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Frontiers in Pharmacology
2023

StefaniaBellino,Anna...
Cell-based medicinal products approved in the European Union: current evidence and perspectives.
Frontiers in Pharmacology
先进疗法药品(ATMPs)是利用细胞和/或基因的药理学、免疫学或代谢特性,旨在恢复、纠正或修改受体的生物功能的创新临床治疗。ATMPs是异质的药物产品,主要开发为个体化和特定患者的治疗,并代表了罕见、遗传性和神经退行性疾病、血液恶性肿瘤、癌症、自身免疫、炎症和骨科疾病等有高医疗需求的疾病的新机会。进入欧洲联盟(EU)市场,第一种ATMPs于2009年推出,截至目前已批准了24种ATMPs。本综述旨在报道EU授权的基于细胞的疗法的当前证据,包括体细胞疗法、组织工程产品和基于细胞的基因疗法产品,如嵌合抗原受体(CAR)T细胞,重点关注在临床试验和现实世界环境中的疗效和安全性评估。尽管基于细胞的疗法对于治疗选择有限的患者具有重要意义,但其在临床实践中的广泛应用仍存在一些限制,包括适应症有限、生产工艺高度复杂、生产成本高、细胞产品易变性以及与活细胞的内在特性相关的潜在安全问题,包括CAR-T诱导的神经毒性和细胞因子释放综合征(CRS)等严重或危及生命的毒性风险。尽管鼓舞人心的研究结果支持ATMPs的临床应用,但还需要额外的数据、长期随访的比较研究和更广泛的现实世界证据,以提供进一步的疗效和安全性的见解。版权所有©2023 Bellino、La Salvia、Cometa和Botta。
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Frontiers in Pharmacology
2023

HalaMBakry,NohaOMans...
Efficacy of metformin in prevention of paclitaxel-induced peripheral neuropathy in breast cancer patients: a randomized controlled trial.
Frontiers in Pharmacology
背景:紫杉醇引起的周围神经病变(PN)是一种严重的临床问题,目前尚无批准用于预防的药物。本研究旨在探讨二甲双胍对乳腺癌患者紫杉醇引起的PN的神经保护作用。方法:经确认乳腺癌诊断并计划接受紫杉醇治疗的患者被随机分配接受二甲双胍或安慰剂。两组患者均接受乳腺癌标准化疗方案。患者在紫杉醇治疗开始前1周开始服用二甲双胍/安慰剂,并在随后连续9周进行研究干预。主要观察指标为发生二级或更高级紫杉醇引起的感觉性PN的发病率。根据美国国立癌症研究所通用不良事件术语(NCI-CTCAE)对PN进行分级。采用肿瘤治疗评估功能量表/妇产科肿瘤学团队-神经毒性(FACTGOG-Ntx)亚量表评估患者生活质量(QoL)。使用简化版疼痛评估问卷(BPI-SF)测量疼痛严重程度。于基线和紫杉醇结束时测量神经生长因子(NGF)和神经肽(NT)的血清水平。结果:共评估了73名患者(二甲双胍组36名,对照组37名)。二甲双胍组发展二级或更高级PN的累积发生率明显低于对照组(14名(38.9%)对比28名(75.7%),p = 0.001)。紫杉醇治疗结束时,二甲双胍组的患者QoL明显优于对照组(中位数(IQR)FACTGOG-Ntx亚量表为24.0(20.5-26.5)对比对照组的21.0(18.0-24.0),p = 0.003)。二甲双胍组的“平均痛苦”和“最严重痛苦”评分较对照组低。紫杉醇治疗结束时,两组之间的血清NGF水平中位数存在显着差异,有利于二甲双胍组(p < 0.05),而NT血清水平在两组之间被认为是可比较的(p = 0.09)。结论:乳腺癌患者使用二甲双胍可显著减轻紫杉醇引起的PN,从而改善患者的QoL。临床试验注册:https://classic.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT05351021,编号NCT05351021。版权 © 2023 Bakry, Mansour, ElKhodary and Soliman.
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Frontiers in Pharmacology
2023

ArankaBrockmueller,S...
Calebin A targets the HIF-1α/NF-κB pathway to suppress colorectal cancer cell migration.
Frontiers in Pharmacology
背景:缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)是主要的与肿瘤相关的转录因子之一,能够调节许多肿瘤特性,如肿瘤细胞的代谢、存活、增殖、血管生成和转移。Calebin A(CA)是从姜黄中提取的一种化合物,通过调节NF-κB通路来发挥其抗癌活性。然而,它对结直肠癌(CRC)细胞迁移中的HIF-1α的影响尚不清楚。方法:使用3D海藻酸钠和单层多细胞TME(成纤维细胞/T淋巴细胞)培养的人CRC细胞(HCT-116),暴露于CA或HIF-1α抑制剂,探究CA对TME诱导的炎症、迁移和肿瘤恶性程度的疗效。结果:CA显著抑制了TME促进的HCT-116细胞增殖和迁移,与HIF-1α抑制剂类似。胶块形成、甲苯胺蓝染色和免疫标记显示,CA通过部分抑制HIF-1α来抑制HCT-116细胞的迁移,HIF-1α对CRC细胞的存活至关重要,这些观察结果通过电镜得到证实。此外,Western blot分析证实,CA抑制了TME诱导的HIF-1α和转移因子生物标志物(如NF-κB、β1整合素和VEGF)的表达,并促进了凋亡(caspase-3),这与HIF-1α抑制剂相似。最后,TME引起了HIF-1α和NF-κB之间有意的配对,推测两个与肿瘤相关的转录因子之间的协同作用对CRC细胞的恶性和迁移至关重要,并且CA以串联方式沉默了这些因子。结论:这些结果揭示了CA信号在CRC细胞迁移中的一种新的调控模式,部分通过HIF-1α/NF-κB,这对癌症治疗可能具有相关的意义。版权所有 © 2023 Brockmueller, Girisa, Motallebi, Kunnumakkara和Shakibaei。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Aug 11

PVNikitin,GRMusina,A...
Сell clusters isolation in glioblastomas and their functional and molecular characterization using new morphometric approaches.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
数字病理学在改善现有诊断方法的工具方面取得了长足的进展。然而,神经病理学等几个病理学领域仍然面临机器学习工具和神经网络分析的覆盖率较低的问题,这可能是由于相应肿瘤如胶质母细胞瘤的细胞和分子结构的复杂性所致。在本研究框架下,我们使用先进的专有工具获取组织学切片图像并进行深度形态学分析,研究了198位胶质母细胞瘤患者的样本,选择了形态学细胞簇。此外,对每个簇中的细胞进行了分离,并研究了它们的增殖、迁移、浸润活性、存活能力、有氧糖酵解活性以及化疗和放疗抗性。我们确定了四个形态学簇,包括小细胞簇、副核内簇、低染色簇和大核簇,它们在形态学参数和功能参数上显著不同。低染色簇细胞显示出最高的增殖活性;大核簇是最活跃的葡萄糖消耗者;副核内簇具有最突出的迁移和浸润活性以及耐受缺氧能力;小细胞簇主要表现为各参数的平均值。此外,额外的分析揭示了一个单独的干细胞亚簇,其分子特性与胶质母细胞瘤干细胞相对应,并存在于这四个簇中。还发现了胶质母细胞瘤的几个关键分子参数,如EGFR、PDGFRA和NF1基因的突变修饰,以及分子GBM亚型与已确定的细胞簇显著相关。因此,这些结果代表了数字病理学在实际领域和胶质瘤癌发病机制的基本问题上的一项值得期待的创新。
版权所有 © 2023。由Elsevier Ltd.出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 16

LizengCheng,YangWei,...
State-of-the-art review of theabrownins: from preparation, structural characterization to health-promoting benefits.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
就健康效益而言,暗茶是全球最佳饮品之一。茶黄素是导致暗茶健康效益的主要成分,被喻为“暗茶中的软黄金”。越来越多的证据表明,茶黄素是具有红褐色和醇厚口感的大分子色素,主要是由茶多酚的氧化聚合形成的。茶黄素是暗茶中的主要活性成分,具有多种促进健康的效应,包括调节脂质代谢、减轻体重增加、减轻糖尿病、缓解非酒精性脂肪肝、清除活性氧、预防肿瘤。更重要的是,在微生物发酵过程中大量产生的茶黄素使得暗茶的降脂效果比其他类型的茶更强。本综述首先总结了茶黄素的制备、结构特点和促进健康效应的最新研究成果,强调了潜在的分子机制,尤其是茶黄素介导的肠道菌群对宿主的多重促健康效应背后的不同机制。此外,本综述指出了当前研究的主要局限性和潜在的未来研究方向,希望为更好地进行理论研究和产业利用提供更新的科学证据。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 08

ClaudiaZHan,RickZLi,...
Human microglia maturation is underpinned by specific gene regulatory networks.
Epigenetics & Chromatin
脑环境高度调节了微胶质细胞表型,但尚不清楚规范人类微胶质细胞成熟的转录网络。本研究对胎儿和出生后的人类微胶质细胞特定发育时期的转录组和表观遗传景观进行了表征,并在诱导多能干细胞(iPSC)衍生的微胶质细胞、脑器官样体和移植到人性化小鼠体内后获得相应的数据。采用考虑转录因子(TF)共存和增强子活性的计算方法平行开发,可预测与胎儿和出生后微胶质细胞相关的共享和状态特异性的基因调控网络。此外,通过将iPSC细胞移植到人性化小鼠体内,许多人类胎儿到出生后的转变特征也得以依时间演变的方式再现。这些数据和伴随的计算方法将有助于进一步阐明人类微胶质细胞获得特定发育阶段和疾病特异性表型的机制。版权 © 2023 The Authors. Elsevier Inc.。保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 15

Shi-WeiYue,Hai-LingL...
m6A-regulated tumor glycolysis: new advances in epigenetics and metabolism.
Epigenetics & Chromatin
糖酵解重编程是癌症的最重要特征之一,并在癌症进展中起着关键作用。在癌细胞中,葡萄糖代谢的改变满足了自我增殖、血管生成、淋巴管生成、转移等需求,并影响着癌症的免疫逃避、预后评估和治疗效果。RNA的N6-甲基腺苷(m6A)修饰在真核细胞中广泛存在。动态可逆的m6A修饰广泛参与了癌干细胞更新与分化、肿瘤治疗耐药性、肿瘤微环境、肿瘤免疫逃逸和肿瘤代谢的调控。近来,越来越多的证据表明,m6A修饰可以以多种方式影响肿瘤的糖酵解过程,从而调节肿瘤的生物行为。本综述讨论了糖酵解在肿瘤发生和发展中的作用,并详细阐述了m6A修饰通过调控糖酵解对不同肿瘤产生的深远影响。我们认为,经m6A修饰的糖酵解在肿瘤治疗中具有重要意义和潜力。©2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 14

JinSun,MingyangSu,Ji...
Cross-platform comparisons for targeted bisulfite sequencing of MGISEQ-2000 and NovaSeq6000.
Epigenetics & Chromatin
精确可复制的下一代测序平台对于鉴定与恶性肿瘤相关的异常DNA甲基化变化,并将其转化为癌症检测、预后和监测等临床应用至关重要。然而,高质量的DNA甲基化测序一直是个挑战,因为亚硫酸氢盐转化的文库序列多样性差严重影响了测序质量和产量。在本研究中,我们使用NovaSeq6000作为对照,测试了MGISEQ-2000测序仪在DNA甲基化测序中的能力,采用了一种已发表的非侵入性胰腺癌检测试验。我们对一系列具有不同肿瘤比例的合成游离DNA(cfDNA)样本进行了测序,发现MGISEQ-2000产生的数据质量与NovaSeq6000相似。MGISEQ-2000测得的甲基化水平与NovaSeq6000高度一致。此外,MGISEQ-2000显示了与NovaSeq6000相当的分析敏感性,表明其在临床检测方面具有潜力。为评估MGISEQ-2000的临床性能,我们对24个临床样本进行了测序,并使用临床诊断模型PDACatch分类器预测样本的病理学情况。MGISEQ-2000的临床模型性能与NovaSeq6000的数据高度一致,曲线下的面积为1。我们还在减小测序深度时使用MGISEQ-2000的数据测试了该模型的稳健性。结果显示,MGISEQ-2000的数据表现出与NovaSeq6000的数据相匹配的PDACatch分类器稳健性。综上所述,MGISEQ-2000表现出类似的数据质量、甲基化水平的一致性、相当的分析敏感性和匹配的临床性能,支持其在检测cfDNA的独特甲基化模式的未来无创早期癌症检测研究中的应用。© 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 15

EtienneSollier,JackK...
COMPASS: joint copy number and mutation phylogeny reconstruction from amplicon single-cell sequencing data.
Epigenetics & Chromatin
重建体细胞DNA变异的历史可以帮助理解肿瘤的演化过程并预测其对治疗的耐药性。单细胞DNA测序(scDNAseq)可以用于研究克隆异质性并推断系统发育关系。然而,现有的用于scDNAseq数据的大多数系统发育方法要么设计用于单核苷酸变异(SNVs),要么设计用于大的拷贝数变异(CNAs),或者不适用于靶向测序。在此,我们开发了一种名为COMPASS的计算方法,用于从靶向scDNAseq数据中推断SNVs和CNAs的联合系统发育。我们使用模拟数据评估了COMPASS,并将其应用于多个数据集,包括一个由123例急性髓系白血病患者组成的队列。COMPASS检测到了可以通过大规模数据进行正交验证的克隆性CNAs,除此之外还检测到了需要单细胞分辨率的次克隆性CNAs,其中一些指向了趋同进化现象。© 2023年 Springer Nature有限公司。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 15

YaoChen,ZiyangXu,Hon...
Regulation of CD8+ T memory and exhaustion by the mTOR signals.
Epigenetics & Chromatin
CD8+ T细胞是适应性免疫系统的关键执行者,负责介导抗肿瘤和抗病毒免疫。静息CD8+ T细胞在胸腺中发育,并在与合适的抗原相遇后迅速在外周被激活,从而诱导这些细胞增殖和分化成对抗初次感染的效应细胞。同时,其中一部分细胞会成为长寿命的记忆CD8+ T细胞,以对抗未来的感染。值得注意的是,记忆细胞的产生和维持受到各种体内条件的深刻影响,如初次激活方式(如急性与慢性免疫)或宿主代谢、炎症或衰老因素的波动。因此,许多T细胞可能会丧失或变得疲劳并不再功能正常。这一过程涉及复杂的细胞内信号通路、转录因子、表观遗传修饰和代谢过程。因此,理解记忆和疲劳CD8+细胞的产生和命运的细胞和分子基础对于利用细胞免疫至关重要。在本综述中,我们关注哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR),特别是在细胞和分子水平上由mTOR复合物2 (mTORC2)介导的记忆和疲劳CD8+ T细胞信号转导。© 2023. 作者。
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