查看全部
查看全部
肿瘤
肾上腺皮质癌
膀胱尿路上皮癌
乳腺浸润癌
宫颈鳞癌和腺癌
胆管癌
结肠癌
结直肠癌
弥漫性大B细胞淋巴瘤
食管癌
胶质母细胞瘤
胶质细胞瘤
头颈癌
肾嫌色细胞癌
肾透明细胞癌
肾乳头状细胞癌
急性髓系白血病
脑低级别胶质瘤
肝癌
肺腺癌
肺癌
肺鳞状细胞癌
间皮瘤
卵巢癌
胰腺癌
嗜铬细胞瘤和副神经节瘤
前列腺癌
直肠癌
肉瘤
皮肤黑色素瘤
胃癌
睾丸癌
甲状腺癌
胸腺瘤
子宫内膜样癌
子宫癌肉瘤
眼部黑色素瘤
其他
肿瘤类器官
肾上腺皮质癌
膀胱尿路上皮癌
乳腺浸润癌
宫颈鳞癌和腺癌
胆管癌
结肠癌
结直肠癌
弥漫性大B细胞淋巴瘤
食管癌
胶质母细胞瘤
胶质细胞瘤
头颈癌
肾嫌色细胞癌
肾透明细胞癌
肾乳头状细胞癌
急性髓系白血病
脑低级别胶质瘤
肝癌
肺腺癌
肺癌
肺鳞状细胞癌
间皮瘤
卵巢癌
胰腺癌
嗜铬细胞瘤和副神经节瘤
前列腺癌
直肠癌
肉瘤
皮肤黑色素瘤
胃癌
睾丸癌
甲状腺癌
胸腺瘤
子宫内膜样癌
子宫癌肉瘤
眼部黑色素瘤
其他
GENES & DEVELOPMENT
2023 Aug 15
ShahanshahKhan,Youn-...
NLRP12 downregulates the Wnt/β-catenin pathway via interaction with STK38 to suppress colorectal cancer.
GENES & DEVELOPMENT
结直肠癌（CRC）在晚期很少能被治愈，强调了探索CRC进展和侵袭机制的重要性。前期研究表明，NLRP12 (NOD样受体家族成员)能够抑制结直肠肿瘤发生，但其精确机制尚不清楚。在这里，我们证明，在Nlrp12缺失小鼠中，侵袭性腺癌的发展与与增殖、基质降解和上皮间质转化（EMT）有关的基因表达升高相关。信号通路分析显示，Nlrp12缺失肿瘤中Wnt/β-catenin通路的激活程度较高，而NF-kB和MAPK通路的激活程度则较低。通过使用Nlrp12条件性基因敲除小鼠，我们证实NLRP12以肠上皮细胞特异性的方式调控肿瘤发生、侵袭性和β-catenin激活。此外，NLRP12缺失使得CRC细胞或器官样体增殖过度。通过蛋白质组研究，我们发现STK38是NLRP12的新型相互作用伴侣，参与了GSK3β磷酸化的抑制，从而导致β-catenin的降解。一致地，NLRP12的表达在小鼠和人类结直肠肿瘤组织中明显减少，而磷酸化GSK3β和β-catenin的表达升高。总而言之，NLRP12是Wnt/β-catenin通路的一种强烈的负调控因子，而NLRP12-STK38-GSK3β信号通路可能是CRC的一个有前景的治疗靶点。
Visits: 12
GENES & DEVELOPMENT
2023
EstebanMRepetto,Lucí...
[Analysis of BRAF and NRAS mutations in thyroid tumors in patients from Argentina].
GENES & DEVELOPMENT
BRAF或NRAS基因的滨波细胞分子变化据报道与癌变过程有关。我们的目标是确定在我们的人群中细针穿刺（FNA）标本中BRAF和NRAS的突变频率。通过qPCR在193个可疑结节的FNA标本上分析了BRAF（密码子600）和NRAS（密码子61）的突变状态，并与115位患者的病理数据进行了比较。在被分类为Bethesda VI（n = 54）的FNA中的样本中，鉴定到BRAF突变体的样本有40例（74.1%）。在组织学上诊断为经典乳头状甲状腺癌（cPTC，n = 47）的样本中，突变率为70%，而在其他亚型中的患病率较低（p = 0.013）。在滨波病变的FNA标本（n = 36）中，NRAS的阳性在滨波癌（FTCs）中的发现率为50%，而在腺瘤中仅为6.7%。最后，BRAF与PTC有淋巴结转移（p = 0.014）和基于阿根廷学会共识的复发相对风险增加之间存在显著相关性（RR = 6.77，p = 0.022）。在PTC中，BRAF突变与其他恶性特征之间没有显著差异。在我们的人群中，观察到了许多PTCs和FTCs中的BRAF和NRAS突变。BRAF突变与淋巴结转移之间存在显著相关性。
Visits: 11
Disease Models & Mechanisms
2023 Aug 15
YakubKSaheed,BukolaF...
Microarray Gene Expression Data Classification Via Wilcoxon Sign Rank Sum and Novel Grey Wolf Optimized Ensemble Learning Models.
Disease Models & Mechanisms
癌症是一种致命的疾病，影响着全世界人们的生活。寻找与单一癌症疾病相关的几个基因可以导致有效的治疗方法。微阵列数据集的困难在于其高维度性；与数据集中较少的样本相比，它们具有大量的特征。此外，微阵列数据通常表现出显著的维度不对称性，以及高级别的冗余和噪声。广泛认为，大多数基因对于所研究的类别缺乏信息价值。最近的研究试图通过采用各种特征选择技术来减少这种高维度性。本文提出了一种新的集成特征选择技术，通过Wilcoxon符号秩和检验（WCSRS）和Fisher检验（F-test）。在实验的第一阶段，进行了数据预处理；随后，通过WCSRS和F-test进行了特征选择，以使WCSRS和F-test的(p-value)概率值用于癌基因鉴定。提取的基因集用于使用集成学习模型（ELM）、随机森林（RF）、极限梯度增强（Xgboost）、Catboost和Adaboost对癌症患者进行分类。为了提高ELM的性能，我们使用Grey Wolf优化器（GWO）对所有ELM的参数进行了优化。实验分析是在结肠癌上进行的，其中包括62名患者（40例恶性和22例良性）的2000个基因。使用WCSRS测试进行特征选择时，经过优化的Xgboost展示了100%的准确率。然而，使用F-test进行特征选择时，经过优化的Catboost展示了100%的准确率。这相对于文献中以前报道的数值增加了15%。
Visits: 12
DIABETES & METABOLISM
2023
RoxanaADamilano,Nata...
[Clinical and evolutionary characteristics of incidental pituitary adenomas: retrospective multicenter study].
DIABETES & METABOLISM
垂体偶发病灶（PIs）是偶然在垂体成像中发现的，与垂体疾病无关的病变。我们进行了一项横断面、回顾性和描述性的研究，旨在分析科尔多瓦市一组PIs患者的临床和发展特点。共纳入67名患者，其中67%为女性，诊断时的中位年龄为44岁。导致首次成像要求的原因中，慢性或反复头痛最普遍（34%）。肿瘤的中位大小为12毫米，58%为巨大的偶发病灶。男性的病灶显著较大（p = 0.04）。在诊断时，包括两性在内，30%显示超出垂体周围的范围，45%侵犯海绵窦。21%的患者出现了神经-眼科损害。年龄与肿瘤大小呈正相关（r = +0.31，p = 0.001）。91%为非功能性肿瘤，21%的患者在首诊时出现了一个或多个激素缺乏。总体而言，26%需要进行手术。没有接受治疗的大部分患者在随访结束时肿瘤大小没有变化（中位数为42个月）。我们强调了我们系列中巨大偶发病灶的高频率，诊断时视野缺损和垂体功能减退症。虽然大多数未经手术的PIs保持稳定，但存在临床上有意义的病灶的高频率。
Visits: 15
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 15
AmyCFan,YusukeNakauc...
RUNX1 loss renders hematopoietic and leukemic cells dependent on interleukin-3 and sensitive to JAK inhibition.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
转录因子RUNX1中的疾病启动突变以遗传和体细胞事件的形式发生，导致患者预后特别差的白血病。然而，RUNX1在白血病发生中的作用尚未完全理解，并且针对RUNX1突变白血病的有效治疗仍然难以找到。在这里，我们使用原发性患者样本和RUNX1敲除模型中的原代人类造血细胞研究了RUNX1丧失如何促进白血病进展，并确定了可靶向的脆弱点。令人惊讶的是，我们发现RUNX1丧失会降低增殖能力和干细胞功能。然而，RUNX1缺乏的细胞选择性上调了白介素-3（IL-3）受体。与IL-3接触，而不是其他JAK/STAT细胞因子，可以解救RUNX1 KO的增殖和竞争缺陷。此外，我们证明了RUNX1丧失抑制了JAK/STAT信号传导，并使RUNX1缺乏的细胞对JAK抑制剂敏感。我们的研究发现了RUNX1突变白血病对IL-3/JAK/STAT信号传导的依赖性，这可能使这些侵袭性血液癌症能够通过现有药物进行靶向治疗。
Visits: 13
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Aug 15
SirleSaul,MarwahKari...
Anticancer pan-ErbB inhibitors reduce inflammation and tissue injury and exert broad-spectrum antiviral effects.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
针对多种病毒利用的宿主因子进行靶向干预可能提供广谱的疫情应对解决方案。我们在对4,413个化合物进行SARS-CoV-2抑制剂筛选中发现了17个不同功能的候选物。我们证明了拉帕替尼和其他ErbB家族受体酪氨酸激酶抑制剂可以抑制SARS-CoV-2、委内瑞拉马脑炎病毒(VEEV)和其他高抗药性的新兴病毒的复制。拉帕替尼抑制了SARS-CoV-2的进入和后期病毒生命周期，并与直接抗病毒药物尼曼替韦尔显示出协同作用。我们发现ErbB1、2和4与SARS-CoV-2 S1蛋白结合，并调节病毒及ACE2的内化，它们对VEEV感染是必需的。在人类肺器官样结构中，拉帕替尼可以保护免受SARS-CoV-2诱导的ErbB调节的途径激活，这些途径与非感染性肺损伤、促炎细胞因子产生和上皮屏障损伤有关。拉帕替尼可以抑制VEEV的复制、细胞因子产生和微流控基础的人类神经血管单位的血脑屏障完整性破坏，并在致命感染小鼠模型中降低死亡率。我们验证了拉帕替尼介导的ErbB活性抑制作为抗病毒作用的重要机制。这些研究结果揭示了ErbBs通过调控病毒复制、炎症和组织损伤的方式，为抗击新兴病毒的再利用、ErbB靶向方法的原理提供了初步证明。
Visits: 13
JCI Insight
2023 Aug 15
AyaGElmarsafawi,Rebe...
Modulating the polyamine-hypusine axis controls generation of CD8+ tissue resident memory T cells.
JCI Insight
谷氨酰氨合酶代谢重编程是T细胞活化的标志。对抗原激活效应因子CD8+ T细胞进行同位素示踪分析表明，谷氨酸是合成多胺——腐胺、亚精胺和精胺的主要碳源。这些代谢物在活化诱导的T细胞增殖以及嘌呤中的产生起着重要作用，而嘌呤来源于亚精胺，与转运延长因子eIF5A形成共价键。本研究表明，谷氨酰氨合酶-多胺-嘌呤轴调控了CD69的表达，CD69是组织内驻留记忆T细胞（TRM）的重要调节因子。阻断这一回路可以增加TRM细胞在外周血液和骨髓中的体外和体内形成，骨髓是TRM细胞的明确位置。此外，阻断多胺-嘌呤轴可以增强人外周血液和肉瘤肿瘤浸润淋巴细胞中CD8+ T细胞的CD69表达以及IFN-γ和TNF-α的产生，同样对人CD8+CAR-T细胞也能起到同样的增加作用。综上所述，这些发现支持通过利用多胺-嘌呤回路来调节TRM细胞以获得治疗效果的观点。
Visits: 16
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 15
MdJunayedNayeen,Jade...
Structure-Based Design of Transport-Specific Multitargeted One-Carbon Metabolism Inhibitors in Cytosol and Mitochondria.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
多靶点制剂可提供对肿瘤的选择性，降低药物耐药性和剂量限制性毒性。我们先前描述了一种对早期和晚期胰腺肿瘤具有有限肿瘤选择性的多靶点的6-取代吡咯并[3,2-d]嘧啶抗叶酸类似物1。通过结构基础设计，使用我们的人源丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT) 2和甘氨酸核糖核苷酸甲酰转移酶(GARFTase)结构，以及5-氨基咪唑-4-羧酸核苷酸甲酰转移酶/肌苷酸单磷酸环水合酶(ATIC)，SHMT1和叶酸受体(FR)α和β的已发布X射线晶体结构，我们获得了11个类似物。通过在分子中引入具有广泛构象灵活性的结构，设计了多靶点抑制和选择性肿瘤转运。通过代谢物拯救，我们确定了线粒体C1代谢以及新陈代谢嘌呤生物合成作为目标途径。与1相比，我们确定了通过叶酸受体(FRs)进行肿瘤选择性转运并增加SHMT2、SHMT1和GARFTase抑制力的类似物(分别增加了28倍、21倍和11倍)。这些多靶点制剂代表了一种令人兴奋的用于靶向癌症治疗的新结构模式，具备比临床使用的抗叶酸类药物更高的选择性和效力优势。
Visits: 12
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 15
Marius-KonstantinKle...
AML with complex karyotype: extreme genomic complexity revealed by combined long-read sequencing and Hi-C technology.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
复杂核型（CK-AML）的急性髓系白血病与不良预后有关，而这部分仅能部分解释为潜在的TP53突变所致。尤其是在存在复杂染色体重排（如染色体结块）的情况下，CK-AML的预后非常不好。然而，基因组重排的复杂性程度对CK-AML的白血病致病表型和治疗抵抗性的贡献仍然大部分未知。我们在一个定义明确的CK-AML队列中应用一种综合分析工作流来检测结构变异（SV），该工作流基于牛津纳米孔（ONT）基因组DNA长读测序（gDNA-LRS）和高通量染色体确认捕获（Hi-C）技术。我们确定了具有极高SV密度的区域。这些重排在很大程度上由靠近哺乳动物广泛间隔重复（MIR）元素的局限性扩增组成，这些扩增通常会导致致癌融合转录本（如USP7::MVD）或致癌驱动基因的失调，这些结果通过RNA-seq和ONT直接cDNA测序得到了确认。我们将这一新现象命名为染色质大灾变。因此，我们综合运用gDNA-LRS和Hi-C的SV检测工作流能够以非常高的分辨率解析那些通过传统测序技术很难分析的区域中的复杂基因组重排，从而提供了一个重要工具来确定复杂核型癌症患者中的新致病驱动因子。版权 © 2023年美国血液学会。
Visits: 16
Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 15
JianxuChen,ZhijieXu,...
SETD1A drives stemness by reprograming epigenetic landscape in hepatocellular carcinoma stem cells.
Epigenetics & Chromatin
肿瘤干细胞（CSCs）负责肿瘤的进展和复发。然而，调控肝细胞癌（HCC）干性的机制尚不清楚。应用基因组规模的CRISPR敲除筛选，我们发现H3K4甲基转移酶SETD1A和Trithorax群蛋白的其他成员驱动HCC的肿瘤干性。SETD1A与HCC患者的临床不良结果呈正相关。SETD1A与血清甲胎蛋白的联合使用显著提高了预测HCC复发的准确性。在机械上，SETD1A促进多种修饰组蛋白酶的转录激活，促进H3K4me3和H3K27me3的沉积，活化致癌增强子和超级增强子，从而同时激活致癌基因和失活肿瘤抑制基因在HCC CSCs中。此外，SETD1A与PABPC1相互作用，共同调控致癌基因上的H3K4me3修饰。我们的数据将SETD1A确定为推动HCC干性和进展的关键表观遗传调控因子，突显了SETD1A作为HCC干细胞干预和治疗的候选靶点的潜力。
Visits: 15