肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

CANCER RESEARCH

JenniferLCotton,Javi...

Expressed barcoding enables high resolution tracking of the evolution of drug tolerance.

CANCER RESEARCH

对于大多数携带EGFR突变的非小细胞肺癌（NSCLC）患者，使用EGFR抑制剂（EGFRi）进行治疗能够引起临床反应。尽管在治疗初期能够减小肿瘤大小，但仍然存在残留疾病导致疾病复发。阐明对于敏感细胞和耐受细胞之间的生物学差异以及揭示耐受细胞在治疗过程中的进化规律，有助于寻找提高EGFRi疗效的策略。在本研究中，我们采用了一种表达条形码系统与单细胞RNA测序相结合的方法，对耐药细胞的起源和克隆进化进行了高分辨率追踪。该平台可以纵向地分析多个克隆中基因表达和药物敏感性在EGFRi治疗中的变化。耐药细胞在基线时具有更高的关键生存通路（例如YAP和EMT）的表达，并且在接受EGFRi治疗后也可以不同程度地改变基因表达，与敏感细胞相比。此外，针对共同下游组分（MAPK）或正交因子（化疗）的药物联合治疗比单独使用EGFRi具有更高的疗效，这很可能归因于对肿瘤中存在的多种EGFRi耐受机制进行更广泛的靶向。总体而言，该方法有助于全面研究治疗应答中的克隆进化，从而为开发改进的诊断方法和针对耐药细胞的治疗策略提供信息。

JenniferWCarlisle,Ti...

Advancing immunotherapy in small cell lung cancer.

小细胞肺癌(SCLC)是一种迅速发展的神经内分泌癌，直到最近，有效治疗方案很少。DNA测序和全转录组学的进展已经确定了关键的亚型；因此，SCLC不再被视为同质性癌症。PD-1抑制剂的化疗免疫疗法现已成为晚期疾病的标准治疗，正在进行的研究工作将此策略应用于局限期的设定。免疫疗法与放疗的联合策略也在局限和广泛期疾病的临床试验中积极进行。简明摘要：小细胞肺癌(SCLC)是一种迅速发展的神经内分泌癌，直到最近，有效治疗方案很少。PD-1抑制剂的化疗免疫疗法现已成为晚期疾病的标准治疗。本综述概述了当前SCLC治疗策略、此患者群中的需求和正在涉及免疫疗法的新兴治疗策略，并希望进一步改善患者的预后。© 2023美国癌症学会。

Experimental Hematology & Oncology

ChiyuanGao,TingZhang...

Development of a Microfluidic Flow Cytometer with a Uniform Optical Field (Uni-μFCM) Enabling Quantitative Analysis of Single-Cell Proteins and Its Applications in Leukemia Gating, Tumor Classification, and Hierarchy of Cancer Stem Cells.

Experimental Hematology & Oncology

快速且定量地估计具有各种分布模式的单细胞蛋白仍然是一个技术挑战。此处开发了一种具有均匀光学场（Uni-μFCM）的微流体流式细胞仪，该仪器能够将结合抗体的多色荧光信号转化为具有任意细胞分布的靶向蛋白数量。作为Uni-μFCM的核心，通过采用微加工的金属窗口来塑造激发光束以实现光学激发和荧光检测的均匀光学场，该模型通过数值模拟和实验表征进行验证。在通过测量四个细胞系的可变大小和来源的三种转录因子的单细胞蛋白定量的Uni-μFCM验证之后，Uni-μFCM应用于：（1）量化髓系和淋巴系白血细胞的膜和细胞质标记物以分类细胞系以及正常和患者的血液样本；（2）测量与基因稳定性相关的关键细胞因子的单细胞表达，区分具有不同恶性程度的口腔和结肠肿瘤细胞系，并且（3）对肝肿瘤细胞系、细胞亚型和肝病患者样本进行单细胞干细胞标记物定量，以确定各种谱系等级。通过定量评估复杂的细胞表型，Uni-μFCM大大扩大了单细胞应用程序中关于白血病分类、肿瘤分类和癌症干细胞谱系确定的表型空间。

Experimental Hematology & Oncology

AliBazarbachi,Myriam...

Improved post-transplant outcomes in recent years for AML patients with FLT3-ITD and wild-type NPM1: a report from the EBMT acute leukemia working party.

Experimental Hematology & Oncology

推荐在FLT3内含子重复（FLT3-ITD）的急性髓系白血病（AML）患者的第一次完全缓解（CR1）中进行异基因造血干细胞移植（allo-HCT）。我们评估了60岁及以下携带FLT3-ITD的AML患者的移植特征和结果的时间变化。我们在2012年至2021年期间确定了1827名成年FLT3-ITD和中间核型AML患者（年龄中位数49岁，范围18-60岁），并在CR1期间进行了移植。NPM1基因突变在72％的患者中发现。我们比较了2012年至2016年期间接受移植的688名患者和2017年至2021年期间接受移植的1139名患者的时间变化。对于野生型NPM1的患者，2年的无白血病生存率（LFS）和总生存率（OS）在时间上显著提高，分别从54％提高到64％（危险比[HR] = 0.67；p = 0.011）和从63％提高到71％（HR = 0.66；p = 0.021）。近年来的异基因造血干细胞移植显著降低了累积复发发生率（CIR）。对于NPM1基因突变的患者，时间上没有显著变化。在FLT3-ITD和野生型NPM1的AML患者中，我们注意到CIR逐渐降低，同时LFS和OS有所改善，这可能反映了FLT-3抑制剂在这种高风险环境中的疗效，包括在移植后的维持期使用。相反，携带FLT3和NPM1基因突变的患者的结果在时间上没有显著变化。

Brain Structure & Function

ManZhao,AixianLiu,Li...

The value of RPS15 and MRPS27 in ischemic stroke.

Brain Structure & Function

缺血性中风是由于大脑供血不足引起的。其具有急性发作、常伴有意识障碍以及较高的死亡率和残疾率。然而，核糖体蛋白（RP）-S15与线粒体核糖体蛋白（MRP）-S27与缺血性中风之间的关系尚不清楚。从GPL6883、GPL11154和GPL570产生的基因表达数据库GSE22255、GSE16561和GSE199435中下载了数据。筛选了差异表达基因（DEGs），并进行了蛋白质相互作用网络的构建和分析、功能富集分析以及基因集富集分析。绘制了基因表达热图。执行了比较毒理基因组数据库分析，以找到与核心基因相关的疾病。TargetScan筛选了调控中心DEGs的miRNAs。鉴定了500个DEGs。根据基因本体分析，发现它们主要富集于白细胞活化、免疫反应中的肌细胞活化、细胞膜、线粒体、分泌囊泡、催化活性、酶结合、核糖核酸结合和剪接。基因集富集分析显示富集项与差异表达基因的富集项相似。获得了20个核心基因。比较毒理基因组数据库分析显示，6个基因（RPS15、RPS2、RPS3、MRPS27、POLR2A、MRPS26）与化学药物引起的肝损伤、坏死、延迟围产期暴露、肾病、肝脏肿大和肿瘤有关。RPS15和MRPS27是缺血性中风的核心基因，在缺血性中风中起着重要作用。版权所有©2023年作者。由Wolters Kluwer Health, Inc.发表。

Brain Structure & Function

DanielLBelavy,ScottD...

Evidence- and data-driven classification of low back pain via artificial intelligence: Protocol of the PREDICT-LBP study.

Brain Structure & Function

在患有腰背痛（LBP）症状的患者中，一旦排除了特定的病因（骨折、感染、炎症性关节炎、癌症、马尾综合征和神经根病变），许多临床医生便会诊断为非特异性腰背痛。因此，目前的非特异性腰背痛治疗方法是通用的。有必要对非特异性腰背痛进行基于数据和证据的多维疼痛相关因素评估的分类，以便在大样本中进行研究。《腰背痛预测性证据驱动智能分类工具》（PREDICT-LBP）项目是一项前瞻性横断面研究，将比较300名患有非特异性腰背痛（年龄在18-55岁之间，男女各半）的女性和男性与100名没有腰背痛史的参照组。参与者将来自公众和当地医疗机构。将收集脊柱组织数据（通过磁共振成像[ MRI] 测定椎间盘组成和形态、椎体脂肪含量以及腰背肌肉形状和组成）、中枢神经系统适应性数据（通过 MRI 测定疼痛阈值、疼痛的时间累积、大脑静息态功能连接、结构连接和区域体积）、心理社会因素（如抑郁、焦虑）和其他肌骨疼痛症状。将通过降维、聚类验证和模糊c均值聚类方法、分类模型和相关敏感性分析，对非特异性腰背痛患者进行亚组分类。该项目是首个个性化的非特异性腰背痛诊断方法，具有在临床实践中广泛应用的潜力。该项目将为评估非特异性腰背痛潜在亚组的特定治疗方法的临床试验提供证据。该分类工具可能会改善患者预后，并降低经济成本。版权所有：© 2023 Belavy et al. 本文为开放获取文章，根据知识共享署名许可协议发布，允许在任何媒体上无限制复制、分发和传播，前提是原作者和出处得到适当的标记。

Brain Structure & Function

ErnestNadal,DelvysRo...

Phase II Trial of Atezolizumab Combined With Carboplatin and Pemetrexed for Patients With Advanced Nonsquamous Non-Small-Cell Lung Cancer With Untreated Brain Metastases (Atezo-Brain, GECP17/05).

Brain Structure & Function

Atezo-Brain研究评估了阿特珠单抗联合化疗治疗复发难治性非小细胞肺癌（NSCLC）患者未治疗脑转移。这是一项单臂II期临床试验，纳入了未经治疗且没有神经症状或无症状但有药物治疗的晚期非鳞状细胞NSCLC患者。地塞米松每日最高可用4毫克一次。阿特珠单抗加卡铂和培美曲塞治疗4至6个周期，然后继续以阿特珠单抗加培美曲塞治疗直至疾病进展，最长治疗2年。主要终点包括在12周时确定无进展生存（PFS）率，以及前9周内Ⅲ级或Ⅳ级不良事件的发生率。根据神经肿瘤内科脑转移反应评估标准评估颅内结局。共纳入40例患者，其中22例（55%）在基线接受皮质类固醇治疗。总体12周PFS率为62.2%（95%可信区间[CrI]，47.1至76.2）。前9周内Ⅲ级或Ⅳ级不良事件发生率为27.5%。大多数神经事件为Ⅰ级和Ⅱ级，但5例患者（12.5%）出现Ⅲ级至Ⅳ级神经事件。随访中位数为31个月时，颅内中位PFS为6.9个月，应答率为42.7%（95% CrI，28.1至57.9）。全身中位PFS为8.9个月，应答率为45%（95% CrI，28.1至57.9）。中位总生存时间（OS）为11.8个月（95% CI，7.6至16.9），2年OS率为27.5%（95% CI，16.6至45.5）。阿特珠单抗加卡铂和培美曲塞在未经治疗的晚期非鳞状细胞NSCLC患者中显示出良好的活性和可接受的安全性。

Stem Cell Reviews and Reports

YuGong,LinglingGe,Qi...

Ethanol Causes Cell Death and Neuronal Differentiation Defect During Initial Neurogenesis of the Neural Retina by Disrupting Calcium Signaling in Human Retinal Organoids.

Stem Cell Reviews and Reports

胎儿酒精综合症（FAS）影响了超过90％的患儿，导致严重的眼球异常，如小眼和视神经发育不良。在妊娠的早期阶段，神经视网膜神经发生的开始代表了人眼发育的关键时期，同时由于缺乏意识，使胚胎视网膜结构在发育过程中暴露于产前乙醇暴露的最高风险。尽管这一时期的重要性至关重要，但短期乙醇暴露对人类神经视网膜发育过程的确切影响和潜在机制仍然不清楚。在本研究中，我们利用人胚胎干细胞衍生的视网膜器官样体（hROs）复制了初始视网膜神经发生的过程，并发现1％（体积/体积）乙醇通过诱导强烈的细胞死亡和视网膜神经节细胞分化缺陷来减缓hROs的生长。大规模RNA-seq分析和两光子显微镜活体钙成像揭示乙醇诱导的RYR1和CACNA1S的下调导致钙信号动态变化。此外，钙结合蛋白RET作为钙信号通路的下游效应基因之一，有协同的作用，集成乙醇和钙信号来阻止神经元分化并引起细胞死亡。总之，我们的研究展示了乙醇对人类胚胎神经视网膜初始神经发生的影响和分子机制，为FAS的眼睛表型提供了新的解释，并可能为易感人群提供预防措施的指导。 © 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature.

BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY

LaiaPuig-Blasco,Krzy...

Loss of cancer cell-derived ADAM15 alters the tumor microenvironment in colorectal tumors.

BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY

肿瘤进展和治疗反应受到肿瘤微环境（TME）中癌细胞与周围环境相互作用的严重影响。许多与此相互作用有关的可溶性因子和信号受体由脱粘蛋白和金属蛋白酶（ADAMs）进行抑制。ADAM15的上调与癌症患者的较差生存率和体外以及小鼠癌模型中的肿瘤促进功能有关。尽管ADAM15参与细胞间和细胞与细胞外基质间的相互作用，但其在体内癌细胞与TME之间的相互作用的作用尚未被探究。因此，我们的目标是了解ADAM15如何调节TME的细胞组成以及其对肿瘤进展的影响。我们在直肠癌患者的肿瘤组织中显示了ADAM15的上调。在同种移植模型的小鼠中，皮下注射野生型和ADAM15敲除CT26结肠癌细胞证实了ADAM15的促肿瘤作用。肿瘤的分析显示了ADAM15缺失肿瘤中更高的免疫细胞浸润和癌细胞凋亡。具体来说，ADAM15缺失导致颗粒细胞数量减少，抗原呈递细胞包括树突状细胞和巨噬细胞的浸润增加，以及更多的T细胞。通过体外实验，我们证实了ADAM15对巨噬细胞迁移的调节作用，并确定了ADAM15衍生的CYR61可能是其调节作用的分子介导物。根据这些发现，我们推测靶向ADAM15可能会增加结直肠肿瘤中免疫细胞的浸润，这是有效免疫疗法的前提条件。© 2023 The Authors. International Journal of Cancer published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of UICC.

LongendriAguilera-Me...

StarPep Toolbox: An Open-Source Software to Assist Chemical Space Analysis of Bioactive Peptides and Their Functions using Complex Networks.

抗微生物肽（AMP）是治疗由多药耐药病原体引起的传染病、某些类型的癌症和其他疾病的有希望的分子。计算机辅助策略是进行高通量筛选AMP的有效工具。本报告重点介绍了StarPep工具箱，这是一个开源且用户友好的软件，利用复杂网络表示、聚类和相似性搜索模型来研究AMP的生物活性化学空间。这项研究的创新之处在于结合了网络科学和相似性搜索技术，使其区别于基于机器学习和其他计算方法的传统方法。AMP化学空间的基于网络的表示提供了肽类药物再利用、开发和优化的有希望的机会。这种方法可以作为发现新一代治疗肽的基准。所有底层代码和安装文件可以在GitHub（https://github.com/Grupo-Medicina-Molecular-y-Traslacional/StarPep）上获得，使用Apache 2.0许可证。补充数据可在Bioinformatics在线获取。© 作者2023年发表，由牛津大学出版。