研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 16
YuhuaShi,AifengQiu,H...
Identification of an autophagy- and macropinocytosis-related prognostic signature for the prediction of prognosis and therapeutic response in gastric cancer.
Cellular & Molecular Immunology
传统的液体活检标志物在胃癌中的阳性率和准确率较低。随着测序技术的快速进步,科学家们在该领域找到了有前途的研究途径。自噬和巨胞饮作用利用不同的途径和机制为肿瘤生长提供资源和燃料。尽管如此,它们潜在的相互作用为发现新型肿瘤生物标志物开辟了一条尚未开发的途径。开发基于自噬和微胞饮相关基因的创新预后特征,旨在预测胃癌患者的结果和治疗反应。此外,为了验证该特征的预后影响,并阐明代表性分子在胃癌中的作用。为了构建和验证胃癌的预后特征,采用COX回归、LASSO回归、生存分析、ROC曲线等生物信息学方法,以及列线图的使用基于从 TCGA 和 GEO 数据库检索的胃癌患者的测序和临床数据。采用GSEA功能富集分析来预测生物学功能。同时,利用qRT-PCR和Western blot实验来定量mRNA和蛋白表达水平。此外,EdU实验和集落形成实验用于检测细胞增殖能力,Transwell实验用于评估胃癌细胞的迁移和侵袭能力。通过一致性聚类和单变量COX分析,发现参与自噬的潜在预后基因和巨胞饮作用被鉴定。基于这些基因,构建了9个基因标签,在预测胃癌患者的生存期、免疫治疗反应和化疗药物耐受性方面表现出较高的准确性。此外,对胃癌组织样本的qRT-PCR分析表明,该特征的代表性基因在胃癌中异常过度表达,其中MATN3作为最显着的分子,通过主动调节癌细胞的增殖、迁移、我们新创建的预后特征具有作为胃癌生物标志物的巨大潜力,而 MATN3 被确定为胃癌的致癌因素。这带来了新的视角,有助于加强胃癌的诊断和治疗。© 2024。作者获得韩国遗传学会的独家许可。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 16
XuezhiLi,XiaodongQu,...
A novel M2-like tumor associated macrophages-related gene signature for predicting the prognosis and immunotherapy efficacy in gastric cancer.
Cellular & Molecular Immunology
M2 样肿瘤相关巨噬细胞(M2 样 TAM)在肿瘤进展和免疫反应中发挥关键作用。然而,M2样TAM相关调控基因在胃癌(GC)中的临床意义和预后价值尚未阐明。在此,我们通过TCGA-STAD和TCGA-STAD的加权基因共表达网络分析鉴定了M2样TAM相关基因。 GSE84437 队列。然后进行 Lasso-Cox 回归分析来筛选特征基因,并构建新的特征来量化每位患者的风险评分。对高危人群的肿瘤突变负荷(TMB)、生存结果、免疫细胞和免疫功能进行分析,以进一步揭示GC患者的免疫状态。使用基因-药物相关性分析和抗癌药物敏感性分析来鉴定潜在的治疗药物。最后,我们通过 qRT-PCR 验证了患者组织中特征基因的 mRNA 表达,并通过 IHC 分析了这些基因的表达分布。开发并验证了 4 个基因(SERPINE1、MATN3、CD36 和 CNTN1)特征,并且风险评分被证明是 GC 患者的独立预后因素。进一步分析发现,高危组GC患者的预后较低危组差,TMB、临床特征、富集通路、TIDE评分、肿瘤微环境特征等方面存在显着差异。最后,我们使用 qRT-PCR 和 IHC 分析来验证特征基因的 mRNA 和蛋白水平表达。这些发现凸显了 M2 样 TAM 的重要性,为 GC 患者的个体化免疫治疗提供了新的视角。© 2024。 )。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 16
Yong-BoChen,XinYang,...
A prognostic model constructed by ferroptosis-associated genes (FAGs) in papillary renal cell carcinoma (PRCC) and its association with tumor mutation burden (TMB) and immune infiltration.
Cellular & Molecular Immunology
本研究旨在鉴定乳头状肾细胞癌(PRCC)中与预后相关的差异表达铁死亡相关基因(DEFAG)。PRCC患者的简单核苷酸变异、转录组谱和相关临床信息的数据来源于癌症基因组图谱(TCGA)数据库。使用 R 中的“limma”包分析铁死亡相关基因 (FAG) 的表达矩阵,以识别差异表达的 DEFAG。采用 Lasso 回归分析以及单变量和多变量 Cox 比例风险回归来识别独立的预后相关 DEFAG 并制定列线图。此外,我们还检查了潜在的独立生存相关临床危险因素,并比较了高风险和低风险患者组之间的免疫细胞浸润和肿瘤突变负荷 (TMB) 差异。对 321 名患者的队列进行了分析,揭示了 12 个 FAG 显着影响总体风险PRCC 患者的生存期 (OS)。其中,两个 mRNA(GCLC、HSBP1)作为独立的预后相关 DEFAG 出现。吸烟状况、肿瘤分期和风险评分被确定为 PRCC 的独立临床危险因素。此外,在高风险组和低风险组之间观察到免疫细胞浸润和功能的显着差异。 GCLC和HSBP1与各种免疫细胞和功能、TMB和免疫逃避相关。这一发现揭示了PRCC中两个独立的与预后相关的DEFAG,并建立了稳健的预后模型,为该疾病的管理提供了潜在的治疗靶点和有希望的见解。 © 2024。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 16
FrançoisFerriere,Fre...
Natural glyceollin soybean extracts elicited with Aspergillus sojae reduce estrogen-dependent breast cancer growth in orally fed mice.
Cellular & Molecular Immunology
先前的研究已经证明这些分子在乳腺癌细胞中具有抗雌激素和抗增殖作用。值得注意的是,我们报道了纯合成甘油蛋白 I 和 II 通过多种途径发挥作用,包括 ERα、FOXM1、AhR 和 HIF 途径,抑制细胞增殖和迁移。在这项研究中,通过与酱油曲霉进行固体发酵获得的粗大豆提取物中富含的甘油蛋白,在体内对植入鸡蛋绒毛尿囊膜中的MCF-7乳腺癌细胞和切除卵巢的裸鼠进行了体内潜在抗肿瘤活性的研究。第一项试验显示,用天然提取物处理的 MCF-7 细胞的迁移显着减少。然而,天然提取物显着降低了口服喂养裸鼠移植肿瘤的雌激素依赖性生长。我们的结果表明,天然大豆提取物轻微但显着地减少了口服喂养的裸鼠移植肿瘤的雌激素依赖性生长。 Ki-67 和组蛋白 H3S10 磷酸化 (H3S10P) 的免疫组织化学证实了这些结果,表明在饲喂发酵提取物的小鼠的移植肿瘤中,这些增殖标记物的表达较低。此外,与对照动物相比,我们观察到血管生成标记物(例如 CD31 和 CD34)的表达较低。令人惊讶的是,移植的 MCF-7 细胞的 RNA 转录组分析显示没有差异基因表达。这些结果可能表明口服天然甘油蛋白在全身发挥生物效应,间接减少肿瘤血管生成,从而减少肿瘤体积。总体而言,我们的结果表明,从大豆中提取的成分甘油蛋白在预防和治疗乳腺癌方面具有潜在的治疗应用。© 2024 作者。 《食品科学杂志》由 Wiley periodicals LLC 代表食品技术专家协会出版。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Aug 16
JunmingHe,DonglinChe...
A single-cell analysis of the NK-cell landscape reveals that dietary restriction boosts NK cell antitumor immunity via Eomesdermin.
Cellular & Molecular Immunology
肿瘤细胞的异常代谢是肿瘤治疗的潜在靶点。在这方面,饮食限制(DR)或其与抗癌药物的组合受到关注,因为它可以阻止肿瘤细胞的生长。除了对肿瘤细胞的作用外,DR还通过调节免疫细胞发挥限制肿瘤生长的外在作用。自然杀伤(NK)细胞是参与肿瘤免疫监视的先天免疫细胞。然而,DR是否可以协助NK细胞控制肿瘤生长仍不确定。在此,我们证明 DR 有效抑制黑色素瘤细胞向肺部的转移。与此相一致的是,在缺乏 NK 细胞的小鼠中,DR 诱导的肿瘤消退最小。单细胞 RNA 测序分析表明,DR 富集了 CD27 CD11b NK 细胞的再生亚群。从机制上讲,DR 激活了涉及转录因子 Eomesodermin (Eomes) 的调节网络,这对于 NK 细胞的发育至关重要。首先,DR通过优化mTORC1信号传导促进Eomes的表达。 Eomes 的上调通过抵消 T-bet 和下游 Zeb2 的表达来恢复功能性 CD27 CD11b NK 细胞亚群。此外,DR 通过增加 Eomes 对染色质的可及性来增强 NK 细胞的功能和趋化性,从而导致粘附分子和趋化因子的表达升高。因此,我们得出结论,DR 疗法通过非肿瘤自主机制增强肿瘤免疫,包括促进 NK 细胞肿瘤免疫监视和激活。
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CANCER
2024 Aug 16
MackenzieWSullivan,S...
Factors associated with an inconclusive result from commercial homologous recombination deficiency testing in ovarian cancer.
CANCER
同源重组缺陷 (HRD) 测试用于确定聚 ADP-核糖聚合酶抑制剂对上皮性卵巢癌且无种系/体细胞 BRCA1/2 改变的患者的适用性。 Myriad MyChoice CDx 报告基因组不稳定性评分 (GIS),以量化 HRD 水平,阳性评分定义为 ≥42。作者试图定义与获得不确定的 HRD 测试结果相关的因素。GIS 是在其机构中检索的 2020 年 4 月至 2023 年 8 月期间接受 HRD 测试、无种系/体细胞 BRCA1/2 有害改变的上皮性卵巢癌患者。临床数据为从医疗记录中提取。在确定的 477 份 HRD 测试结果中,57 份 (12%) 没有结论。高级别浆液性卵巢癌的 GIS 高于其他组织学类型(中位数 29 比 21,p < .001)。大多数 HRD 病例的组织学级别为高级别浆液性;没有透明细胞或子宫内膜样组织学病例 HRD 阳性。在单变量分析中,间隔时间与初次细胞减灭术、其他标本来源与手术标本以及化疗暴露是不确定 HRD 测试的危险因素。在多变量分析中,化疗暴露和组织来源与不确定的测试结果相关,手术标本比其他来源(活检、细胞学等)更有可能产生结论性结果。年龄、分期、自我报告的种族和组织学与不确定的结果无关。与其他来源的上皮性卵巢癌组织采集相比,手术组织更有可能产生结论性的 HRD 测试结果。如果可行,在开始新辅助化疗前进行腹腔镜活检可能会增加获得可解释的 HRD 测试结果的可能性。© 2024 美国癌症协会。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 16
LauraMBartos,Stefani...
Remote Neuroinflammation in Newly Diagnosed Glioblastoma Correlates with Unfavorable Clinical Outcome.
Brain Structure & Function
目前的治疗策略在治疗胶质母细胞瘤(成人最常见的原发性脑肿瘤)方面仍然只取得了有限的成功。除了肿瘤微环境的特征之外,还描述了胶质母细胞瘤患者大脑的整体变化。然而,原发肿瘤部位远处神经炎症的影响和分子特征尚未完全阐明。我们对新诊断的胶质母细胞瘤 (n=41)、WHO 2 级星形细胞瘤 (n= 7) 和健康对照 (n=20) 并比较非病变(即对侧)半球的 TSPO-PET 信号。使用同源 SB28 胶质母细胞瘤小鼠的回译来表征细胞水平上的 PET 改变。最终,多重基因表达分析用于分析远程大脑中的免疫细胞。我们的研究显示,与健康对照相比,新诊断的胶质母细胞瘤患者对侧半球的 TSPO-PET 信号升高。对侧 TSPO 与持续癫痫发作和较短的总生存期相关,与肿瘤表型无关。对同基因胶质母细胞瘤小鼠的反向翻译确定了骨髓细胞是对侧 TSPO-PET 信号增加的主要来源,并确定了一种复杂的免疫特征,其特征是远处大脑区域的骨髓细胞激活和免疫抑制。可以用 TSPO- 检测对侧半球内的神经炎症。 PET 成像与新诊断的胶质母细胞瘤患者的不良预后相关。远程神经炎症的分子特征促进了对有害全脑炎症患者的免疫调节策略的评估,如高 TSPO 表达所反映的那样。
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Brain Structure & Function
2024 Aug 16
MichaelHellwig,Patri...
Dietary glycation compounds - implications for human health.
Brain Structure & Function
术语“糖化化合物”包括多种结构多样的化合物,这些化合物是通过美拉德反应(还原糖和氨基酸之间的化学反应)内源性和在食物中形成的。内源产生的糖化化合物被认为会导致一系列疾病。这导致了这样的假设:食物中存在的糖化化合物也可能造成不利影响,从而对人类健康构成营养风险。在这项工作中,德国研究基金会 (DFG) 参议院食品安全委员会 (SKLM) 总结​​了有关糖化化合物的形成、发生、暴露和毒性的数据(A 部分),并系统地评估了膳食摄入特定糖化化合物之间的潜在关联和疾病,包括过敏、糖尿病、心血管和肾脏疾病、肠道/胃毒性、大脑/认知障碍和癌症(B 部分)。在 Pubmed (Medline)、Scopus 和 Web of Science 中使用定义单个糖基化化合物和与食品、营养和饮食主题领域相关的相关疾病模式的关键词组合进行系统检索,检索到了与研究问题相关的 253 篇原始出版物。其中,只有 192 种被发现符合先前定义的质量标准,因此被认为适合评估膳食糖化化合物的潜在健康风险。然而,对于本次评估中考虑的每项不利健康影响,仅确定了有限数量的人类、动物和体外研究。虽然由于队列规模小、研究持续时间短和混杂因素,对人类的研究往往受到限制,但允许控制接触单个糖化化合物的动物实验研究为糖耐量受损、胰岛素抵抗、心血管影响和肾损伤提供了一些证据。对口服二羰基化合物的反应,尽管剂量水平远远超过估计的人体暴露量。整个数据库通常不一致或不确定。根据这项系统评价,SKLM 得出的结论是,目前没有令人信服的证据表明饮食中糖化化合物的摄入与不良健康影响之间存在因果关系。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2024 Jul 30
DongDi,ChenchengZhan...
Mechanism of Yishen Chuchan decoction intervention of Parkinson's disease based on network pharmacology and experimental verification.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
帕金森病(PD)的发病率随着年龄的增长而迅速上升。随着全球老龄化的到来,PD患者数量随着老年人口的增加而不断增加,特别是在中国。此前,我们根据临床经验发现益肾除颤汤(YCD)具有缓解症状、延缓病情进展、控制PD发展的潜力。然而,其潜在机制仍有待探讨。本研究通过网络药理学和实验验证的系统方法,探讨了YCD在缓解PD方面可能的治疗效果,旨在为中医治疗PD提供新的认识。 YCD的化学结构和性质取自中药系统药理学数据库(TCMSP)、SwissADME、PubChem和PubMed。使用 Swiss Target Prediction、GeneCard、PubChem 和 UniProt 确定了 YCD 和 PD 的潜在目标。草药成分目标网络是通过 Cytoscape 软件创建的。此外,通过使用STRING数据库,筛选了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。通过Metascape数据库进行基因功能GO和KEGG通路富集分析。制备来自 Sprague-Dawley (SD) 大鼠的 YCD 药物大鼠血清,并用鱼藤酮预处理 SH-SY5Y 细胞以建立 PD 模型。为了检查 YCD 对这些细胞的影响并探索 p38 丝裂原激活蛋白激酶 (MAPK) 途径的机制作用,用血清或 p38 MAPK 途径抑制剂预处理细胞。本研究采用细胞计数试剂盒 (CCK)-8 测定和 Hoechst 33,342 染色来评估 YCD 含药大鼠血清对鱼藤酮处理的 SH-SY5Y 细胞诱导的活力和形态变化。通过流式细胞术评估细胞凋亡。免疫荧光染色评估微管相关蛋白 2 (MAP2) 水平。采用酶联免疫吸附测定(ELISA)来定量炎症介质白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的浓度。此外,还测定了活性氧(ROS)和超氧化物歧化酶(SOD)水平。 Western Blotting 测量了总 p38 MAPK (p-p38) 和磷酸化 p38 MAPK (p-p38) 的表达。本研究鉴定了 YCD 中的 65 种活性成分,这些成分被发现针对 801 个特定基因。通过筛选,从 PD 和 YCD 之间的 172 个重叠靶标中识别出 63 个潜在核心靶标。通过 GO 和 KEGG 分析对这些靶标进行了检查,揭示了它们与 MAPK、PI3K-Akt 信号通路、正向控制蛋白磷酸化和神经退行性疾病通路的显着相关性。 SH-SY5Y细胞用2μM鱼藤酮处理48小时,细胞活力降低至50%,并降低MAP2表达,增加细胞凋亡、氧化应激、炎症和p-p38表达的发生率。 YCD含药大鼠血清显着提高存活率,降低细胞凋亡率,并增加MAP2表达。 YCD 含药血清增加 SOD,减少 ROS,并抑制 IL-6、IL-1β 和 TNF-α 水平,从而抑制鱼藤酮处理的 SH-SY5Y 细胞的氧化应激和炎症。此外,YCD 含药血清显着降低了鱼藤酮诱导的 p-p38 表达。 SB203580是p38 MAPK的特异性抑制剂,还可以抑制p-p38表达、凋亡,恢复细胞形态损伤,改善炎症和氧化应激。YCD在体外增强细胞活力,降低凋亡率、炎症和氧化应激。这些有益作用可能涉及抑制 p38 通路和抑制 p38 MAPK 的磷酸化。© 2024 作者。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2024 Aug 14
CeciliaRomanò,HaoJia...
Chemical synthesis and immunological evaluation of cancer vaccines based on ganglioside antigens and α-galactosylceramide.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
iNKT 细胞通常被称为免疫系统的“瑞士军刀”,已成为癌症疫苗疗法的核心角色。激活iNKT细胞的糖脂,例如α-半乳糖神经酰胺(αGalCer),可以增强针对共同传递的癌症抗原的免疫反应,并已应用于自我辅助抗肿瘤疫苗的设计。在此背景下,这项工作重点是神经节苷脂肿瘤相关碳水化合物抗原(TACA)的化学合成,即 GM3 和 (Neu5Gc)GM3 抗原,它们与 αGalCer 的缀合,以及它们配制到脂质体中作为其体内递送的有效平台。含有 GM3-αGalCer、(Neu5Gc)GM3-αGalCer 和等摩尔量的两种缀合物的脂质体已得到充分表征,并且它们激活 iNKT 细胞的能力已在小鼠和人类细胞测定中得到体外证实。这些候选药物在体内免疫研究中进行了测试,证明其能够诱导 TH1 和 TH2 细胞因子,从而产生 IgG 抗体的所有亚类。值得注意的是,该研究还表明,针对两种 TACA 的血清抗体(单独使用或联合使用)具有交叉反应性。这一发现对未来的疫苗设计产生了影响——即使选择了高度肿瘤选择性抗原,产生的抗体反应也可能比预期更广泛。该期刊版权所有©英国皇家化学学会。
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