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Microbiology Spectrum
2023 Aug 23

IgnacioGrafia,Marian...
Epidemiology and risk factors for recurrence in biliary source bloodstream infection episodes in oncological patients.
Microbiology Spectrum
我们旨在描述肿瘤患者中胆源性血流感染(BSIs)的特征和结果。其次,我们分析了复发BSI发作的危险因素。我们对肿瘤患者中的所有胆源性BSIs发作进行了前瞻性收集(2008-2019年)和回顾性分析,并进行了 logistic 回归分析。我们制定了一个规则将患者分成复发胆源性BSI风险群。共记录了291名肿瘤患者中400个胆源性BSIs。最常见的致病菌是大肠埃希氏菌(42%)和克雷伯菌(27%),其中86个(21.5%)是由多重耐药的革兰氏阴性杆菌(MDR-GNB)引起的。多重耐药的革兰氏阴性杆菌的比例随时间增加。总体上,73名患者发展了118次复发性BSI发作。复发性BSI发作的独立危险因素包括先前的抗生素治疗(OR 3.781,95% CI 1.906-7.503),胆道支架(OR 2.232,95% CI 1.157-4.305),因可疑胆源性感染导致的先前入院(OR 4.409,95% CI 2.338-8.311)和由MDR-GNB引起的BSI发作(OR 2.857,95% CI 1.389-5.874)。利用这些变量,我们生成了一个得分,用于预测复发性胆源性BSI,接受者操作特性(ROC)曲线下面积为0.819。在23.8%的患者中使用了不合适的经验性抗生素治疗(IEAT),30天死亡率为19.5%。总结起来,肿瘤患者中的胆源性BSI主要由革兰氏阴性杆菌引起,其中多重耐药率高且逐渐增加,不合适的经验性抗生素治疗和高死亡率。复发性BSI发作频繁。我们开发了一个简单的得分来识别复发发作,以有可能制定预防策略。重要性:本研究显示肿瘤患者中的胆源性血流感染(BSIs)主要由革兰氏阴性杆菌(GNB)引起,多重耐药率高且逐渐增加。重要的是,复发性胆源性BSI发作非常频繁,并与化疗延误、不合适的经验性抗生素治疗率高以及30天死亡率(19.5%)相关。利用与复发BSI发作相关的变量,我们生成了一个高准确性的得分,用于预测复发性胆源性BSI发作。该得分可用于制定预防策略,降低复发发作和相关病死率与发病率的风险。
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Annals of Clinical and Translational Neurology
2023 Aug 23

SamirAbu-Rumeileh,Lo...
Plasma β-synuclein, GFAP, and neurofilaments in patients with malignant gliomas undergoing surgical and adjuvant therapy.
Annals of Clinical and Translational Neurology
我们分析了33例进行手术和辅助治疗的恶性胶质瘤患者的血浆β-前突索质蛋白(β-前突索质蛋白),胶质纤维酸性蛋白(GFAP)和神经丝蛋白(NfL和NfH)的长期浓度和预后作用。与其他肿瘤病例相比,胶质母细胞瘤患者的GFAP和NfL水平升高。β-前突索质蛋白,NfL和NfH在手术后增加,而GFAP在长期随访中减少。β-前突索质蛋白和神经丝蛋白浓度受手术和/或放疗方案的影响。GFAP和神经丝蛋白水平与生存率显著相关。恶性胶质瘤类型的血浆神经元和星形胶质生物标志物在手术和辅助治疗后显示出不同的变化轨迹。 © 2023 The Authors. Annals of Clinical and Translational Neurology由Wiley Periodicals LLC代表美国神经学协会出版。
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Frontiers in Endocrinology
2023

WeiXu,TianxiaoJiang,...
GADD45B regulates the carcinogenesis process of chronic atrophic gastritis and the metabolic pathways of gastric cancer.
Frontiers in Endocrinology
胃癌仍然是全球健康领域面临的重大挑战,其负担仍然很大。胃癌(GC)的发展与慢性萎缩性胃炎(CAG)密切相关,然而目前对于CAG诱导癌变的潜在机制的研究还十分有限。本研究通过整体转录组和单细胞转录组数据,对CAG中的致癌基因进行了全面的研究。我们采用hdWGCNA方法,将非萎缩性胃炎(NAG)作为对照组,鉴定了特异于CAG的致病基因。此外,我们比较了CAG与GC,在单细胞转录组分析中,将正常胃组织作为对照组。通过对已鉴定的致病基因进行交集分析,我们通过蛋白质相互作用网络分析,确定了关键的网络分子。为了进一步筛选基因,我们采用了LASSO、SVM-RFE和RF技术,得到了与CAG相关的一组癌症相关基因(CRGs)。为了识别与胃癌进展有关的CRGs,我们对基因集进行了单变量COX回归分析。随后,我们探讨了CRGs与胃癌患者的免疫浸润、药物敏感性和临床特征之间的关系。我们采用GSVA方法研究了CRGs如何调节胃癌细胞信号通路,而细胞间通信的分析揭示了CRGs对胃癌肿瘤微环境内的信号传递的影响。最后,我们分析了胃癌进展过程中代谢途径的变化。
使用hdWGCNA,我们共鉴定到了143个CAG和GC共有的致病基因。为了进一步研究其潜在机制,我们进行了蛋白质相互作用网络分析,并采用了机器学习筛选技术。结果,我们确定了15个与慢性萎缩性胃炎有特定关联的致癌基因。通过ROC再分析和预后分析,我们确定GADD45B是参与CAG癌变最显著的基因。免疫组织化学染色和差异分析揭示,GADD45B在GC组织中表达较低,而在正常胃组织中表达较高。此外,根据预后分析,GADD45B的高表达与GC患者的不良预后呈相关性。此外,免疫浸润分析显示GADD45B与多种免疫细胞浸润有关。通过将GADD45B与临床特征相关,我们发现它主要影响GC的浸润深度。通过细胞间通信分析,我们发现CD99信号通路网络和CDH信号通路网络是慢性萎缩性胃炎发展过程中显著改变胃组织微环境的主要通信途径。具体而言,GADD45B低表达的GC细胞主要参与CDH信号通路的网络通信,而GADD45B高表达的GC细胞在两个信号通路中起着至关重要的作用。此外,我们还发现了几个代谢途径,包括D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢以及N-糖基生物合成等,这些途径在胃癌的发生和进展中发挥重要作用,除此之外还有六个其他代谢途径。
总之,我们的研究重点发现了CAG和GC共有的143个致病基因,并特别关注了与CAG相关的15个致癌基因。我们确定了GADD45B是慢性萎缩性胃炎癌变中最重要的基因,其在GC组织中与正常胃组织呈差异表达。此外,GADD45B的表达与患者预后相关,并与免疫细胞浸润有关。我们的研究还强调了CD99和CDH信号通路网络在CAG发展过程中对胃组织微环境的影响。此外,我们还确定了在GC进展过程中所涉及的关键代谢途径。GADD45B作为与慢性萎缩性胃炎相关的致癌基因,在胃癌的发展中起着关键的作用。GADD45B的表达下降与GC的发生有关。此外,GADD45B的表达水平与GC患者的不良预后密切相关,影响了肿瘤微环境中各种细胞的浸润模式,并影响了胃癌进展中的代谢途径。
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Frontiers in Immunology
2023

BogacAybey,ShengZhao...
Immune cell type signature discovery and random forest classification for analysis of single cell gene expression datasets.
Frontiers in Immunology
强大的免疫细胞基因表达特征是单细胞研究分析的核心。几乎所有已知的免疫细胞特征集都是利用单基因表达数据集得出的。利用多个集成数据集的能力可能会产生高质量的免疫细胞特征集,这可用作基于机器学习的细胞类型分类方法的优质输入。我们建立了一种基于基因对基因表达相似性的新工作流程,用于发现免疫细胞类型特征。该工作流程利用了多个数据集,包括来自六种不同癌症类型的七个单细胞表达数据集,并得到了十一个免疫细胞类型特异性基因表达特征。我们使用这些特征集来训练适用于单细胞RNA-seq数据集的随机森林分类器进行免疫细胞类型分配。与常用的细胞类型分配方法相比,在独立基准数据集上,我们获得了类似或更好的预测结果。我们的基因特征集在基于随机森林的细胞类型分类中比其他已发表的免疫细胞类型基因集具有更高的预测得分。我们进一步通过重新分析已发表的IFN刺激实验来展示了我们方法如何帮助避免下游统计分析中的偏差。我们展示了我们免疫细胞特征的质量以及它们在基于随机森林的细胞分类方法中的优秀表现。我们认为基于我们相对简洁的基因集进行细胞分类,并结合随机森林方法,不仅与广泛使用的发表方法相匹配或超越,还使得对细胞类型之间差异基因表达的下游统计分析能够涵盖更多基因。与以前的细胞分类算法相比。版权所有 © 2023 Aybey,Zhao,Brors和Staub。
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Frontiers in Immunology
2023

You-WeiWang,Jia-Chen...
Post-translational modifications and immune responses in liver cancer.
Frontiers in Immunology
翻译摘要:
翻译如下:
后转录修饰(PTM)是指将功能基团共价连接到蛋白底物上,导致结构和功能的改变。 PTM不仅调节肝癌的发展和进展,还在癌症免疫反应中扮演关键角色。癌症免疫包括先天和适应性免疫对肿瘤抗原、肿瘤细胞和肿瘤微环境进行综合监视的努力。越来越多的证据表明,利用免疫系统抗击癌症的潜力的免疫疗法可以有效地改善癌症患者的预后并延长生存时间。本综述全面总结了在肝癌免疫监视中与磷酸化、泛素化、SUMO化和糖基化等关键PTM之间的当前认识。此外,本文还着重介绍了与这些修饰相关的潜在治疗肝癌免疫疗法反应增强的靶点。版权所有©2023年王、左、陈和李。
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Arthritis & Rheumatology
2023 Aug 23

JoshuaLeisring,Serge...
The Clinical Evaluation and Management of Thrombotic Microangiopathy.
Arthritis & Rheumatology
血栓性微血管病(TMA)指的是一组具有临床和组织病理特征的多种疾病。临床上,TMA的特征是微血管性溶血性贫血(MAHA),消耗性血小板减少症和器官损伤,这是由于内皮损伤和血管阻塞引起的。有几种不同的疾病状态以不同的病理生理机制表现为TMA。这些情况与重要的发病率和死亡率相关,并需要迅速的识别和治疗。血栓性血小板减少性紫癜性肾病(TTP)和溶血性尿毒症综合征(HUS)通常被认为是TMA的原发性形式,但TMA更常与其他并发症如感染、妊娠、自身免疫性疾病或恶性高血压等共存。由于疾病特异性检测的有限可用性,决定TMA的原因是一项具有诊断挑战的任务。然而,确定潜在病因是至关重要的,因为治疗策略有所不同。我们对导致TMA的疾病的认识不断发展。最新的进展已经提高了我们对推动TMA的各种不同病因机制的理解。有针对性的治疗方法的开发已经显著改善了患者的预后。在本文中,我们回顾了不同TMA引发疾病的发病机制和临床特征。我们概述了诊断和治疗的实际方法,并讨论经验性和疾病特异性治疗策略。本文受版权保护。版权所有。本文受版权保护。版权所有。
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Chinese Medicine
2023 Aug 22

JingmingZhuang,Jiaha...
Mechanisms of Xiaozheng decoction for anti-bladder cancer effects via affecting the GSK3β/β-catenin signaling pathways: a network pharmacology-directed experimental investigation.
Chinese Medicine
小郑汤与术后膀胱内灌注相结合已被证明能改善膀胱癌患者的预后并预防复发。然而,这种中草药配方的疗效机制仍不清楚。本研究旨在利用基于网络药理学的实验,识别小郑汤的重要成分,并探究其抗膀胱癌作用和机制。从传统中药(TCM)数据库收集了小郑汤中每种草药的化学成分。采用网络药理学预测作用的靶蛋白和途径。利用疾病数据库识别与膀胱癌相关的靶基因。构建蛋白质相互作用(PPI)网络来说明与相交靶蛋白的相互作用。使用基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析确定关键靶标。在分子对接预测后建立了一个化合物-靶标-途径网络。通过超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC-qTOF-MS)确定的核心化学成分进行了膀胱癌细胞系的体外实验,以验证网络药理学的结论。提取了45种活性化合物,并描述了它们与传统中药(TCMs)和蛋白靶标的关系,包括7种草药、45种活性成分和557个蛋白靶标。潜在TCM靶基因与膀胱癌相关基因的交集得到322个基因。GO和KEGG分析表明这些靶标可能参与许多与癌症相关的途径。分子对接结果显示,除mandenol外,候选化合物可以与受体形成稳定的构象。对三种膀胱癌细胞系进行的体外实验表明,槲皮素和另外两种引人注目的新化合物——低甲氧基姜黄素和葛它酮,通过B细胞淋巴瘤2/Bcl-2相关X(Bcl-2/BAX)途径显著促进癌细胞凋亡,并通过糖原合酶激酶3β(GSK3β)/β-连环蛋白途径抑制增殖和迁移。通过应用网络药理学和进行体外实验,初步阐明了小郑汤对抗膀胱癌的机制,确定了其主要活性成分和靶标,为未来研究提供了科学依据。© 2023. 国际中国医学学会和BioMed Central有限公司。
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Protein & Cell
2023 Aug 23

YuWang,HaihongHu,Lus...
Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling for Prediction of 5-FU Pharmacokinetics in Cancer Patients with Hepatic Impairment After 5-FU and Capecitabine Administration.
Protein & Cell
5-氟尿嘧啶(5-FU)及其前药卡培他滨是常用的抗肿瘤药物。本研究旨在建立卡培他滨代谢物和5-FU代谢物的生理药动学(PBPK)模型,描述肝损伤癌症患者的肿瘤和血浆中的药物动力学。以PK-Sim®和MoBi®软件为基础,开发了包括癌症区域的模型,并通过25个口服卡培他滨和18个静脉注射5-FU的癌症患者研究的R编程语言进行评估。大多数模拟的Cmax和AUClast值在观察值的两倍误差范围内,成功地构建了PBPK模型。模拟结果显示,在肝功能损伤的癌症患者中,口服卡培他滨后,肿瘤中5-FU的Cmax和AUClast的变化分别为1.956和3.676,而静脉注射5-FU后未观察到显著变化。此外,肿瘤组织中的5-FU浓度随着肿瘤灌注而增加,但与肿瘤大小无关。敏感性分析显示,二氢嘧啶脱氢酶(DPD)和其他代谢酶的活性、卡培他滨在肠道的渗透性和血浆蛋白比例因子在肿瘤和血浆5-FU药动学中起着重要作用。PBPK模型的预测结果表明,肝功能损伤的癌症患者无需调整卡培他滨或5-FU的剂量,但在观察到毒性反应时会有所减少。此外,对于5-FU在肿瘤中的浓度,血流速率而非肿瘤大小至关重要。总之,这些模型可以预测不同场景中具有不同特征的癌症患者肿瘤中5-FU的药代动力学。© 2023. 作者(名)在Springer Science+Business Media, LLC,隶属于Springer Nature的独家许可下发表。
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Food & Function
2023 Aug 23

WaleedElsayedKhedr,M...
Silver and gold nanoparticles: Eco-friendly synthesis, antibiofilm, antiviral, and anticancer bioactivities.
Food & Function
本研究首次采用经济实惠和环保的方法,利用棉籽饼和牛乳酵母提取物对银纳米颗粒(AgNPs)和金纳米颗粒(AuNPs)进行了绿色合成。通过UV-Vis光谱、动态光散射分析(DLS)、透射电子显微镜(TEM)、选择区域电子衍射(SAED)和傅里叶变换红外光谱(FTIR)对生物合成的纳米颗粒进行了表征。此外,还对生物合成的纳米颗粒进行了对负性细菌(大肠杆菌、奇异变形杆菌、克雷伯氏菌、沙门氏菌和铜绿假单胞菌)、金黄色葡萄球菌以及抗人类腺病毒第5型(HAdV-5)和HepG2肝细胞癌细胞的体外生物膜形成和抗癌活性测试。银纳米颗粒和金纳米颗粒的UV-Vis吸收光谱在440nm和540nm处出现了最大吸光度。DLS测量结果表明,银纳米颗粒和金纳米颗粒的最高强度分别为84nm和73.9nm。FTIR测量确定了棉籽饼和牛乳酵母提取物中有一些功能性基团能够将银离子和金离子还原为金属银和金。通过TEM和SAED图案分析,确认了银纳米颗粒和金纳米颗粒的形态和粒径。生物合成的银纳米颗粒和金纳米颗粒对大肠杆菌、奇异变形杆菌、克雷伯氏菌、沙门氏菌、铜绿假单胞菌和金黄色葡萄球菌所产生的生物膜具有良好的抑制作用。此外,它们对人类肝癌细胞(HepG-2)的抗癌活性和抗人腺病毒第5型感染的抗病毒活性也有一定作用。最后,本研究结果对纳米生物技术、制药和食品包装领域具有非常显著的价值,可以通过开发环保和经济的多功能纳米颗粒来开发抗菌和/或抗癌药物。
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Aesthetic Surgery Journal
2023 Aug 23

PilSeonEo,HyunbinKim...
Robotic-Assisted Latissimus Dorsi Flap Harvest in Partial Breast Reconstruction: Comparison With Endoscopic and Conventional Approaches.
Aesthetic Surgery Journal
广泛应用于乳房重建的背阔肌肌瓣,已经引入了几种方法。为了比较使用背阔肌肌瓣经部分乳房切除的机器人辅助乳房重建与传统和内窥镜辅助技术的结果。本前瞻性单中心研究纳入了2020年3月至2021年12月接受背阔肌肌瓣部分乳房切除和乳房重建的韩国女性乳腺癌患者。比较了常规、内窥镜辅助和机器人辅助技术的手术结果以及患者满意度。共有57名患者纳入该研究,其中20例接受常规重建,17例和20例接受内窥镜和机器人手术。三种方法在术后麻醉药物剂量(p = 0.459)、住院期间(p = 0.225)和住院期间供体部位引流总量的平均值(p = 0.175)方面无显著差异。在手术后特别是供体部位疤痕的患者满意度方面,常规方法与其他两种技术相比显示出明显较低的评分。背阔肌肌瓣经部分乳房切除后的机器人辅助乳房重建显示出较高的患者满意度,超过常规开放方法。考虑到机器人手术比内窥镜技术更方便,机器人手术有可能成为常规开放手术或内窥镜手术的良好替代选择。© 作者 2023. 版权由牛津大学出版社代表美容学会所有。保留所有权利。有关许可,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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