激活诱导的胞苷脱氨酶（ AID）通过体细胞高变性（ SHM ）和类别转换重组（ CSR ）在促进B细胞多样性方面起着至关重要的作用。虽然AID主要与体液免疫反应的生理功能相关，但它也与淋巴瘤的发生和进展有关。已经发现AID的异常会破坏B细胞和T细胞系淋巴母细胞白血病中的基因网络和信号通路，尽管其在癌变过程中的完整作用尚不清楚。本综述提出了AID的另类作用，并探讨了其在调节肿瘤发生中的离靶效应。在本综述中，我们首先概述了AID的生理功能及其调控。 AID通过SHM和CSR在促进B细胞多样性方面起着至关重要的作用。然后，我们讨论AID的离靶效应，包括诱发非Ig的突变、表观遗传修饰以及作为辅因子的另类作用。我们还探讨了将AID归位的网络。此外，我们总结了AID在自身免疫性疾病和血液肿瘤中的离靶效应。最后，我们评估了AID在实体肿瘤中的离靶效应。本综述的主要重点是了解AID如何以及何时靶向特定基因座位，并探讨其对癌变的影响。总的来说，本综述旨在全面了解AID的生理和离靶效应，为自身免疫性疾病、血液肿瘤和实体肿瘤的新治疗策略的开发做出贡献。版权所有© 2023 Jiao，Lv，Wang，Fan和Yang。

临床参数为基础的判断图表和分期系统在预测肝内胆管癌（ICC）患者的生存中提供有限的信息。在本研究中，我们开发了一种甲基化标记，能精确预测手术后的总体生存（OS）。我们在中国的三个肝胆中心的两个独立队列（发现队列，n=164；验证队列，n=170）中进行了基于全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）的DNA甲基化的表观基因组研究。通过参考差异甲基化区域（DMRs），我们提出了预后性甲基化区域（PMRs）的概念，其中包括连续预后性甲基化CpGs（PMCs）。基于机器学习策略（随机森林和最小绝对收缩和选择回归），在发现队列中构建了一个基于14个PMRs的预后性甲基化评分（PMS），并在验证队列中得到验证。预测整体生存的PMS的C指数在发现队列和验证队列中分别为0.79和0.74。在整个队列中，PMS是生存的独立预测因子（风险比（HR）=8.12；95%置信区间（CI）：5.48-12.04；P<0.001），而PMS的C指数（0.78）显著高于约翰·霍普金斯大学医学院（JHUSM）的判断图表（0.69，P<0.001）、东方肝胆外科医院（EHBSH）的判断图表（0.67，P<0.001）、美国肿瘤协会（AJCC）肿瘤-淋巴结-转移（TNM）分期系统（0.61，P<0.001）和MEGNA预后评分（0.60，P<0.001）。PMS的第四分位数的患者可以从辅助治疗（AT）中获益（HR=0.54；95%CI：0.32-0.91；log-rank P=0.043），而第一至三分位数的患者则无法。然而，其他判断图表和分期系统却做不到这一点。对潜在机制的进一步分析表明，PMS与肿瘤生物行为、通路激活和免疫微环境有关。PMS可以提高ICC患者预测的准确性，并识别出能从AT中获益的患者，有可能促进对ICC患者的治疗决策。2023年 肝胆外科与营养。保留所有权利。

作为世界范围内第六最常诊断的癌症和第四导致癌症相关死亡的原因，肝癌被认为是一种严重疾病，其患病率高且预后较差。当前用于肝癌的抗癌药物存在一些缺陷，如在疾病后期疗效有限、对健康细胞产生毒性以及潜在的药物耐药性。大量证据表明，基于香豆素的化合物是有效的抗癌剂，目前有许多类似物正在临床前和临床研究中进行调查。本研究旨在探索一类新型的8-甲氧基香豆素-3-羧酸酰胺对肝癌的抗肿瘤效力。为了实现这一目标，我们设计、合成和表征了一组新的N-(取代苯基)-8-甲氧基香豆素-3-羧酰胺类似物。抗肿瘤活性评估显示，合成的化合物类对Hep-G2细胞具有显著的细胞毒性，而对正常细胞影响不明显。在合成的化合物中，化合物7对Hep-G2细胞表现出最强的细胞毒作用，其IC50为0.75微米，比staurosporine药物(IC50 = 8.37微米)更强。对化合物7抗增值活性的机制研究表明，其干扰DNA复制并诱导DNA损伤，导致细胞周期停滞，如细胞量在G1和G2/M期的百分比明显降低，而在S期的百分比增加。流式细胞术分析进一步揭示，化合物7具有触发HepG-2细胞坏死和凋亡的能力。进一步的机制研究表明，化合物7对细胞色素P450和血管内皮生长因子受体-2(VEGFR-2)蛋白具有强烈的双重抑制活性，而与索拉非尼药物相比具有更强的相结合亲和力。进一步详细的计算研究表明，化合物7对VEGFR2和CYP450蛋白的结合腔具有较高的亲和力。总的来说，我们的发现表明，新合成的化合物类，尤其是化合物7，有望成为开发高效抗肿瘤药物治疗肝癌的有希望的支架。Copyright © 2023 Radwan, Abo-Elabass, Abd El-Baky, Alshwyeh, Almaimani, Almaimani, Ibrahim, Albogami, Jaremko, Alshawwa and Saied.

囊蛋白C（CyC）是一种分泌型半胱氨酸蛋白酶抑制剂，其生物学功能尚不清楚。许多患者在糖皮质激素（GC）治疗期间，特别是在血浆中CyC水平升高。本研究利用基因组关联和结构方程模型将GC与CyC的系统调控联系起来，以确定CyC生产遗传学在英国生物库中的相关性。CyC的生产以及捕捉CyC生产易感性的多基因得分（PGS）与总体和癌症相关死亡的增加有关。我们发现GC受体直接靶向CyC，导致巨噬细胞和癌细胞对GC的响应性CyC分泌。CyC敲除的肿瘤显示显著降低的生长速度和TREM2+巨噬细胞的招募，后者与癌症免疫治疗失败有关。此外，由联合临床试验队列中的685名转移性癌症患者所构建的CyC生产PGS预测了检查点免疫治疗失败。综上所述，CyC可能通过TREM2+巨噬细胞招募起到GC效应通路的作用，并可能成为联合癌症免疫治疗的潜在靶点。©2023。

肾透明细胞癌（KIRC）是一种常见的恶性肿瘤，具有高度的异质性和遗传不稳定性。同源重组缺陷（HRD）产生的DNA双链断裂是基因组不稳定性的已知贡献因素，可促进肿瘤发展。然而，目前尚不清楚与HRD相关的分子特征在KIRC中是否具有预测作用。发现队列包括来自癌症基因组图谱数据库的501名KIRC患者。HRD患者的基因组和转录组数据用于全面分析。单细胞RNA测序（scRNA-seq）用于验证大规模RNA测序的测试结果。在本研究中，高HRD评分的患者与低HRD评分的患者相比有更差的预后。DNA损伤应答信号通路和免疫相关信号通路在HRD阳性亚组中显著富集。进一步对肿瘤微环境（TME）进行全面分析发现，耗竭的CD8+ T细胞的信号在HRD阳性亚组中富集。最后，scRNA-seq分析证实HRD阳性患者中免疫相关信号通路的上调。综上所述，本研究不仅证明了高HRD评分是KIRC患者有效的预后生物标志物，还揭示了HRD阳性肿瘤中的TME。版权：© He等。

背景：坏死程序化细胞死亡在结肠腺癌（COAD）中起到重要作用。我们旨在通过利用与坏死程序化相关的长链非编码RNA（NRL）开发患有COAD的免疫浸润与干细胞性之间的关系通过风险评分剖析检测方法。方法：我们的研究基于来自癌基因组图谱（TCGA）的基因表达数据和相关临床信息进行。坏死程序化相关基因（NRGs）从基因组和基因组百科全书（KEGG）数据库中获得。使用皮尔逊相关性分析，Cox回归和最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归确定了NRL预后签名（NRLPS）。运用qRT-PCR方法检测了NRLs的表达。运用多种算法识别了免疫细胞浸润与NRLPS风险评分之间的关系。进一步分析了体细胞突变、肿瘤干性指数（TSI）和药物敏感性。结果：为构建NRLPS，我们研究了15个长链非编码RNA。此外，高风险亚组的NRLPS患者的生存率低于低风险亚组的患者。通过GSEA分析，发现NRL在Notch、Hedgehog和Smoothened通路中丰富。免疫浸润分析显示，两个风险组之间的CD8+T细胞、树突状细胞和CD4+T细胞存在显著差异。此外，我们的NRLPS与肿瘤微环境的调节、肿瘤突变负担（TMB）和干细胞性相关。最后，我们的NRLPS证实在预测COAD患者的免疫治疗和化疗的疗效方面具有潜在应用价值。结论：基于NRLs，为COAD患者开发了一个预后模型，使个体化定制免疫治疗和化疗成为可能。(Li, Wang, Liu, Xiao和Yi, 2023版权所有)

人类胆碱脱氢酶（CHDH）是一种位于线粒体内的跨膜蛋白。CHDH已被证明是一种重要的催化酶，催化胆碱氧化生成甜菜碱，并在线粒体损伤后参与线粒体自噬过程。近年来，越来越多的研究集中在CHDH上，并发现它与各种疾病的发病机制密切相关，包括肿瘤预后。在本文中，我们总结了CHDH基因定位、蛋白结构和基本功能，并讨论了CHDH在代谢性疾病和其他疾病研究中的进展。此外，我们描述了CHDH在不同类型恶性肿瘤进展中的调节作用。此外，CHDH在多种疾病的主要致病机制可能与单核苷酸多态性（SNP）有关。我们期望通过诊断CHDH基因SNP位点，为临床诊断和预后预测疾病提供新的策略和依据。我们的工作评估了CHDH作为与一些代谢性疾病和肿瘤诊断相关的分子标记的可行性，这可能为相关疾病和肿瘤的治疗提供新的靶点。版权所有©2023年李、沈、杨、廉、李、李、黄、沈和刘。

鉴于长非编码RNA (lncRNA) 在许多癌症中的功能多样性，它们正在受到特别关注。lncRNA 不仅通过参与各种信号通路发挥着癌基因和肿瘤抑制基因的作用，还是多种癌症的预测标志物，包括急性髓系白血病（AML）。考虑到这一点，我们调查了可能充当介导剂的lncRNA，分别是热休克蛋白和铁死亡之间的两个过程，它们在肿瘤发生中似乎密切相关。使用综合生物信息学方法，我们确定了在AML患者中具有预后价值的四个lncRNA（AL138716.1，AC000120.1，AC004947.1和LINC01547）。有趣的是，其中两个（AC000120.1和LINC01547）已经被报道与AML相关，AC004947.1则被认为具有致癌潜力。特别地，所获得的标志显示高风险患者的生存概率较低，反之亦然。据我们所知，这是第一个可能与AML中的热休克蛋白和铁死亡过程相关的lncRNA预测模型。然而，有必要使用患者样本进行验证。版权所有 © 2023 Ge、Wang、Sharma、Jaehde、Essler、Schmid和Schmidt-Wolf。

肿瘤微环境（TME）是一个复杂的生态系统，积极参与癌症发生和发展的各个阶段。肿瘤生物行为的一些特征，如增殖、迁移、侵袭、抑制凋亡、免疫逃逸、血管生成和代谢重编程，受到肿瘤微环境的影响。研究表明，非编码RNA，特别是长链非编码RNA和肿瘤源性外泌体中的微小RNA，作为调节血管生成的机制，促进细胞间通讯。它们刺激肿瘤生长、血管生成、转移和肿瘤微环境重编程。通过探索外源性非编码RNA与肿瘤相关内皮细胞之间的关系，以及它们在血管生成中的作用，临床医生将获得新的治疗观点。版权所有 © 2023 Duan、Fu、Jiang、Peng、Ousmane、Zhang和Wang。

乳腺癌是妇女中所有癌症类型中导致死亡的第二大原因。它的性质高度异质性，意味着肿瘤具有不同的形态，即使在患有相同类型肿瘤的人中也存在异质性。由于不同类型乳腺癌的变异性，已经发展了几种分期和分类系统。由于高度异质性，个体化治疗成为一种新策略。三阴性乳腺癌（TNBC）是所有乳腺癌亚型中约占10% -15%。TNBC是指乳腺癌的亚型，其中细胞不表达雌激素受体，孕激素受体或人类表皮生长因子受体（ER，PR和HER）。TNBC的肿瘤具有多样化的遗传标记和预后指标。我们在Cancer Cell Line Encyclopedia（CCLE）和Genomics of Drug Sensitivity in Cancer（GDSC）数据库中使用人类乳腺癌细胞系和药物敏感性数据来寻找潜在药物。我们采用三种不同的机器学习方法评估6种对TNBC细胞系具有预测能力的有效药物。然后，根据这些标记物在乳腺癌中的参与程度进行初步筛选，并利用Cleveland数据库的数据进行放射性抗性测试。观察到Panobinostat、PLX4720、Lapatinib、Nilotinib、Selumetinib和Tanespimycin是对TNBC细胞系具有疗效的6种药物。我们可以鉴定出可能用于已批准药物的潜在衍生物。仅有一种标记物（SETD7）对短名单中的所有六种药物敏感，而另外两种标记物（SRARP和YIPF5）对放射线和药物都敏感。此外，我们没有发现任何TNBC的放射性抗性标记物。所提出的生物标记物和药物敏感性分析将为未来的临床研究提供潜在的候选人。Copyright © 2023 Kaushik and Zhao.