研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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CELL DEATH AND DIFFERENTIATION
2023 Aug 15
SiyuTan,ZehuaWang,Na...
Transcription factor Zhx2 is a checkpoint that programs macrophage polarization and antitumor response.
CELL DEATH AND DIFFERENTIATION
肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)通常被肿瘤微环境(TME)教育成具有促肿瘤功能的巨噬细胞。巨噬细胞重编程被提出作为一种潜在的肿瘤免疫疗法策略。我们最近证明了锌指蛋白和基因盒2(Zhx2)在巨噬细胞的代谢编程中起关键作用。然而,Zhx2是否负责巨噬细胞极化和TAMs重编程尚不完全清楚。在这里,我们展示了Zhx2在炎症刺激和TME下控制巨噬细胞极化的作用。Zhx2在鼠肝肿瘤模型中特异性地删除巨噬细胞,抑制了LPS诱导的促炎性极化,但促进了IL-4和TME诱导的抗炎性和促肿瘤表型转变。TME中的因素,尤其是乳酸,显著降低了TAMs中Zhx2的表达,导致TAMs转向促肿瘤表型并进一步促进癌症进展。值得注意的是,TAM中ZHX2表达降低与肝细胞癌患者的差生存率相关。机制研究揭示了Zhx2与NF-κB p65结合,并结合到Irf1启动子,从而在巨噬细胞中促进了Irf1的转录活性。Zhx2通过调节Irf1的转录来维持巨噬细胞极化,可能成为巨噬细胞为基础的癌症免疫疗法的潜在靶点。© 2023作者,采用ADMC Associazione Differenziamento e Morte Cellulare的独家许可。
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CELL
2023 Aug 09
YifatGeffen,Shankara...
Pan-cancer analysis of post-translational modifications reveals shared patterns of protein regulation.
CELL
翻译如下: 翻译:转录后修饰(PTMs)在正常和癌细胞中起着调节细胞信号和生理作用的关键作用。质谱技术的进步使得对PTM水平的高通量、准确和敏感测量成为可能,从而更好地理解它们的作用、普遍性和交互作用。在这里,我们对来自1,110名患者的PTM蛋白质组学数据进行了分析,覆盖了11种癌症类型(其中10种来自美国国家癌症研究所的临床蛋白质组学肿瘤分析联盟[CPTAC])。我们的研究揭示了涉及重要癌症过程的蛋白乙酰化和磷酸化的全癌症模式。这些模式揭示了来自不同癌症类型的肿瘤亚群,包括那些因磷酸化引起DNA修复失调、因乙酰化引起的代谢调节改变与免疫应答相关、因乙酰化和磷酸化之间的交互作用而受到影响的激酶特异性以及修饰组蛋白调控的改变。总的来说,这个资源突出了PTMs所主导的丰富生物学,并揭示了潜在的新的治疗途径。版权所有© 2023 The Authors. 由Elsevier公司出版。保留所有权利。
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CANCER CELL
2023 Aug 14
YizeLi,YongchaoDou,F...
Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis.
CANCER CELL
美国国家癌症研究所的临床蛋白质肿瘤分析共同体(CPTAC)从蛋白-基因组角度研究肿瘤,创建了丰富的多组学数据集,将基因组异常与癌症表型相连接。为了推动全癌症研究,我们已经为10个队列中的>1000个肿瘤生成了经过协调的基因组、转录组、蛋白质组和临床数据,为科学发现创建了一套连贯而强大的数据集。我们概述了CPTAC全癌症工作组在数据协调、数据传播和计算资源方面的努力,以帮助生物学发现。我们还讨论了多组学数据整合和分析的挑战,特别是处理核苷酸测序和质谱蛋白质组学数据的独特挑战。 Copyright © 2023 The Authors. Elsevier Inc. 版权所有。保留所有权利。
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CANCER CELL
2023 Aug 13
Wen-WeiLiang,RitaJui...
Integrative multi-omic cancer profiling reveals DNA methylation patterns associated with therapeutic vulnerability and cell-of-origin.
CANCER CELL
DNA甲基化在细胞身份的建立和维持中起着至关重要的作用。然而,在肿瘤发展过程中,DNA甲基化经常发生失调,并与其他遗传变异密切相关。在本研究中,我们利用对687个肾脏、脑、胰腺、肺、头颈部和子宫内膜的肿瘤和与其相邻的非受累组织进行多组学分析,鉴定与RNA和蛋白质丰度变化相关的异常甲基化,并构建了一个Pan-Cancer目录。我们发现了与细胞系特异性表观遗传调控相关的驱动基因,包括子宫内膜癌中的低甲基化FGFR2。我们显示高甲基化STAT5A与广泛的区域调控下调和免疫细胞耗尽相关,这表明STAT5A表观遗传调控在鳞状肿瘤的免疫抑制中构成了一个分子开关。我们进一步证明了甲基化亚型富集信息可以解释起源细胞、肿瘤内部异质性和肿瘤表型。总体而言,我们鉴定了驱动转录和翻译变化的顺式作用DNA甲基化事件,揭示了肿瘤表观遗传景观及其起源细胞的作用。版权所有 © 2023年作者。Elsevier Inc.保留所有权利。
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CANCER
2023 Aug 16
ChristopherDGaffney,...
The oncologic risk of magnetic resonance imaging-targeted and systematic cores in patients treated with radical prostatectomy.
CANCER
核磁共振成像(MRI)指引的前列腺活检(MRI-biopsy)可检测到系统活检(S-biopsy)未发现的高分级(GG)前列腺癌。然而,对于MRI-biopsy和S-biopsy所检测到的癌症,在评估是否具有等效的肿瘤学风险方面存在疑问。 作者评估了MRI-biopsy和S-biopsy所诊断GG的相对肿瘤学风险。本研究是一项回顾性分析,对Memorial Sloan Kettering癌症中心在2014年至2022年期间进行前列腺切除术的所有同时进行MRI-biopsy和S-biopsy的患者进行评估。使用三个Logistic回归模型,以不良病理学为主要结果(4级原发模式,任何5级模式,精囊浸润或淋巴结受累)。第一个模型包括术前前列腺特异性抗原水平、阳性和阴性S-biopsy核心的数量、S-biopsy GG和MRI-biopsy GG。第二个模型排除了MRI-biopsy GG,得到基于S-biopsy GG的平均风险。第三个模型排除了S-biopsy GG,得到基于MRI-biopsy GG的风险。使用Cox回归进行二次分析,评估了生化复发的12个月风险。总共确定了991名患者,其中包括359名(36%)存在不良病理学结果。相较于仅S-biopsy GG,MRI-biopsy GG对肿瘤学风险产生了影响(p < 0.001)。然而,如果两次活检的分级不一致,则风险处于两个分级之间。例如,对于S-biopsy GG为GG2和GG3的患者,进展性病理学的平均风险分别为19%和66%,而对于S-biopsy GG为GG2和MRI-biopsy GG为GG3的患者,平均风险为47%。生化复发12个月的相应估计分别为5.8%、15%和10%。当前的发现对基于最高GG确定风险组的实践提出了疑问。因为治疗算法在很大程度上依赖于GG,所以迫切需要进一步研究,以评估前列腺肿瘤的肿瘤学风险与检测技术的关系。 利用核磁共振成像(MRI)辅助诊断前列腺癌有助于检测出更多高级别癌症,而不仅仅依赖于系统活检。然而,我们不知道通过MRI诊断出的高级别癌症是否对患者的危险性与通过系统活检诊断出的高级别癌症相同。我们检查了所有接受过MRI活检和系统活检后进行前列腺切除的患者,以确定这些患者是否存在侵袭性癌症的危险因素和迹象(癌症是否扩散到前列腺外部或者是非常高级别的癌症)。我们发现,如果系统活检和MRI指引活检之间存在分级差异,则侵袭性癌症的风险处于两个分级之间。© 2023 American Cancer Society.
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Open Biology
2023 Aug
PanosSoultanas,Laure...
The metabolic control of DNA replication: mechanism and function.
Open Biology
新陈代谢和DNA复制是生命中最基本的两个生物功能。新陈代谢的分解支将营养物质分解以产生能量和由新陈代谢的合成支所使用的前体,用于合成大分子。DNA复制消耗能量和前体以忠实地复制基因组,将遗传物质从一代传递到下一代。我们对支撑和调控这两个生物功能的机制有着精确的理解。然而,调控复制到新陈代谢的分子机制及其生物功能大多仍然未知。了解生物如何通过细胞周期动态变化对波动的营养刺激做出回应,并且如何在各种生长条件下以可重复且独特的时序调控DNA合成是很重要的,对整个生命领域都有广泛的影响。在总结奠定代谢控制复制概念的重要研究后,我们回顾了从细菌到人类的与复制相关的代谢数据。然后呈现了支撑这些联系的分子见解,并提出代谢调控复制利用信号系统,调节代谢组稳态以编排复制的时序化。这种控制系统的突出复制表型凸显了其在复制调控以及可能的遗传稳定性和肿瘤发生中的重要性。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Aug 13
NogaUssishkin,Daphna...
A Bloody Feast - Nutritional Regulation of Hematopoiesis.
Experimental Hematology & Oncology
造血干细胞为我们提供了终身的血细胞供应。因此,它们的正常功能对生命来说是极其重要的,而它们的功能异常可能导致感染和恶性疾病。这些细胞具有特定的代谢需求,以实现它们终生的功能和产血能力。带着罗马诗人尤文纳尔的“健康的心灵在健康的身体中”这句话,我们对我们日常饮食与我们的血液质量之间的联系感到好奇,并希望通过特定的饮食调整来改善我们的造血干细胞功能并预防疾病。如今,膳食补充剂是一个不断扩大的市场,充满了提供更好健康的潜力和承诺。然而,许多这些补充剂与人体生理的联系尚不清楚。一些研究团体已开始通过研究特定营养物质对造血过程的代谢调控来阐明这一点。除了与膳食补充剂的联系外,这些研究还显著提高了我们对基本造血干细胞生物学的理解。在此,我们总结了关于特定维生素和氨基酸对正常造血和造血干细胞功能的影响的最新知识,这些物质可能被考虑为膳食补充剂。我们提出,提高我们对营养与血液生理之间联系的理解,最终可以推动健康保健政策、流程和标准的优化。版权所有 © 2023年。由Elsevier Inc.发表。
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BRITISH JOURNAL OF SPORTS MEDICINE
2023 Aug 15
AronOnerup,KirstenMe...
Associations between cardiorespiratory fitness in youth and the incidence of site-specific cancer in men: a cohort study with register linkage.
BRITISH JOURNAL OF SPORTS MEDICINE
为了评估年轻男性心肺体能(CRF)与特定部位癌症发病率之间的关联,进行了一项瑞典人群的队列研究,该研究通过对1968-2005年间接受军队征兵的男性进行登记链接。CRF是通过征兵时进行的最大心肺负荷周期测试来评估的。Cox回归模型评估了线性相关性,并包括CRF、年龄、征兵年份和地点、体重指数以及父母教育水平。为了便于解释和比较结果,CRF也被分为低、中、高三个分类。在平均随访时间为33年的1,078,000名男性中进行了初步分析,其中有84,117名在至少一个部位上发生了癌症。更高的CRF与头颈部(n=2738,HR 0.81,95% CI 0.74 to 0.90)、食道(n=689,HR 0.61,95% CI 0.50 to 0.74)、胃(n=902,HR 0.79,95% CI 0.67 to 0.94)、胰腺(n=1280,HR 0.88,95% CI 0.76 to 1.01)、肝脏(n=1111,HR 0.60,95% CI 0.51 to 0.71)、结肠(n=3222,HR 0.82,95% CI 0.75 to 0.90)、直肠(n=2337,HR 0.95,95% CI 0.85 to 1.05)、肾脏(n=1753,HR 0.80,95% CI 0.70 to 0.90)和肺脏(n=1635,HR 0.58,95% CI 0.51 to 0.66)癌症的发生风险比例呈线性相关。然而,更高的CRF预测出患前列腺癌(n=14,232,HR 1.07,95% CI 1.03 to 1.12)和恶性皮肤癌(n=23,064,HR 1.31,95% CI 1.27 to 1.36)的发病风险比例更高。我们报道了健康年轻男性的更高CRF与特定部位癌症的发病风险之间的多个保护性关联。这些结果对公共卫生政策制定有重要意义,强化了通过改善青年人的CRF来促进健康的激励。© 作者(或其雇主)2023年授权重用,根据CC BY许可。BMJ发表。
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BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
2023 Aug 16
StefanoGiardino,Filo...
How to optimize outcome of patients undergoing HLA-matched related haematopoietic stem cell transplantation in acquired and inherited bone marrow failure syndromes.
BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
在具有健康配型相关供者(MRD)的情况下,经过弱化程度的预处理方案进行前期同种异体造血干细胞移植(allo-HSCT)是儿童获得性重型再障碍性贫血(aSAA)和先天性骨髓功能衰竭综合症(iBMFs)的标准治疗方法。Alsultan等人的论文报道了低剂量环磷酰胺、氟达拉滨和胸腺球蛋白预处理的MRD HSCT的安全性和疗效,在aSAA和非Fanconi iBMFs方面加强了免疫抑制方法在allo-HSCT中针对特定非恶性疾病亚群的关键作用的概念,为讨论在BMF患者中实现MRD HSCT后患者长期生存的关键要点提供了机会。评述文章:Alsultan等人。使用低剂量环磷酰胺、氟达拉滨和胸腺球蛋白进行人类白细胞抗原配型相关造血干细胞移植治疗儿童重型再障碍性贫血。《英国血液学杂志》2023年(在线发表前)。doi:10.1111/bjh.19004。© 2023 The Authors. British Journal of Haematology,British Society for Haematology和John Wiley&Sons Ltd.发表。
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BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
2023 Aug 16
ChristineERyan,Rebec...
Clinical efficacy and safety of chimeric antigen receptor T-cell therapy for mantle cell lymphoma with secondary central nervous system involvement.
BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
关于具有淋巴滤泡携带细胞淋巴瘤(MCL)并发次级中枢神经系统(SCNS)受累的嵌合抗原受体(CAR)T细胞治疗结果的数据有限。我们在美国三所学术中心识别了10例MCL并伴有SCNS受累的患者,接受了抗CD19 CAR T细胞治疗。在中枢神经系统(86%)和全身(90%)观察到了频繁的客观反应,1年无进展生存率为47%。7例患者发生了免疫效应细胞相关的神经毒性综合征(n = 2级别1,n = 5级别3)。我们的结果表明,在这种情况下,抗CD19 CAR T细胞治疗是可行的,并且可能需要进一步的关于该人群神经毒性的数据。©2023 British Society for Haematology and John Wiley & Sons Ltd.
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