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Cell Death & Disease
2023 Sep 08
GiacomoOliveira,AnnM...
Preexisting tumor-resident T cells with cytotoxic potential associate with response to neoadjuvant anti-PD-1 in head and neck cancer.
Cell Death & Disease
约50%的局部晚期头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者在明确治疗后出现复发。术前给予抗 programmed cell death protein 1(PD-1)免疫治疗可使肿瘤微环境(TME)内发生显著的病理性肿瘤反应(pTR)。然而,术前 PD-1 阻滞对抗肿瘤 T 细胞动态的机制尚未解决,缺乏提高病理性反应的方法。根据一个第二期试验(NCT02296684)的观察,接受两剂术前帕博利珠单抗治疗的患者中有45%出现明显的pTR(≥50%)。对14个肿瘤活检标本中的17,158个 CD8+ T 细胞进行单细胞分析,其中包括6个术前-术后新辅助治疗标本,发现反应性肿瘤具有克隆扩张的疑似肿瘤特异性疲劳CD8+肿瘤浸润淋巴细胞(TILs),且具有高细胞毒潜能(CTX+)和 ZNF683 表达,属于组织驻留记忆程序。经过5周的 PD-1 阻滞后的病理学反应与之前存在的 CTX+ZNF683+CD8+ TILs 的激活一致,伴随着存活肿瘤和相关肿瘤抗原的丧失。反应与浸润术前病变的高数量 CD103+PD-1+CD8+ T 细胞相关,而非疲劳的持续存在的克隆和克隆置换相对较小。相反,不反应的术前 TME 缺乏 ZNF683+CTX+ TILs,且后来积累高度耗竭的克隆。在 HNSCC 中,复苏之前存在的 ZNF683+CTX+ TILs 是术后新辅助设置中的主要响应机制。
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Cell Death & Disease
2023 Sep 08
LeiDeng,ChangchuanJi...
Risk of Further Progression or Death Among Durable Progression-Free Survivors With Melanoma or Non-Small-Cell Lung Cancer in PD-1 Blockade Trials: Implications for Imaging Surveillance.
Cell Death & Disease
报道了黑色素瘤或非小细胞肺癌(NSCLC)患者在接受PD-(L)1免疫疗法后具有持续无进展存活(dPFSors)超过2年。然而,仍存在进展风险,最佳影像监测间隔尚不清楚。从至少5年的PD-1阻断临床试验中提取了患者的无进展生存期(PFS)个体数据。PFS至少为2年的患者被认为是dPFSors。计算了每个后续年度中每3、4、6和12个月的进展/死亡(P/D)的条件风险。我们预先设定了3个不同的扫描风险水平(10%、15%或20%),以便临床医生和患者基于影像频率和风险承受能力来确定扫描间隔。如果每次扫描的95% CI的上限低于预先设定的水平,则间隔被认为是可接受的。
在1,495例黑色素瘤和3,752例NSCLC患者中,分别有474例(31.7%)和586例(15.6%)为dPFSors。其中,额外3年的PFS概率分别为76.4%和48.1%。在3年中,不超过8%的患者在任何一个季度中出现P/D。对于黑色素瘤dPFSors,以10%的风险阈值,第三年可以每6个月扫描一次,第四和第五年则每12个月扫描一次。对于NSCLC,第三年的间隔为每3个月一次,第四和第五年则为每4个月一次。15%和20%的更高风险承受能力将允许更少的扫描频率。
根据其自身的风险承受水平,我们的研究结果允许临床医生和dPFSors基于数据做出关于影像监测时间表的决策,超过每3个月一次的情况。
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PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023
LaurenEHein,Shuvasre...
TGF-β1 activates neutrophil signaling and gene expression but not migration.
PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
肿瘤相关中性粒细胞出现在多种癌症中,并且通常被报道为对结果产生负面影响。肿瘤微环境中存在的转化生长因子β(TGF-β)据报道有助于将中性粒细胞倾斜为更具有促肿瘤表型的状态。然而,目前尚不清楚TGF-β对中性粒细胞信号传导和迁移的影响。我们试图表征TGF-β在原代人类中性粒细胞和中性粒细胞样细胞系HL-60中的信号传导,并确定其是否直接诱导中性粒细胞迁移。我们发现TGF-β1无法在转膜或盖培迁移实验中诱导中性粒细胞趋化。然而,TGF-β1以剂量和时间依赖的方式激活中性粒细胞中的经典SMAD3信号传导和非经典ERK1/2信号传导。此外,浸润性乳腺癌细胞所分泌的肿瘤条件培养基(TCM)中的TGF-β1导致SMAD3激活。我们发现TCM诱导中性粒细胞分泌白三烯B4(LTB4),后者是一种重要的脂质介质,能够扩大中性粒细胞的招募范围。然而,单独的TGF-β1不能诱导LTB4的分泌。RNA测序揭示了TGF-β1和TCM改变了HL-60细胞的基因表达,包括促肿瘤基因OSM(oncostatin M)和血管内皮生长因子A(VEGFA)的mRNA水平。对TGF-β1对中性粒细胞信号传导、迁移和基因表达的作用和影响的新认识,对了解肿瘤微环境中中性粒细胞的变化具有重要意义。
版权:© 2023 Hein等。本文为开放获取文章,根据创作共享许可证无限制使用、分发和再生产,只要保留原始作者和来源的署名。
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PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Sep 08
WeiguoXiang,LijieZha...
Discovery of ARD-1676 as a Highly Potent and Orally Efficacious AR PROTAC Degrader with a Broad Activity against AR Mutants for the Treatment of AR + Human Prostate Cancer.
PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
本文报道了ARD-1676的发现和广泛的特性研究,它是一种高效的口服蛋白质降解酶(PROTAC)降解剂,主要作用于雄激素受体(AR)。ARD-1676是使用一类新型AR配体和一种新型脑脊髓灰质空白卷曲蛋白(cereblon)配体设计的。在AR+ VCaP和LNCaP细胞系中,其DC50值分别为0.1纳摩尔和1.1纳摩尔,IC50值分别为11.5纳摩尔和2.8纳摩尔。ARD-1676有效地引起了一系列临床相关的AR突变体的降解。ARD-1676在小鼠、大鼠、狗和猴子中的口服生物利用度分别为67%、44%、31%和99%。在小鼠中,口服ARD-1676有效降低了VCaP肿瘤组织中的AR蛋白水平,并且在VCaP小鼠异种移植肿瘤模型中抑制了肿瘤生长,没有表现出任何毒性迹象。ARD-1676是治疗AR+人类前列腺癌的一个高度有希望的开发候选药物。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Sep 06
OkanAvcı,Yakupİriağa...
PROPSEA, safety evaluation of palbociclib and ribociclib in older patients with breast cancer: A prospective real-world TOG study.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
本研究旨在探讨65岁及以上年龄段的转移性乳腺癌患者中帕博西尼布和瑞博西尼布的毒性和管理情况。在接受帕博西尼布和瑞博西尼布治疗的老年患者中,使用老年人8项评估量表(G8量表)和格罗宁根体衰老指数评估体弱状态。根据基线患者特征,记录和分析剂量调整、药物停用以及其他严重不良事件(SAEs)。共纳入土耳其28个中心的160名患者(帕博西尼布=76,瑞博西尼布=84)。其中43名患者年龄≥75岁。两种药物的首剂调整最常见的原因是中性粒细胞减少症(帕博西尼布97%,瑞博西尼布69%)。瑞博西尼布剂量调整的另外原因包括肝功能检测升高(10%)和肾功能损害(6%)。帕博西尼布停药率为3.9%,瑞博西尼布停药率为6%。使用帕博西尼布的患者中,SAEs发生率为11.8%,瑞博西尼布患者为15.5%。有2级或以上的ECOG疾病状况和年龄超过75岁与剂量减少相关。严重中性粒细胞减少症在非骨转移性疾病患者中更常见,在接受第三线及更高线治疗、同时存在非粒细胞减少的血液副作用(对于瑞博西尼布患者)的患者中更常见。肥胖患者中中性粒细胞减少症较少见。我们的结果表明,在年龄≥75岁和/或ECOG疾病状况≥2的患者中,以降低剂量开始使用帕博西尼布和瑞博西尼布是合理的。版权所有©2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2023 Sep 08
WentaoHu,LianglunChe...
Learning from Incorrectness: Active Learning with Negative Pre-training and Curriculum Querying for Histological Tissue Classification.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
组织切片的层级组织组织分类是一种有效的组织切片分析预处理方法。然而,使用深度学习对组织进行分类需要昂贵的注释成本。为了缓解注释预算的限制,将主动学习(AL)应用于组织分类是一种有前途的解决方案。然而,在应用过程中,各类别之间的性能存在很大的不平衡,与相对性能不足的类别相对应的组织对于癌症诊断同样重要。本文中,我们提出了一种主动学习框架称为ICAL,其中包含错误性负预训练(INP)和类别化课程查询(CCQ),这两种方法从类别到类别和类别自身的角度解决了上述问题。尤其是,INP将来自CCQ的错误预测结果作为负预训练的补充标签,以更好地在训练过程中区分相似类别。CCQ根据INP训练的模型对每个类别的学习状态进行调整,利用不确定性评估并补偿由于类别性能不足而引起的查询偏差。在两个组织分类数据集上的实验结果表明,ICAL在少于16%的标记数据下实现了接近完全监督学习的性能。与最先进的主动学习算法相比,ICAL在所有类别中实现了更好且更平衡的性能,且在极低的标注预算下保持了稳健性。源代码将在https://github.com/LactorHwt/ICAL发布。
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HEART & LUNG
2023 Sep 08
HuiZhao,VikrenSarkar...
Technical note: Clinical evaluation of a newly released surface-guided radiation therapy system on DIBH for left breast radiation therapy.
HEART & LUNG
已经证明,通过使用深呼吸靶区放疗技术(DIBH)可以显著减少左乳癌放射治疗中的平均心脏剂量和左前降支(LAD)剂量。表面引导的深呼吸靶区放疗技术(Surface-guided DIBH)在过去十年中被广泛采用,目前主要有三种商用的三维复原技术(SGRT)系统。目前,有关新发布的SGRT系统在DIBH应用方面的性能报告非常有限。本研究旨在评估新发布的SGRT系统在左乳癌深呼吸靶区放疗中的临床表现。本研究纳入了25名采用Varian Identify系统进行DIBH治疗的左侧乳腺癌患者(共计493次治疗)。评估了临床表现的四个方面:深呼吸前患者准备期间自由呼吸Identify偏移、深呼吸期间的Identify偏移、深呼吸期间Identify与放射照射口的一致性以及深呼吸参考表面在患者移动后的重新获取。计算了每个患者自由呼吸Identify偏移和深呼吸Identify偏移的系统误差和随机误差。当患者深呼吸位于(± 0.3 cm,± 30°)的临床容忍度范围内时,进行放射照射口的摄影。然后将其与治疗区域的设计射线图(DRRs)进行比较。如果照射口显示患者对不符合DRRs在3mm内的调整,会进行患者移位,并重新捕获参考表面,然后进行验证照射口。对于自由呼吸阶段的人体表面Identify偏移,所有患者的系统误差和随机误差均在(0.4 cm,1.50°)范围内。最大的患者系统误差和随机误差分别为(1.1 cm,6.20°)和(0.9 cm,20°),而最大振幅的Identify偏移为(2.59 cm,90°)。 Identify SGRT系统成功地指导了所有493次深呼吸治疗。对于深呼吸阶段的Identify偏移,系统误差和随机误差均在(0.2 cm,2.30°)范围内。其中7名患者由于表面变异或位置偏移而需要重新捕获表面参考。所有由Identify引导的深呼吸验证照射口均获得了主治医生的批准。本评估结果表明Identify系统在表面引导的患者定位和表面引导的深呼吸成像和治疗递送方面的效果显著。彩色编码的实时患者表面匹配反馈功能有助于评估患者对准精度并调整患者的位置以匹配参考位置。© 2023年美国医学物理师协会。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 08
XingqunMa,YuxiaTang,...
Interpretable XGBoost-SHAP Model Predicts Nanoparticles Delivery Efficiency Based on Tumor Genomic Mutations and Nanoparticle Properties.
GENES & DEVELOPMENT
为了促进纳米医学的发展,深入理解纳米颗粒(NPs)与体内肿瘤的复杂相互作用及其对NPs输送效率的主导作用非常关键。在此,我们提出了一个可解释的XGBoost-SHAP模型,将NPs的物理化学性质和肿瘤基因组特征结合起来,以预测其输送效率。在测试集上,最大输送效率、注射后24小时和168小时的输送效率的相关系数分别为0.66、0.75和0.54。特征重要性分析表明,肿瘤基因组突变及其与NPs性质的相互作用在NPs输送中起着重要作用。通过基因本体富集分析进一步探索了与NPs输送相关的基因的生物途径。我们的工作提供了一个预测和解释对异质性肿瘤的NPs输送效率的流程,并强调同时使用组学数据和可解释的机器学习算法来发现NPs与个体肿瘤之间相互作用的力量,这对于个性化精准纳米医学的发展至关重要。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 07
LiboZhou,JinhongMei,...
Integrative analysis identifies AKAP8L as an immunological and prognostic biomarker of pan-cancer.
GENES & DEVELOPMENT
A-激酶锚定蛋白8L(AKAP8L)属于A-激酶锚定蛋白(AKAP)家族。最近的研究证明了AKAP8L与各种肿瘤的进展有关。为了更全面地了解AKAP8L在不同类型癌症中的意义,我们对多个组织学数据集进行了详细分析,包括全癌基因表达水平、生物学功能、分子特性,以及AKAP8L在全癌的诊断和预后价值。此外,我们还重点关注了肾透明细胞肾癌(KIRC),并探讨了AKAP8L与临床特征、不同患者亚群体的预后、共表达基因和差异表达基因(DEG)的相关性。我们还进行了AKAP8L建立的单克隆抗体的免疫组织化学染色和半定量验证。我们的研究结果表明,AKAP8L的表达在大多数癌症类型以及不同癌症分子和免疫亚型中都存在显著差异。此外,AKAP8L具有准确预测癌症的强大能力,并且与癌症预后强烈相关,这表明AKAP8L可能是癌症诊断和预后的潜在生物标志物。此外,AKAP8L的高表达水平与KIRC的总体生存(OS)、疾病特定生存(DSS)以及无进展生存期(PFI)显著相关,尤其是在不同临床亚组中。总之,AKAP8L有潜力作为诊断和预后的关键分子生物标志物,在KIRC中作为独立的预后风险因子,并且是癌症治疗的新的分子靶标。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Sep 07
BowenLai,HengJiang,Y...
Identification of ROCK1 as a novel biomarker for postmenopausal osteoporosis and pan-cancer analysis.
GENES & DEVELOPMENT
绝经后骨质疏松症(PMOP)是一种常见的影响全球范围的骨骼疾病。老年女性骨质疏松骨折的风险增加对个体和社会造成了重大负担。然而,目前对PMOP缺乏可靠的诊断标志物和精确的治疗靶点仍然是一个主要挑战。从GEO数据库下载了与PMOP相关的数据集GSE7429、GSE56814、GSE56815和GSE147287。使用"limma"软件包确定了差异表达基因(DEGs)。采用WGCNA和机器学习选择与PMOP高度相关的关键模块基因。对所有DEGs和选择的关键中心基因进行了GSEA、DO、GO和KEGG富集分析。通过GeneMANIA数据库构建了蛋白质相互作用网络。ROC曲线和AUC值验证了关键基因在训练和验证数据集中的诊断价值。xCell免疫浸润和单细胞分析确定了关键基因在PMOP免疫反应中的功能。泛癌分析揭示了关键基因在肿瘤中的作用。共鉴定了1278个PMOP患者和健康对照组之间的DEGs。紫色模块和青色模块被选为关键模块,将DEGs和模块基因合并后,选择出112个共同基因。五种机器学习算法筛选出了三个关键基因(KCNJ2、HIPK1和ROCK1),并为这些关键基因构建了PPI网络。ROC曲线验证了ROCK1在既往PMOP训练集(AUC=0.73)和验证集(AUC=0.81)的诊断价值。针对低ROCK1患者进行了GSEA分析,得出最重要富集领域为蛋白质结合和免疫反应。在PMOP中,DCs和NKT细胞表达水平较高。泛癌分析显示低ROCK1表达与SKCM以及肾肿瘤(KIRP、KICH和KIRC)相关。ROCK1与PMOP的发病机制和免疫浸润显著相关,并影响肿瘤的发展、进展和预后,从而为PMOP和肿瘤提供了潜在的治疗靶点。然而,还需要进一步的实验室和临床证据,在临床应用ROCK1作为治疗靶点之前。
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