Myc是在各种组织中驱动肿瘤发生的最为知名的致癌基因之一。从大脑到血液，其失调破坏了细胞正常功能的生理途径。Myc的作用是在基因表达水平上进行的，Myc基本上控制了转录的各个方面。事实上，除了作为一个经典的、与染色质结合的转录因子外，Myc还控制了RNA聚合酶II（RNAPII）的转录暂停释放、延伸和终止以及mRNA的帽子化。因此，明显的是，对Myc功能的最小干扰会导致恶性细胞行为，并且大量的文献主要关注Myc的功能失调。在健康细胞中，Myc控制着与细胞周期（及其增殖）、细胞凋亡、新陈代谢和细胞大小、血管生成、分化和干细胞自我更新等关键功能有关的分子机制。在这个后一方面，研究老化和再生医学领域中一个热门话题的组织再生中，Myc还被发现参与其调节。事实上，Myc似乎在伤口愈合、周围神经、肝脏、胰腺甚至心脏的恢复中起着作用。在这里，我们讨论了Myc在组织再生中的作用的最新研究现状，概述了其除了癌症以外的强大作用。

癌症是一种复杂而致命的健康问题，其特征是形成潜在恶性肿瘤或癌细胞。这些细胞与其环境之间的动态相互作用对疾病至关重要。数学模型可以增进我们对这些相互作用的理解，帮助我们预测疾病进展和治疗策略。在本研究中，我们为肺癌特别开发了一个分数肿瘤-免疫相互作用模型（FTIIM-LC）。我们介绍了与Caputo算子相关的一些定义和重要结果。我们采用广义拉盖尔多项式（GLPs）方法找到了FTIIM-LC模型的最优解。然后，我们进行了数值模拟，并将我们的方法的结果与其他技术和真实数据进行了比较。在本文中，我们提出了一个FTIIM-LC模型。所提出模型的近似解是利用一组新的多项式，即GLPs，进行扩展得到的。为了简化过程，我们整合了拉格朗日乘子、GLPs以及分数和普通导数的运算矩阵。我们进行了数值模拟，研究了不同分数阶的影响，并达到了预期的理论结果。本研究的发现表明，所使用的优化方法能够有效地预测和分析复杂现象。这种创新方法还可以应用于其他非线性微分方程，如分数Klein-Gordon方程、分数扩散-波动方程、乳腺癌模型和分数最优控制问题。© 2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature的一部分。

空间分辨代谢组学能够在原位研究肿瘤代谢物。肿瘤的间质和内质异质性是与患者预后密切相关的关键因素。肾上腺皮质癌（ACC）是一种非常罕见的肿瘤，与存活率较低有关。其临床预后具有高度变异性，但至今我们尚未了解肿瘤代谢异质性的贡献。对肿瘤异质性的深入理解需要通过基于分子特征的肿瘤亚群体的鉴定来评估与肿瘤侵袭性相关的情况。本研究使用高质量质谱成像（MALDI傅里叶变换离子回旋共振质谱成像）的空间代谢组学，通过代谢物亚群体的全新发现和Simpson多样性指数来评估代谢异质性。在72名ACC患者中鉴定出肿瘤亚群体后，我们还与25个正常肾上腺皮质组织切片进行了比较，以鉴定它们的共同和独特的代谢亚群体。我们观察到ACC肿瘤的异质性变异性，并发现高代谢异质性与较差的临床预后有关。此外，我们还鉴定出了作为独立预后因素的肿瘤亚群体，并发现了4种相关的抗癌药物作用途径。我们的研究可能有助于全面了解ACC中肿瘤亚群体的生物学意义，并表明代谢异质性可能会影响化疗。

CD8+ T细胞可以识别由HLA-I类分子展示的肿瘤抗原，并消灭肿瘤细胞。尽管其肿瘤突变负担较低，但免疫检查点阻断（ICB）常对肾细胞癌（RCC）患者有益。在这项利用蛋白质组基因组方法的研究中，我们直接且全面地探索了RCC组织中的HLA-I类呈递肽组，并证明其中含有一小部分来源于人内源性逆转录病毒（hERV）的肽段。肿瘤组织与正常肾组织的比较揭示了肿瘤相关的hERV抗原，其中一个抗原具有免疫原性，并被宿主肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）所识别。hERV抗原的刺激可在健康供体来源的外周血单个核细胞（PBMC）中诱导活化的CD8+ T细胞。这些结果突显了针对hERV3895抗原的抗肿瘤CD8+ T细胞监视存在，并暗示其在RCC患者中的临床应用。

生物药物在癌症治疗中至关重要，因为它们能够刺激人体的自然免疫反应来对抗癌症，但它们价格昂贵。生物类似物相对于专利生物药物来说更加经济实惠，但必须验证它们与创新药物一样有效。生物类似物的特征和可替代性评估需要大量的数据点来进行验证。本研究提出了通过开发和绿色评估正交测试方案和纯度指示法来对两种新的贝伐单抗（BVZ）生物类似物进行质量评估，其中包括凝胶过滤（SE-HPLC）、反相（RP-HPLC）和阳离子交换色谱（CEX-HPLC），以及动态光散射（DLS）和十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）。采用SE-HPLC方法对BVZ单体及其聚集物和/或碎片进行筛选和验证。计算峰纯度和系统适用性参数。结果表明，正交方案是评估单克隆抗体稳定性的有用工具，它是生物类似性评估的关键指标。DLS和SDS-PAGE的结果相互比较，揭示了BVZ创新型药物和其生物类似物之间的保持时间和条带模式的相似性。这些结果显示Avastin®和所研究的生物类似物在相关化合物峰面积和视觉分子量方面具有相同的特征，并且SDS-PAGE技术被认为是最环保的技术之一。所获得的结果突出了评估相似性和差异对于确保所研究产品的生物相似性和可替代性的重要性。© 2023作者。由牛津大学出版社代表AOAC INTERNATIONAL出版。保留所有权利。如需许可，请发送电子邮件至journals.permissions@oup.com。

细胞外小囊泡（sEVs）在肿瘤微环境中细胞间载体交换中发挥关键作用。本研究旨在阐明肝细胞癌（HCC）源sEV-clathrin light chain A（CLTA）在重塑微血管环境中的功能和机制。使用酶联免疫吸附试验（ELISA）分析HCC患者循环sEV中的CLTA水平。通过多种功能性分析检查sEV-CLTA对HCC癌性特性的影响。使用质谱法确定sEV-CLTA在人脐静脉内皮细胞（HUVECs）中的下游效应蛋白。进行管形成、萌发、透过内皮侵袭和血管渗漏实验，以确定sEV-CLTA及其下游效应蛋白basigin（BSG）在HUVECs中的功能。在患者源移植瘤（PDXs）小鼠模型中测试BSG抑制剂SP-8356。与对照个体相比，HCC患者的循环sEV中CLTA水平显著增加，并且在手术后患者中减少。HCC源sEV-CLTA增强HCC的癌性特性，破坏内皮完整性并诱导血管新生。机制上，CLTA通过稳定和上调BSG来重塑微血管环境。最后，SP-8356单独或与索拉非尼联合可减弱PDXs的生长。该研究揭示了HCC源sEV-CLTA在微血管环境形成中的作用。抑制CLTA及其介导的途径可能为HCC患者阐明新的治疗策略。© 2023年作者。由代表国际细胞外囊泡学会的Wiley Periodicals, LLC发表《细胞外小囊泡杂志》。

早期生命阶段的营养状况可能对动物的新陈代谢产生持久的影响，尽管这些长期效应的机制仍不清楚。表观遗传修饰被认为是在这一关键发育阶段编码早期生命营养记忆的主要候选机制。然而，这些表观遗传变化在何种程度上发生并持续的时间仍然不确定，这在一定程度上是由于直接刺激胎儿以特定营养物质在卵胎哺乳动物系统中的挑战。在本研究中，我们使用七彩鱼作为卵胎脊椎动物模型，建立了一种早期高脂饮食（HFD）模型。幼虫从孵化阶段（受精后一周）开始喂养HFD，持续六周，然后转为正常饮食（NC），直到成年阶段为止。我们研究了肝脏在这一时期的转录组和表观遗传状态的变化。我们发现，HFD引发了简单肝脏脂肪变性，并伴随肝脏转录组、染色质可访问性和组蛋白修饰的剧烈变化，尤其是在代谢基因方面。这些变化在长期NC后大部分逆转，表明肝细胞的表观遗传状态具有很高的可塑性。然而，我们发现了一定数量的基因组位点显示出非可逆的表观遗传变化，尤其是与细胞信号传导、肝纤维化和肝细胞癌相关的基因周围，暗示早期HFD喂养引发的肝细胞状态变化是持久的。总之，我们的数据显示早期HFD喂养会触发七彩鱼肝细胞中可逆和持久的表观遗传变化。我们的数据为营养规划的表观遗传机制提供了新的见解，并提供了非哺乳类脊椎动物早期HFD模型的长期表观遗传状态的综合图谱。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

尽管常规疗法在治疗儿童脑瘤（PBTs）方面的生存率进展不大，不能完全治愈，但迫切需要新的策略来克服传统疗法的毒副作用。共抑制免疫检查点分子（如CTLA-4、PD-1/PD-L1等）和组蛋白变种中的表观遗传改变（例如在肿瘤微环境中帮助免疫逃逸的H3K27me3）在PBTs的治疗中并没有引起太多关注。然而，对组蛋白蛋白中的乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、泛素乙酰化和泛素类多聚（ADP）核糖化等关键表观遗传机制性改变已经得到广泛认可。儿童脑瘤中的关键检查点包括细胞毒性T淋巴细胞抗原-4（CTLA-4）、程序性细胞死亡蛋白-1（PD-1）、程序性死亡配体-1（PDL1）、OX-2膜糖蛋白（CD200）和吲哚胺2,3-二氧化酶（IDO）。本综述文章涵盖了多种共抑制免疫检查点蛋白和组蛋白表观遗传改变在不同癌症中的作用的现状。我们进一步讨论了这些检查点背后的机制、细胞信号传导、临床和临床前研究的现状以及儿童脑瘤免疫治疗的未来机会。总之，本文进一步讨论了这些干预措施在提供更好疗法选择方面的可能性。版权所有© Bentham Science Publishers；如有任何疑问，请发送电子邮件至 epub@benthamscience.net。

爱泼斯坦 - 巴尔病毒（EBV）与10％的人类胃癌相关，这些胃癌通过CpG岛甲基化表型来区分。在胃癌肿瘤和细胞系中，EBV基因组还表现出高度的5-甲基胞嘧啶（5mC）标记，这些标记由宿主DNA甲基转移酶（DNMT）在每个细胞周期中传播。因此，我们试图确定小分子脱氧胞苷核苷（DCB）通过抑制DNMT对EBV基因组5mC和染色质结构的影响，这两者在两个肿瘤源性胃癌细胞系YCCEL1和SNU719中。通过减少可表示亚硫酸盐测序，ATAC-seq和RNA测序对DCB对EBV基因组5mC，染色质结构和病毒基因表达的影响进行了分析。脱氧胞苷核苷处理导致全局病毒基因组低甲基化及开放染色质的全局增加。最引人注目的发现是通过单个RRBS测序读数分析甲基化模式，显示EBV基因组包含异质的表观遗传状态池，其中每个状态在脱氧胞苷核苷处理时会受到侵蚀。我们观察到围绕EBV基因组CTCF结合位点和溶解基因转录起始位点的异质性5mC表观等位基因模式。这些结果凸显了5mC在维持EBV基因组染色质结构和潜伏期中的重要性。此外，5mC表观等位基因的存在表明EBV阳性胃癌携带转录上不同的EBV表位，这些可能在维持潜伏期和推动肿瘤发生中发挥不同的功能。重要性：通过DNA甲基化（5mC），组蛋白修饰和染色质回路的表观锁定，可以控制爱泼斯坦 - 巴尔病毒（EBV）的潜伏。然而，它们如何在EBV相关的胃癌中决定转录程序尚未完全理解。EBV相关胃癌显示出5mC高甲基化表型。这种癌症亚型的潜在治疗方法是DNA去甲基化剂，它可以诱导EBV溶解性复活并靶向细胞DNA的高甲基化。在本研究中，我们确定了两个肿瘤源性胃癌细胞系内的EBV表观等位表现出多样性群体，这些表观等位表现受到去甲基化剂的干扰。在关键调控区域的随机DNA甲基化模式可能是自发复活的潜在机制。我们的结果强调了表观修饰对EBV潜伏期和生命周期的关键作用，这是通过5mC和宿主蛋白CCCTC结合因子之间的相互作用来维持的。

急性髓系白血病（AML）是一种儿科患者中常见的白血病，治愈率低且预后差。AML免疫微环境和甲基化的调控有待探索。儿童和成年AML患者的表观遗传因子存在显著差异，并且治疗方法的效率在这两组患者之间有所不同。我们从多个数据库收集了儿童AML患者的mRNA、miRNA和DNA甲基化数据。鉴定出差异表达基因，并构建了基因-miRNA调控网络。通过整合LASSO和Cox回归建立了预后风险模型，并生成了一张示意图。基于该模型，我们研究了肿瘤浸润的免疫细胞和细胞间通信，分析了与预后因素相关的生物学功能和通路。此外，我们探讨了所有预后因素与基因模块之间的关系，并确定了这些因素对治疗方法的影响。我们开发了一个高效的预后风险模型，并确定了HOXA9、SORT1、SH3BP5、mir-224和mir-335作为生物标志物。我们在外部数据集中验证了这些发现，并观察到年龄与儿童患者风险之间的相关性。风险评分较低的AML样本具有更好的预后和更高的免疫上调生物标志物表达，而且免疫评分较低。此外，我们还检测到高风险组和低风险组样本之间在免疫细胞浸润和相互作用方面存在差异，这影响了免疫疗法的疗效。我们评估了所有预后因素，并预测了免疫疗法和药物的效果。本研究全面调查了儿童AML的甲基化标记基因在基因组和转录组水平上的作用。本研究旨在增强AML患者的风险分层、预后评估和治疗效果评估。该研究还突出了儿童AML的独特性，并促进了新免疫疗法和靶向治疗策略的发展。© 2023. 作者，独家授权Springer-Verlag GmbH Germany，属于Springer Nature。