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肿瘤
HEART & LUNG
2023 Sep 07
QiChang,ZhennanYan,M...
Mining multi-center heterogeneous medical data with distributed synthetic learning.
HEART & LUNG
在医疗分析中，由于隐私保护和医疗系统中的数据异构性，克服多中心数据使用的障碍是具有挑战性的。在本研究中，我们提出了分布式合成学习（DSL）架构，以跨多个医疗中心学习并确保个人敏感信息的保护。DSL通过基于生成对抗网络的合成学习的形式生成一种完全合成的医学影像数据集，以建立一个均质数据集。所提出的DSL架构具有以下关键功能：多模态学习、缺失模态补全学习和持续学习。我们系统评估了DSL在心脏计算机断层扫描血管造影（CTA）、脑肿瘤磁共振成像以及组织病理学细胞核数据集上的性能。大量实验证明了DSL作为高质量的合成医学影像提供者的优越性能，通过使用理想的合成质量指标Dist-FID来评估。我们展示了DSL可以适应异构数据，并且在分割模态不对齐的真实数据集上的性能超过实际模态分割模型55%，超过时间序列数据集分割模型8%。© 2023. Springer Nature Limited.
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Journal of Translational Medicine
2023 Sep 07
FanghuaYe,WenZhang,C...
Antileukemic effect of venetoclax and hypomethylating agents via caspase-3/GSDME-mediated pyroptosis.
Journal of Translational Medicine
将B细胞淋巴瘤2（Bcl-2）识别为治疗青春期骨髓性白血病（AML）的治疗靶点，已经引起了一种范式转变。由于其细胞毒性和免疫原性效应，焦痂病是一种新型的抗肿瘤治疗机制。文特克拉克斯（venetoclax）与低甲基化剂（HMAs）的联合应用已经显示出持久反应并显著改善AML患者的预后。然而，我们对此联合活性的机制的理解仍在不断发展。我们研究了Bcl-2抑制剂文特克拉克斯是否诱导AML细胞焦亡以及鉴定了焦亡效应蛋白。通过使用Western blotting、免疫沉淀、RNA干扰、CCK8实验和LDH实验，我们探索了焦亡效应的机制。我们调查了焦亡效应蛋白GSDME的表达与AML预后之间的关系。我们研究了GSDME去甲基化与文特克拉克斯治疗的焦亡效应的关系，并在小鼠模型和临床样本中进行了验证。文特克拉克斯诱导的焦亡是通过依赖于caspase-3的GSDME裂解来介导的。在机制上，文特克拉克斯通过激活内源性凋亡途径上调caspase-3和GSDME的裂解。通过公共数据库和患者样本分析，我们发现GSDME在AML中通过启动子甲基化下调，并且低GSDME表达与糟糕预后显著相关。体内外实验表明，GSDME过表达或HMAs介导的GSDME表达修复显著增加了AML中文特克拉克斯诱导的焦亡。GSDME介导的焦亡可能是Bcl-2抑制剂的抗白血病效应的一个新的方面。该发现为潜在的生物标志物和治疗策略提供了新的见解，解释了文特克拉克斯和HMAs在AML中的临床活性。© 2023年。BioMed Central Ltd，Springer Nature的一部分。
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npj Precision Oncology
2023 Sep 07
HongyingZhao,RongkeJ...
The regulatory role of cancer stem cell marker gene CXCR4 in the growth and metastasis of gastric cancer.
npj Precision Oncology
单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）由于其解析细胞异质性的能力，正日益被广泛应用于筛选与癌变相关的基因。本研究旨在通过scRNA-seq与bulk RNA-seq相结合，揭示胃癌（GC）生长和转移的癌干细胞（CSCs）标记基因CXCR4的分子机制。GC相关的scRNA-seq数据从GEO数据库下载，在UMAP聚类分析后，利用K-means算法排除非恶性细胞。批量RNA-seq数据和临床样本信息从UCSC Xena数据库下载。GO和KEGG通路分析验证了基因与通路之间的相关性。利用体外和体内功能实验检测受扰动的CXCR4对恶性表型、肿瘤发生和肝转移的影响。在GC组织样本中鉴定出大量高变异基因。选取前20个主成分，并将细胞分为6种细胞类型。惡性上皮細胞的C4细胞聚类可能为CSCs。将CXCR4单独挑选为CSCs的标记基因。CXCR4表达高的GC患者生存率较差。CXCR4的沉默抑制了CSCs的恶性表型，同时在裸鼠体内抑制了肿瘤发生和肝转移。CSC标记基因CXCR4可能是促进CSCs的恶性表型、肿瘤生长和肝转移的关键基因。© 2023. Nature Publishing Group UK.
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npj Precision Oncology
2023 Sep 07
AuroraGaeta,MartaTag...
Are sex and gender considered in head and neck cancer clinical studies?
npj Precision Oncology
我们通过检查ClinicalTrials.gov (AACT)上关于头颈癌 (HNC) 临床研究中是否包含了性别和/或性别 (S/G) 的内容，以及在特定亚组（即口腔、喉咙和峡部）中是否提到了人乳头状瘤病毒 (HPV)。只有5%的HNC研究中提到了将S/G作为计划分析变量。与干预性研究相比，观察性研究对待S/G作为分析变量的比例更高（10% vs 5%，P值≤ 0.001）。提到S/G的研究中，有8%涉及超过100名受试者，而有4%涉及少于100名受试者（P值≤ 0.001）。在随机方案中，提到S/G的研究在计划样本超过100名患者且包含HPV状况时更多（P值< 0.05）。小规模对照研究对S/G作为分析变量的提及比例较低，而在无对照研究中较高（分别是4%和10%，其中对于少于100名受试者的研究）。在样本量超过100名受试者的对照和随机研究中，存在更显著的S/G被作为分析变量提及情况。只有18%的口腔腔喉部研究提到了HPV。干预性研究在HNC研究设计中通常没有考虑到S/G。因此，尽管是基础但在涉及HNC的研究中，往往没有考虑到S/G变量。在发表在科学期刊上的试验中（P值= 0.01），以及最近的临床试验中（P值= 0.002），S/G被更多地考虑到，这表明人们越来越意识到其重要性。然而，有必要系统地包括S/G在研究设计中，以更好地突出与性别相关的疾病发病率和预后差异，并使科学和医学充满适当的生物学和文化差异。© 2023. Nature Publishing Group UK.
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npj Precision Oncology
2023 Sep 07
VipinShankarChelakko...
MC1R signaling through the cAMP-CREB/ATF-1 and ERK-NFκB pathways accelerates G1/S transition promoting breast cancer progression.
npj Precision Oncology
MC1R，一个G蛋白偶联受体，能够在黑色素细胞中触发紫外线诱导的黑色素合成和DNA修复，并与黑色素瘤的发病机制相关。虽然MC1R广泛在不同组织类型中表达，但其在非皮肤组织中的功能相对未知。在本研究中，我们展示了与黑色素瘤发生相关的MC1R变异在多种癌症患者中较少被发现。进一步的探索表明，与正常乳腺组织相比，乳腺癌组织中MC1R的表达显著增加，且MC1R的沉默显著降低了乳腺癌细胞的体外和体内增殖。机制上，MC1R信号通过MC1R-cAMP-CREB/ATF-1和MC1R-ERK-NFκB轴加速了乳腺癌细胞的G1-S转变。我们的结果揭示了MC1R与乳腺癌之间的新关联，这可能在治疗上具有潜在的靶向性。此外，我们的结果表明，在特定环境中，MC1R增强/激活疗法应谨慎使用，因为它们可能在某些情况下促进肿瘤发展。© 2023. Nature Publishing Group UK.
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Molecular Cancer
2023 Sep 07
SiyaoLiu,WenchuanWu,...
The evolution and heterogeneity of neutrophils in cancers: origins, subsets, functions, orchestrations and clinical applications.
Molecular Cancer
中性粒细胞是人体内最常见的先天免疫细胞，在近年来由于参与肿瘤进展而受到广泛关注。本综述旨在从整个生命周期的角度阐明中性粒细胞在肿瘤中的重要作用和潜在机制，从骨髓发育、循环到肿瘤微环境（TME）的过程中对其进行追踪。基于对其异质性的理解，我们描述了异常中性粒细胞与肿瘤临床表现之间的关系。具体而言，我们探索了TME内中性粒细胞的功能、起源和极化。此外，我们还对中性粒细胞与临床管理之间的复杂关系进行了广泛分析，包括基于中性粒细胞的临床治疗策略。总之，我们坚信将未来的研究重点放在理解中性粒细胞展示的显著异质性上是至关重要的。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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EUROPEAN JOURNAL OF PEDIATRICS
2023 Sep 08
CleitonFormentin,And...
Posterior fossa tumors in children: current insights.
EUROPEAN JOURNAL OF PEDIATRICS
虽然成年人大多数颅内肿瘤发生在大脑半球周围，但45%到60%的儿科肿瘤位于后颅窝，尽管这个解剖区域只占颅内体积的10%。世界卫生组织对中枢神经系统肿瘤的最新分类版对儿童肿瘤的分类产生了重大影响，也影响到后颅窝肿瘤。分子生物标志物在儿童后颅窝肿瘤的诊断、预后和治疗中起着重要作用，可以用于预测患者的预后和对治疗的反应，并监测其疗效。尽管遗传研究已经确定了多种后颅窝肿瘤类型，这些类型在定位、起源细胞、遗传机制和临床行为方面存在差异，但最近的治疗策略仍然依赖于统一的方法，主要是基于切除范围。然而，在生物或分子分级标准指导下制定治疗决策以及利用分子靶向治疗针对特定肿瘤生物学特征的进展已经取得了显著进展。本综述主要关注儿童后颅窝常见亚型肿瘤的诊断和治疗的最新进展，以及未来的潜在治疗方法。结论：分子生物标志物在儿童后颅窝肿瘤的诊断、预后和个体化治疗方案中起着核心作用。它们可以预测患者的预后，衡量治疗反应，并评估治疗的有效性。神经影像学和治疗的进展显著提高了这些肿瘤患儿的预后。
已知内容：
- 中枢神经系统肿瘤是儿童和青少年最常见的实体肿瘤，其中约45%到60%位于后颅窝。
- 通常采用神经外科手术、放射治疗和化疗等综合方法来处理儿童后颅窝肿瘤。
新内容：
- 在儿童后颅窝肿瘤的诊断、分类和管理方面取得了显著进展，从而提高了生存率和生活质量。
© 2023. 作者，独家授权于德国施普林格出版社，隶属于施普林格自然出版集团。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 07
KirstyAndresen,Helen...
The risk of acute kidney injury in colorectal cancer survivors: an english population-based matched cohort study.
Disease Models & Mechanisms
近几十年来，结直肠癌的存活率有所提高，但人们担心幸存者可能由于癌症治疗的不良影响或癌症本身的并发症而发生肾脏问题。我们对结直肠癌幸存者与没有先前癌症的人进行了急性肾损伤（AKI）风险的量化比较。采用回顾性配对队列研究，利用与英国（HES-APC）医院数据相连的临床实践研究数据链黄金的电子健康记录初级护理数据。将1997年至2018年间的结直肠癌患者与年龄、性别和全科医生实践相匹配的无先前癌症的人进行了个体匹配。使用Cox模型估计结直肠癌幸存者与无癌症个体相比发生急性肾损伤问题的医院诊断风险比值，整体和根据诊断后时间进行分层调整了其他个体因素（结果风险比值）。共有20,340名结直肠癌幸存者与100,058名无癌症个体进行了匹配。与无癌症的人相比，结直肠癌幸存者患急性肾损伤的风险增加（调整后风险比值=2.16；95%置信区间2.05-2.27）。在诊断后的第一年，风险比值最高（调整后风险比值7.47，6.66-8.37），并随时间的推移逐渐减弱，但在诊断后5年后仍存在较高的患急性肾损伤的风险（调整后风险比值=1.26，1.17-1.37）。结直肠癌和AKI之间的关联在年轻人、男性以及存在既往慢性肾脏疾病的人群中更为明显。结直肠癌幸存者在癌症诊断后的几年中患急性肾损伤的风险增加，这表明有必要优先监测、预防和管理这一癌症幸存者群体的肾脏问题。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 08
HuiHuang,LimeiYang
Research Progress of Inflammatory Factors in Chronic Obstructive Pulmonary Disease with Pulmonary Hypertension at High Altitude.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
慢性阻塞性肺疾病（COPD）目前是全球发病率和死亡率最高的疾病之一，是一种严重的公共卫生问题。肺动脉高压是COPD的常见并发症。目前，肺动脉高压的发病机制尚不清楚。已知导致COPD患者肺动脉高压的因素包括低氧和炎症。低氧是由于肺损伤和供氧不足导致的，可以引起肺血管收缩和增加血管阻力，从而促进COPD患者肺动脉高压的发展。炎症也在肺动脉高压的进展中起重要作用。COPD患者的肺组织中存在炎症反应，并释放出各种炎症介质。这些介质可以刺激肺动脉内皮细胞和平滑肌细胞的异常增殖，导致血管壁增厚和血流受限。本文重点讨论了四种炎症因子（白介素(IL)-1β、IL-6、IL-8和肿瘤坏死因子(TNF)-α）在肺动脉高压中的发病机制。IL-1β、IL-6、IL-8和TNF-α是已知的促炎细胞因子，在炎症反应中起到重要作用。在肺动脉高压的背景下，这些炎症因子与肺血管重塑有关，导致血管阻力增加和血流受损。本文的研究将深入探讨IL-1β、IL-6、IL-8和TNF-α在肺血管重塑、内皮功能障碍、平滑肌细胞增殖和炎症中的作用。研究的目标是全面介绍它们在肺动脉高压中的参与程度，并探讨这些因素如何受高海拔地区普遍存在的低氧环境影响。通过关注这些炎症因子在高海拔地区的相关性，我们希望为该地区居民提供有价值的见解，以指导临床管理策略、预防措施和潜在治疗干预措施，降低他们患肺动脉高压的风险。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 05
GabrieleFoos,NinaBla...
A meta-analysis of epitopes in prostate-specific antigens identifies opportunities and knowledge gaps.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
癌症抗原数据库和分析资源（CEDAR）是一个新开发的癌症抗原数据的存储库，这些数据来自同行评议的出版物，其中包括特异性表位的T细胞、抗体和MHC配体测定。本文将重点介绍CEDAR的功能，并阐明与表位相关的前列腺癌研究的进展。元分析集中在描述8个前列腺特异性（PS）抗原表位的子集数据。这些蛋白质与460个表位相关联，其中包括187个T细胞表位、109个B细胞表位和271个MHC配体表位。表位的数量与蛋白质的长度无关，但我们发现特定PS抗原的引用次数与报告的表位数之间存在显著正相关性。共发现44个不同的I类和27个II类限制因子，其中以HLA-A*02:01和HLA-DRB1*01:01描述的表位最多。细胞因子测定主要限于IFNg测定，仅进行了很少数量的四聚体测定。单克隆和多克隆B细胞反应是平衡的，ELISA/免疫印迹测定中研究的表位最多。此外，表位通常以与前列腺癌相关的方式进行描述，很少具体说明疾病状态。我们发现，在体和肿瘤识别测定很少，具有注释的B/T细胞受体信息的表位数量有限。通过使用ImmunomeBrowser工具，我们确定了潜在的免疫优势区域。CEDAR为与前列腺特异性抗原相关的表位提供了一个综合的存储库。这个具有丰富可搜索的T细胞、B细胞和MHC配体信息的表位数据库为科学界提供了一个有用的工具。同时，我们还发现了一些可以通过实验分析解决的重要知识空白。版权©2023。由Elsevier Inc.出版。
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