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ECLINICALMEDICINE
2023 Sep
AnandVKulkarni,Harsh...
Effectiveness and safety of atezolizumab-bevacizumab in patients with unresectable hepatocellular carcinoma: a systematic review and meta-analysis.
ECLINICALMEDICINE
Atezolizumab-bevacizumab(atezo-bev)被推荐作为不能手术的肝细胞癌(uHCC)患者的一线治疗方案。然而,其在其他人群中的有效性和安全性,包括那些伴有Child-Turcotte-Pugh(CTP)B级肝硬化的患者尚不清楚。对于这个系统综述和荟萃分析,从2020年5月1日到2022年10月5日搜索了包括PubMed、Embase和Scopus在内的电子数据库,最后访问日期是2023年1月31日。对于接受atezo-bev的患者,将三种不同病情下的CTP-A和CTP-B级肝硬化的患者、接受酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)的患者以及接受该药物作为一线和后线治疗的患者的进展无病生存期(PFS)、总生存期(OS)和放射学反应率进行比较。该方案已在Prospero(CRD42022364430)注册。共有47项研究(n = 5400例患者),PFS和OS的合并效果分别为6.86(95%CI,6.31-7.41)个月和13.8个月(95%CI,11.81-15.8)。根据RECIST标准,客观反应率(ORR)和疾病控制率分别为26.7%(24.6-29.1)和75.3%(73.1-77.4),根据mRECIST标准为34%(30.3-37.8)和73.6%(68.8-78)。在接受atezo-bev的患者中,CTP-B级肝硬化患者的RECIST(比值比[OR],1.42 [0.77-2.6];P = 0.25)和mRECIST标准(OR,1.33 [0.52-3.39];P = 0.53)的ORR与CTP-A级肝硬化患者相似,但PFS较短(平均差异[MD]: 3.83个月[1.81-5.84])。与接受TKIs的患者相比,接受atezo-bev的患者PFS更长(MD: 2.27个月[0.94-3.5]),ORR更高(RECIST:OR,1.44 [1.01-2.04]和mRECIST:OR,1.33 [1.01-1.75])。与一线治疗相比,后线治疗在九项研究中的ORR较低(RECIST:OR,1.82 [1.3-2.53];P < 0.001和mRECIST:OR,2.02 [1.34-3.05]),但PFS相当(MD: 0.58个月[-0.18至1.35])。CTP-A和CTP-B级肝硬化患者发生≥3级不良事件的比率相当(OR,0.89 [0.45-1.74]),atezo-bev和TKIs患者的比率也相当(OR,0.86 [0.61-1.2])。我们的研究结果表明,atezo-bev作为uHCC和CTP-A或CTP-B级肝硬化患者的一线全身治疗方案是安全而有效的。我们接受了来自Roche印度私人有限公司的非招标资助用于出版。© 2023 作者。
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ECLINICALMEDICINE
2023 Sep
HeLi,ChangfaXia,Siyi...
Long-term esophageal cancer risk and distinct surveillance intervals after a single endoscopy screening: a multicentre population-based cohort study.
ECLINICALMEDICINE
推荐对轻度-中度异型增生和阴性内窥镜结果进行内窥镜监测,时间间隔分别为3年和5年,但证据有限。本研究旨在评估经过单次内窥镜筛查后的食管癌(EC)长期发病率和死亡率。我们纳入了2007-2012年在中国农村的六个中心进行内窥镜筛查的40-69岁食管癌高危人群,其基线诊断结果为阴性内窥镜结果、轻度异型增生或中度异型增生。对参与者进行EC发病率和死亡率的随访。通过Kaplan-Meier分析估计EC的累积发病率和死亡率。使用Cox回归模型计算基线内窥镜诊断与EC发病率和死亡率之间关联的调整危险比(HR)和95%置信区间(CI)。使用标化发病率比(SIR)和标化死亡率比(SMR)比较单次内窥镜筛查后的EC发病率和死亡率与中国农村人群的情况。共纳入42,827名参与者(其中40,977名阴性内窥镜结果,1562名轻度异型增生和288名中度异型增生);在中位数10.62年的随访期间,确认268例EC病例和128例EC死亡。10年时,阴性内窥镜结果组中的累积EC发病率为0.45%(0.38-0.52),轻度异型增生组为2.39%(1.62-3.16),中度异型增生组为8.90%(5.57-12.24);10年时的累积EC死亡率分别为0.23%(0.18-0.27),0.96%(0.46-1.46)和2.50%(0.67-4.33)。与阴性内窥镜结果组相比,轻度异型增生组的EC发病率和死亡率的HR值分别为3.52(2.49-4.97)和2.43(1.41-4.19),中度异型增生组分别为13.18(8.78-19.76)和6.46(3.13-13.29)。轻度异型增生组的SIR为1.95(1.69-2.24),中度异型增生组为6.75(6.25-7.28);SMR分别为0.43(0.31-0.58),1.07(0.88-1.29)和2.67(2.36-3.01)。单次内窥镜筛查后阴性内窥镜结果的个体EC风险比普通人群低,持续时间可达10.62年,而轻度-中度异型增生者的风险升高。我们的结果支持每3年对轻度-中度异型增生进行内窥镜监测,并建议阴性内窥镜结果后将监测间隔延长至10年。中国国家重点研发计划、京津冀基础研究合作专项和深圳三明市医学项目资助。© 2023 The Author(s).
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Computational and Structural Biotechnology Journal
2023
SichengZhou,NanWang,...
A cross-institutional evaluation on breast cancer phenotyping NLP algorithms on electronic health records.
Computational and Structural Biotechnology Journal
基于Transformer的语言模型由于在临床自然语言处理任务上的优秀表现而在临床领域中得到了广泛应用。然而,在模型开发过程中,往往忽略了这些模型的泛化能力。本研究评估了基于Transformer的临床自然语言处理模型CancerBERT以及经典机器学习模型(如条件随机场CRF、双向长短期记忆条件随机场BiLSTM-CRF)在不同临床机构之间的泛化能力,通过进行乳腺癌表型提取任务。我们从明尼苏达大学(UMN)和梅奥诊所(MC)的电子病历中收集了两个乳腺癌患者的临床语料库,并按照相同的标准进行了注释。我们开发了三种类型的自然语言处理模型(即CRF、BiLSTM-CRF和CancerBERT)来从临床文本中提取癌症表型。我们使用不同的学习策略(模型迁移和局部训练)在不同的测试集上评估了模型的泛化能力。通过与模型性能之间的关联,评估了实体覆盖率得分。我们在UMN和MC手动注释了200份和161份临床文档。两个机构的语料库在目标实体之间的相似度要高于整体语料库。在两个临床机构的独立测试集和置换测试集中,CancerBERT模型获得了最佳性能。在一个机构开发并在另一个机构进行进一步微调的CancerBERT模型相比于在本地数据上开发的模型也取得了合理的性能(微平均F1值:0.925 vs 0.932)。结果表明,在我们的命名实体识别任务中,CancerBERT模型在三种临床自然语言处理模型中具有较强的学习能力和泛化性能,并且具有识别复杂实体的优势,如具有不同标签的实体。
© 2023 The Authors. Published by Elsevier B.V. on behalf of Research Network of Computational and Structural Biotechnology.
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Frontiers in Endocrinology
2023
MiaoTian,Ying-BoHan,...
The role of lactoferrin in bone remodeling: evaluation of its potential in targeted delivery and treatment of metabolic bone diseases and orthopedic conditions.
Frontiers in Endocrinology
乳铁蛋白(Lf)是一种内源性合成的多功能蛋白质,具有免疫调节、抗菌、抗病毒和抗癌等多种生物学作用。最近的研究揭示了Lf在骨重塑中的重要功能,它能调节成骨细胞、软骨细胞、破骨细胞和间充质干细胞的功能。参与Lf信号通路的信号分子包括低密度脂蛋白受体相关蛋白-1(LRP-1)、转化生长因子β(TGF-β)和胰岛素样生长因子-1(IGF-1),它们能激活ERK、PI3K/Akt和NF-κB等下游通路。这些通路共同刺激成骨细胞的增殖、分化和骨化过程,同时抑制破骨细胞的分化和活性。此外,Lf对核因子kappa B(NF-κB)的抑制作用能直接抑制破骨细胞的形成和活性。Lf还通过激活线粒体活化蛋白激酶/外周信号调节激酶(MAPK/ERK)和磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路,促进软骨祖细胞的增殖和分化为软骨细胞,并通过抑制NF-κB通路抑制基质降解酶的表达。Lf促进了成骨细胞和软骨细胞的活性,抑制了破骨细胞的功能,加速骨折修复的过程。此外,研究表明,Lf能够通过促进骨形成和抑制骨吸收来纠正骨质疏松症中紊乱的骨重塑。Lf在骨健康方面的这些有益效应已经引起了在营养保健品和制药领域中的探索。然而,由于Lf分子较大,小型生物活性肽在制药应用中更为常见。这些肽已经在动物研究中证明能促进骨折修复和逆转骨质疏松症,显示出作为骨相关疾病治疗药物的潜力。然而,血清中Lf的有效浓度可能无法在需要骨再生的部位达到足够的水平,因此需要开发各种给药策略来提高Lf的生物利用度,并将Lf的活性浓度定位到需要骨再生的部位。本综述对上述问题进行了批判性讨论,揭示了Lf在骨重塑中的作用以及Lf作为骨疾病治疗靶标的潜力。版权所有© 2023 Tian, Han, Yang, Li, Shi and Tian.
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Frontiers in Endocrinology
2023
MônicaGadelha,PeterJ...
Long-term efficacy and safety of osilodrostat in patients with Cushing's disease: results from the LINC 4 study extension.
Frontiers in Endocrinology
为了评估奥伊奥胆酮在库欣病患者中的长期疗效和安全性,进行了多中心、48周的III期LINC 4临床试验,并设有可选的延长期,最初计划延续至96周。患者可以在延长期内继续参与,直到当地获得管理访问计划或其他替代治疗,或在其研究中批准的方案修订规定的要求之一实现,要求患者在96周前的4周内进行治疗终点访视。延长期中评估的研究结果包括:平均尿游离皮质酮(mUFC)反应率;mUFC、血清皮质酮和深夜唾液皮质酮(LNSC)的变化;心血管和代谢相关参数的变化;血压、腰围和体重的变化;库欣病体征的改变;与健康相关生活质量的患者报告结果的变化;肿瘤体积的变化;以及不良事件的情况。结果进行了描述性分析,未进行正式的统计检验。
共有60名进入试验的患者,53名完成了延长期,其中29名患者接受了超过96周的奥伊奥胆酮治疗(奥伊奥胆酮的中位持续时间:87.1周)。在核心试验期间观察到的mUFC正常化患者比例在延长期期间得以维持。在试验结束时,72.4%的患者达到了mUFC正常范围。同时还观察到了血清皮质酮和LNSC的显著降低。在核心试验期间观察到的大多数心血管和代谢相关参数的改善,以及库欣病的体征改善,在延长期内得以维持或继续改善。奥伊奥胆酮耐受性良好,其安全性与先前报告一致。
奥伊奥胆酮提供了长期的皮质酮分泌控制,并伴随临床体征和过度皮质酮症的持续改善。奥伊奥胆酮是库欣病患者的有效长期治疗方法。
ClinicalTrials.gov,编号NCT02180217。
版权所有 © 2023 Gadelha、Snyder、Witek、Bex、Belaya、Turcu、Feelders、Heaney、Paul、Pedroncelli和Auchus。
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Frontiers in Immunology
2023
NikolaosKoutras,Vasi...
Integrated signaling and transcriptome analysis reveals Src family kinase individualities and novel pathways controlled by their constitutive activity.
Frontiers in Immunology
Src家族激酶(SFKs)Lck和Lyn对淋巴细胞的发育和功能至关重要。尽管它们的表达模式在组织限制方面存在差异,但这两种激酶共享相同的功能,其中最显著的是对抗原受体胞内尾部ITAM基序的磷酸化。Lck主要在T淋巴细胞中表达;然而,在B-1细胞亚群和包括急性和慢性B细胞白血病在内的许多病理情况中,它也可以在异位存在。Lck对B细胞信号传导装置的确切影响仍然不明确,并且引发了关于SFK成员之间选择性的机制的长期问题。在这项工作中,我们试图研究Lck在B细胞中异位功能的机制基础,并将其与主导的B细胞SFK Lyn引发的事件进行比较。我们的结果揭示了这两种SFKs显示的底物多样性,然而,这种多样性受到它们易感性差异的缓冲,揭示了SFK成员特异性微调方面迄今未被理解的一个方面。此外,我们展示了Lck和Lyn生成的信号足以在不存在受体/共受体结合的情况下诱导转录组变化,使其类似于B细胞激活。最后,我们的分析揭示了SFK在调节细胞应激反应平衡方面的尚未被认识的作用,促进了ER-噬菌体的开始,这是B淋巴细胞中一个完全未被表征的过程。版权所有 © 2023 Koutras, Morfos, Konnaris, Kouvela, Shaukat, Stathopoulos, Stamatopoulou and Nika.
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Frontiers in Immunology
2023
JieXing,ChangfengMan...
Factors impacting the benefits and pathogenicity of Th17 cells in the tumor microenvironment.
Frontiers in Immunology
肿瘤发展与复杂的肿瘤微环境密切相关,该环境包括肿瘤细胞、血管、肿瘤基质细胞、浸润的免疫细胞以及相关效应分子。T辅助17细胞(Th17细胞)是CD4+ T细胞的亚群,以对抗细菌和真菌感染、介导炎症反应的能力而闻名,并表现出依赖环境的效应功能。在肿瘤微环境中,不同的分子信号调控Th17细胞的增殖、分化、代谢重编程和表型转换。因此,Th17细胞对肿瘤的进展有双重影响,可以促进或抑制肿瘤生长。本综述旨在研究肿瘤微环境中各种改变对Th17细胞的抗肿瘤和促肿瘤效应的影响,为探索额外的肿瘤免疫疗法策略提供有价值的线索。© 2023 Xing, Man, Liu, Zhang and Peng.
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Frontiers in Immunology
2023
ChiaraMBiatta,Michel...
The fading guardian: clinical relevance of TP53 null mutation in high-grade serous ovarian cancers.
Frontiers in Immunology
我们评估了一系列高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中免疫组化p53染色和TP53基因突变之间的一致性。此外,我们还寻找了p53过度表达和缺失表达组之间的预后差异。包括受HGSOC影响的患者,对每个病例进行了p53免疫组化染色和分子检测(Sanger测序)。进行Kaplan-Meier生存分析以确定TP53突变类型或p53染色模式是否影响总生存率(OS)和无进展生存率(PFS)。共考虑了34例HGSOC。所有免疫组化p53表达为零的病例(n=16)显示了TP53基因突变(n=9个无义突变,n=4个内移缺失突变,n=2个剪接突变,n=1个内移插入突变)。18例p53过度表达的病例中有16例显示了TP53基因错义突变。共有33例病例的随访数据可用(中位随访时间15个月)。我们观察到p53表达为空组的OS显著降低(HR = 3.64,95% CI 1.01-13.16)。免疫组化检测是大多数情况下TP53基因突变的可靠替代方法。尽管研究人群规模较小且中位随访时间有限,我们可以推断,携带p53基因空突变的HGSOC是一个更具侵袭性的亚组。版权所有© 2023 Biatta, Paudice, Greppi, Parrella, Parodi, De Luca, Cerruti, Mammoliti, Caroti, Menichini, Fronza, Pesce, Marcenaro和Vellone。
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Frontiers in Immunology
2023
RoanEZaied,TayazaFad...
De novo identification of complex traits associated with asthma.
Frontiers in Immunology
哮喘是一种异质性炎症性疾病,通常与其他复杂表型相关联。确定与哮喘相关的疾病并揭示介导其相互作用的分子机制可以帮助解开哮喘的异质性。网络分析是解开此类疾病间关系的有力方法。在这里,我们将共同的单核苷酸多态性(SNP)与基因表达之间的物理接触信息和肺部和全血中的表达定量性状基因座(eQTL)数据整合起来,构建了两个组织特异性的空间基因调控网络(GRN)。然后,通过识别受哮喘相关空间eQTL函数影响的基因来定位每个组织特异性GRN内的哮喘GRN(级别0)。根据与哮喘GRN相距四个边缘或级别以内的关联蛋白进行后续识别。然后将0-4级的基因局部调控的eQTL与GWAS Catalog进行查询,以识别在每个级别上富集(超几何检验;FDR ≤ 0.05)的特征。我们在肺部和血液GRN中分别找到了80个和82个显著富集的特征。 所有识别出的特征都已被报道与哮喘共病或相关(正或负)(如抑郁症状和肺癌),除了8个特征,其与哮喘的关联有待确认(如网织红细胞计数)。我们的分析还准确指出了将哮喘与已识别的哮喘相关特征联系起来的变异体和基因,其中一部分在使用新西兰26,781例哮喘患者的健康记录进行共病分析时得到了复制。我们的发现方法在感兴趣的组织中,无需事先选择相互作用特征,可以识别哮喘临近的调控空间中富集的特征。其预测拓宽了我们对哮喘可能的共享分子相互作用和治疗靶点的理解,而目前尚无治愈方法。版权所有 © 2023 Zaied, Fadason和O'Sullivan。
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Frontiers in Immunology
2023
ZhijianWang,XuenuoCh...
Based on disulfidptosis-related glycolytic genes to construct a signature for predicting prognosis and immune infiltration analysis of hepatocellular carcinoma.
Frontiers in Immunology
肝细胞癌(HCC)包括几种不同的分子亚型,其预后意义不同。然而,至今尚未对基于与硫键脱氧和糖酵解相关的分子亚型及其相关代谢组学和免疫微环境的HCC预后标志进行全面分析。基于硫源相关的糖酵解基因(DRGGs)表达差异,将HCC患者分为不同亚型。建立并验证危险预后标记。最后,使用免疫组织化学(IHC)和定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)评估标记中关键基因SLCO1B1的表达水平。使用多重免疫荧光法探索该基因与免疫细胞的关联。通过细胞计数试剂盒-8,创口愈合和集落形成实验研究细胞的生物学功能。不同亚型的患者具有特定的临床病理特征,预后和免疫微环境。我们确定了七个有价值的基因,并构建了一个危险预后标记。风险评分分析显示,与高风险组相比,低风险组具有更好的预后,更高的免疫评分和更丰富的免疫相关通路,与肿瘤亚型一致。此外,IHC和qRT-PCR分析显示HCC组织中SLCO1B1的表达下降。功能实验显示,SLCO1B1的过表达抑制了HCC细胞的增殖,迁移和侵袭能力。我们开发了一个预后标记,可以帮助临床医生预测HCC患者的总生存期,并为靶向治疗提供参考价值。版权所有©2023 Wang, Chen, Zhang, Chen, Peng和Huang.
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