人类脂肪来源的干细胞释放的小型细胞外囊泡（sEV），即外泌体，作为将干细胞再生能力传递给受伤细胞以促进创伤愈合的一种手段，其功能日益被认识到。外泌体富含鞯脂和长非编码RNA（lncRNA），例如转移相关的肺腺癌转录本1（MALAT1）。我们在MALAT1中鉴定了潜在的鞯脂应答顺式元件（CRCE）。我们假设CRCE能够响应细胞内的鞯脂水平，以调控外泌体的MALAT1包装。许多细胞内的MALAT1水平超过了编码蛋白基因的水平，而且其在外泌体中的表达同样很高。鞯脂还调节外泌体的合成，但尚未证实通过鞯脂磷脂酶和鞯脂合酶途径对外泌体载体的内容进行调节。我们在收集了培养基后，将ADSC与鞯脂磷脂酶抑制剂GW4869和鞯脂合成的刺激剂C2-和C6-短链鞯脂一起处理，然后从条件培养基中分离出外泌体，并使用外泌体处理人皮肤成纤维细胞（HDF）培养物进行细胞迁移刮痕试验和线粒体应激测试以评估氧耗率（OCR）。通过处理ADSC与GW4869抑制剂处理后，鞯脂磷脂酶的抑制降低了小型EV中MALAT1的水平。使用C2-和C6-鞯脂刺激剂刺激鞯脂合成可以增加细胞和EVs中的MALAT1水平。在将EV施加到HDF中之后，我们评估了sEV MALAT1在HDF中的功能作用。对照组sEV增加了HDF的迁移，并显著增加了ATP产生、基础和最大呼吸的OCR。来自GW4869处理的ADSC的sEV抑制了细胞迁移和最大呼吸。然而，分别从C2-和C6-处理的细胞中获得的sEV在这两个功能上都有所增加，但与对照EV相比，仅在最大呼吸方面显著增加。sEV通常是外泌体，但在ADSC经过GW4869和C6-鞯脂胺处理后，它们变大并被视为微囊泡。鞯脂合成调节了MALAT1外泌体的含量，而鞯脂磷脂酶抑制剂阻断了MALAT1从ADSC外泌体中分泌出来。我们的研究结果与MALAT1增加细胞迁移和线粒体MALAT1改变细胞中最大呼吸有关的报道一致。由于MALAT1对外泌体功能至关重要，因此增加外泌体中的MALAT1应该对创伤愈合有益，正如这些实验所示。视频摘要。© 2023年，《BioMed Central有限公司》，施普林格自然出版集团的一部分。

尽管存在实际的复杂性，人体同位素示踪研究变得越来越可行。然而，在充分利用人体示踪研究之前，需要解决一些技术上的挑战。首先，由于组织切除仅限于单一手术时间点，因此，鼠标中的绝对代谢通量测量并不容易应用于人体模型。其次，同位素示踪尚未被用于在体内检测细胞类型之间的代谢差异。在这里，我们讨论了当前的模型，并提出了一种替代液态肿瘤环境，以克服这些限制。此外，我们还强调了目前用于在细胞分离技术后维持同位素标记富集度的策略，以促进细胞类型特异性分析。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。

新颖的精准医学治疗靶向基因组定义明确的人群。罕见的亚群使得在临床试验或单一实际世界数据(RWD)来源内研究变得具有挑战性，因此可能需要从不同的RWD来源中进行数据汇总以保证可行性。对于汇总数据的异质性评估尤其复杂，当对比汇总的实际世界对照组(rwCC)和单臂临床试验(SAT)时，因为个别比较是不独立的，所有比较都是将rwCC与相同的SAT进行对比。我们的目标是为基于rwCC用例的RWD汇总开发一个方法论框架，并模拟异质性评估的新方法，特别针对小数据集。我们提出了一个包括以下步骤的框架：预先确定、数据集合格性评估和结果分析(包括结果异质性评估)。然后，我们使用标准的元分析方法和修正Cochran's Q检验，以及直接比较来自rwCC的个体参与者数据(IPD)，模拟了一项关于SAT与两个rwCC之间的二进制响应结果的异质性评估。我们发现，调整后的Cochran's Q检验和IPD方法在检测真实差异方面具有相同的统计功效，两种方法均优于标准的Cochran's Q检验。当在SAT与rwCC之间的零差异场景中评估异质性的影响时，统计功效不足导致一类错误的增加。同样，在SAT与rwCC之间存在真实差异的替代场景中，我们发现严重的二类错误，异质性测试缺乏统计功效导致对治疗效果的低估。在设计SAT的rwCC过程中，我们开发了一种汇总RWD来源的方法论框架。在这个过程中进行异质性检验时，调整后的Cochran's Q检验与IPD异质性检验的统计功效相匹配。定量异质性测试在防止一类或二类错误方面的局限性表明，这些测试最好用于描述性，并在基于临床/数据考虑仔细选择数据集后使用。我们希望这些发现能促进严谨地汇总RWD以揭示对肿瘤学患者有益的深刻见解。 © 2023. BioMed Central有限公司，施普林格自然出版集团的一部分。

胃肠道（GI）癌症是一种影响消化器官的恶性肿瘤。在放射治疗期间，放射肿瘤学家必须准确地将X射线束瞄准肿瘤，同时避免影响胃和肠道的未受影响区域。因此，精确的自动化GI图像分割在临床实践中迫切需要。虽然全卷积网络（FCN）和U-Net框架在医学图像分割方面表现出色，但它们对模拟器的长程依赖性建模能力受到了卷积核受限接受域的限制。变形器由于其固有的全局自注意机制具有强大的全局建模能力。TransUnet模型通过混合CNN-transformer编码器发挥了卷积神经网络（CNN）和变形器模型的优势。然而，编码器中的高低级特征串联在融合全局和局部信息方面效果不佳。为了克服这个限制，我们提出了一种创新的基于变形器的医学图像分割架构，称为BiFTransNet，该架构在解码器阶段引入了一个BiFusion模块，通过从各种模块中集成特征，实现了有效的全局和局部特征融合。此外，还引入了多级损失（ML）策略，以监督每个解码器层的学习过程，并优化在不同尺度上使用全球和局部融合的上下文特征。我们的方法在UW-Madison胃肠道分割数据集上获得了89.51%的Dice分数和86.54%的交并比（IoU）分数。此外，我们的方法在Synapse多器官分割数据集上达到了78.77%的Dice分数和27.94%的Hausdorff距离（HD）。与现有技术方法相比，我们提出的方法在胃肠道分割任务中实现了更优越的分割性能。更重要的是，我们的方法可以轻松扩展到CT和MRI等不同模态的医学分割。我们的方法实现了临床多模式医学分割，并为临床放射治疗计划提供决策支持。版权©2023 Elsevier有限公司。保留所有权利。

对于不对[177Lu]Lu-PSMA疗法有反应的晚期转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）患者，有效的治疗选择有限。通过[225Ac]Ac-PSMA获得的临床结果是很有前景的。我们回顾性分析了2018年12月至2022年10月接受[225Ac]Ac-PSMA治疗的患者的疗效。方法：我们评估了23例mCRPC患者（平均年龄70.3±8.8岁）在[177Lu]Lu-PSMA治疗（2-9个疗程）失败后的治疗结果。根据CTCAE 5.0标准评估其安全性。根据前列腺特异性膜抗原PET进展标准和前列腺特异性抗原（PSA）响应（根据前列腺癌工作组2标准）评估第一个[225Ac]Ac-PSMA疗程后的治疗疗效。结果：所有患者均接受了去势治疗，其中22例（96%）和19例（83%）患者分别接受了化疗和二代抗雄激素治疗。其中1例患者接受了4个疗程，2例接受了3个疗程，8例接受了2个疗程，12例接受了1个疗程的[225Ac]Ac-PSMA治疗。疗程间隔的中位数为13周（范围为8-28周）。每个疗程中[225Ac]Ac-PSMA的平均活度为7.6 MBq（范围为6.2-10.0 MBq）。患者处于晚期疾病阶段，肿瘤负担非常高。尽管在[225Ac]Ac-PSMA治疗后，5例患者（26%）表现出最佳的PSA响应，但在11例患者（58%; n = 19）中观察到了至少某种程度的PSA下降。治疗反应经过[68Ga]Ga-PSMA PET/CT成像的患者进行了评估。在第一个疗程后（n = 18），根据前列腺特异性膜抗原PET进展标准，有50%的患者（n = 9）显示疾病进展，疾病控制率计算结果为50%。无进展生存中位数为3.1个月，总生存中位数为7.7个月。有1例患者出现3级血液系统毒性反应，另1例患者出现3级肾毒性。虽然所有患者在治疗前都有口干症状，但腮腺SUVmax减少了33%。结论：我们观察到，即使在完成了其他所有治疗选择的晚期转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）患者中，[225Ac]Ac-PSMA疗法仍安全有效，显示出潜力。© 2023年由核医学与分子影像学学会发表。

在恶性肿瘤中，包括胶质母细胞瘤（GBM）在内，代谢基因的再编程和随后的代谢表型变化广泛发生。FOXM1是一个强有力的转录因子，通过调控许多基因的表达起到致癌作用。作为一个含有SET结构域的蛋白质，SET7是一个蛋白质赖氨酸甲基转移酶，可以对组蛋白蛋白质和其他蛋白质进行单甲基化修饰。组蛋白的表观遗传修饰通过对DNA的启动子进行表观遗传修饰并干预肿瘤发展来调节基因表达。FASN的活化增加了新生脂肪酸（FA）合成，这是癌细胞的一个标志性特征。在这里，我们报告了FOXM1可能直接促进SET7的转录，并激活SET7-H3K4me1-FASN轴，从而维持新生FA合成。© 2023. 细胞死亡和分化协会（ADMC）。

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是一种多因素病症，其病因复杂。随着肥胖症的流行，全球的发病率不断增加，现在被认为是西方国家最常见的肝病。NAFLD的发展和进展机制非常复杂，尚不完全理解。越来越多的研究显示，表观遗传和表观转录组机制的紊乱在多种疾病，包括慢性肝病中起到了致病的作用。本研究对合计903例肝组织样本进行了表观遗传和表观转录组基因表达的综合分析，这些样本分别对应于正常肝脏患者、肥胖患者以及非酒精性脂肪肝（NAFL）和非酒精性脂肪性肝炎（NASH）患者，这些是NAFLD进展的不同阶段。我们以无偏的方式整合了十个转录组数据集，对它们进行了强有力的分析和比较。我们描述了这种疾病过程中表观遗传和表观转录组基因表达的完整情况，发现了与疾病进展、尤其是肝纤维化发展密切相关的基因表达异常特征。其中大部分表观遗传和表观转录组效应因子在人类NAFLD中尚未被描述过，其异常表达可能具有致病意义。我们还对参与表观遗传和表观转录组效应因子底物和辅酶代谢的酶的表达进行了综合分析。本研究提供了关于NAFLD病因的新信息，并可能在指导治疗该病以及其进展到肝细胞癌阶段的药物靶点鉴定方面发挥作用。© 2023. 作者（们）。

T-细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）是一种侵袭性的血液恶性肿瘤，其特点是具有不对称富集的白血病始终细胞（LIC）活性的受限细胞亚群。然而，目前尚不清楚哪些信号通路促进LIC的维持和进展。在本研究中，我们通过综合实验方法来评估生物钟在调控T-ALL中分子机制和信号通路对细胞动力学的影响。该方法包括对shRNA修饰的T-ALL细胞系的基因表达谱分析以及白血病细胞的染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq）。我们还对患者源性异种移植模型细胞亚群进行遗传操作，以评估人源T-ALL中生物钟缺失对LIC活性的调控作用。我们报告，在通过shRNA介导的CLOCK和BMAL1基因敲低破坏昼夜节律时钟电路的情况下，PDX移植入免疫缺陷宿主小鼠后，从PDX获得的LIC的体外生长和体内活性均受到负面影响。此外，基因表达数据与白血病细胞的ChIP-Seq数据显示，生物钟直接促进了关键参与JAK/STAT信号通路的基因（如IL20RB）的表达，使T-ALL细胞对白细胞介素20（IL20）的反应性增强。总之，我们的数据支持生物钟驱动IL20R表达的概念，从而促进JAK/STAT信号通路的激活，并促进T-ALL中的LIC活性。结果表明，有选择性地靶向生物钟组分可能对T-ALL患者的治疗具有重要意义。© 2023年。意大利国家癌症研究所“Regina Elena”。

可测量的残余疾病（MRD）是急性髓系白血病（AML）中的一个重要生物标志物。然而，许多患者无法通过目前的方法检测到MRD。我们通过对115例AML患者和86例对照组进行分析，开发出了一种高灵敏度的细胞外DNA中的5-羟甲基脱氧胞苷（5hmC）特征。5hmC方法检测到了29例MRD阴性患者中的20例，这些患者在多参数流式细胞术中MRD呈阴性，并检测到了14例分子方法中MRD呈阴性的患者中的11例。5hmC方法检测到的MRD与无复发生存率显著相关。这种新方法可在大多数AML患者中使用，并可能对AML患者的管理产生重要影响。© 2023年，Springer Nature旗下的BioMed Central Ltd.

通过将基于质谱的蛋白质组学和磷酸蛋白质组学与基因组学、表观基因组学和转录组学相结合，蛋白组学基因组学提供了癌症的综合分子特征化。利用这种方法，临床蛋白质肿瘤分析联盟（CPTAC）已对10种癌症类型的1000多个原发性肿瘤进行了特征化研究，其中许多肿瘤有相匹配的正常组织。在这里，我们介绍了LinkedOmicsKB，这是一个蛋白组学基因组学数据驱动的知识库，通过约40,000个基于基因、蛋白质、突变和表型的网页，向公众提供了一致处理和系统预计算的CPTAC全癌种蛋白组学数据。可视化技术能够有效地探索和推理复杂互相关联的数据。通过三个案例研究，我们展示了LinkedOmicsKB在提供新的思路方面的实际实用性，包括基因、磷酸化位点、体细胞突变和癌症表型等。LinkedOmicsKB预先计算了19701个编码基因、125969个磷酸化位点和256个基因型和表型的结果，为加速蛋白组学基因组学数据驱动的发现提供了全面的资源，以改善我们对人类癌症的理解和治疗。此论文的透明同行评审过程的记录已包含在附属信息中。版权所有©2023 Elsevier Inc. 保留所有权利。