研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Comp Immunol Microb
2024 Aug 13
GustavoWillianPandol...
Neoplastic and non-neoplastic diseases associated with feline leukaemia virus (FeLV) in cats in southern Brazil.
Comp Immunol Microb
本研究的目的是对与猫 FeLV 感染相关的疾病进行分类。总共 154 只猫接受了尸检、组织病理学检查和抗 FeLV 免疫组织化学 (IHC),其中 83 只 (50.9%) IHC FeLV 呈阳性。猫的平均年龄为4.1岁,其中幼猫占3.6%,幼猫占34.9%,壮猫占37.4%,成年猫占18.1%,老年猫占2.4%,年龄未知占3.6%。肿瘤性疾病最为常见,其中以白血病和淋巴瘤为主,其次是病毒性疾病、细菌性疾病、创伤性疾病、退行性疾病、中毒性疾病、寄生虫性疾病、畸形性疾病等。 FeLV 猫被诊断出患有肿瘤的可能性是其他疾病的 5.73 倍。 FeLV 猫患白血病(OR = 7.75)和淋巴瘤(OR = 6.75)的比值比(OR)高于其他肿瘤。 FeLV 感染在混合品种中更为普遍,从幼年到成年的雄性,患有肿瘤疾病,包括白血病和淋巴瘤。因此,由于 FeLV 的高发病率,了解与 FeLV 相关的疾病在巴西至关重要,这可能会鼓励实施预防措施以减少其传播。版权所有 © 2024 Elsevier Ltd。保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 17
AkilandeswariRamu,Le...
Identification of prostate cancer associated genes for diagnosis and prognosis: a modernized in silico approach.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
前列腺癌 (PCa) 是男性癌症相关死亡的第二大原因。诊断 PCa 依赖于称为诊断生物标记的分子标记,而预后生物标记用于识别 PCa 治疗中涉及的关键蛋白质。本研究旨在收集 PCa 相关基因并评估它们作为 PCa 诊断或预后生物标志物的潜力。汇编了 PubMed 1936 年 5 月至 2020 年 12 月期间 152,064 个 PCa 相关数据的语料库。此外,从国家生物技术信息中心 (NCBI) 数据库收集了 4199 个与 PCa 术语相关的基因。使用 pubmed.mineR 提取 PubMed 语料库数据来识别 PCa 相关基因。使用各种工具进行网络和通路分析,例如 STRING、DAVID、KEGG、MCODE 2.0、cytoHubba 应用程序、CluePedia 和 ClueGO 应用程序。使用随机森林、支持向量机、神经网络算法和考克斯比例风险模型来识别重要的标记基因。这项研究报告了 3062 个独特的 PCa 相关基因以及 2518 个相应的独特 PMID。 PubMed 中鉴定了 IL6、MAPK3、JUN、FOS、ACTB、MYC 和 TGFB1 等诊断标记物,同时突出显示了 ACTB 和 HDAC1 等预后标记物。这表明 PubMed 数据提供的潜在目标基因超过了 NCBI 数据库中的目标基因。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 的一部分)的独家许可。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 17
AlessiaCimadamore,Li...
Patients ask and pathologists answer: ten questions around prostate cancer grading.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
病理学家与临床医生(主要是泌尿科医生)密切合作,更新格里森分级系统,以反映当前前列腺癌诊断、预后和治疗的实践和方法。这导致了所谓的患者倡导和患者信息的发展。报告了患者向病理学家提出的有关 PCa 分级的 10 个常见问题以及后者给出的答案。© 2024。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 17
TingTingChung,SangKy...
Prognostic significance of HS2ST1 expression in patients with hepatocellular carcinoma.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
硫酸乙酰肝素 2-O-磺基转移酶 1 (HS2ST1) 催化硫酸乙酰肝素蛋白聚糖中葡萄糖醛酸残基的硫酸化,使这些蛋白聚糖能够与肿瘤微环境中的众多配体相互作用。然而,HS2ST1表达在癌症中的预后作用仍不清楚。本研究调查了HS2ST1表达水平及其在各种癌症类型中的预后意义,证明了HS2ST1表达在肝细胞癌(HCC)患者中的预后价值,并鉴定了与HS2ST1表达相关的分子特征使用基因表达谱交互分析 (GEPIA) 门户对来自癌症基因组图谱 (TCGA) 数据集的 HS2ST1 表达和患者生存数据进行分析。我们从 TCGA 以及日本和法国国际癌症基因组联盟 (ICGC) 数据库中获取了 HCC 患者的基因表达和临床病理信息,并进行了生存分析。我们还检查了与 HS2ST1 表达相关的相关蛋白网络、差异表达基因、基因集富集和肿瘤免疫微环境特征。与正常组织相比,HS2ST1 在八种肿瘤类型中表现出较高的表达,并且与包括 HCC 在内的五种肿瘤的不良预后相关。在两个 ICGC HCC 队列中,HS2ST1 状态与不良预后相关。 HCC 肿瘤中 HS2ST1 表达升高与参与细胞周期进展、蛋白质分泌和 mTORC1 信号传导的信号通路相关。此外,HS2ST1 表达水平与肿瘤微环境中的免疫细胞浸润呈负相关。我们的研究阐明了 HCC 患者中 HS2ST1 表达的预后意义,并深入了解 HS2ST1 在信号通路和肿瘤微环境中的潜在作用。© 2024。作者。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2024 Aug 16
KensukeNakagawara,Ma...
NR4A ablation improves mitochondrial fitness for long persistence in human CAR-T cells against solid tumors.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
由于浸润率低、扩增能力差、肿瘤内T细胞耗竭等多种因素,嵌合抗原受体(CAR)-T细胞对实体瘤的抗肿瘤作用有限。 NR4A 转录因子已被证明在小鼠 T 细胞耗竭中发挥重要作用。然而,每个NR4a因子对人类T细胞分化的精确贡献仍有待阐明。在本研究中,我们在识别人类表皮生长因子受体类型的人类CAR-T细胞中删除了NR4A家族因子NR4A1、NR4A2和NR4A3 2 (HER2) 通过使用 CRISPR/Cas9 系统。我们通过将 CAR-T 细胞与 Her2 A549 肺腺癌细胞反复共培养,在体外诱导这些细胞的 T 细胞耗竭,并评估细胞表面标志物,如记忆和耗竭表型、增殖能力、细胞因子产生和代谢活性。我们通过将 CAR-T 细胞转移到 A549 荷瘤免疫缺陷小鼠体内,验证了 NR4A1/2/3 三重敲除 (TKO) CAR-T 细胞的体内抗肿瘤毒性。人 NR4A-TKO CAR-T 细胞对体外重复抗原刺激,与对照 CAR-T 细胞相比,在体外和体内均保持更高的肿瘤杀伤活性。对 NR4A 单击、双击和 TKO 效果的比较表明,三重 KO 在避免力竭方面最有效。此外,在包括老年人在内的各种供体的 T 细胞中也观察到 NR4A TKO 的抗肿瘤作用显着增强。从机制上讲,NR4A TKO CAR-T细胞表现出增强的线粒体氧化磷酸化,因此可以在肿瘤内持续更长时间。NR4A因子通过线粒体基因表达调节CAR-T细胞的持久性和干细胞性,因此NR4A是产生CAR-T细胞的非常有前途的靶点。针对实体瘤的优质 CAR-T 细胞。© 作者(或其雇主)2024。根据 CC BY-NC 允许重复使用。禁止商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 10
FubinLiu,JingyiXu,Xi...
Dietary flavonoid intake and risk of hormone-related cancers: A population-based prospective cohort study.
Epigenetics & Chromatin
膳食黄酮类化合物可能通过调节激素、抑制炎症和氧化应激而具有抗癌特性,因此可能对激素相关癌症 (HRC) 产生潜在影响。我们的目的是检查类黄酮摄入量与 HRC 风险之间的关联,以及这种关联是否是由参与生物机制的血液生物标志物介导的。英国生物银行的这项前瞻性队列研究纳入了 187,350 名在最后一次饮食召回完成时未患癌症的参与者。使用 24 小时饮食回忆来评估类黄酮及其亚类的膳食摄入量。在基线时收集静脉血并分析炎症、激素和氧化应激的生物标志物。通过特定原因的 Cox 比例风险模型估算类黄酮摄入量与 HRC 风险之间关联的风险比 (HR) 和 95% 置信区间 (CI)。通过中介分析研究了血液生物标志物在黄酮类化合物与 HRC 关联中的作用。在中位随访时间 9.5 年中,有 3,392 名女性乳腺癌、417 名卵巢癌、516 名子宫内膜癌、4,305 名前列腺癌、45 名睾丸癌和 146 名女性罹患乳腺癌。记录了甲状腺癌病例。与最低五分位数相比,总黄酮类摄入量最高五分位数中乳腺癌的多变量调整 HR (95% CI) 为 0.89 (0.80-0.99),卵巢癌为 0.68 (0.50-0.92),卵巢癌为 0.88 (0.80-0.98)。 )针对女性特有的癌症。对于亚类,黄酮醇和花青素的摄入量与女性特有癌症的风险呈负相关(Ptrend <0.05)。花青素摄入量与前列腺癌风险呈正相关,而异黄酮摄入量与甲状腺癌风险呈负相关(Ptrend <0.05)。此外,炎症、激素和氧化应激的某些生物标志物共同介导类黄酮摄入量与女性特有癌症和前列腺癌风险的关联。我们的研究结果强调了膳食类黄酮对于预防一般人群中 HRC 的重要性,为流行病学提供了依据。膳食指南的证据。版权所有 © 2024 Elsevier GmbH。版权所有。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 14
AnuraagBukkuri,Frede...
Of criminals and cancer: The importance of social bonds and innate morality on cellular societies.
Epigenetics & Chromatin
目前癌症生物学的教条认为,癌症是一个身份问题:细胞 DNA 的突变导致它“失控”并增殖失控。然而,这在很大程度上忽略了细胞与细胞相互作用的作用,并且无法解释诸如癌症逆转、表观遗传癌症的存在和异物致癌等现象。在这篇概念验证论文中,我们利用犯罪学提出,癌症也可以被概念化为一个相关问题:尽管细胞的遗传学至关重要,但其与其他细胞相互作用的影响在确定其表型时同样重要。我们创建了一个简单的基于代理的正常细胞和癌细胞之间相互作用的网络模型来证明这一想法。我们发现细胞间的高突变率和低水平的连接都可以促进肿瘤发生。将癌症视为组织中细胞间通讯网络的崩溃,很好地补充了以基因为中心的范式,并为理解和治疗癌症提供了新的视角。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 16
JiaGe,JuanGe,GuTang,...
Machine learning-based identification of biomarkers and drugs in immunologically cold and hot pancreatic adenocarcinomas.
Epigenetics & Chromatin
胰腺癌(PAAD)通常表现出“冷”或免疫抑制的肿瘤环境,这与免疫检查点阻断疗法的抵抗有关;然而,其根本机制尚不完全清楚。在这里,我们的目的是提高对肿瘤微环境中发生的分子机制的理解,并确定生物标志物、治疗靶点和改善 PAAD 治疗的潜在药物。根据具有不同疾病结果的免疫热或冷 PAAD 亚型对患者进行分类。进行 Cox 回归和加权相关网络分析来构建一个新的基因特征,称为“热肿瘤、预后和免疫相关基因下调”(DPIRG),用于通过机器学习开发 PAAD 的预后模型。毫升)。全面分析了DPIRGs在PAAD中的作用,并通过ML识别了能够区分PAAD免疫亚型和预测预后的生物标志物基因。使用公共单细胞转录组和蛋白质组资源验证生物标志物的表达。通过分子对接研究鉴定出使冷肿瘤变热的候选药物和相应的靶蛋白。使用DPIRG签名作为输入数据,从137个ML组合中选择生存随机森林和偏最小二乘回归Cox的组合来构建优化的PAAD预后模型。通过分析遗传/表观遗传改变、免疫浸润、通路富集和 miRNA 调控,研究了 DPIRG 的作用和分子机制。鉴定了生物标志物和潜在的治疗靶点,包括 PLEC、TRPV1 和 ITGB4 等,并验证了生物标志物的细胞类型特异性表达。候选药物包括沙利度胺、SB-431542 和博来霉素 A2,是根据其有利地调节 DPIRG 表达的能力而确定的。通过结合多种 ML 算法,我们开发了一种在 PAAD 队列中具有出色性能的新型预后模型。事实证明,ML 对于识别生物标志物和改善 PAAD 患者分层和免疫治疗的潜在靶点也具有强大的作用。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 16
XiaojingChen,XitongJ...
Triage performance of PAX1m/JAM3m in opportunistic cervical cancer screening of non‒16/18 human papillomavirus-positive women: a multicenter prospective study in China.
Epigenetics & Chromatin
在本研究中,我们旨在验证 PAX1 和 JAM3 甲基化 (PAX1m/JAM3m) 测试作为检测非 16/18 高危人乳头瘤病毒中 3 级或更严重的宫颈上皮内瘤变 (CIN3 ) 的分类工具的性能。阳性患者(非 16/18 hrHPV  )。比较了液基细胞学 (LBC) 的分诊性能和检测 CIN3  的 PAX1m/JAM3m 测试。总共 1851 名参与者有宫颈组织学结果并纳入分析。对于意义不明或更差的非典型鳞状细胞 (LBC ≥ ASCUS) 和 PAX1m/JAM3m 检测,LBC 检测结果的敏感性/特异性分别为 90.1%/26.7% 和 84.8%/88.5%。 PAX1m/JAM3m( ) 在整个队列中具有最高的诊断 AUC(0.866,95% 置信区间 (CI) 0.837-0.896)。所有癌症 (n = 20) 均通过 PAX1m/JAM3m( ) 检测。与LBC ≥ ASCUS相比,PAX1m/JAM3m( )使需要转诊进行阴道镜检查的患者数量减少了57.21%(74.66% vs. 17.45%)。 LBC ≥ ASCUS 和 PAX1m/JAM3m( ) 检测 CIN3  的优势比分别为 3.3 (95% CI 2.0-5.9) 和 42.6 (27.1-69.6) (p < 0.001)。 LBC ≥ ASCUS 或 PAX1m/JAM3m( ) 组合略微提高了诊断敏感性(98.0%,95% CI:95.8-100%)和转诊率(77.09%),但降低了诊断特异性(24.8%,22.7-26.8%) ).在非 16/18 hrHPV( ) 女性中,PAX1m/JAM3m 在检测 CIN3   方面优于细胞学。与 LBC ≥ ASCUS 相比,PAX1m/JAM3m( ) 显着减少了转诊阴道镜的数量,且不影响诊断敏感性。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 17
MihaelaChisca,Jean-D...
Antibodies against endogenous retroviruses.
Epigenetics & Chromatin
人类基因组包含数十万个古代逆转录病毒的整合,这些整合是在数百万年的进化过程中积累的。为了减少基因组的进一步扩增,宿主通过表观遗传抑制来阻止这些内源性逆转录病毒 (ERV) 的转录,并且随着进化时间的推移,ERV 会因突变和缺失的积累而丧失能力。然而,最近内源化的 ERV 群体的几个成员仍然保留产生病毒 RNA、逆转录病毒蛋白和更高阶结构(包括病毒粒子)的能力。病毒特征的保留,加上表观遗传抑制的可逆性,特别是在癌症中,允许免疫学上意想不到的ERV表达,适应性免疫系统将其视为真正的逆转录病毒感染,并对其做出反应。因此,已在多种疾病中以及偶尔在健康个体中检测到与 ERV 抗原反应的抗体。尽管它们是自身的一部分,但 ERV 抗原的逆转录病毒遗留物以及与疾病状态的关联以及可能的疾病状态的因果关系可能将它们与典型的自身抗原区分开来。因此,针对 ERV 抗原的抗体的致病能力或实际上的宿主保护能力可能取决于具体情况。在这里,我们回顾了典型 ERV 蛋白的免疫原性,重点是抗体反应及其潜在的疾病影响。© 2024 作者。约翰·威利出版的免疫学评论
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