部分。

我们报告了一种个性化的肿瘤信息技术，名为“基于患者特异性变异的疾病预后和潜在治疗标记追踪技术”（PROPHET），利用50个患者特异性变异的深度测序，检测分子残余病（MRD），检测限度为0.004%。PROPHET与最先进的固定面板检测方法同时应用于181名初期非小细胞肺癌患者的760份血浆样本。PROPHET在周转肿瘤DNA（ctDNA）方面呈现出更高的敏感性，基线敏感性为45%。在预后分析中，PROPHET表现出超强的性能，并显示出平均领先时间为299天，能够准确预测复发。个性化非典型变异占总数的98.2%，其预后效应与典型变异相似。提出的肿瘤-淋巴结-转移-血液（TNMB）分级在术后判断辅助治疗预后时具有超越TNM分期的优势。PROPHET展示了评估辅助治疗效果和作为模糊的放射诊断的裁判的潜力。这些发现突显了个性化癌症技术在MRD检测方面的潜在优势。© 2023 Elsevier Inc. 发布。

通过数学、传统组织学和基因组学的结合，证实高度侵袭性透明细胞肾细胞癌（CCRCC）表现出较低水平的肿瘤内异质性（ITH）。我们假设，旨在保持较高ITH水平的治疗策略将有助于减缓癌症演化并改善生存。版权所有© 2023 Elsevier Inc. 保留所有权利。