氧化应激在癌症恶病质期间骨骼肌萎缩中扮演重要角色，更多的糖酵解肌肉受到优先影响。拮抗序数1/SQSTM1（即p62），特别是在丝氨酸349位点（小鼠为丝氨酸351位点）磷酸化时，竞争性地结合到Kelch样ECH相关蛋白1（Keap1），激活核因子红细胞2相关因子2（Nrf2）。Nrf2然后促进靶基因中抗氧化剂/电子激素应答元件的转录。然而，p62在恶病质中对肌肉消耗保护的潜在作用尚待确定。在这里，我们利用已被广泛接受的Lewis肺癌（LLC）诱导恶病质模型的小鼠中，展示了更氧化和更抗恶病质的腓肠肌较更糖酵解和更易恶病质的伸趾长肌中更高的抗氧化蛋白表达（即NQO1，HO-1，GSTM1，CuZnSOD，MnSOD和EcSOD）。这伴随着腓肠肌中更高的p62（总量和磷酸化）和核Nrf2水平，这与已知磷酸化p62或促进p62磷酸化的蛋白（即NBR1、CK1、PKCδ和TAK1）的表达较高相伴。肌肉特异性p62增益功能（即在p62 mTg小鼠中）激活Nrf2核转位并增加糖酵解肌肉中多种抗氧化蛋白（即CuZnSOD，MnSOD，EcSOD，NQO1和GSTM1）的表达。有趣的是，肌肉Nrf2部分缺陷削弱了大部分这些蛋白（即CuZnSOD，EcSOD和NQO1）的增加，这表明肌肉p62通过其他尚未确定的机制也能刺激抗氧化蛋白的表达。值得注意的是，p62增益功能减轻了LLC受影响小鼠中的糖酵解肌肉萎缩。总的来说，我们的发现确定了骨骼肌p62作为癌症恶病质的潜在治疗靶点。©2023年美国实验生物学会。

相对于膀胱和皮肤等部位，肝脏是免疫特权的场所。为了研究肝癌环境中免疫反应的减弱，我们比较了从肝细胞癌（HCC）和其他六种癌症中获得的适应性免疫受体（IR）重组序列的数量和特征。在这些癌症中，HCC的IR重组序列数量最低，并且是唯一一种具有免疫球蛋白而不是T细胞受体重组序列数量更多的癌症。为了更好地了解肿瘤微环境中获得的适应性IR对HCC病例结果的影响，我们对HCC肿瘤TRB和IGH互补决定区-3（CDR3）氨基酸（AA）序列以及已知的乙型肝炎病毒（HBV）表位之间的化学互补性进行了定量分析。HCC驻留CDR3和三个HBV表位之间的高化学互补性与提高的生存概率相关，这包括了代表不同CDR3恢复算法的两个CDR3来源。这些结果表明CDR3 AA序列有潜力作为HCC患者分层的生物标志物，以及未来治疗方法的指导。© 2023 Wiley Periodicals LLC.

属于α乳头瘤病毒属（α-HPVs）的人乳头瘤病毒（HPV）类型分为与肿瘤发生相关的高危和低危HPVs两类。根据传统风险分类，超过30个α-HPVs未被分类，并且使用L1基因进行系统分类的HPV群组与传统风险分类群组不完全对应。在本研究中，我们提出了一种新的宫颈病变进展风险分类策略。通过四个E6风险可区分的氨基酸（E6-RDAAs），我们成功地扩展了传统分类，使其包括α-HPVs并解决了差异。我们使用来自日本参与者的325个宫颈拭子标本的α-HPV靶向序列数据验证了我们的分类系统。临床结果与E6-RDAA分类显著相关。数据集中没有传统分类的五种HPV类型（HPV30、34、67和69）根据我们的分类标准均为高危。本研究报告利用一种新的风险分类策略揭示了罕见的生殖道HPV类型的致癌性。© 2023 Wiley Periodicals LLC.

患者来源的器官小球在基础科学和向个体化医学以及革命性药物研发方向的转化应用中正日益受到青睐。然而，对于肿瘤小球而言，仍存在器官小球生长率低、肿瘤细胞纯度低的挑战，即构建的小球中肿瘤表型的重现。本文报道了一种微流控液滴封装的方法，为肿瘤细胞的生长和组织结构提供结构指导，使之发展为具有高纯度和高建模成功率的肿瘤小球，与传统的非工程小球建模方法相比，即非工程小球。通过组织学检查，对病人来源的样本进行了建模效力和小球质量的检验，涵盖了食道癌、肺癌和结直肠癌组织，这些都证明在液滴工程小球中有显著的意义。© 2023 UICC。

疟原虫是一种单细胞的细胞内原生动物寄生虫，引起人类疟疾，这是一种致命的媒介传播的传染病。疟疾病理学的一个关键阶段是寄生虫蛋白质，包括分子伴侣和共伴侣等寄生虫外源蛋白质的入侵人类红细胞，导致剧烈的重塑。寄生虫在人体宿主内的生存是由疟原虫热休克蛋白70（PfHsp70）和J域蛋白（PfJDP）介导的，它们作为伴侣和共伴侣合作。已经证明了两个复合物对疟疾的生存和病理具有重要作用：PfHsp70-x-PFE0055c（外源）和PfHsp70-2-PfSec63（内质网）。我们对药物再利用库-大流行响应盒(Pandemic Response Box)进行了虚拟筛选，以识别能够特异性破坏这些伴侣复合物的小分子。确定了五个排名靠前的化合物，相比人体系统具有优先结合亲和力的疟疾伴侣系统：三个PfHsp70-PfJDP结合剂，MBX 1641、zoliflodacin和itraconazole；两个J域结合剂，ezetimibe和苯-二氮杂-酮。通过重复的分子对接和分子动力学模拟验证了这些化合物，结果证实除MBX 1461外，所有化合物均优先结合到疟疾伴侣系统。对PfHsp70-PfJDP结合剂的详细接触分析发现了两种不同类型的调节剂，即潜在抑制复合物形成的化合物（MBX 1461）和潜在稳定复合物的化合物（zoliflodacin和itraconazole）。这些数据表明，zoliflodacin和itraconazole是疟疾系统的潜在新型调节剂。对J域结合剂（ezetimibe和苯-二氮杂-酮）的详细接触分析表明，它们与疟疾J域相比人体系统不仅具有更高的亲和力，而且姿势更佳。这些数据表明，ezetimibe和苯-二氮杂-酮是疟疾伴侣系统的潜在特异性抑制剂。伊曲康唑和依泽替米布均为FDA批准的药物，具有抗疟活性，并最近被重新用于癌症治疗。这是首次发现此类药物般化合物作为PfHsp70-PfJDP复合物的潜在调节剂，并且它们代表了新的候选药物，可进行验证和开发成为抗疟药物。 版权 © 2023 Singh，Almaazmi，Dutta，Keyzers和Blatch。

铜凋亡是一种新型的程序性细胞死亡，与其他类型如易燃凋亡、铁凋亡和自噬有所不同。它是癌症治疗的一个有希望的新靶点。此外，免疫相关基因在癌症进展和患者预后中起着关键作用。因此，我们的研究旨在基于铜凋亡和免疫相关基因为肺腺癌患者构建一个生存预测模型。该模型可以用于提高个体化治疗水平。我们从癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达杂志（GEO）数据库中收集了肺腺癌（LUAD）患者的RNA测序（RNA-seq）数据。通过基因集变异分析（GSVA）确定了GSE68465队列中的免疫细胞浸润水平，并使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定了免疫相关基因（IRGs）。此外，使用无监督聚类鉴定了与铜凋亡相关的基因（CRGs）。进行单变量COX回归分析和最小绝对收缩选择操作（LASSO）回归分析，开发了铜凋亡和免疫相关基因（CIRGs）的风险预测模型，并进行了验证。使用各种算法探索了风险评分与免疫浸润水平之间的关系，并基于单细胞测序对模型基因进行了分析。最后，通过定量实时荧光PCR（qRT-PCR）、免疫组化（IHC）和免疫印迹（WB）确认了特征基因的表达。我们鉴定了5个致癌驱动基因，分别为CD79B、PEBP1、PTK2B、STXBP1和ZNF671，并开发了比例风险回归模型。研究结果表明，在高风险组中，训练集和验证集的生存率显著降低。此外，与低风险组相比，高风险组显示较低的免疫细胞浸润水平和免疫检查点的表达。版权所有 © 2023张、曲、马、李、魏、王、曾、聂、张、尹、周和杨。

目的 探索非凋亡调节性细胞死亡基因（NARCDs）在肺腺癌中的潜在生物学功能，并评估其在肺腺癌中的预后预测价值。方法 从癌症基因组图谱和基因表达图谱数据库中下载肺腺癌的转录组数据。我们使用R软件识别肺腺癌组织与正常组织之间表达差异的NARCDs。采用单变量Cox回归分析和最小绝对收缩和选择算子Cox回归构建NARCDs签名。通过Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征曲线以及单变量和多变量Cox回归分析评估NARCDs签名的预测能力。采用基因集变异分析、Gene Ontology和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes对NARCDs签名进行功能富集分析。此外，分析高和低NARCDs得分组之间的肿瘤突变负荷、肿瘤微环境、肿瘤免疫功能障碍和排斥得分以及化疗药物敏感性的差异。最后，使用STRING和Cytoscape软件构建NARCDs和免疫相关基因的蛋白质相互作用网络。结果我们鉴定了与预后相关的34个表达差异显著的NARCDs，其中16个基因（ATIC、AURKA、CA9、ITGB4、DDIT4、CDK5R1、CAV1、RRM2、GAPDH、SRXN1、NLRC4、GLS2、ADRB2、CX3CL1、GDF15和ADRA1A）被选择用于构建NARCDs签名。NARCDs签名被确定为独立的预后因子（P < 0.001）。功能分析显示高NARCDs得分组和低NARCDs得分组在错配修复，p53信号通路和细胞周期方面存在显著差异（均P < 0.05）。NARCDs低得分组具有较低的肿瘤突变负荷，较高的免疫得分，较高的肿瘤免疫功能障碍和排斥得分以及较低的药物敏感性（均P < 0.05）。此外，NARCDs和免疫相关基因的蛋白质相互作用网络中的10个中心基因（CXCL5、TLR4、JUN、IL6、CCL2、CXCL2、ILA、IFNG、IL33和GAPDH）均为免疫相关基因。结论基于16个基因的NARCDs预后模型是一个独立的预后因子，能够有效预测肺腺癌患者的临床预后，并为临床治疗提供帮助。

前列腺癌（PC）的诊断困难常常导致对PC的过度诊断和过度治疗，这凸显了对新型分子标记的需求。本综述的目的是概述目前用于PC分子标记的细胞代谢组学。我们在PubMed上进行了全面搜索，检索了2004年1月至2022年8月间发表的关于PC检测、发展、侵袭性、复发和治疗反应的生物标记研究。虽然有潜在的研究报道了能够区分良性和癌性前列腺组织的区别性分子存在。但是，关于与疾病发展、治疗反应或肿瘤复发有关的特征分子的研究很少。这些研究大多使用高维数据集，而潜在的代谢产物研究数量经常超过可用样本的数量。鉴于此，预分析、统计学、方法学和混杂因素，如抗雄激素治疗（NAT），也可能与数据集中PC和相关对照样本之间的化学计量多变量差异相关联。尽管存在方法学和程序上的挑战，一系列方法学群体和过程一致地鉴定出一些特征代谢产物和通路，这些产物和通路似乎对PC细胞代谢组学在肿瘤形成和复发中发挥重要作用。

大脑皮层通过一系列精心策划的细胞和分子事件发展，最终产生高度特化的神经元和胶质细胞。在发育过程中，皮层神经元和胶质获得精确的细胞排列和结构，以支持更高级的认知功能。几十年的研究使用啮齿动物模型、自然回脑动物模型、人类病理标本以及最近的人类脑器官模型揭示，啮齿动物重现了人类大脑皮层的一些但不是全部的细胞和分子特征。而啮齿动物的大脑皮层是光滑的或无脑沟的，更大的哺乳动物，包括人类和非人灵长类，具有高度褶皱/回脑皮层，以适应神经元质量的扩展和表面积的增加。一些基因进化出来，用于推动皮质脑沟化，这些基因是通过基因复制或新生产生的，或是通过改变祖先基因或其基因调控区域的结构/功能产生的。主要的脑沟在特定的位置形成，受几个信号通路（如Notch、Fgf、Wnt、PI3K、Shh）的分子"蓝图"的预设，并受胞外基质的影响。影响神经前体细胞增殖和/或神经发生的突变，主要是上层神经元的突变，会扰乱脑沟化过程。下面我们将回顾皮质折叠的分子驱动因素及其在疾病中的作用。

急性骨髓性白血病（AML）是一种异质性疾病，其中治疗反应和患者生存状况高度受白血病生物学影响。本综述的目的在于总结AML分类、风险分层模型、可测量残留疾病（MRD）和越来越多的治疗选择，这些都为AML的精准医学铺平了道路。AML分类和风险分层最近通过纳入与诊断和预测结局相关的新型分子标记进行了更新。此外，共突变模式的影响正在调查中，新方法使用机器学习算法进行个体化风险评估也开始被采用。分子标记在预测非重度治疗反应方面也越来越有用。MRD以其高灵敏度通报治疗反应，允许动态患者风险评估和早期干预。最后，在AML治疗方面取得了重要进展，目前有越来越多的靶向治疗方法问世，并有许多新型治疗方法正在开发中，取得了有前景的早期结果。对AML生物学的进一步理解正在推动改进风险分层和治疗方面的重要进展，以前所未有的速度实现AML的精准医学发展。版权所有 © 2023 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。