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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 21

JiashengWang,AkramAl...
CD19-targeted chimeric antigen receptor T-cell therapy in patients with concurrent B-cell Non-Hodgkin lymphoma and rheumatic autoimmune diseases: a propensity score matching study.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
类风湿性自身免疫疾病不仅涉及自体抗体的产生,还表现出T细胞功能障碍。对于既患有B细胞非霍奇金淋巴瘤(NHL)又患有类风湿性自身免疫疾病的患者,CD19靶向嵌合抗原受体(CAR)T细胞治疗的安全性和疗效尚不清楚。通过集聚的电子健康记录数据库,将患有类风湿性自身免疫疾病的患者(自动组)与与之倾向性匹配的没有类风湿性自身免疾病的患者(非自动组)进行了比较。从2019年1月到2023年1月,1363名接受了CD19靶向CAR T细胞治疗的患者中,有58例(4.3%)同时患有类风湿性自身免疫疾病。两组患者的细胞因子释放综合征(CRS)和免疫效应细胞相关性神经毒性综合征(ICANS)的发病率、严重程度和管理情况相似。此外,两组患者的下一次治疗或死亡时间也相似(风险比[HR] 0.97,95%置信区间[CI] 0.60至1.59,对数秩P = 0.91),以及总体生存期(HR 0.90,95%CI 0.46至1.78,P = 0.76)。在CAR T细胞输注后,类风湿性自身免疫疾病患者的炎症标志物减少,自体抗体消失,而激素和改变疾病病程的药物使用也减少。总之,类风湿性自身免疫疾病患者的CAR T细胞治疗的安全性和疗效无受影响,并且取得了更好的基础性类风湿性疾病的生化控制。© 2023作者(由Springer Nature予以独家许可)。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Jul 31

RezaMirfakhraie,Bent...
All about blinatumomab: the bispecific T cell engager immunotherapy for B cell acute lymphoblastic leukemia.
Stem Cell Research & Therapy
B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)占白血病病例的约75%,在儿童和成年人中常见。近年来,疾病诊断、分层和预后方面的进展使不同亚群的ALL能够更好地被表征。尽管B-ALL完全缓解率有显著改善,但最小残留病(MRD)和复发/难治(R/R)情况下的患者的预后仍然较差。然而,诸如靶向酪氨酸激酶或CD20分子的药物、联合治疗和改进的支持性护理等新型治疗已经改变了B-ALL的治疗模式。同时,blinatumomab已经被FDA批准用于MRD阳性或R/R的B-ALL患者。Blinatumomab是一种双特异性T细胞连接因子,含有识别结域CD3和CD19,可以重定向细胞毒性T细胞溶解B细胞。接受该药物治疗的患者报道了包括长期总生存率和改善MRD阴性反应率在内的有希望的疗效。将blinatumomab添加到新的ALL方案中似乎对改善预后不佳的B-ALL患者具有潜力。然而,神经毒性和细胞因子释放综合征是blinatumomab治疗后的两种主要不良事件。本综述对blinatumomab在R/R和MRD阳性B-ALL患者中的功能和疗效进行了总结。此外,本文简要讨论了blinatumomab作为一种新型疗法在B-ALL患者中的积极和负面方面。版权所有©2023。由Elsevier España,S.L.U.出版。
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CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY
2023 Aug 19

PijushChakraborty,Ma...
Role of aberrant phase separation in pathological protein aggregation.
CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY
神经退行性疾病与许多不同的内源性无序蛋白质或含有内源性无序区域的蛋白质的病理性沉积相关。最新的证据表明,这些蛋白质可以发生液液相分离,并在细胞中形成无膜小器官。此外,这些蛋白质形成的生物分子凝结物可能发生液-固相转变,由此成熟为淀粉样纤维、寡聚体物种或无定形聚集体,从而导致几种神经退行性疾病的病理学。在这里,我们讨论了与神经退行有关的神经元蛋白质tau、α-synuclein、sarcoma融合(FUS)以及43kDa的反应DNA结合蛋白(TDP-43)的相分离作用在病理性蛋白质聚集的背景下的作用。版权所有© 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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BMC Medical Research Methodology
2023 Aug 21

KimiyaGohari,Anoshir...
A Bayesian latent class extension of naive Bayesian classifier and its application to the classification of gastric cancer patients.
BMC Medical Research Methodology
朴素贝叶斯(Naive Bayes, NB)分类器是机器学习(Machine Learning, ML)中广泛使用的强大的监督算法。然而,其有效性依赖于条件独立性的严格假设,而在现实世界的场景中这种假设经常被违反。为了解决这个限制,各种研究已经探索了各种扩展NB以解决数据的非条件独立性问题的方法。这些方法可以大致分为两个主要类别:特征选择和结构扩展。在这个特定的研究中,我们提出了一种新颖的方法来增强NB,通过引入一个潜变量作为属性的父节点。我们使用一种灵活的技术称为贝叶斯潜类分析(Bayesian Latent Class Analysis, BLCA)来定义这个潜变量。因此,我们的最终模型结合了NB和BLCA的优势,形成了我们所称的NB-BLCA。通过引入潜变量,我们旨在捕捉属性之间的复杂依赖关系,提高分类器的整体性能。参数学习提供了期望最大化(Expectation-Maximization, EM)算法和吉布斯采样方法两种。通过进行模拟研究来评估模型的分类效果与普通NB模型相比。此外,使用与976名胃癌(Gastric Cancer, GC)和1189名非溃疡性消化不良(Non-ulcer dyspepsia, NUD)患者相关的真实世界数据,以展示模型在实际应用中的性能。使用十折交叉验证评估模型的有效性。根据测试数据中更高的分类敏感性和特异性,该模型在所有模拟场景中均优于普通NB。使用吉布斯采样准确率的NB-BLCA模型为87.77(95% CI:84.87-90.29)。而使用EM算法和普通NB分类器的NB-BLCA模型的该指数分别估计为77.22(95% CI:73.64-80.53)和74.71(95% CI:71.02-78.15)。当考虑修改NB分类器时,将潜变量纳入模型中在医学和健康相关领域特别有许多优势。通过这样做,研究人员可以避开在局部学习和结构扩展方法中需要的广泛搜索算法和结构学习。纳入潜类变量可以在模型构建过程中融合所有属性。因此,当独立性假设被违反时,尤其是在涉及健康和医学的领域,NB-BLCA模型是传统NB分类器的合适替代品。© 2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature一部分。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 21

TakashiTaida,YukiOht...
Treatment strategy changes for inflammatory bowel diseases in biologic era: results from a multicenter cohort in Japan, Far East 1000.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
临床治疗炎症性肠病时,许多靶向分子药物,包括生物制剂,已经出现,但其高昂的价格限制了其广泛应用。本研究旨在揭示日本生物制剂实施前后炎症性肠病患者特征和治疗策略的变化,日本独特的医疗保险体系允许炎症性肠病患者和医生选择患者费用最低的药物。本研究采用前瞻性队列研究,包括日本炎症性肠病专家和非专家医院。本研究根据英夫利昔单抗实施的年份将患者分为两组,作为生物制剂实施前和生物制剂时代组。使用关联分析评估了两组治疗策略的特征。本研究分析了542例溃疡性结肠炎(UC)和186例克罗恩病(CD)。生物制剂时代组中UC患者的比例为53.3%,CD患者的比例为76.2%。生物制剂时代组的UC诊断年龄(33.9岁vs. 38.8岁,P<0.001)和CD诊断年龄(24.3岁vs. 31.9岁,P<0.001)明显较高。多种药物使用史的患者的关联分析显示,生物制剂实施前时代组的患者选择了抗肿瘤坏死因子(TNF)-α药物,而生物制剂时代组的患者更倾向于选择其他机制不同于抗TNF-α的生物制剂。综上所述,本研究表明,炎症性肠病的患者特征和治疗偏好在生物制剂实施前后发生了变化。© 2023. Springer Nature Limited.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 21

PaulaCristinaGalati,...
Body mass trajectory from diagnosis to the end of treatment in a pediatric acute lymphoblastic leukemia cohort.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)治疗的进展显著提高了存活率,治疗后期效应成为一个日益关注的问题。ALL治疗后肥胖的发展频繁发生,并可能显著增加长期发病率和死亡率。我们对208例ALL儿童从诊断到完成治疗的体重轨迹进行了研究。我们发现,7.2%的孩子在诊断时超重或肥胖,到诱导治疗结束时增长到19.7%,治疗完成后增至20.8%。在多因素线性回归模型中,ALL诊断时的年龄、化疗方案类型和诊断时的BMI z评分是诱导治疗后BMI z评分的显著预测因子,而诊断时的BMI z评分是治疗完成后BMI z评分的唯一显著预测因子。在120例儿童的亚组中,我们发现诊断时的营养状况与ALL复发风险或整体生存率无关。我们的发现表明,在ALL治疗早期出现体重增加,并且这是由诊断时的体重状况预测的。因此,在整个治疗过程中应该评估营养状况,并且应早期考虑体重管理干预,尤其是对于诊断时体重较高的患者。© 2023. Springer Nature Limited.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 21

RenéeSarmentodeOlive...
Use of PET/CT to detect myocardial inflammation and the risk of malignant arrhythmia in chronic Chagas disease.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
Chagas心脏病(CHD)是以进行性心肌炎症以及心肌纤维化和片段性异常为特征的疾病,可能导致恶性室性心律失常和猝死。这种心律失常可能与晚期CHD中心肌内寄生虫持续感染或炎症有关。正电子发射计算机断层显像/计算机断层扫描(PET/CT)已被用于检测非缺血型心肌病,如结节病炎中的心肌炎症,并可能对CHD患者的风险预测有用。
本前瞻性横断面研究于2019年5月至2022年3月期间招募了24名慢性CHD门诊患者。患者分为两组:那些需植入心脏除颤器的持续性室性心动过速和/或突然心脏死亡的患者,以及那些具有相同CHD分期但无复杂性室性心律失常的患者。患者接受了18F-脱氧葡萄糖(18F-FDG)和68Ga-DOTATOC PET/CT检查,并采集了血样进行聚合酶链反应定性检测寄生虫。尽管患有和不患有复杂性室性心律失常的患者所示的18F-FDG和68Ga-DOTATOC摄取比例相似,但68Ga-DOTATOC修正的SUVmax在复杂心律失常的患者中较高(3.4比1.7;P = .046),暗示炎症可能与CHD晚期的恶性心律失常存在关联。我们还在两组患者中检测到Trypanosoma cruzi,而在具有恶性心律失常组中有增加的寄生虫感染趋势,但没有统计学显著性(66.7%对33.3%)。
PET/CT上的18F-FDG和68Ga-DOTATOC摄取可能对检测Chagas心肌病患者的心肌炎症有用,并且68Ga-DOTATOC摄取可能与恶性心律失常的存在有关,具有潜在的治疗意义。
© 2023。作者独家授权给美国核医学学会。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Aug

YewenShi,XiaoyongRen...
TP53 gain-of-function mutation modulates the immunosuppressive microenvironment in non-HPV-associated oral squamous cell carcinoma.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
TP53,作为固体癌症中最常发生突变的基因,对大多数癌症特征具有深远的影响。头颈癌中,包括口腔鳞状细胞癌(OSCC)在内,存在高频的体细胞TP53突变。我们的研究旨在了解TP53增强功能突变在调控OSCC肿瘤免疫微环境(TIME)中的作用。通过短发夹RNA沉默合成基因有突变的p53R172H,我们观察到在免疫功能正常和免疫缺陷小鼠中肿瘤生长的变化。利用HTG EdgeSeq靶向信使RNA测序分析了失活突变p53R172H的肿瘤中的细胞因子和免疫细胞标记物。流式细胞术和多重免疫荧光作用(mIF)证实了突变p53R172H在TIME中的作用。通过CIBERSORT分析OSC患者的基因表达,并利用mIF验证了蛋白质水平上的免疫环境。突变p53R172H对细胞因子转录组网络的贡献抑制了细胞毒性CD8 + T细胞的浸润,并促进了调节性T细胞和M2巨噬细胞的肿瘤内招募。此外,p53R172H还调节了免疫细胞种群的空间分布,以及其在肿瘤中心和周边内部位置间的分布。有趣的是,p53R172H突变肿瘤中浸润了表达编程性细胞死亡蛋白1的CD8 +和CD4 + T细胞,并且这些肿瘤对免疫检查点抑制剂和干扰素基因1兴奋剂治疗有响应。通过CIBERSORT分析人类OSCC样本,发现了免疫细胞种群与TP53R175H突变之间的关联,这与我们的合成小鼠肿瘤模型的发现相平行。这些发现证明了携带TP53R172H增强功能突变的合成肿瘤调节TIME以逃避肿瘤免疫,导致肿瘤进展和生存率降低。© 作者(或其雇主)2023年。在CC BY-NC许可下允许再次使用。无商业再利用。由BMJ出版。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Aug

AimiliaSchina,Zsofia...
Intratumoral T-cell and B-cell receptor architecture associates with distinct immune tumor microenvironment features and clinical outcomes of anti-PD-1/L1 immunotherapy.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
肿瘤微环境中B细胞和T细胞之间有效的合作可能导致已建立的肿瘤的退缩。B细胞和T细胞可以通过它们的受体复合物以极高的特异性识别肿瘤抗原。然而,是否一种多样的肿瘤细胞内B细胞和T细胞受体(BCR,TCR)亚基组合对肿瘤免疫微环境(TIME)和接受免疫治疗患者的临床结果产生影响尚不清楚。我们从大型临床数据集中提取了关于BCR和TCR亚基组合多样性的信息,并测量了免疫受体多样性特征、TIME和接受抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的临床结果之间的关联。在多种肿瘤类型中,TCR亚基组合的多样性与高度活化的TIME强相关,而BCR多样性更与抗体反应相关,但与整体B细胞浸润以及与肿瘤内CD8+T细胞活性相关的测量值无关。无论是TCR还是BCR多样性都不是多种癌症类型患者存活的独立预测生物标志物。然而,TCR和BCR多样性与已建立的免疫治疗反应生物标志物结合后,可以显著改善预测模型的性能。总的来说,这些数据表明肿瘤内与BCR多样性和抗体反应相关的B细胞存在一种尚未探索的免疫学作用,而此作用与经典的抗癌T细胞肿瘤内活动是独立的。
© 作者(或他们的雇主)2023。在CC BY-NC下允许再使用。不可商业再利用。有关权利和权限,请参阅BMJ的发布说明。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Aug

SiyuZhang,WenbeiPeng...
C1q+ tumor-associated macrophages contribute to immunosuppression through fatty acid metabolic reprogramming in malignant pleural effusion.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
尽管免疫检查点阻断(ICB)疗法在癌症治疗中展现出显著的效益,但部分癌症患者表现出不敏感性或因存在大量免疫抑制细胞而产生获得性耐药。作为主要的免疫抑制细胞群体,肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)阻碍了抗肿瘤免疫应答;然而,其潜在机制尚未完全阐明。我们通过单细胞RNA测序分析来描绘巨噬细胞景观,并揭示了成分1q(C1q)阳性TAMs的潜在机制。我们使用人类和小鼠的恶性胸腔积液(MPE)来探索C1q阳性TAMs的表型和功能。C1q阳性TAMs高度表达多种抑制性分子,其高浸润与不良预后显著相关。C1q阳性TAMs通过损害CD8阳性T细胞的抗肿瘤效应,促进MPE免疫抑制。从机理上讲,C1q阳性TAMs增强脂肪酸结合蛋白5(FABP5)介导的脂肪酸代谢,激活过氧化物酶体增殖物激活受体-γ转录因子,增加抑制性分子的基因表达。高脂饮食增加C1q阳性TAMs中抑制性分子的表达,加重MPE微环境的免疫抑制效应,而低脂饮食改善这些效应。此外,FABP5抑制剂抑制TAMs中抑制性分子的表达和肿瘤进展,同时增强ICB疗法在MPE和肺癌中的疗效。C1q阳性TAMs阻碍CD8阳性T细胞的抗肿瘤效应,促进MPE免疫抑制。针对C1q阳性TAMs可有效缓解免疫抑制,并增强ICB疗法的疗效。C1q阳性TAMs亚群有望成为癌症免疫治疗的治疗靶点。
© 作者(或其雇主)2023年。根据CC BY-NC授权,允许重新使用。无商业再利用。详见权限和条款。由BMJ出版。
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