研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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CHINESE MEDICAL JOURNAL
2023 Aug 18
YueqiZhao,PengDong,W...
γδ T cells: Major advances in basic and clinical research in tumor immunotherapy.
CHINESE MEDICAL JOURNAL
γδ T细胞是一类固有免疫T细胞。由于它们只占所有免疫细胞的一小部分,并且与这些细胞相关的许多基本因素仍不清楚,所以它们并未引起足够的关注。然而,近年来随着肿瘤免疫治疗的快速发展,γδ T细胞因其在大多数肿瘤细胞上无需主要组织相容性复合物(MHC)限制即能发挥细胞毒作用的能力而受到越来越多的关注。越来越多的基础研究聚焦于γδ T细胞的发育、抗原识别、激活和抗肿瘤免疫应答。此外,正在开发基于γδ T细胞的免疫治疗策略,并且开展对这些策略的临床试验的数量也在增加。本综述主要总结了γδ T细胞在肿瘤免疫治疗中的基础研究和临床应用的进展,为将来进一步开发基于γδ T细胞的策略提供理论依据。 版权所有©2023中国医学会,由Wolters Kluwer, Inc.根据CC-BY-NC-ND许可证制作。
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Frontiers in Genetics
2023
SonuKumar,NeetiNadda...
Assessments of TP53 and CTNNB1 gene hotspot mutations in circulating tumour DNA of hepatitis B virus-induced hepatocellular carcinoma.
Frontiers in Genetics
背景:乙型肝炎病毒(HBV)感染是慢性肝病的主要原因之一,从慢性乙型肝炎(CHB)发展到纤维化、肝硬化和肝细胞癌(HCC)。肝细胞癌的早期检测和基于实验室的筛查仍然是重大挑战。本研究旨在确定作为液体活检标志物的被释放到循环中的癌症标志基因特征(即循环肿瘤DNA(ctDNA)),是否可以用于肝细胞癌的筛查、早期检测和预后。 方法:共评估了130名受试者,包括HBV-HCC(n = 80)、HBV肝硬化和非肝硬化(n = 35)以及健康对照组(n = 15),通过基于Sanger循环测序和液滴数字PCR(ddPCR)的方法,检测ctDNA中TP53和β-连环蛋白(CTNNB1)基因热点突变。确定突变检测频率、突变分数百分比以及它们与肿瘤分期、死亡率和吸烟习惯的关联。 结果:针对32名肝细胞癌患者进行了基于Sanger循环测序。Predict SNP Tools分析表明,ctDNA序列中存在几个致病驱动突变,包括TP53基因外显子7中的p.D228N、p.C229R、p.H233R、p.Y234D、p.S240T、p.G245S和p.R249M,以及CTNNB1基因外显子3中的p.S33T。肝细胞癌患者中,p.R249M突变通过测序检测到为主要突变(25%的病例),但并无主导突变在c.747G>T(p.R249S)的位置上,该突变是HBV-HCC患者报道过的。我们开发了双探针ddPCR方法,用于确定TP53(p.R249M和p.R249S)和CTNNB1(p.S45P)基因的突变和野生型拷贝数,以及它们在所有130个受试者中的突变分数百分比。TP53 R249M和CTNNB1 S45P突变分别在31.25%和26.25%的HCC患者中检测到,并伴有较高的突变/野生型分数百分比(1.81%和1.73%),与肝硬化和非肝硬化患者相比具有显著性。合并TP53和CTNNB1基因驱动突变的HCC患者生存率较低。TP53 R249M突变还与吸烟习惯显著相关(p < 0.0001)(OR为11.77,95%CI为3.219-36.20),但TP53 R249S突变的情况则不同。 结论:通过ddPCR筛查ctDNA中的TP53和CTNNB1基因突变可能有助于早期检测和鉴定HCC进展的风险。版权所有© 2023 Kumar, Nadda, Quadri, Kumar, Paul, Tanwar, Gamanagatti, Dash, Saraya, Shalimar和Nayak。
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Frontiers in Genetics
2023
GuangqiangMeng,PengL...
KLK2 single-nucleotide polymorphism rs198977 is associated with increased susceptibility and hyperleukocytosis in AML.
Frontiers in Genetics
引言:急性髓系白血病(AML)是一种具有异常分子多样性的异质性髓系恶性肿瘤。组织卡利克雷因2(KLK2)是一种丝氨酸蛋白酶,与恶性肿瘤的发生和发展密切相关。各种基因的单核苷酸多态性(SNP)与AML的易感性、治疗和生存有关。方法:我们研究了KLK2 SNP rs198977和rs2664155与AML的关联。我们从汉族人口中招募了284名AML患者和280名健康对照者,并利用MassARRAY系统对KLK2 SNP rs198977和rs2664155进行了基因分型。结果:利用AML患者和对照的临床数据,包括AML易感性、血液计数、风险分层、对诱导化疗的反应和生存情况,我们的结果显示,KLK2 rs198977 TT基因型在隐性模型中与AML易感性的风险增加相关。关于AML患者的白细胞计数,结果显示KLK2 rs198977 TT基因型在共显模型中与高白细胞症的风险增加相关。此外,在隐性模型中,具有KLK2 SNP rs198977 TT基因型的AML患者有着高白细胞症的风险增加。KLK2 rs2664155与AML之间没有显著相关性。讨论:本研究表明,KLK2 rs198977可能是AML发生和高白细胞症中的一个重要遗传因素,为疾病进展和新的治疗靶点提供了新的视角。版权所有© 2023 Meng, Li, Li, Wu, Ma, Sun and Ji.
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 18
NatálieKlubíčková,Mi...
Poorly differentiated extra-axial extraskeletal chordoma diagnosed by methylation profiling: case report and analysis of brachyury expression in SWI/SNF-deficient tumors.
Cellular & Molecular Immunology
Chordoma是一种罕见的具有脊索分化的恶性肿瘤,通常影响年轻患者的轴骨骨骼。我们报告了一例74岁男性患者膝盖滑膜和软组织涉及的高级别上皮样肿瘤。初步活检结果不确定,但建议诊断为原发不明的转移性透明细胞癌。然而,影像学检查未显示出任何原发病变。切除标本由可辨别细胞边界的卵圆形至多边形细胞群和片状细胞组成,细胞质清晰或轻微的淡染性,核呈圆形至卵圆形,偶见明显的嗜酸性核仁。注意到罕见的非典型有丝分裂、坏死区域和畸形核。活检和切除标本进行了广泛的分子遗传学分析,包括甲基化分型。DKFZ肉瘤分类器将甲基化类别诊断为脊索瘤(分化程度低),校准分数为0.96,并且复制数变异图谱中观察到SMARCB1基因座的缺失。为验证这些发现,进行了T-Brachyury和SMARCB1免疫染色,结果表明肿瘤细胞弥漫核阳性,SMARCB1完全丧失。为了评估SWI/SNF缺陷肿瘤中T-Brachyury免疫阳性的患病率,并评估其对差分程度较差的脊索瘤的特异性,我们分析了一系列23个SMARCB1或SMARCA4缺陷肿瘤,均为阴性。在整合所有可用数据的基础上,包括在传统脊索瘤中不存在任何形态特征的情况下,将该例诊断为差分程度较差的脊索瘤。正如本文所揭示的,在对某些经过精选的无法分类的软组织肿瘤进行诊断过程中,利用甲基化分型可能会提高这些极其罕见的软组织肿瘤的检出率,并使其更好地表征。© 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 18
YeShen,LianmingZhou,...
MED1 induces M2 polarization of tumor-associated macrophages to aggravate breast cancer.
Cellular & Molecular Immunology
女性乳腺癌是一种常见的恶性肿瘤,其5年生存率仍然较低。介质亚基1(MED1)基因与巨噬细胞表型转化之间的相关性可能是影响癌症治疗效果的关键因素。本研究拟探讨MED1在巨噬细胞极化中的作用及其对乳腺癌恶性行为的进一步影响。进行生物信息学分析以预测MED1在乳腺癌中的表达模式。流式细胞术用于检测MED1过表达或沉默对巨噬细胞极化的影响。酶联免疫吸附实验用于分析异常MED1表达对巨噬细胞细胞因子分泌的影响。CCK-8、集落形成、Transwell和划痕愈合实验用于研究巨噬细胞条件培养基对乳腺癌细胞恶性行为的影响。MED1表达在M2巨噬细胞中显著增加,MED1过表达显著增加了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的M2极化和IL-10细胞因子水平。与此同时,MED1过表达的M2巨噬细胞可以显著促进乳腺癌细胞的恶性行为。Dasatinib救助实验证实,MED1诱导的M2巨噬细胞极化可以促进乳腺癌细胞的恶性进展。总之,MED1可以诱导M2巨噬细胞极化,从而调节乳腺癌细胞的恶性行为。 © 2023. 作者授予遗传学出版社独家许可。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 18
ShuaiQian,JunLiu,Wen...
METTL14 drives growth and metastasis of non-small cell lung cancer by regulating pri-miR-93-5p maturation and TXNIP expression.
Cellular & Molecular Immunology
非小细胞肺癌(NSCLC)是一种常见且具有侵袭性的恶性肿瘤,在全球范围内导致大量癌症相关死亡。解析调控NSCLC生长和转移的分子机制对于鉴定新的治疗靶点和开发有效的抗癌策略至关重要。一个值得关注的机制是METTL14的参与,METTL14是一种涉及多种细胞过程的RNA甲基转移酶,在NSCLC进展中发挥着作用。本研究的目标是调查METTL14在NSCLC发展和转移中的作用,并阐明其潜在的分子机制。通过了解METTL14对NSCLC发病机制的影响,本研究旨在为NSCLC治疗中的靶向治疗提供可能的途径。我们使用生物信息学和高通量转录组测序分析筛选影响NSCLC的调控机制。Kaplan-Meier方法评估了METTL14表达与NSCLC患者预后的相关性。通过克隆形成实验、流式细胞术、划痕实验和Transwell实验检查了操纵METTL14对NSCLC细胞恶性表型的影响。在裸鼠中评估了NSCLC细胞的肿瘤形成能力和转移潜能。METTL14在NSCLC组织和细胞系中过度表达。其高表达与NSCLC患者不良预后有关。METTL14沉默促进了NSCLC细胞的凋亡,并抑制了增殖、迁移和侵袭。miR-93-5p通过靶向和抑制TXNIP发挥作用。METTL14增加了miR-93-5p的表达,并通过m6A改变使pri-miR-93-5p成熟,以抑制TXNIP,从而抑制NSCLC细胞凋亡。通过控制miR-93-5p/TXNIP轴,METTL14增加了裸鼠中NSCLC细胞的肿瘤形成潜能和肺转移能力。本研究揭示了METTL14在NSCLC发展和转移中的作用,并将METTL14确定为NSCLC治疗的潜在靶点。© 2023. 作者独家授权给韩国基因学会。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 18
MonicaCeol,LisaGiane...
Human parietal epithelial cells (PECs) and proteinuria in lupus nephritis: a role for ClC-5, megalin, and cubilin?
Cellular & Molecular Immunology
顶膜上皮细胞是位于Bowman囊上的一群异质细胞。这些细胞被认为通过一种尚未确定的机制内化白蛋白,尽管已经证明白蛋白能够诱导顶膜上皮细胞的表型变化。近曲小管细胞是通过ClC-5、megalin和cubilin组成的高分子复合物来处理白蛋白的主要参与者。本研究调查了ClC-5、megalin和cubilin在蛋白尿性狼疮性肾炎患者和对照组患者的肾活检标本中对顶膜上皮细胞的作用,并确定了发生在病理环境中的表型改变。对Lupus Nephritis患者的23例肾活检标本和9例对照活检标本(从肾癌切除术中获得)进行了ClC-5、megalin、cubilin、ANXA3、podocalyxin、CD24、CD44、HSA和LTA标记的免疫组化和免疫荧光分析。我们鉴定并描述了两个亚群的肥大顶膜上皮细胞,即ANXA3+/Podocalyxin-/CD44-,都表达ClC-5、megalin和cubilin,并位于近曲小管极:第一个亚群,CD24+/HSA-/LTA-,具有人类成年顶膜上皮多能祖细胞的特征;第二个亚群,CD24-/LTA+/HSA+,有成为表型上皮细胞的近曲小管细胞的承诺。在狼疮性肾炎患者中,ClC-5、megalin和cubilin阳性的肥大顶膜上皮细胞的肾小球数量明显高于对照组。我们的结果可能进一步揭示了位于近曲小管极位置的肥大顶膜上皮细胞在狼疮性肾炎患者蛋白内吞作用中的作用。这些数据还表明,在Bowman囊中存在的肥大顶膜上皮细胞可能是对其他肾小球肾炎中观察到的蛋白负荷做出反应的潜在资源。© 2023. 作者(们)。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 18
LeaLing-YuKan,BenChu...
Immunoregulatory and Anti-cancer Activities of Combination Treatment of Novel Four-Herb Formula and Doxorubicin in 4T1-Breast Cancer Bearing Mice.
Cellular & Molecular Immunology
为了研究新型四草方(4HF)与多柔比星(doxorubicin)联合治疗三阴性乳腺癌(TNBC)的体内免疫调节和抗肿瘤机制。我们培养了小鼠源性三阴性乳腺癌细胞系4T1,在小鼠乳腺中接种了这些细胞。将66只小鼠随机分为6组(每组11只):天然组、对照组、LD 4HF组(低剂量4HF)、HD 4HF组(高剂量4HF)、LD 4HF + D组(低剂量4HF和多柔比星)、D组(多柔比星)。除了天然组,每只小鼠皮下接种了5 × 105个4T1细胞悬浮于100 µL生理盐水中的乳腺脂肪垫中。从肿瘤细胞接种的那天起,肿瘤生长了6天。LD组和HD组每天口服658 mg/kg和2,630 mg/kg的4HF。LD 4HF+D组每天口服658 mg/kg的4HF,并每周腹腔注射多柔比星(5 mg/kg)。D组每周腹腔注射多柔比星(5 mg/kg)。天然处理组每天口服0.2 mL双蒸馏水和每周腹腔注射0.1 mL生理盐水。对照组每天口服0.2 mL双蒸馏水。治疗持续30天。治疗结束后,收集小鼠器官,通过免疫表型分析、基因和多重分析、组织学染色和肠道菌群分析来研究免疫活性。 4HF和多柔比星联合治疗小鼠明显减少肿瘤和脾脏负担(P<0.05),改变了低氧和整体免疫淋巴细胞结构,并调节肠道菌群以促进抗肿瘤免疫活性。此外,瘤体中的免疫抑制基因、细胞因子和趋化因子,如C-C基序趋化因子2和白细胞介素-10被明显下调(P<0.05)。4HF-多柔比星联合治疗表现出协同作用,最有效地激活抗肿瘤免疫反应(P<0.05)。 上述结果为评估4HF在乳腺癌中的免疫调节机制提供了证据,并支持其作为辅助治疗药物或免疫补充剂的临床意义。 © 2023年。中华中西医结合杂志社和施普林格出版社德国的一部分。
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Experimental Hematology & Oncology
2023
HuangyiFang,YusongZh...
Primary microcephaly gene CENPE is a novel biomarker and potential therapeutic target for non-WNT/non-SHH medulloblastoma.
Experimental Hematology & Oncology
非WNT/non-SHH型髓母细胞瘤(MB)是髓母细胞瘤中遗传异质性最高的亚型之一,目前的治疗策略效果不佳且存在明显的副作用。作为Centromeric protein (CENP)家族的成员,Centromeric protein E (CENPE)是一个微管加端定位的着丝粒蛋白激酶。CENPE的杂合突变可导致原发性小头畸形综合征。有报道称在MB中CENPE表达上调,但其在MB发展中的作用尚不清楚。我们从GEO数据库下载相关RNA序列数据和相匹配的临床信息。生物信息学分析包括差异基因表达分析、Kaplan-Meier生存分析、诺莫图分析、ROC曲线分析、免疫细胞浸润分析和基因功能富集分析。此外,通过在体外实验使用CENPE特异性siRNA验证了CENPE表达对非WNT/non-SHH MB的细胞增殖、细胞周期和p53信号通路的影响。与正常组织相比,CENPE在MB组织中高表达,并且作为非WNT/non-SHH MB患者存活的独立预后因子。诺莫图分析和ROC曲线进一步证实了这些发现。同时,免疫细胞浸润分析显示CENPE可能参与非WNT/non-SHH MB的免疫应答和肿瘤微环境(TME)。此外,基因富集分析显示CENPE与非WNT/non-SHH MB的细胞周期和p53通路密切相关。体外实验验证显示抑制CENPE可以通过激活p53信号通路和阻断细胞周期来抑制细胞增殖。CENPE在非WNT/non-SHH MB中的表达与不良预后呈正相关。CENPE可能通过调节细胞周期、p53通路和免疫浸润影响肿瘤进展。因此,CENPE很有可能是非WNT/non-SHH MB的新生物标志物和潜在治疗靶点。 版权所有 © 2023 Fang, Zhang, Lin, Sun, Wen, Sheng和Lin。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2023 Aug 18
JialiPang,BilinLiang...
A denoised multi-omics integration framework for cancer subtype classification and survival prediction.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
高通量测序数据的可获得性为全面了解人类疾病提供了机会,同时也为使用如此高维数据进行机器学习模型的训练带来了挑战。在这里,我们提出了一个去噪多组学整合框架,该框架包含了一个分布特征去噪算法,即基于分布的特征选择(FSD),用于降维,并且一个多组学整合框架,即注意力多组学整合(AttentionMOI),用于预测癌症预后和鉴定癌症亚型。我们证明了FSD在单组学数据或多组学数据上都可以改善模型性能,用于15个癌症类型的肿瘤基因组图谱计划(TCGA)中的生存预测和肾癌亚型识别。而我们的整合框架AttentionMOI在特征维度高的情况下,优于机器学习模型和当前的多组学整合算法。此外,FSD还能够识别与癌症预后相关的特征,并可以被考虑为生物标志物。© 作者 2023. 版权所有,由牛津大学出版社出版。如需授权,请发送电子邮件至: journals.permissions@oup.com.
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