放线菌属于革兰氏阳性菌，其遗传物质中的G:C比例较高。其因能产生具有多种用途的生物活性物质以及对极端环境适应能力而备受关注和研究。最近的研究表明，放线菌通过合成抗癌化合物可能在预防和治疗癌症中发挥重要作用。本综述的目的是概括目前对放线菌与不同类型癌症之间联系的认识。本文详述放线菌生物活性化合物具有抗癌性质的多样性，并阐明其作用机制，探讨其在癌症治疗中的潜在应用。此外，本综述重点强调微生物组对癌症的发生和进展的影响，并讨论放线菌在控制微生物组和调控肿瘤微环境方面可能带来的潜在益处，以治愈或预防癌症。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd.

尽管深度神经网络（DNN）在预测癌症药物的疗效方面取得了成功，但其决策过程的缺乏可解释性是一个重要的挑战。以前的研究提出了模仿基因本体结构的方法，以便解释网络中每个神经元的作用。然而，这些以前的方法需要大量的GPU资源，并且限制了其用于基因组广泛模型的拓展。我们开发了SparseGO，一种稀疏可解释的神经网络，用于预测癌细胞系的药物反应以及其作用机制（MoA）。为了确保模型的泛化性，我们在多个数据集上进行了训练，并使用三种交叉验证方案评估了其性能。其高效性使其能够与基因表达一起使用。此外，SparseGO结合了XAI技术（DeepLIFT）和支持向量机，以计算发现药物的作用机制。与其他方法相比，SparseGO的稀疏实现显著减少了GPU内存使用和训练速度，使其能够处理基因表达而不是突变作为输入数据。使用表达来改进SparseGO的准确性并使其能够用于药物重定位。此外，基因表达还可以预测使用265种药物来训练SparseGO的MoA。在parbendazole和PD153035等研究较少的药物上进行了验证。SparseGO是一种有效的XAI方法，用于预测，更重要的是，理解药物反应。由Cancer Research UK [C355/A26819]、AECC科学基金会和Fondazione AIRC资助的Accelerator Award Programme，巴斯克政府基金 (PIBA_2020_1_0055项目) 和Synlethal项目 (RETOS Investigacion, 西班牙政府)。版权所有 © 2023 作者。Elsevier B.V.发表并保留所有权利。

质谱（MS）基于蛋白质组学在各个实验室医学领域中得到日益广泛应用，用于鉴定和定量各种生物样本中的生物分子。MS基于蛋白质组学不断扩展，并广泛应用于早期检测、预后、治疗反应预测和监测的生物标志物发现。此外，使这些先进的测试更具可访问性和经济性将具有最大的医疗卫生效益。本综述文章重点介绍了MS基于临床蛋白质组学在微生物学实验室、癌症研究和代谢紊乱诊断方面创造的新范式。该技术在疾病检测和治疗监测方面优于传统方法，因其多重复杂性能、卓越的分析特异性和敏感性以及低周转时间。尽管在开发和采用一些基于MS的临床蛋白质组学实践方面取得了成就，但预计在不久的将来将有更多的实践从实验室过渡到床边。该综述提供了早期试验和近期进展的见解（主要涵盖NCBI数据库的文献），介绍了蛋白质组学在临床实验室中的应用。© 2023年 BioMed Central Ltd.，Springer Nature的一部分。

为评估硝酸阿伦膦酸钠作为治疗实验性牙周炎的局部辅助疗法对接受化疗的雄性大鼠的疗效。将180只雄性大鼠随机分为两组（n = 90），根据系统治疗分为生理盐水溶液（PSS）和5-氟尿嘧啶，并分为三个亚组（n = 30），即无治疗、洗根和平整术以及硝酸阿伦膦酸钠组。实验性牙周炎诱导后7天进行治疗。在诱导后的第14、22和37天收集标本。评估骨槽骨水平、叉骨处骨的百分比、叉骨处无活力骨的百分比、组织病理学特征以及酒石酸酸性磷酸酯酶（TRAP）和骨钙素（OCN）的免疫标记模式。 在未进行治疗的情况下，5-氟尿嘧啶组中的牙槽骨最少，无活力骨最多。在接受5-氟尿嘧啶治疗并接受牙周治疗的动物中，与单纯洗根和平整术相比，辅助应用硝酸阿伦膦酸钠导致叉骨处骨的百分比更高，并导致牙槽骨丢失更严重。使用硝酸阿伦膦酸钠时，无论是否进行系统治疗，牙周组织的结构和细胞密度模式均更好。在未进行治疗的情况下，TRAP表达量更高。在存在5-氟尿嘧啶的情况下，硝酸阿伦膦酸钠对骨钙素的免疫标记模式没有影响。 局部使用硝酸阿伦膦酸钠作为辅助疗法，可以防止在接受抗癌化疗药物5-氟尿嘧啶的雄性大鼠实验性牙周炎中进行洗根和平整术后的牙槽骨丢失，并改善牙周组织的组织病理学特征。版权所有©2023 Elsevier Ltd. All rights reserved.

佩米曲塞（Pemetrexed）是一种有效的多靶点抗叶酸类药物，对非鳞状非小细胞肺癌（non-Sq NSCLC）和恶性胸膜间皮瘤具有可接受的毒性。维生素B12和叶酸作为预药可以减少佩米曲塞化疗的严重毒性发生频率，然而，不良反应在临床应用中较为常见。本研究旨在鉴定与佩米曲塞化疗的毒性和疗效相关的临床因素和单核苷酸多态性（SNPs）。 本观察性研究于2012年10月至2019年12月进行，我们使用多变量 logistic 回归或 Cox 回归分析评估了佩米曲塞化疗的毒性和疗效。共有106名患者接受了佩米曲塞化疗。我们对4例恶性胸膜间皮瘤患者和67例非鳞状非小细胞肺癌患者进行了SNPs分析。 除去辅助治疗中的4例患者，63例非鳞状非小细胞肺癌患者的中位无进展生存（PFS）和总生存时间分别为6.8和33.3个月。通过倾向性评分调整的多变量Cox分析显示，PFS的有利因素包括酶前叶酸水平≥9.3ng/mL、铂类联合使用、贝伐单抗联合使用、化疗前维生素B12水平<1136pg/mL、BHMT (742 G>A)基因型为A/A或A/G，以及DHFR (680 C>A)基因型为A/A或A/C。有利的预后因素包括良好的身体状况、较低的吸烟指数、身体质量指数≥20.66kg/m2、酶前叶酸水平≥5.55ng/mL、化疗前较高的视黄醇结合蛋白水平，以及MTRR (66 A>G)基因型为A/G。在进行SNPs分析的71名患者中，血液毒性和非血液毒性3-4级的发生率分别为38%和36.6%。通过倾向性评分调整的多变量logistic回归分析显示，血液毒性3-4级的危险因素包括化疗前维生素B12水平<486pg/mL、化疗前白细胞计数<6120/µL、化疗前叶酸水平<15.8ng/mL、降低剂量化疗状态，以及MTHFR (677 C>T)基因型为C/T或T/T。非血液毒性2-4级的危险因素包括化疗前同型半胱氨酸水平≥11.8nmol/mL、化疗前甲状腺激素结合转运蛋白水平<21.5mg/dL、MTHFR (677 C>T)基因型为C/C或T/T，以及SLC19A1 [IVS2 (4935) G>A]基因型为A/A或G/G。 关于叶酸和甲硫氨酸循环的代谢产物和SNPs的信息将有助于预测佩米曲塞的毒性和疗效。本试验于2012年11月20日在大学医院医学信息网络（UMIN000009366）进行了回顾性注册。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

2-羟基戊二酸酯 (2HG) 是三羧酸循环 (TCA) 的副产物，可在健康个体的组织中被快速检测到。2HG以两种旋光异构体的形式存在：S-2HG和R-2HG。在这里，我们探讨了这两种异构体在CD8+T细胞生物学中的差异作用，发现它们对增殖、分化和T细胞功能具有高度差异的影响。我们在这里展示了对可能潜在地解释这些差异效应的特定α-酮戊二酸 (αKG) 依赖酶的结构确定者的分析。用外源的S-2HG处理CD8+T细胞，但不是R-2HG，增加了树突状突触的树突突触形态和增加了抗肿瘤活性。这些数据表明S-2HG和R-2HG应被视为T细胞功能调节中两个独立而重要的角色。 © 2023版权所有 Elsevier Inc. 发行

神经嵴细胞是从神经上皮脱落的多潜能细胞，迁移于胚胎全身。异常的迁移导致发育缺陷。动物模型正在促进我们对神经嵴异常的理解，但现实中的迁移行为却知之甚少。在这里，我们证明小鼠神经嵴细胞在体内表现出基于肌动蛋白的膜足和须足。通过使用神经嵴特异性基因敲除或抑制剂，我们表明丝氨酸/苏氨酸激酶糖原合成酶激酶-3 (GSK3)和细胞骨架调节因子膜足素 (Lpd) 在膜足形成中起到关键作用，同时抑制了焦点粘附的成熟。Lpd是GSK3的底物，Lpd的磷酸化有利于与Scar/WAVE复合物 (膜足形成) 作用，而减少与VASP和Mena的相互作用 (粘附成熟和须足形成)。这对哺乳动物神经嵴迁移中细胞骨架调控的理解对神经嵴异常和癌症具有普遍意义。版权所有 ©2023作者。由Elsevier Inc.发表，保留所有权利。

我们在这里报告了一种新的且简易的方法，用于通过完整细胞合成磷脂@gold纳米花(AuNFs)作为一种新型仿生有机-无机混合材料。这种纳米结构最引人注目的特点是其在近红外(NIR)和可见光谱区域具有双吸收峰，使其成为一种潜在的对活性氧(ROS)诱导的细胞凋亡起反应的光敏剂。与之前的研究相比，这里提出的纳米结构在一个反应过程中使用活细胞膜中存在的磷脂(作为供体细胞)进行合成，并可检测到AuNF形成的微观过程。通过透射电子显微镜(TEM)、FT-IR、31P-NMR和UV-Vis光谱对所得到的AuNFs的性质进行了评估。设计的细胞膜基纳米结构看起来像一个完整的细胞，能够与其他细胞(作为目标细胞)相互作用，并能在近红外照射下产生细胞毒性的单线态氧。生成的ROS在启动程序性细胞死亡(凋亡)和癌症光动力疗法(PDT)的进程中起着关键作用。对乳腺癌MCF-7细胞的细胞实验表明，它们可能作为光动力疗法剂具有有效性。版权所有 © 2023，由Elsevier B.V.出版。

同步多原发癌的发展是头颈部恶性肿瘤患者死亡的主要原因之一。本文报告了一例同步导管内乳头状黏液性癌（IPMC）浸润性病例，该病例同时存在上颌龈癌。一名73岁的女性患者因上颌左侧龈部出现肿块就诊于我院。口内检查发现在左侧上颌后部的牙龈上有一个50 × 25 mm大小的外生性肿瘤，并在细胞学检查中诊断为鳞状细胞癌。18-氟脱氧葡萄糖正电子发射计算机断层显像（18FDG-PET/CT）显示左侧上颌龈、颈部淋巴结和主胰管中有增加的代谢物积聚。胰管肿瘤经食管胃十二指肠镜活检（EGD）并进行病理诊断，结果为IPMC浸润。该患者被诊断为同步的双原发癌，包括cT4aN2bM0级别的上颌龈癌和cT3N0M0级别的IPMC浸润性癌。患者拒绝进行根治治疗，最终于11个月后死亡。18FDG-PET/CT、EGD以及多学科的协作是检测和确定同步双原发癌的治疗策略所必需的。© 2023. BioMed Central公司，Springer Nature子公司。

DNA损伤应答（DDR）信号的持续激活已被证明在癌症化疗失败中发挥重要作用。然而，癌细胞中DDR持续的机制仍不清楚。在本研究中，我们发现编码为CTBP1-DT长链非编码RNA的DDUP微蛋白的表达在顺铂耐药性卵巢癌细胞中大幅增加，并且与顺铂为基础的治疗反应呈负相关。使用患者衍生的人类癌细胞模型，我们观察到DNA损伤引起的DDUP聚焦使RAD18/RAD51C和RAD18/PCNA复合物在DNA损伤位点上持续存在，从而通过双重RAD51C介导的同源重组（HR）和增殖细胞核抗原（PCNA）介导的后复制修复（PRR）机制导致顺铂抗药性。值得注意的是，ATR抑制剂的治疗破坏了DDUP/RAD18的相互作用，并消除了DDUP对延长DNA损伤信号的影响，从而导致卵巢癌细胞在体内对顺铂为基础的治疗产生高敏感性。总的来说，我们的研究揭示了DDUP介导的异常DDR信号与顺铂抗药性的关系，并描述了一种潜在的治疗方案，用于管理铂类耐药性卵巢癌。© 2023年。作者(s)。