研究动态
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Frontiers in Immunology
2023
ClaudioTripodo,Giorg...
Pseudotemporal ordering of spatial lymphoid tissue microenvironment profiles trails Unclassified DLBCL at the periphery of the follicle.
Frontiers in Immunology
我们已经建立了反应性淋巴组织中不同微区的转录标记的伪时序排序,即生发中心暗区(DZ)、生发中心明亮区(LZ)和滤泡周围区(Peri)。通过利用从DZ、LZ和Peri的功能微环境中得出的伪时间轨迹,我们已经对弥漫性大B细胞淋巴瘤病例的转录组进行了排序。结果伪时间轨迹的高点,特征是TNFR信号通路和抑制性免疫检查点过度表达的分子程序富集,与离散的滤泡周围生物学相交。这种观察与富含不可分类/3型COO类别的DLBCL病例相关,引发了关于这个特殊病例群体可能具有额外的生发中心微环境印记的问题。本报告为弥漫性大B细胞淋巴瘤中功能淋巴组织微环境转录谱与起源细胞概念的不断发展之间的关系提供了引人思考的视角。版权所有 © 2023 Tripodo, Bertolazzi, Cancila, Morello和Iannitto。
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Frontiers of Medicine
2023 Sep 08
DaweiXie,ZhengWang,B...
High frequency of alternative splicing variants of the oncogene Focal Adhesion Kinase in neuroendocrine tumors of the pancreas and breast.
Frontiers of Medicine
神经内分泌肿瘤(NENs)是一组分布在不同器官的异质性肿瘤,其特征性遗传异常尚未确定。基于对包含33种癌症亚型的9193名患者乳腺癌基因组图谱数据库进行的分析,我们发现在8例胰腺神经内分泌癌中有7例(87.5%)和170例胰腺导管腺癌(PDACs)中有20例(11.76%)中出现了含有Box 6/Box 7的FAK变体(FAK6/7)。我们对157例中国患者的胰腺肿瘤样本进行了FAK变异的检测,发现在45例胰腺NENs中有34例(75.6%),40例胰腺实性假乳头状肿瘤中有19例(47.5%),和69例PDACs中有2例(2.9%)呈FAK6/7阳性。我们还对乳腺神经内分泌癌(BrNECs)进行了FAK片段变异的测试,发现在15例BrNECs中有14例(93.3%)呈FAK6/7阳性,而在23例非-NEC乳腺癌中则没有阳性样本。我们探讨了潜在的机制并发现,在FAK6/7阳性的胰腺肿瘤和乳腺肿瘤中,有一个剪接因子丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白4(SRRM4)的过度表达,促进了细胞中FAK6/7的形成。这些结果提示FAK6/7可能是NENs的生物标记物,并可能成为这些孤立疾病的潜在治疗靶点。 © 2023. 高等教育出版社。
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Immunity & Ageing
2023 Sep 08
AhmedHAlSharie,Abdul...
Cyclin dependent kinase inhibitor 3 (CDKN3) upregulation is associated with unfavorable prognosis in clear cell renal cell carcinoma and shapes tumor immune microenvironment: A bioinformatics analysis.
Immunity & Ageing
细胞周期调控蛋白在许多人类恶性肿瘤的发展和进展中起着重要作用。识别它们的生物学功能以及它们的预后效用是一个积极研究的领域。作为阐明透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的分子特性的持续努力的延续,我们提出了一项针对cyclin-dependent kinase inhibitor 3(CDKN3)在ccRCC中的预后和机制作用的全面生物信息学研究。通过UCSC Xena浏览器,我们获得了癌症基因组图谱计划的ccRCC队列,以获取CDKN3 mRNA表达数据及其相应的临床病理学变量。使用单变量和多变量Cox回归分析评估CDKN3的独立预后标识。利用基因集富集分析和共表达基因功能注释来识别与CDKN3相关的改变分子通路。使用TIMER 2.0和基因表达谱交互分析评估肿瘤免疫微环境。在癌症基因组图谱计划的ccRCC队列中,CDKN3上调与缩短总生存期(风险比[HR] = 2.325,95%置信区间[CI]:1.703- 3.173,P < .0001)相关。单变量(HR: 0.426,95%CI: 0.316-0.576,P < .001)和多变量(HR: 0.560,95%CI: 0.409-0.766,P < .001)Cox回归分析表明CDKN3是总生存期的独立预后变量。高CDKN3表达与以下通路富集相关,包括移植排斥、上皮间质转化、有丝分裂纺锤体、炎症反应、IL-6/JAK/STAT3信号通路、精子生成、TNF-α/NF-kB通路、补体活化、KRAS信号通路和INF-γ信号。CDKN3还与各种免疫细胞的显著浸润以及与免疫相关基因的显著相关性相关。CDKN3是ccRCC的不良预后生物标志物,会改变多种分子通路并影响肿瘤免疫微环境。版权所有 © 2023作者。 Wolters Kluwer Health, Inc.出版。
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Immunity & Ageing
2023 Sep 08
Hong-RuiLu,Peng-FeiZ...
Predictive value of NLR and PLR for immune-related adverse events: a systematic review and meta-analysis.
Immunity & Ageing
目前,缺乏经济实惠且易获取的指标,能准确预测由免疫检查点抑制剂(ICIs)使用导致的免疫相关不良事件(irAEs)。为了填补这一知识空白,我们的研究探讨了中性粒细胞-淋巴细胞比值(NLR)和血小板-淋巴细胞比值(PLR)这两个比率对肿瘤患者irAEs的潜在预测价值。我们在PubMed、Embase和Cochrane图书馆进行了系统检索。包括使用NLR或PLR与irAEs相关的研究。对所选研究进行了质量和偏倚风险评估。基于Cox模型分析创建了森林图。进行了随机效应的荟萃分析以估计比值比(OR)及其95%的置信区间(CI)。筛选594项研究后,共纳入了7项合格研究,涉及1068名肿瘤患者。基于Cox回归分析显示,低中性粒细胞-淋巴细胞比值(L-NLR)(OR = 3.02,95% CI 1.51至6.05,P = 0.002)和低血小板-淋巴细胞比值(L-PLR)(OR = 1.83,95% CI 1.21至2.76,P = 0.004)与irAEs相关。在切点值的亚组分析中,当NLR切点值为3时,irAEs与NLR显著相关(OR = 2.63,95% CI 1.63至4.26,P < 0.001)。低L-NLR和L-PLR均与irAEs显著相关。因此,对于被确定为irAEs风险较高的患者,应进行更加细致的监测和密切观察。© 2023。作者,以独家许可授予西班牙肿瘤学协会(FESEO)。
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Bone & Joint Journal
2023 Aug 30
MaramAlaa,NouranAl-S...
Comparative Shotgun Proteomics Reveals the Characteristic Protein Signature of Osteosarcoma Subtypes.
Bone & Joint Journal
骨肉瘤是一种影响青少年和年轻成年人的原发性恶性骨肿瘤。本研究旨在确定能够区分不同骨肉瘤亚型的蛋白质组学特征,为了解其分子异质性以及潜在的个体化治疗方法提供见解。利用先进的蛋白质组学技术,我们分析了来自儿童骨肉瘤患者队列的FFPE肿瘤样本,涵盖了四个不同的亚型。差异表达分析揭示了能够区分这些亚型的显著蛋白质组学特征,突显了与不同肿瘤特征相关的不同分子特征。与此相反,临床决定因素与儿童骨肉瘤的蛋白质组学特征无相关性。鉴定的蛋白质组学特征涵盖了多种参与聚焦粘附、细胞外基质受体相互作用、PI3K-Akt信号通路和癌症中的蛋白聚糖的蛋白质,是富集通路中的顶级。这些发现强调了在诊断或开发个体化治疗策略时考虑骨肉瘤的分子异质性的重要性。通过确定亚型特异蛋白质组学特征,临床医生可以根据个体患者来调整治疗方案,优化治疗效果并减少不良反应。
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Bone & Joint Journal
2023 Sep 08
VengJeanHeng,MonicaS...
Robust mixed electron-photon radiation therapy planning for soft tissue sarcoma.
Bone & Joint Journal
混合电子-光子束放疗(MBRT)是一种新兴技术,其中外部电子和光子束同时优化为单一的治疗计划。MBRT利用电子的剂量迅速下降和高表面剂量,同时通过利用光子的陡峭半影保持靶区的一致性。本研究旨在研究MBRT对软组织肉瘤(STS)患者的剂量学益处。以传统基于光子的容积调制弧疗法(VMAT)治疗的下肢STS 22例回顾性队列被重新计划为MBRT。Varian TrueBeam线性加速器上的VMAT和MBRT治疗均采用Millenium多叶片准直器进行计划。MBRT计划的电子束未使用电子隔离器、切开或其他共轭性分鬆装置。MBRT计划通过鲁棒列生成算法优化,使用6 MV光子和五种电子能量(6、9、12、16、20 MeV)的组合。本研究中的电子束以标准的100 cm源轴距(SAD)进行计划。使用Wilcoxon符号秩检验比较临床靶区容积(CTV)、骨骼、正常组织带和其他危及器官(OAR)的剂量。在原始VMAT治疗中,10例患者需要组织等效块。由于较高的电子进入剂量,MBRT计划不需要块。处方剂量下CTV的覆盖在两种治疗方式的计划中被认为是临床等效的:V 50Gy (MBRT) = 97.9 ± 0.2%,V 50Gy (VMAT) = 98.1 ± 0.6% (p=0.34)。通过比较MBRT和VMAT计划中OAR的剂量差异的绝对配对差异,我们观察到MBRT计划中的正常组织V 20Gy比VMAT计划降低了14.9 ± 3.2% (p < 10 - 6) $p<10^{-6}$ 。类似地,MBRT计划中的骨骼V 50Gy相对于骨骼体积减少了8.2 ± 4.0% (p < 10 - 3) $p<10^{-3}$ 。对于皮下侵犯的STS,与VMAT相比,MBRT可以在不损害靶区覆盖的情况下,显著减少OAR的剂量。MBRT计划可以在常规线性加速器上实施,而无需使用电子隔离器、缩短源到表面距离(SSD)或块。本研究表明,MBRT是一种具有明显剂量学益处的可行技术。© 2023 The Authors. Medical Physics published by Wiley Periodicals LLC on behalf of American Association of Physicists in Medicine.
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Bone & Joint Journal
2023
FYuSmirnov,YuSKornev...
[Micotic aneurysm of the internal carotid artery in a patient with sarcoidosis as a cause of ischemic stroke and profuse epitaxis].
Bone & Joint Journal
本文描述了以下病例:一名63岁的肺结节病患者,长期使用美地松治疗后出现剧烈鼻衄,并在入院时出现中风的临床表现。入院时的脑部计算机断层扫描(CT)显示蝶窦后壁破坏,左眼视神经投影区有密度增高的区域,被认为是蝶窦的肿瘤或炎症性变化。CT血管造影显示左侧内颈动脉(LICA)从C1段开始完全闭塞。在血栓取出时,患者出现鼻腔剧烈出血。根据分段血管造影,恢复了LICA到蝶窦段的顺行血流;在剧烈出血的背景下,可以看到对比剂从LICA进入蝶窦,进一步到达鼻咽部;在蝶窦的投影中,发现了一个需要区分巨大动脉瘤、动静脉瘘和蝶窦肿瘤的结构。根据临床需要,在岩骨段水平进行了支持性血管栓塞术,停止了出血,但患者因急性出血性贫血而死亡。尸检发现了LICA的真菌性动脉瘤,并导致鼻出血,后来因形成扩展性血栓而暂时停止。这反过来成为中风的原因。
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Bone & Joint Journal
2023 Sep 08
ShanJiang,XuanLu,Ruo...
Salvage hematopoietic stem cell transplantation for patients with higher leukemia burden in relapsed or refractory acute myeloid leukemia: a ten-year study.
Bone & Joint Journal
复发难治性急性髓系白血病(R-R AML)患者,特别是非缓解(NR)患者,在异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)后预后差。为了优化R-R AML患者的整个allo-HSCT过程,并确定影响HSCT后临床结果的潜在因素,我们回顾性分析了2013年至2022年在华中科技大学同济医学院协和医院血液病研究所进行救治性allo-HSCT的44名成年R-R AML患者,这些患者在NR状态下或合并自髓外白血病。 44名患者的1年和2年总生存率(OS)分别为55.3%(95%置信区间[CI],41.1%-74.3%)和44.4%(95%CI,30.2%-65.4%)。1年和2年累积复发率(CIR)分别为39.4%(95%CI,38.0%-40.7%)和53.0%(95%CI,51.0%-55.1%),1年和2年无白血病生存率(LFS)分别为37.8%(95%CI,24.8%-57.7%)和20.3%(95%CI,9.1%-45.3%)。100天、1年和2年的治疗相关性死亡率(TRM)分别为13.8%(95%CI,13.3%-14.4%)、22.8%(95%CI,21.9%-23.7%)和26.7%(95%CI,25.5%-27.8%)。多因素分析显示,移植后出现慢性移植物抗宿主病(cGVHD)的患者复发率较低。我们的分析还表明,骨髓中的生物计数<20%和≥20%的患者在allo-HSCT后具有可比的临床结果。总之,我们的研究表明,在移植时无论白血病负担如何,NR状态或合并自髓外白血病的R-R AML患者都可以从allo-HSCT中受益。接受allo-HSCT后出现cGVHD的患者可能由于增强的移植物抗白血病(GVL)效应而具有较低的复发率,但应控制cGVHD在轻度至中度水平,以避免危及生命的并发症。© 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.
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Bone & Joint Journal
2023 Sep 08
BianyunCai,LeizhenHu...
Black phosphorus-incorporated novel Ti-12Mo-10Zr implant for multimodal treatment of osteosarcoma.
Bone & Joint Journal
骨肿瘤切除后的大骨缺损的修复和重建仍然是一个巨大的临床挑战。目前,骨科植入物重建是修复骨缺损的主流治疗方法。然而,根据临床反馈,局部肿瘤复发和骨移植不愈合是导致骨缺损修复和重建失败的常见原因,严重危及患者的身心健康。在此基础上,选择自主研制的低模量Ti-12Mo-10Zr合金(TMZ)作为基底材料。为了改善其生物活性和骨整合性能,通过微弧氧化法 (MAO) 在TMZ合金上制备了含有钙、氧和磷的共掺杂微孔设计。然后,将黑磷 (BP) 纳米片结合到MAO处理过的TMZ合金上以获得多功能复合材料。所得到的BP-MAO-TMZ植入体在808 nm近红外激光照射下表现出优异的光热效应和对骨肉瘤癌细胞的有效消融作用,而TMZ合金没有观察到光热或治疗效应。同时,经过MAO处理后获得的结构/成分仿生涂层以及BP纳米片结合后的P驱动原位生物矿化性能赋予BP-MAO-TMZ植入体对MC3T3-E1成骨细胞的活性、增殖和分化能力具有协同促进效果。本研究有望为骨肿瘤患者的手术切除后的骨再生困难和肿瘤复发等问题提供有效的临床解决方案,并解决恶性骨肿瘤患者预后不佳、术后生活质量差等一系列医学问题。© 2023. 作者(们), 独立授权给Springer Nature B.V.
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Food & Function
2023 Sep 08
DénesBerta,SaschaGeh...
Mechanism-Based Redesign of GAP to Activate Oncogenic Ras.
Food & Function
Ras GTP酶在细胞信号转导途径中起着关键作用。Ras基因的突变在约三分之一的癌细胞系中发生,并且通常与不良的临床预后相关。热点残基Gly12、Gly13和Gln61涵盖了97%的致癌突变,这些突变损害了Ras的酶活性。使用QM/MM自由能计算,我们提出了一种双步机制来描述由野生型Ras.GAP复合物催化的GTP水解过程。我们发现,通过Gln61作为瞬态Brønsted碱来发生催化性水的去质子化。我们还使用QM/MM最小化确定了关键致癌Ras突变体G12D和G12C的反应轨迹,与实验观察到的催化活性丧失相吻合,从而验证了我们的反应机制。利用优化后的反应路径,我们设计了一种快速准确的过程来设计激活G12D Ras的GAP突变体。我们替换了活性位点附近的GAP残基,并确定了190个单突变体的激活能垒。我们还构建了一个用于超快筛选的机器学习模型,通过快速预测能垒高度,在单一突变和双突变上进行了测试。这项研究表明,通过QM/MM反应路径优化可以实现快速准确的筛选,以设计具有增强催化活性的蛋白质序列。预测将出现几个GAP突变,可以重新启用致癌G12D的催化活性,为克服异常的Ras驱动信号转导提供了有前途的途径,而不是抑制酶活性。所概述的计算筛选方案同样适用于设计类似的配体和辅基。
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