致癌基因引起的DNA复制压力（RS）和由此导致的致病性R-loop形成已知会阻碍S期进展。然而，在这种高压力条件下，癌细胞通过尚未完全理解的机制持续增殖。在这里，我们报道了在许多类型的癌症中高度表达的牛磺酸上调基因1（TUG1）长非编码RNA（lncRNA）作为癌细胞内在R-loop的重要调节因子。在RS条件下，TUG1通过激活ATR-CHK1信号通路迅速上调表达，与RPA和DHX9相互作用，并解决特定位点的R-loop，特别是在CA重复微卫星位点。TUG1的耗竭导致过多的R-loop积累和增强的RS，从而显著抑制肿瘤生长。我们的数据揭示了TUG1作为解决癌细胞中R-loop积累的重要分子的作用，并且建议以TUG1为靶点的治疗方法作为癌症治疗的有效途径。© 2023. 作者。

RNA结合蛋白Musashi1（MSI1）在多种癌症中显示出增加的表达水平，并已被引入为某些恶性肿瘤的预后标志物。预期如果该基因编码某些miRNA，则其可能在癌症发展中发挥作用或可被视为预后生物标志物。因此，在本研究中，我们旨在发现MSI1基因内部错位区域中的新的miRNA（s）。在这里，我们报道了两个在MSI1基因的第四个错位区域内的新的miRNA，命名为MSM2和MSM3，这些miRNA是在生物信息学研究中预测的多个miRNA前体中选出的。实验分析中，相应的前体miRNA被转染到HEK293T细胞中，并检测到了成熟miRNA的外源表达。其中两个成熟miRNA，即MSM3-3p和MSM3-5p是由MSM3前体生成的，而MSM2-5p是来自于MSM2。此外，MCF-7和SH-SY5Y细胞系中检测到了MSM2-5p和MSM3-3p的内源表达。这两个成熟miRNA的表达也在乳腺癌的临床样本中检测到。此外，通过双荧光素酶报告试验，证实了MSM3-3p与PDE11A的3'UTR区域之间的相互作用。总的来说，我们的数据证明了在乳腺癌细胞中MSI1基因编码了两个新的miRNA。© 2023. Springer Nature Limited.

癌症抑制基因 BRCA1 相关蛋白-1（BAP1）是一种被认可的抑制肿瘤基因。胚系 BAP1 的致病/可能致病等位基因变异与多种肿瘤的易感性相关，包括葡萄膜黑素瘤、恶性胸膜和腹膜间皮瘤、肾细胞癌以及特定的非恶性皮肤肿瘤，作为常染色体显性的 BAP1-肿瘤易感综合征的一部分。BAP1 携带者发展至少一个 BAP1-相关肿瘤的终身风险高达 85%，尽管由于收集偏差的存在，当前的风险估计很可能被高估了。关于许多罕见的癌症易感综合征一样，目前对于监测的实用性科学证据有限，因此，对于 BAP1 携带者的管理建议基于专家意见。迄今为止，欧洲关于 BAP1 携带者的建议尚未发表，但由于这种新近描述的综合征的出现表型和通过大型基因面板或肿瘤测序发现的 BAP1 携带者数量增加，这种建议是必需的。为此，英国 CanGene-CanVar 项目的临床指南工作小组邀请了欧洲合作者合作，制定了在欧洲范围内协调监测计划的指南。在核心小组和扩展专家小组（包括遗传学家、眼科学家、肿瘤学家、皮肤科医生和病理学家等34位欧洲专家）完成文献综述和 Delphi 调查后，我们获得了与 BAP1 检测和监测相关的建议。同时，我们也认识到这些基本以证据为依据但务实的建议将随着来自研究合作的进一步数据不断演变，以完善对表型谱和监测结果的认识。©2023. 作者。

癌症治疗抵抗是由肿瘤内存在各种类型的细胞和异质性引起的。肿瘤细胞与细胞-微环境的相互作用在肿瘤的进展和侵袭中起着重要作用，这对于诊断和耐药化疗有重要意义。在本研究中，我们开发了3D生物印刷的体外模型，模拟了由共培养细胞在具有控制结构的水凝胶基质中分布的乳腺癌肿瘤微环境的模型。我们假设肿瘤可以通过癌细胞负载的共培养水凝胶构造来表示，而其微环境可以在能产生化学梯度的微流控芯片中进行建模。乳腺癌细胞（MCF7和MDA-MB-231）和非肿瘤性乳腺上皮细胞（MCF10A）被嵌入藻酸盐-明胶水凝胶中，并使用多头挤出生物印刷机进行印刷。我们的方法能够对共培养系统中的细胞的位置和排列进行精确控制，使得能够设计各种肿瘤结构。我们创建了具有两种不同类型细胞的样本，这些细胞在特定的初始位置上被精确控制着每种细胞类型的密度。这些细胞要么是随机混合的，要么是按顺序分层放置以创建细胞异质性。为了研究细胞对化学诱导的迁移，我们在一间带有逐渐化学梯度的腔室中开发了一个化学微环境。作为一个概念验证，我们使用这个装置研究了在不同比例的MCF10A细胞存在下，MDA-MB-231细胞对上皮生长因子梯度的不同迁移模式。我们的方法结合了3D生物印刷和微流体设备，可以创建多样的肿瘤结构，这些结构代表了不同患者中的肿瘤。这提供了一个优秀的工具，用于以高空间和时间分辨率研究癌细胞的行为。© 2023 Springer Nature Limited.

TROAP与trophinin和bystin相互作用，在胚胎着床过程中发挥关键作用。在有丝分裂过程中，TROAP对纺锤体组装和中心体完整性至关重要。已有研究表明，TROAP在多种癌症中促进肿瘤发生。我们进行了这项研究，评估TROAP在非小细胞肺癌中的生物学和临床意义。收集了48对肺腺癌（LUAD）组织和癌旁组织。通过RT-qPCR、Western blot和免疫组化分析，检测了LUAD细胞系和对照细胞系中TROAP的RNA和蛋白质表达。构建了TROAP沉默和过表达载体，并转染到肺癌细胞中。使用CCK-8、Transwell和划痕愈合实验评估了细胞的生存能力、迁移和侵袭能力。通过Western blot确定了PI3K/AKT和EMT信号通路以及METTL3的表达情况。我们发现TROAP在非小细胞肺癌组织和细胞系中富集。相比于对照组，在非小细胞肺癌中，TROAP沉默抑制了细胞的增殖、迁移和侵袭。机制分析表明，TROAP激活了PI3K/AKT和EMT信号通路。在一定程度上，TROAP受METTL3的调节。总之，TROAP通过PI3K/AKT和EMT信号通路促进了非小细胞肺癌的进展，并且TROAP可能被视为非小细胞肺癌治疗的一个新靶点。© 2023版权归作者独家许可Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature所有。

英格诺苏斯链球菌（AGS）是口腔中的机会性人体病原微生物。乙溶血亚组的链球菌咽腺炎链球菌亚种分泌链球溶素S（SLS），不仅具有溶血活性，还对培养的人类细胞株具有细胞毒性。然而，SLS的详细作用机制和宿主细胞的细胞反应尚未完全阐明。为了确定产生SLS的乙溶血咽腺炎链球菌亚种的致病潜力，调查了对人类口腔鳞状细胞癌细胞HSC-2诱导SLS-依赖反应的能力，以确定产生SLS的乙溶血咽腺炎链球菌亚种的致病潜力。研究发现，在与产生SLS的乙溶血咽腺炎链球菌亚种的培养上清液共孵育的HSC-2细胞中，Ca2+内流以及早期生长反应（EGR）和活化蛋白-1（AP-1）等转录因子的即刻早期基因（IEG）表达显著增加。此外，这种SLS依赖性的表达增加在除jun外，通过Ca2+螯合显著抑制。这些结果表明，SLS引起细胞内Ca2+内流，随之大大增强IEG编码转录因子的表达。本研究的结果有助于了解产生SLS的AGS的致病性。 ©2023. Springer Nature Limited.

反应不佳的多发性骨髓瘤患者（MM）的预后比原发反应者更差，在这个人群中缺乏有效的治疗方法。然而，现代治疗时代初次耐药疾病的预后尚未进行研究。我们回顾了在我院接受三联/四联疗法治疗的MM患者，以评估初次耐药疾病的发生率和拯救性治疗对此人群的影响。我们共鉴定了1127名患者，其中1086名患者在进行了4至6个疗程后进行了血液学反应评价。在这些患者中，93.3％（1013名）显示出治疗反应，而6.7％（73名）患者患有初次耐药疾病。初次耐药疾病的患者中，中位总生存期（OS）为51.3个月，单变量和多变量分析中，患者存活期缩短的风险增加（危险比[HR]，3.5 [95%置信区间（CI），2.5-4.9]，HR，4.3 [95% CI，2.6-6.9]）。在初次耐药疾病患者的亚组分析中，接受二线自体干细胞移植（ASCT）的患者与未接受ASCT的患者相比，具有较长的二次无进展生存期（20.9 vs 8.1个月；P < .01）和二次OS（74.7 vs 31.3个月；P = .02）。我们得出结论，在当前时代，早期进展仍是影响较短OS的重要因素，并且对于这一人群，拯救性ASCT可能是最有益的选择。

作为生物学和医学领域的科学家，您精通英语和简体中文。请将以下段落准确地翻译成简体中文，符合学术论文的语言模式，并保持原文陈述结构： 作为细胞代谢的关键细胞器，线粒体常常在形态、组分和功能上对各种环境压力和细胞需求做出适应性变化。以往的线粒体研究逐渐从关注形态变化分析发展到系统的多组学研究，从而揭示了细胞之间或单个细胞内线粒体群体之间的线粒体变异。线粒体变异的现象被定义为线粒体异质性。此外，已经报道线粒体异质性影响各种生理过程，包括组织稳态、组织修复、免疫调节和肿瘤进展。在此，我们全面综述了不同组织在病理状态下的线粒体异质性，涉及线粒体DNA、RNA、蛋白质和脂质组分的变异特征。然后，总结了导致线粒体异质性的机制，如线粒体基因组的突变和线粒体蛋白的导入导致线粒体DNA和蛋白质组分的异质性。此外，我们还探索了多个角度，以更好地理解细胞之间线粒体异质性的奥秘。最后，我们总结了针对线粒体异质性的潜在治疗方法，包括减轻线粒体氧化损伤、减少线粒体碳负荷和增强线粒体生物合成以缓解各种病理状态。最近在靶向线粒体基因编辑方面的技术进展的可能性也进行了讨论。© 2023. 华西医院，四川大学。

免疫检查点抑制剂（ICIs）在结直肠癌（CRC）患者的某一子集中诱导持久的临床反应。然而，对ICIs的不满意反应率和缺乏适当的生物标志物来选择适合进行ICIs治疗的患者，对于当前免疫疗法构成了一个重大挑战。与癌症免疫应答密切相关的炎症相关分子A20，对“吞噬我”信号和免疫疗法效果的影响尚不清楚。我们发现，在体外和体内，A20的下调显著改善了CRC的抗肿瘤免疫应答和PD-1抑制剂的疗效。CRC组织中A20表达较高与免疫细胞浸润，包括CD3（+），CD8（+）T细胞和巨噬细胞的数量减少相关，并且预后较差。通过增加和减少A20功能研究证明，A20能够通过上调STC1（stanniocalcin 1）蛋白，与CRT（calreticulin）结合并滞留在线粒体上，从而减少细胞膜上“吞噬我”信号分子CRT的转位。机械上，A20抑制了糖原合成酶激酶3β（GSK3β）对STC1蛋白在Thr86位点的磷酸化，从而降低了STC1蛋白的降解速率。我们的发现揭示了炎症分子A20和CRC中“吞噬我”信号之间的新的相互作用，可能成为选择能够从ICI疗法中获益最多的CRC患者的新型预测生物标志物。 ©2023. 四川大学华西医院。

艾滋病相关定义和非艾滋病相关癌症（ADC/NADC）使艾滋病毒感染者（PLHIV）易患严重疾病。本多中心研究旨在调查ADC和NADC对ICU接收的PLHIV的预后影响。研究组纳入了法国12所大学附属ICU在2015年至2020年期间所有接收的PLHIV。通过logistic回归和潜在独立变量的向后消除，测量ADC和NADC对住院期间的病死率（主要研究终点）的影响。分析ADC/NADC与住院期间治疗限制决策（次要研究终点）之间的关联。比较出院时存活的患者在指数住院期间的一年病死率（探索性研究终点），以明确ADC、NADC或无癌症之间的差异。在纳入的939例PLHIV中（中位年龄52 [43-59]岁；74.4%接受合并抗逆转录病毒治疗），97例（10.3%）有活动性NADC（主要为肺和肠道肿瘤），106例（11.3%）有活动性ADC（主要为艾滋病定义的非霍奇金淋巴瘤）。初次入院是常见情况，这些亚组中的大多数入院因细菌性败血症和非感染性肿瘤相关并发症而发生。没有癌症患者的医院病死率为12.4%，ADC患者为30.2%，NADC患者为45.4%（P<0.0001）。经过重要性和脆弱性标记的调整之后，NADC（调整后的比值比[aOR]，7.00；95%置信区间[CI]，4.07-12.05）和ADC（aOR，3.11；95% CI 1.76-5.51）与住院期间死亡独立相关。没有癌症患者的TLD患病率为8.0%，ADC患者为17.9%，NADC患者为33.0%（P<0.0001）-在癌症患者中，器官功能衰竭和非肿瘤性合并症较少被考虑。在指数住院期间存活的患者中，无癌症患者的一年病死率为7.8%，ADC患者为17.0%，NADC患者为33.3%（P<0.0001）。NADC和ADC的患病率相等，成为TLD的主要依据，并且在需要接受ICU治疗的PLHIV当前人群中强烈预示住院期间死亡。© 2023. La Société de Réanimation de Langue Francaise = 法国重症监护协会（SRLF）。