研究动态
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Protein & Cell
2023 Aug 17
JunLiu,PengZhu
A Novel Gene Signature Associated with Protein Post-translational Modification to Predict Clinical Outcomes and Therapeutic Responses of Colorectal Cancer.
Protein & Cell
累计的证据突出展示了多样的蛋白质翻译后修饰(PTM)在结直肠癌(CRC)的发生和进展中的生物学意义。本研究分析了十种 PTM 模式(泛素化、甲基化、磷酸化、糖基化、乙酰化、SUMO化、柠檬酰化、尼酰化、美拉酰化和ADP核糖基化)以用于模型构建。建立了一个具有14个基因签名的翻译后修饰指数(PTMI)。在九个独立数据集的验证后发现,高 PTMI 的 CRC 患者预后较差。通过将 PTMI 与临床特征结合,构建了一个预测性能优异的格点图。通过无监督聚类,识别出两个 CRC 分子亚型,其存活时间有明显差异。此外,PTMI 与已知的免疫调节因子和肿瘤微环境成分相关。与高 PTMI 患者相比,低 PTMI 患者对氟尿嘧啶类化疗和免疫检查点阻断疗法的反应更好,这一点在多个独立数据集中得到验证。然而,高 PTMI 患者可能对贝伐单抗更敏感。总之,我们通过全面分析多样的蛋白质翻译后修饰模式建立了一种新的 PTMI 模型,可以准确预测 CRC 患者的临床预后和治疗反应。©2023. 作者或许可的排他许可给 Springer Science+Business Media, LLC,属于 Springer Nature 的一部分。
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Food & Function
2023 Aug 17
SanjeevDebipersadh,H...
Bioaccumulation, Bioindication and Health Risk Assessment of Heavy Metals in Cape Horse Mackerel (Trachurus trachurus) and Slinger Seabream (Chrysoblephus puniceus) in the Durban Basin and Cape Vidal, South Africa.
Food & Function
大气中的重金属(HMs)在海洋鱼类中的生物积累是一个日益严重的全球性问题,可能对人类健康产生潜在风险。本研究分析了2018年4月至2019年2月在受污染的德班盆地和原始的维达尔角所捕捞到的成年雄性和雌性赤鞭鯖和矶鲷鱼的肌肉组织、鳃和肠道中的HMs。结果表明HMs水平存在种间、空间和器官特异性的变异。在德班盆地,矶鲷鱼的As(2.3±0.2)mg/kg,Cr(2.6±0.2)mg/kg, Ni(2.0±0.1)mg/kg和Pb(4.1±0.3)mg/kg的生物积累超过了世界卫生组织(WHO)的规定限值。赤鞭鯖的Ni(1.6±0.2)mg/kg,Pb(4.7±0.6)mg/kg和Zn(52±3.01)mg/kg也超过了WHO的规定限值。对于两个物种的肌肉来说,德班盆地的金属污染指数(MPI)值(>5.13)高于维达尔角(<3.32)。矶鲷鱼的肝脏和鳃以及赤鞭鯖的肠道表现出与环境浓度成比例的较高HMs积累模式,说明这两个物种具有HMs污染的生物指示潜力。风险评估表明,两种鱼类的铬(Cr)目标危害指数>1,铅(Pb)目标癌症风险<10-4,表明从德班盆地的鱼类摄入可能存在重要的非致癌和致癌健康风险。本研究建议针对矶鲷鱼的日常摄入限量为16克/天,赤鞭鯖为14克/天,以确保健康安全。这些发现有助于了解德班盆地的HMs污染,并为决策者和政策制定者提供重要信息,以制定有效的策略来缓解和管理鱼类群体中的HMs污染。©2023年。作者(们)。
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Food & Function
2023 Aug 17
AdelakunOdunyemi,Tas...
Economic burden of non-communicable diseases on households in Nigeria: evidence from the Nigeria living standard survey 2018-19.
Food & Function
尼日利亚非传染性疾病(NCDs)的重要性体现在其不断增加的负担,迅速超越传染性疾病。由于大部分NCD照护都是由个人支付的费用,而且NCDs往往通过慢性残疾造成相当大的收入损失,因此增加的与NCD相关的健康负担也可能对经济产生不利影响。鉴于尼日利亚缺乏有关NCDs的经济负担的最新国家水平证据,本研究旨在通过分析尼日利亚患有NCDs的家庭由于个人支付支出和生产力损失而遭受的财务困难的范围,产生新的证据。本研究分析了尼日利亚最新一轮(2018-19)尼日利亚生活标准调查(NLSS)的横截面数据。使用家庭层面的健康和消费数据,采用2018年由世界卫生组织欧洲地区最近开发的更加公平的方法,估计了因个人支付健康支出而产生的灾难性健康支出(CHE)和贫困化效应。还利用收入和工作时间损失数据,运用基于输入的人力资本方法估计了NCD患者的生产力损失。平均而言,患有NCDs的家庭每年在NCD照护上花费了122,313.60 ₦ 或 398.52 美元,占家庭食品支出的24%。研究发现,癌症治疗、心理问题和肾脏疾病的个人支付支出显著造成了NCD照护的费用。个人支付支出导致家庭遭受灾难性和贫困化的后果。估计结果显示,2018年约有30%的患有NCDs的家庭在世界卫生组织欧洲地区提供的40%门槛下经历了CHE。研究还发现,NCD药物费用是影响患有NCDs家庭遭受CHE的重要因素。结果显示,尼日利亚各州和地理区域在CHE和贫穷程度上存在异质性,农村和东北地缘政治位置集中度较高。研究还发现,垫付费用导致了20%的NCD患者家庭贫困或进一步贫困,另外10%处于贫困边缘。结果显示,患有NCDs的家庭中几乎没有未满足需求的情况。本研究强调了NCDs对尼日利亚家庭的重大影响以及对贫困和弱势群体特别是有效政策干预的需求。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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HEART & LUNG
2023 Aug 17
JKupusovic,MWeber,FB...
PET/CT-identified atrial hypermetabolism is an index of atrial inflammation in patients with atrial fibrillation.
HEART & LUNG
尽管心房炎症在房颤(AF)的病理生理中起到重要作用,但是心房炎症的鉴定仍然具有挑战性。我们的目的是建立一种正电子发射计算机体层摄影/计算机断层扫描(PET/CT)协议,使用18氟标记的脱氧葡萄糖(18F-FDG)来检测作为心房炎症代理的心房高代谢情况。我们纳入了n = 75例心房颤动患者和n = 75例非房颤患者进行三种常见的PET/CT协议(每组n = 25),这些协议针对(a)预定的禁食方案中的炎症,(b)预定的禁食方案中的恶性肿瘤,以及(c)允许最大化葡萄糖摄取的心脏生存能力进行了优化。我们在预定的位置分析了18F-FDG摄取。在禁食方案(炎症[13/25 vs 0/25]和恶性肿瘤[10/25 vs 0/25])中观察到房颤与非房颤患者间的心房摄取差异,而生存能力方案显示两组均存在非特异性摄取。在炎症方案中,房颤患者右心房的摄取更高(最大标准摄取值:2.5±.7 vs 2.0±.7,P = .01),心房附壁摄取更高(最大标准摄取值:2.4±.7 vs 2.0±.6,P = .03),心外脂肪组织摄取更高(最大标准摄取值:1.4±.5 vs 1.1±.4,P = .04)。恶性肿瘤和生存能力方案无法区分房颤和非房颤。葡萄糖摄取抑制方案似乎适用于检测房颤和非房颤患者之间的不同心房18F-FDG摄取。基于影像的炎症评估可能有助于分层房颤患者,并提供个体化的治疗策略。 © 2023. 该作者持有美国核心心脏学会的独家许可。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 17
YahuaWu,BinDu,Mingqi...
The identification of genes associated T-cell exhaustion and construction of prognostic signature to predict immunotherapy response in lung adenocarcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
T细胞耗竭(T-cell exhaustion,Tex)被认为是肺腺癌免疫治疗耐药性和预后不良的原因之一。因此,我们使用加权相关网络分析方法在癌症基因图谱(TCGA)中识别与Tex相关的基因。基于Tex相关基因的无监督聚类方法将患者分为聚类1和聚类2。然后,我们采用随机森林和最小绝对收缩选择算子方法识别出9个关键基因,构建风险评分。患者被分为低风险组和高风险组。多变量Cox分析显示风险评分是TCGA和GSE72094队列中的独立预后因子。此外,聚类2中风险评分高的患者具有最差的预后。免疫应答预测分析显示低风险组具有更高的免疫、基质、评估分数,较高的免疫表型评分(IPS),较低的肿瘤免疫失调和排斥分数,这表明低风险组对免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗有较好的反应。同时,我们还包括了两个独立的免疫治疗队列,这些队列也证实了低风险组对ICIs治疗的良好反应。此外,我们还发现了两组在化疗和靶向药物敏感度方面的差异。最后,我们建立了一种预测模型以促进临床决策。© 2023. Springer Nature Limited.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 17
XiangxiongFeng
Integrative analysis of GWAS and transcriptomics data reveal key genes for non-small lung cancer.
GENES & DEVELOPMENT
肺癌是世界上最常见和致命的癌症之一。肺癌的两种主要类型是非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC)。超过85%的肺癌是NSCLC。遗传因素在NSCLC的风险中起着重要作用。越来越多的研究关注于分子水平上研究风险因素。本研究旨在建立一个流程,通过将全基因组关联分析(GWAS)和转录组学数据与机器学习相结合,有效地识别NSCLC的遗传风险因素。GWAS数据集和GWAS摘要数据从GWAS目录下载,其中包括欧洲人群中的肺癌遗传变异。然后,利用GWAS摘要数据,使用名为FUMAGWAS的网络服务器对显著SNP的功能进行分析。NSCLC和非NSCLC人群的转录组学数据用于构建机器学习模型,以识别有助于预测NSCLC的关键基因。利用BART癌症网络服务器确定了最具上调和下调表达的基因,并通过文献回顾验证了这些基因的作用机制。通过利用机器学习进行GWAS和转录组学分析的综合分析,我们发现了与NSCLC相关的多个SNP和基因。该计算流程可能有助于NSCLC和其他疾病的生物标志物发现。©2023. The Author(s), under exclusive license to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 17
LiqingYu,JiachengZhe...
Circ_0067934: a circular RNA with roles in human cancer.
GENES & DEVELOPMENT
循环RNA(circRNA)是由预前mRNA反向剪接产生的非编码RNA(ncRNA),其特点是5'端缺乏帽子结构,3'端具有多聚腺苷酸尾。近年来,随着RNA测序和生物信息学方法的发展,circRNA的重要临床价值逐渐被揭示。Circ_0067934是位于3q26.2染色体上的一个由PRKCI(蛋白激酶C“Iota”)的外显子15和16反向剪接形成的长度为170个核苷酸的RNA分子。最近的研究发现,在各种肿瘤中circ_0067934的上调或下调与肿瘤大小、TNM分期和预后不良相关。基于癌细胞实验,过表达或沉默circ_0067934会促进癌细胞的增殖、迁移活性和侵袭。可能的机制包括circ_0067934与miRNAs(miR-545、miR-1304、miR-1301-3p、miR-1182、miR-7和miR-1324)结合来调节基因的转录后表达。其他机制包括抑制Wnt/β-连环蛋白和PI3K/AKT信号通路。在本文中,我们总结了circ_0067934在不同肿瘤中的生物学功能和可能的机制,以促进进一步探索其在临床诊断、治疗和预后评估中的转化应用。© 2023. 作者(们)。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 18
XiChen,YuqianWang,Sh...
Application of the PGT-M strategy using single sperm and/or affected embryos as probands for linkage analysis in males with hereditary tumor syndromes without family history.
GENES & DEVELOPMENT
由于遗传性肿瘤综合征对患者的身体和心理健康产生的不利影响,以及传给下一代的风险增加,遗传性肿瘤综合征引起了相当的关注。这促使人们对探索胚胎植入前遗传学检测(PGT)作为一种治疗选项以减轻和消除这些影响的兴趣日益增长。几项研究表明,新突变成为许多遗传性肿瘤综合征的主要原因,这给PGT带来了一定的困难。在缺乏足够的遗传连锁信息(父母和后代)的情况下,单倍型构建似乎是不可实现的。在这项研究中,研究人员利用单个精子或受影响的胚胎作为样本来进行单核苷酸多态性连锁分析,用于具有新突变的病例。对于复杂的突变,精子与胚胎检测相结合的策略将提高准确性,同时避免使用单一检测材料的局限性和潜在失败。该研究招募了11对具有男性新突变携带者的夫妇,包括3种肿瘤类型和4种基因。迄今为止,已经确诊怀孕的夫妇中有4对,已经出生了3个健康婴儿。羊水穿刺或脐带血验证的结果与PGT-M的结果一致。该研究旨在介绍PGT-M策略在遗传性肿瘤综合征中的应用。© 2023. 作者,独家授权给日本人类遗传学学会。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Aug 17
YuichiroIwamoto,Tomo...
Simple standing test without furosemide is useful in the diagnosis of primary aldosteronism.
DIABETES & METABOLISM
原发性醛固酮增多症(PA)是继发性高血压的已知原因。我们长期以来在PA患者中进行了简单的站立试验。另一方面,关于简单站立试验在PA中的实用性的报道很少。本研究是一项单中心的回顾性观察研究。共纳入了173名因高血压或肾上腺肿瘤入院的患者。符合排除标准的80名患者被排除在外,纳入了31名非PA患者、26名单侧PA患者和36名双侧PA患者。在120分钟的站立或坐立后进行了简单的站立试验,并计算了醛固酮/肾素比(ARR)和血浆醛固酮浓度的百分比增加(% PAC的增加)。在单侧PA(1143(528-2200))和双侧PA(521(374-765))受试对象的简单站立试验中,平均ARR显著高于非PA受试对象(152(102-240))(p < 0.0001,p = 0.0013,分别)。单侧PA受试对象的PAC增加百分比在站立负荷后显著低于非PA受试对象(110(96-140))(p = 0.0003),而非PA与双侧PA受试对象之间无差异(p = 0.99)。本研究中用于PA诊断的简单站立试验的截断值为364(AUC = 0.948,敏感性 = 83.8%,特异性 = 93.5%,假阳性率 = 3.7%,假阴性率 = 25.6%,p < 0.001),它的诊断性能不逊于卡托普利负荷试验。简单站立试验对PA的诊断性能不逊于卡托普利负荷试验。单侧PA患者的PAC百分比增加显著低于双侧PA患者。这些结果显示了简单站立试验的实用性,可以与一般PA筛查测试同时进行。© 2023. Springer Nature Limited.
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PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
2023
TehnanIAMohamed,Olai...
Automatic detection and classification of lung cancer CT scans based on deep learning and ebola optimization search algorithm.
PHYSICAL THERAPY & REHABILITATION JOURNAL
近年来的研究表明,非传染性疾病如癌症的传播有所增加。肺癌的诊断和检测在近年来已成为一个主要障碍。早期的肺癌诊断和检测将可可靠地促进全球范围内许多生命的安全和生存。利用医学图像进行精确定类化肺癌将有助于医生选择合适的治疗方法,降低癌症死亡率。在使用卷积神经网络(CNN)进行肺癌检测的领域有许多工作已进行。然而,由于CT扫描中的多方面设计,肺癌的预测仍然具有困难。此外,CNN模型存在一些问题会影响它们的性能,包括选择最佳的架构,选择适当的模型参数,以及选择最佳的权重和偏置值。为解决CT图像中选择用于肺癌分类的最佳权重和偏置组合的问题,本研究提出了一个混合元启发式和CNN算法。我们首先设计了一个CNN架构,然后计算了模型的解向量。得到的解向量被传递给埃博拉优化搜索算法(EOSA),以选择最佳的权重和偏置组合来训练CNN模型以处理分类问题。经过彻底训练EOSA-CNN混合模型后,我们得到了最佳配置,其表现良好。通过对公开可访问的伊拉克肿瘤教学医院/全国癌症疾病中心(IQ-OTH/NCCD)肺癌数据集进行实验,结果显示EOSA元启发式算法的分类准确率为0.9321。同样地,在性能比较方面,EOSA-CNN与其他方法GA-CNN、LCBO-CNN、MVO-CNN、SBO-CNN、WOA-CNN和经典CNN的比较也进行了计算和呈现。结果表明,EOSA-CNN在正常、良性和恶性病例中分别获得了0.7941、0.97951和0.9328的特异性,以及0.9038、0.13333和0.9071的敏感性。这证实了该混合算法在肺癌分类方面提供了较好的解决方案。版权所有:©2023 Mohamed等。本文是根据Creative Commons Attribution License(知识共享许可证)开放获取的文章,允许在任何媒介中自由使用、分发和复制,前提是原作者和来源得到了适当的认可。
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