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GYNECOLOGIC ONCOLOGY
2024 Aug 14
TanyaLRoss,RenhuaNa,...
Are exercise and sitting time during chemotherapy for ovarian cancer associated with treatment-related side-effects, chemotherapy completion and survival?
GYNECOLOGIC ONCOLOGY
为了评估化疗期间的运动和静坐时间是否与化疗副作用、计划化疗的完成和生存相关。我们使用了卵巢癌预后和生活方式 (OPAL) 研究的数据,该研究是一项针对新诊断上皮细胞癌成人的全国性前瞻性队列卵巢癌。在每三个月一次的问卷调查中,我们询问了过去一周的锻炼和静坐时间,以及与治疗相关的副作用。有关治疗、毒性、进展和死亡的详细信息是从病历中提取的。我们分别使用线性、Logistic 和 Cox 回归来评估运动和静坐时间、化疗副作用和完成(相对剂量强度≥85%)和生存之间的关联。 503 名符合条件的参与者被纳入一项或多项分析。参与较高强度运动(每周≥30分钟中等强度运动;24%)的患者报告慢性病/癌症治疗功能评估 (FACIT)-疲劳(32.2 vs. 26.7)和 FACT-试验结果指数显着改善(69.4 vs. 61.7) 分数,并且与最少锻炼者 (<每周 30 分钟中等强度运动
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GYNECOLOGIC ONCOLOGY
2024 Aug 14
ChristinaAMetcalf,Ch...
Treating new-onset cognitive complaints after risk-reducing salpingo-oophorectomy: A randomized controlled crossover trial of lisdexamfetamine.
GYNECOLOGIC ONCOLOGY
旨在确定精神兴奋剂赖右苯丙胺是否可以改善接受过降低风险输卵管卵巢切除术并报告新发执行功能困难的癌症遗传风险女性的认知功能的主观和客观测量。 69 名参与者被分配到一项随机对照交叉试验对活性药物(赖右苯丙胺)和安慰剂进行为期 6 周的试验,并在意向治疗框架中间隔至少 2 周的冲洗(临床试验注册号:NCT03187353)。在试验基线、中点和终点,参与者完成了执行功能的自我报告测量(布朗注意力缺陷障碍量表)。在研究基线和试验终点,参与者完成了持续注意力、注意力/工作记忆和言语学习/记忆认知任务。每个试验在第 2、3、4 和 6 周时评估副作用。从试验基线到试验终点,与安慰剂相比,赖右苯丙胺显着提高了自我报告布朗注意力缺陷障碍量表的总分(以及四项得分)五个子域)以及注意力和工作记忆性能。与安慰剂相比,更多参与者认可赖右苯丙胺试验中的副作用;然而,试验完成率相似,表明赖右苯丙胺仍然具有良好的耐受性。赖右苯丙胺改善了注意力和工作记忆的主观和客观测量,并且可以为在降低风险的输卵管卵巢切除术后经历认知困难的女性提供替代治疗选择。版权© 2024。由爱思唯尔公司出版。
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GYNECOLOGIC ONCOLOGY
2024 Aug 14
CharlotteRGamble,Yon...
Neighborhood economic vulnerability as a predictor for patterns of care and outcomes for patients with uterine cancer.
GYNECOLOGIC ONCOLOGY
量化社区社会经济脆弱性的影响,因为它与子宫癌治疗和生存方面的种族差异有关。这项回顾性队列研究纳入了 2004 年至 2017 年在纽约州接受子宫切除术的诊断为子宫癌的患者。计算了通过区域剥夺指数量化的社区社会经济脆弱性。主要结局是遵循指南治疗;次要结果是 5 年总生存率。最终队列中共有 34,356 名患者。居住在弱势社区与接受适当辅助化疗(59.7% vs. 75.7%,aRR = 0.81;95% CI,0.77-0.86)和及时手术(63.7% vs. 74.5%,aRR = 0.85;95% CI,0.77-0.86)和及时手术的可能性相关。 95% CI,0.82-0.87)。与富裕社区相比,居住在弱势社区的人的全因死亡率高 24%(aHR = 1.24;95% CI,1.16-1.32)。黑人/白人 5 年总生存率的最大种族差异出现在最富裕的社区,为 18.6%,其中白人患者的生存率为 79.8%,黑人患者的生存率为 61.2%(aHR 1.31;95% CI 1.14-1.51)。对于晚期疾病患者来说,这种差异是由于白人患者的生存率随着社区富裕程度的增加而提高,但黑人患者的生存率没有变化。在控制年龄、合并症、保险、肿瘤组织学、分期和等级的调整分析中,纽约市最富裕社区的差距仍然最大(aHR = 1.59;95%CI 1.26-1.2.01)。社区社会经济脆弱性与此相关子宫癌患者的预后较差。最大的黑人/白人生存差距出现在最富裕的社区。社区富裕程度可能不会影响晚期子宫内膜癌黑人患者的生存。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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GENOME RESEARCH
2024 Aug 15
MatthewVJWiens,Hosse...
Benchmarking bulk and single-cell variant calling approaches on Chromium scRNA-seq and scATAC-seq libraries.
GENOME RESEARCH
scRNA-seq 和 scATAC-seq 等单细胞测序方法已成为研究组织组成的广泛且有效的工具。越来越多的变体调用者被应用于这些方法来解决样本的遗传异质性,特别是在检测肿瘤的克隆结构的情况下。通常,传统的批量 DNA 变体识别器应用于单细胞文库的合并读数以检测候选突变。最近,多项研究已将此类调用程序应用于单个细胞的读取,其中一些研究指出能够以更高的灵敏度检测罕见变异。许多研究将这两种方法应用于 Chromium (10x Genomics) scRNA-seq 和 scATAC-seq 方法。然而,与现有的单细胞方法相比,基于 Chromium 的文库可能会给变体调用带来额外的挑战,从而引发对从此类工作流程中获得的变体的有效性的质疑。为了确定 Chromium scRNA-seq 和 scATAC-seq 文库的各种变体调用方法的优点和挑战,我们使用具有匹配的批量全基因组测序的样本文库来评估调用者的性能。我们审查了调用程序的性能,发现应用于池读取的批量调用程序的性能明显优于单个单元方法。我们还评估了 scRNA-seq 和 scATAC-seq 方法独特的变体,发现噪声模式,同时也发现了 RNA 编辑事件的潜在捕获。最后,我们回顾了单细胞水平的变异检出可以检测罕见体细胞变异的概念,提供的经验结果表明在单细胞 Chromium 文库中解决此类变异是不可行的。由冷泉港实验室出版社出版。
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ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
2024 Aug 14
YuYan,ZiyeYang,Liqun...
High-quality models for assessing the effects of environmental pollutants on the nervous system: 3D brain organoids.
ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
环境问题的普遍存在以及人类暴露于环境污染物的风险日益增加已成为全球关注的问题。日益严重的环境污染是近年来大多数神经相关疾病发病率上升的主要原因之一。然而,直接人类研究的伦理约束和动物模型的种族限制减缓了该领域的研究进展。本研究的目的是利用脑类器官作为新模型,综述不同环境污染物对大脑的神经毒性,并得出结论:脑类器官可能在评估环境污染物影响神经发生和引起神经发病的机制中发挥关键作用。为了准确确定环境污染物对神经系统的负面影响,与发育中的大脑高度相似的自组织大脑类器官已成为研究环境污染物对人类大脑发育和疾病影响的新模型系统。本研究以脑类器官为模型,总结了不同环境污染物对神经系统的神经毒性,包括脑类器官的结构变化、神经元分化和迁移的抑制、线粒体功能的损伤、细胞纤毛的损伤以及对信号通路的影响。总之,接触环境污染物可能对神经系统造成不同程度的神经毒性。因此,了解如何利用脑类器官改善环境污染引起的神经系统疾病至关重要。版权所有 © 2024 The Authors。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Jul 15
OliviaDavis,CarmenLe...
Impact of Primary Disease Site of Involvement by Early-Stage Follicular Lymphoma on Patient Outcomes.
Disease Models & Mechanisms
滤泡性淋巴瘤是一种常见的非霍奇金淋巴瘤,可以始于全身多种组织。虽然大多数患者可能能够在这种疾病中生存多年,但治愈仍然非常困难。我们试图使用大型国家数据库来研究早期疾病中滤泡性淋巴瘤原发部位对患者结果的影响。基线从 NCI 监测、流行病学和最终结果 (SEER) 数据库中确定并提取了 2000 年至 2015 年诊断为滤泡性淋巴瘤的患者的人口统计和疾病数据。原发疾病部位分为两组之一:淋巴结疾病(淋巴结和脾脏)和结外疾病(其他所有疾病)。使用汇总统计、Kaplan-Meier 方法和 Cox 比例风险模型进行单变量和多变量分析。最终分析共纳入 13,400 名患者,大多数为非西班牙裔白人 (81%),分期I (63%) 和结节 FL (79%)。淋巴结疾病的中位总生存期为 15.1 年 [95% CI (14.6-15.6)],而结外疾病的中位总生存期为 15.8 年 [95% CI (14.9-16.3)]。结外疾病患者的总生存率稍好一些 [HR = 0.89,95% CI (0.84-0.96); p 值 = 0.00012]。在控制年龄和种族后,这一发现仍然一致[HR = 0.84,95% CI (0.79-0.90); p 值 <0.0001]。早期滤泡性淋巴瘤的主要受累部位可能会对患者的治疗结果产生影响,需要进一步调查。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 15
XiaonaLiu,RuiGuo,Don...
Homotypic cell-in-cell structure as a novel prognostic predictor in non-small cell lung cancer and frequently localized at the invasive front.
Disease Models & Mechanisms
同型细胞内结构(hoCIC)与肿瘤增殖、侵袭和转移相关,被认为是多种癌症的有前景的预后标志物。然而,hoCIC 在非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的作用仍不清楚。肿瘤组织切片取自 411 名 NSCLC 患者。我们分析了临床病理学变量与 HOCIC 数量之间的关系。采用 LASSO 和多变量 Cox 回归分析来确定 NSCLC 的预后因素。使用 Kaplan-Meier 曲线和对数秩检验评估 hoCIC 对总生存期 (OS) 和无病生存期 (DFS) 的影响。使用 C 指数、时间相关曲线下面积 (AUC)、净重分类改进 (NRI)、综合辨别改进 (IDI)、校准曲线和决策曲线分析 (DCA) 开发和验证 OS 和 DFS 的预后模型。在队列中,56% 的患者患有 HOCIC,而 44% 的患者没有。值得注意的是,hoCIC 主要发现于肿瘤侵袭前沿。男性、吸烟、鳞状细胞癌、低分化、肿瘤大小 ≥ 3 cm、TNM分期晚期、淋巴结转移、胸膜侵犯、血管侵犯、坏死、P53突变、Ki-67高表达被确定为相对危险因素对于 HOCIC。此外,hoCIC 被发现是 OS 和 DFS 的重要预后因素,hoCIC 频率越高,预后越差。我们基于 hoCIC 构建了用于预测 1 年、3 年和 5 年 OS 和 DFS 的列线图,校准曲线显示预测结果与实际结果之间具有良好的一致性。 C指数、时间依赖性AUC、NRI、IDI和DCA分析的结果表明,将hoCIC纳入预后模型显着增强了其预测能力和临床适用性。 HoCIC 表明 NSCLC 患者的 OS 和 DFS 具有独立的预测价值。此外,hoCIC 在肿瘤侵袭前沿的频繁定位表明 hoCIC 与肿瘤侵袭和转移之间存在很强的关联。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024
AtsuyaMorita,MizuhoN...
An In Vivo Metastasis Model Using Genotype-Defined Tumor Organoids.
Disease Models & Mechanisms
最近的癌症基因组分析发现了经常突变的基因,这些基因导致癌症(包括结直肠癌(CRC))的发生和恶性进展。我们之前构建了携带 CRC 主要驱动突变的小鼠模型,即 Apc、Kras、Tgfbr2、Trp53 和 Fbxw7 的组合。对模型的综合组织学分析显示突变组合与恶性表型(例如侵袭、上皮间质转化(EMT)和转移)之间存在联系。癌症相关死亡的主要原因是转移,因此了解转移的机制对于开发新的治疗策略非常重要。为此,我们建立了来自不同基因型小鼠的肠道肿瘤来源的类器官,并通过将类器官移植到脾脏中生成肝转移模型。通过对移植模型的组织学和影像学分析,我们确定Apc、Kras、Tgfbr2和Trp53突变的组合促进肝转移的高发生率。我们还通过模型分析证明了由遗传和表型不同的细胞组成的肿瘤细胞簇的多克隆转移。这些类器官移植模型再现了人类结直肠癌转移,作为临床前模型构成了基础和临床癌症研究的有用工具。我们在此报告类器官培养和转移模型生成的实验方案。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 的一部分)的独家许可。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 16
ErinJAielloBowles,Co...
Endocrine therapy initiation among women diagnosed with ductal carcinoma in situ from 2001 to 2018.
Disease Models & Mechanisms
20 年前发表的试验表明他莫昔芬对患有导管原位癌 (DCIS) 的女性有益;但随后内分泌治疗的采用率较低。我们估计了 2001 年至 2018 年间社区环境中患有 DCIS 的女性开始内分泌治疗的情况,反映了比之前的研究更近几年的诊断结果。该回顾性队列包括 2001 年至 2018 年间诊断出首次原发性 DCIS 的 20 岁成年女性,并随访至 2019 年,并加入了美国三个综合医疗保健系统之一。我们从 DCIS 诊断后 12 个月内的电子药房记录中收集了内分泌治疗配药(他莫昔芬、芳香酶抑制剂 [AI])的数据。使用具有对数关联和泊松分布的广义线性模型,我们根据患者、肿瘤(包括雌激素受体 [ER] 状态)和治疗特征估计了随时间变化的内分泌治疗起始率。在 2020 名患有 DCIS 的女性中,有 587 名 (29%)诊断后 12 个月内开始内分泌治疗(1208 名 ER 阳性 DCIS 女性中的 36%)。在使用内分泌治疗的女性中,506 名 (86%) 开始使用他莫昔芬,81 名 (14%) 开始使用 AI。 2001 年至 2017 年间,开始接受年龄调整内分泌治疗的比例从 34% 下降至 21%; 2015 年至 2018 年间,人工智能的使用率从 8% 增加到 35%。不太可能开始内分泌治疗的女性为 ER 阴性或具有临界/未知或无 ER 测试结果、诊断时≥65 岁、黑人且未接受放射治疗。 三分之一的诊断为 DCIS 的女性开始内分泌治疗,并且使用量减少随着时间的推移。了解为什么适合接受内分泌治疗的女性不开始治疗对于最大限度地提高 DCIS 诊断后的无病生存率非常重要。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 的一部分)的独家许可。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 16
EiriniTrichia,FionaM...
Associations of fruit intake with adiposity and cardiometabolic biomarkers in UK Biobank.
Disease Models & Mechanisms
食用水果与降低心血管疾病(CVD)风险有关,但其潜在机制尚不清楚。我们调查了水果摄入量与肥胖、血压、血脂、低度炎症、血糖和氧化应激标志物的横向和前瞻性关联。主要分析包括来自英国生物银行的 365 534 名中年成年人的基线数据,其中 11 510 名和 38 988 名患者分别参加了第一次和第二次随访,基线时没有 CVD 和癌症。使用问卷评估基线时的水果消费频率。我们评估了水果与肥胖(体重指数、腰围和体脂百分比)、收缩压和舒张压、血脂(低密度和高密度脂蛋白、甘油三酯和载脂蛋白 B)、血糖的横向和前瞻性关联(血红蛋白 A1c)、低度炎症(C 反应蛋白)和氧化应激(γ-谷氨酰转移酶),使用根据社会经济和生活方式因素进行调整的线性回归模型。在一个子集中重复分析,进行两到五次完整的 24 小时饮食评估 (n = 26 596),以便调整总能量摄入量。基线时的水果摄入量通常与基线时的肥胖和生物标志物呈弱负相关。除了与舒张压、C 反应蛋白、γ-谷氨酰转移酶和肥胖呈负相关外,大多数这些关系在随访中并未持续存在。然而,对于大多数机制而言,在进一步调整的模型中,高水果摄入量和低水果摄入量(> 3 份与 < 1 份/天)之间的平均水平变化小于 0.1 标准差 (SD)(而所有这些模型的差异均为 < 0.2 SD) )。例如,第一次随访时,与低水果摄入量相比,高水果摄入量时的腰围和舒张压分别降低了 1 厘米和 1 毫米汞柱(95% 置信区间:分别为 -1.8、-0.1 和 -1.8、-0.3)。 24 小时饮食评估子集的分析显示出总体相似的关联。我们观察到,水果摄入量高的人和水果摄入量低的人在肥胖和心脏代谢生物标志物方面存在非常小的差异,其中大多数在随访期间并没有持续存在。未来对其他机制的研究和对混杂因素的详细评估可能会进一步阐明水果与心血管疾病的相关性。© 2024。作者。
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