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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2023 Aug 18

XiaoboYang,BeiZhang,...
OTTM: an automated classification tool for translational drug discovery from omics data.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
临床样本中的组学数据是目标发现和药物研发的主要来源。通常,可以从组学数据中确定出数百或数千个差异表达的基因或蛋白质。这种可能性的规模对于使用生化或细胞实验来进行目标发现和验证来说是令人不知所措的。大多数这些蛋白质和基因没有相应的药物甚至活性化合物。此外,其中部分可能已经被报道与感兴趣的疾病相关。为了促进从组学数据中实现转化药物研发,我们开发了一个名为组学和文本驱动的转化医学(OTTM)的新的分类工具。该工具可以通过药物可用性评估和文献挖掘明显缩小需要进一步验证的蛋白质或基因范围。在我们之前的蛋白质组学研究中,针对4489个候选蛋白质,OTTM推荐了40种FDA批准的或临床试验药物,其中有15种可以商业获得并且在肝细胞癌Hep-G2细胞上进行了测试。两种药物-曲奎宁琥珀酸盐(一种FDA批准的针对CYC1的抗疟药物)和布拉纳普兰(一种III期临床试验药物,针对SMN1,用于治疗脊髓性肌萎缩)-显示出对Hep-G2细胞活力具有强烈的抑制活性,表明CYC1和SMN1可能是肝细胞癌的潜在治疗靶蛋白。总之,OTTM是一个高效的分类工具,可以加快从组学数据中发现有效药物和靶点,本文在线和局部版本的OTTM可在http://otter-simm.com/ottm.html找到。©作者2023年.由牛津大学出版社发表。
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BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
2023 Aug 17

MicheleMerli,Frances...
Deciphering molecular complexity of HCV-associated lymphoproliferation.
BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
最近的临床研究表明,在仅接受直接作用抗病毒药物(DAAs)治疗的丙型肝炎病毒相关的温和淋巴增殖性疾病(LPD)患者中,淋巴瘤反应取得了显著成效。然而,LPD对DAAs的分子机制仍知之甚少。作者在本文中提供了关于这个问题的新的分子见解,报告了在大多数情况下B细胞克隆的内部变异和持续存在,尽管病毒已消除并且有益的临床结果。这些引人注目的数据表明,对这些患者来说,分子反应的获得可能不是“功能性治愈”所必需的。进一步的全面免疫遗传学和突变研究对于解析这一生物谜题,最终在这一领域改进治疗策略都至关重要。对以下论文的评论:Mazzaro等人。在丙型肝炎病毒相关的淋巴增殖性疾病患者中,单克隆B细胞扩展和内部克隆多样化尽管病毒已消除仍持续存在。《英国血液学杂志》,2023年(提前在线访问)。doi:10.1111/bjh.19002。© 2023年英国血液学会和John Wiley & Sons Ltd.
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BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
2023 Aug 17

MatthewCollin
Histiocytic neoplasms: Going, going, but not quite gone.
BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
BRAF与MEK抑制剂已彻底改变了高危组织细胞结构肿瘤患者的治疗,但完全的疗效是否意味着可以停药治疗?相关评述:Reiner等人关于组织细胞结构肿瘤患者中靶向治疗中断后的结果。《英国血液学杂志》2023年在线出版。doi:10.1111/bjh.18964.© 2023英国血液学协会和约翰威利及子公司。
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Brain Structure & Function
2023 Aug 18

AValetopoulou,KAquil...
Rupture of a flow aneurysm secondary to spontaneous extracranial to intracranial revascularisation in the posterior fossa following radiation-induced vasculopathy for cerebellar tumour.
Brain Structure & Function
青少年接受脑肿瘤的颅脑放疗治疗时,患有脑血管并发症的风险增加。放射线诱发的动脉branchiogenic moyamoya综合症(MMS)是其众所周知的并发症。我们报道了一个8岁男孩的病例,他有髓母细胞瘤的病史,接受手术切除并进行术后辅助肿瘤治疗。六年后,他出现小脑/室管膜下出血。他接受了急诊外侧脑室引流(EVD)插入术,随后进行了后颅骨下颅后开颅手术。在开放硬脑膜时,我们注意到右侧小脑半球表面有一条异常血管,并未干扰。术中未发现明显异常。脑血管造影证实,在此EC-IC搭桥中,右侧枕动脉(OA)与后下脑动脉(PICA)外颅内侧部位存在搭桥,该EC-IC搭桥供应了PICA远端领域。一条假定的血流动脉瘤从PICA远端的搭桥处起源,被鉴定为出血的原因。我们强调了该患者群中头颅内出血的罕见原因。接受放射治疗的儿童可能具有极其敏感的脑血管,需要密切关注并评估自发出血后的血管病理性并发症的情况。© 2023作者,独家授权给施普林格-自然出版集团旗下的施普林格-德国公司。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2023 Aug 18

CharlotteBouquerel,A...
Bridging the gap between tumor-on-chip and clinics: a systematic review of 15 years of studies.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
在过去的15年里,肿瘤学研究领域在新型细胞培养模型的发展方面取得了重要进展,例如肿瘤芯片(ToC)系统。在这篇全面概述中,我们汇集了物理学家、生物学家、临床医生和制药公司的专家,从多学科角度展示ToC研究的当前状态、其独特特点以及面临的挑战。为了为读者提供对ToC领域的清晰而定量的理解,我们对2005年至2022年间与ToC相关的300多篇出版物进行了广泛的系统分析。ToC模型通过实现对各种参数的精确控制,具有其他体外模型所不具备的关键优势。这些参数包括细胞外基质的特性、对细胞施加的机械力、物理化学环境、细胞组成以及肿瘤微环境的结构。这种精细控制使得ToC能够密切模拟肿瘤内的复杂微环境和相互作用,以高度真实的方式研究癌症进展和治疗反应。重要的是,通过纳入来自患者的细胞或肿瘤异种移植物,ToC模型在临床验证方面展示了有希望的结果。我们还研究了ToC在制药行业中的潜力,预计ToC的采用将逐渐增加。展望未来,鉴于临床试验的高失败率和对3R原则(代替、减少、改进动物实验)的日益重视,ToC模型在癌症研究方面具有巨大潜力。在接下来的十年里,通过ToC模型产生的数据有可能用于发现新的治疗靶点,为监管目的做出贡献,改进临床前药物测试并减少对动物模型的依赖。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2023 Aug 16

JonasGoßen,RuiPedroR...
AI-based identification of therapeutic agents targeting GPCRs: introducing ligand type classifiers and systems biology.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
通过计算机辅助筛选,确定与G蛋白偶联受体(GPCR)具有新型化学结构的配体,尤其是非生理性配体,是一项具有挑战性的任务。在这里,我们提出了一种方法,通过结构数据与随机森林激动剂/拮抗剂分类器和信号转导动力学模型相结合,来鉴定新型化学结构的配体。作为实证案例,我们将此方法应用在鉴定人类腺苷转膜受体2A型的新型拮抗剂上,该受体是治疗帕金森病和癌症的一个有吸引力的靶点。我们在放射性配体结合试验中对所鉴定的拮抗剂进行了测试。在其中,我们发现了一种具有很大区别于迄今为止报道的所有拮抗剂的有希望的配体,其结合亲和力为310 ± 23.4 nM。因此,我们的方案被证明是一种在保存纳摩尔量级的拮抗潜力和结合亲和力的前提下,鉴定具有新型化学结构的有希望的配体候选物的强大方法。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Aug 18

JunjiTerao
Revisiting carotenoids as dietary antioxidants for human health and disease prevention.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
人类是唯一的无差别类胡萝卜素积累者,所以人体积累了不同类型和浓度不同的膳食类胡萝卜素。过去,由于类胡萝卜素可以抑制单一分子氧(1O2)而被认为是生理抗氧化剂。在20世纪90年代,大规模干预研究未能证明补充β-胡萝卜素摄入量减少肺癌发病率,尽管其抗氧化活性被认为有助于预防氧化应激诱导的癌变。然而,随着1O2的病理生理作用的出现,以及膳食类胡萝卜素诱导抗氧化酶的能力被揭示出来,类胡萝卜素的抗氧化活性又引起了新的关注。本综述聚焦于来自水果和蔬菜的六种主要类胡萝卜素,并从促进健康和预防疾病的角度重新考察它们作为生物抗氧化剂的生理功能。β-胡萝卜素9',10'-氧化酶衍生物通过促进抗氧化酶活性的增加来触发作用。叶黄素和玉米黄素在人类黄斑细胞中选择性积累,以充当抗氧化剂,保护免受光引起的黄斑损伤。番茄红素专属且浓度较高地积累在睾丸中,其抗氧化活性可能有助于消除氧化损伤。膳食类胡萝卜素在皮肤受光照后,在皮肤中持久沉积后展现出其抗氧化活性。应该确定适当的膳食类胡萝卜素摄入水平以预防疾病,因为如果过度积累,它们可能会产生有害的过氧化物作用。最后,预计很快将会理解人类为何是无差别类胡萝卜素积累者的原因。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2023 Aug 18

KanLi,JiaweiWu,Shuan...
Rosmarinic acid alleviates intestinal inflammatory damage and inhibits endoplasmic reticulum stress and smooth muscle contraction abnormalities in intestinal tissues by regulating gut microbiota.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
宿主-细菌相互作用在炎症性肠病(IBD)中起着关键作用。肠道菌群失调可能导致肠道病理变化。迷迭香酸(RA)是一种天然酚酸化合物,具有抗氧化、抗癌、抗炎、抗细胞凋亡、抗纤维化和抗细菌活性,在急性IBD中具有缓解效果。我们建立了小鼠体内模型,并进行组织学染色以直接观察RA对肠道的改变。通过16S rRNA高通量测序观察了RA对小鼠肠道菌群的影响,通过qPCR和Western blot检测了RA对肠道作用机制的影响。结果显示RA对肠道具有显著的保护作用。RA上调了乳酸杆菌约翰逊菌(Lactobacillus johnsonii)和鼠菌株阿尔若米土古菌(Candidatus Arthromitus sp SFB-mouse-NL)的丰度,下调了广谱双歧杆菌(Bifidobacterium pseudolongum)、大肠埃希氏菌(Escherichia coli)和拉贡布斯汀肠杆菌(Romboutsia ilealis)的丰度。RA降调了ROCK,RhoA,CaM,MLC,MLCK,ZEB1,ZO-1,ZO-2,occludin,E-cadherin,IL-1β,IL-6,TNF-α,GRP78,PERK,IRE1,ATF6,CHOP,Caspase12,Caspase9,Caspase3,Bax,Cytc,RIPK1,RIPK3,MLKL的表达,并上调了IL-10和Bcl-2的表达。这些结果显示RA通过修复肠道菌群失调、减轻内质网应激、抑制细胞死亡和纠正平滑肌收缩调节失常,从而抑制了紧密连接损伤引起的炎症。本研究结果揭示了RA可以通过调节肠道菌群对小鼠小肠具有保护作用。重要性炎症性肠病(IBD)是一种慢性、反复发作的胃肠系统障碍。本研究探究了迷迭香酸对肠道的保护作用。结果显示RA在减少炎症损伤、内质网应激、平滑肌收缩异常和调节肠道菌群紊乱方面具有效果。
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Am J Physiol-Heart C
2023 Aug 18

AbhaBanerjee,Chandra...
Immune Interactions in Pembrolizumab (PD-1 Inhibitor) Cancer Therapy And Cardiovascular Complications.
Am J Physiol-Heart C
免疫疗法如Pembrolizumab(PEM)在许多癌症类型的治疗中越来越普遍。PEM通过增强T细胞抗肿瘤反应的方式已有大量文献报道。然而,PEM对其他免疫细胞在促进肿瘤退缩和清除方面的相互作用尚不明确,需要进一步研究。本综述提供了文献报道PEM与刺激先天免疫细胞和适应性免疫细胞相互作用的发现,这种相互作用增强了细胞毒性表型,并触发细胞因子和趋化因子的分泌,对人体有益和有害的效应都存在。我们还描述了这如何导致PEM诱发少见但未充分报道的免疫相关心血管并发症的快速发展和致残并致命后果。本综述鼓励进一步研究PEM诱发的心血管并发症,以及癌症患者中其他免疫细胞的相互作用。随着PEM疗法在癌症治疗中的扩大应用,我们期望本综述能够告知皮肤科(黑色素瘤皮肤癌)、眼科(眼部肿瘤)和病理学(血液恶性肿瘤)等不同医学专科的医疗专家有关PEM导致的心脏并发症的信息。
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Alzheimers & Dementia
2023 Aug 18

AhsasGoyal,YogeshMur...
A Comprehensive Review on Therapeutic Potential of a Natural Anthraquinone Derivative Emodin in Brain-related Disorders.
Alzheimers & Dementia
脑相关疾病是当今世界上最重要和最复杂的健康问题之一。这些脑相关疾病导致全球大量的疾病和死亡。然而,研究人员已经投入大量时间研究这些疾病,并取得了积极的结果;然而,当前可用于治疗这些疾病的药物数量相当有限。大黄素(EM)是一种多酚化合物,具有许多健康益处。它是从大黄根部提取的生物活性单体,具有抗炎、抗氧化、抗癌和神经保护性能。一系列临床前试验显示,EM对许多脑相关疾病具有保护作用。本综述根据多个临床前研究的结果,评估了EM作为治疗和管理各种脑相关疾病的药物的潜力,并考虑了该化合物的治疗性能。版权所有© Bentham Science Publishers;如有任何查询,请发送电子邮件至epub@benthamscience.net。
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