研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Frontiers in Pharmacology
2023
YaqianTan,QiSong
Research trends and hotspots on the links between caveolin and cancer: bibliometric and visual analysis from 2003 to 2022.
Frontiers in Pharmacology
引言:大量的研究表明,蛋白质质膜组是细胞过程中的关键调控因子。最近,越来越多的证据表明,蛋白质质膜组在肿瘤进展中起着至关重要的作用。由于尚未发表相关的计量学研究,因此我们进行了计量学和可视化分析,以描绘与蛋白质质膜组与癌症相关的研究知识框架。方法:从Web of Science Core Collection数据库中获取了2003年至2022年期间发表的相关英文研究。使用VOSviewer、CiteSpace、R-bibliometrix等三个程序和计量学网站(http://bibliometric.com/)构建了基于国家、机构、作者、期刊、引用和关键词分析的网络。结果:共提取和鉴定了2463篇文献。美国发表文献最多且总引用次数最多,托马斯·杰斐逊大学是最有成果的机构。迈克尔·P·利桑蒂是这个研究领域中最有影响力的学者。《Cell Cycle》期刊是本主题上发表最多的期刊。最有本地引用的文献是题为《Caveolin-1 in oncogenic transformation, cancer, and metastasis》的文章。基于关键词和引用文献进行了全面的分析。最初的研究前沿主要涉及“信号转导”、“人类乳腺癌”、“癌基因转化细胞”、“肿瘤抑制基因”和“成纤维细胞”。而近年来,研究重点转向“肿瘤微环境”、“上皮间质转化”、“纳米颗粒”和“干细胞”。结论:综上所述,我们的计量学分析显示,蛋白质质膜组在癌症研究中仍然引起关注。研究热点和前沿已从癌症信号调控转向癌症治疗潜在靶点和新技术。这些结果可为未来研究的指导提供基于数据的参考。版权所有 © 2023 Tan and Song.
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Frontiers in Pharmacology
2023
Zhen-ChuTang,QiangQu...
Bibliometric analysis of evolutionary trends and hotspots of super-enhancers in cancer.
Frontiers in Pharmacology
引言:过去十年来,超增强子(Super-enhancer,SE)作为一个研究热点,受到人们在癌症发生、发展和预后方面的关注。为了揭示癌症研究中SE的热点和其演化趋势,对该主题进行了文献计量分析。方法:系统分类了2022年12月31日前发表在WOSCC上的文献,并使用Citespace、bibliometric.com/app和GraphPad Prism进行了数据分析。结果:在筛选掉不恰当的文献和重复数据后,选取了911篇文献进行进一步的文献计量分析。前五个研究领域分别为肿瘤学(257,28.211%)、细胞生物学(210,23.052%)、生物化学与分子生物学(209,22.942%)、科学技术与其他主题(138,15.148%)和遗传学与遗传(132,14.490%)。美利坚合众国(United States)是文献数量最多的国家(462,50.71%),其次是中国(303,33.26%)。在最具产出的机构中,美国有四个,新加坡有一个,即新加坡国立大学。哈佛医学院(7.68%)的文章百分比最高。Richard A是发表文章数量最多的作者,共发表了32篇文章。前三名作者来自白头研究所的一个研究团队。超过三分之二的研究得到了美国国立卫生研究院的支持(337,37.654%)和美国健康与人类服务部(337,37.654%)。"超增强子"(525)、"细胞身份"(258)、"表达"(223)、"癌症"(205)和"转录因子"(193)是前五个关键词。讨论:自2013年以来,与SE和癌症有关的文献呈现快速增长的趋势。美国在该领域继续发挥领导作用,因为文献数量、机构、资助机构和作者均来自美国,其次是中国和欧洲国家。多个国家之间存在着密切的合作关系。SE在细胞身份、基因转录、表达和抑制,以及SE和转录因子之间的关系,以及对SE的选择性抑制等方面引起了广泛关注,表明这些是研究的热点问题(本文引自:唐,屈,滕,庄,徐和屈,2023)。
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Frontiers in Pharmacology
2023
YinShi,DiXiao,Shuish...
Cost-effectiveness of maintenance niraparib with an individualized starting dosage in patients with platinum-sensitive recurrent ovarian cancer in China.
Frontiers in Pharmacology
目的:与例行监测相比,Niraparib可以改善铂敏感复发性卵巢癌(PSROC)患者的生存时间,但伴随着增加的费用。基于NORA试验,我们首次评估了中国个体化起始剂量(ISD)维持性Niraparib的经济效益。方法:建立了马尔科夫模型,模拟了每种策略的费用和健康结果。测量了总费用、质调整生命年(QALY)和增量费用效益比(ICER)。进行了一维和概率敏感性分析,以估计模型的稳健性。还进行了情景分析。结果:与例行监测相比,Niraparib在有无生殖系BRCA(gBRCA)突变的人群中,QALY分别增加了0.59和0.30,增量费用分别为10,860.79美元和12,098.54美元。Niraparib相对于例行监测的ICER分别为18,653.67美元/QALY和39,212.99美元/QALY。在37,488美元/QALY的意愿支付(WTP)阈值下,ISD提高了gBRCA突变组中从9.35%到30.73%的经济效益概率,以及非gBRCA突变人群中从0.77%到11.74%的概率。在中国人均国内生产总值最高的地区,Niraparib 在gBRCA突变和非gBRCA突变人群中分别有74.23%和76.10%的经济效益概率。针对上述WTP阈值,对于全国基本医疗保险受益人,Niraparib的经济效益为100%。结论:与例行监测相比,对于PSROC的维持治疗,gBRCA突变人群中的Niraparib的ISD是经济有效的,在非gBRCA突变患者中则更加有效但代价高昂。优化的Niraparib价格、经济地位和医疗保险覆盖可能有助于领域经济结果。 版权所有 © 2023 Shi, Xiao, Li, Liu and Zhang.
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Frontiers in Pharmacology
2023
MohiniChaurasia,Romi...
A review of FDA approved drugs and their formulations for the treatment of breast cancer.
Frontiers in Pharmacology
乳腺癌是全球最常见的实体肿瘤之一。多年来,人们一直进行着广泛的研究,以应对用于治疗实体肿瘤的选择性化合物的挑战。该文章旨在总结美国FDA批准或正在审批用于乳腺癌治疗或缓解的治疗药物。结构化的检索被用于在以往发表的同行评审研究论文中寻找注册分子的数据,并根据用于不同乳腺癌分期的一线/辅助治疗中使用的各类药物划分数据。我们收录了300多篇同行评审的论文,包括研究论文和综述文章,以便为读者提供有用的全面信息。讨论了39种药物的当前状况、剂量方案、作用机制、药代动力学、可能的副作用和市售制剂。文章另一个有趣的方面是关注目前正在临床试验或正在进行批准过程中的这些药物的新型制剂。这个详尽的综述将成为从事这些药物制剂开发领域的研究人员的一站式解决方案。版权所有©2023 Chaurasia、Singh、Sur和Flora。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Aug 07
LeiYang,ChenxuZhai,Y...
CFHA-Net: A polyp segmentation method with cross-scale fusion strategy and hybrid attention.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
现代时代,结直肠癌是一种常见疾病,其中大多数病例由息肉引起。因此,医学图像分割领域对息肉分割的关注度很高。近年来,基于U-Net网络的变种网络已经在息肉分割挑战中展示出良好的分割效果。本文提出了一种称为CFHA-Net的息肉分割模型,该模型结合了交叉尺度特征融合策略和混合注意机制。受到特征学习的启发,编码器单元引入了交叉尺度上下文融合(CCF)模块,该模块执行跨层特征融合,增强不同尺度的特征信息。通过提出的三重混合注意(THA)模块对跳跃连接进行优化,汇聚了来自三个方向的空间和通道注意特征,改善了特征之间的远距离依赖性,有助于识别随后的息肉病变边界。此外,在瓶颈层增加了密集感知特征融合(DFF)模块,该模块组合了密集连接和多感受野融合模块,以捕获更全面的上下文信息。此外,提出了混合池化(HP)模块和混合上采样(HU)模块,以帮助分割网络获取更多上下文特征。针对息肉分割的三个典型数据集(CVC-ClinicDB、Kvasir-SEG、EndoTect)进行了一系列实验,以评估所提出的CFHA-Net的有效性和泛化性。实验结果证明了所提方法的有效性和泛化性,许多性能指标超过了相关先进分割网络。因此,所提出的CFHA-Net可能是医学图像分析中解决息肉分割挑战的有希望的解决方案。所提出的CFHA-Net的源代码可在https://github.com/CXzhai/CFHA-Net.git获得。版权所有©2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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Comput Meth Prog Bio
2023 Aug 05
SalvinSPrasad,Ravine...
Enhanced joint hybrid deep neural network explainable artificial intelligence model for 1-hr ahead solar ultraviolet index prediction.
Comput Meth Prog Bio
太阳紫外线(UV)辐射暴露可能导致恶性角质细胞癌和眼部疾病。开发一种用户友好、便携、实时的太阳紫外线警报系统,特别是适用于可穿戴式电子移动设备,有助于减少紫外线暴露,作为个人和职业性紫外线风险管理的关键措施。本研究旨在设计一种受人工智能启发的早期预警工具,用于针对澳大利亚高紫外线暴露的热点地区的紫外线指数(UVI)的短期预测,该工具整合了卫星获取的和基于地面的预测因素。该研究还使用可解释的人工智能方法提高了新设计工具的可靠性。 采用增强型联合混合可解释深度神经网络模型(称为EJH-X-DNN),该模型包括特征选择和超参数调整两个阶段,使用贝叶斯优化进行。通过与其他六个竞争基准模型的全面评估,我们进一步验证了EJH-X-DNN模型的可靠性。提出的模型使用局部解释性模型无关解释(LIME)、Shapley可加性解释(SHAP)和置换特征重要性(PFI)等强大的模型无关解释框架进行局部和全局解释。 新提出的模型在预测小时紫外线指数方面表现出色,针对达尔文、艾丽斯泉、汤斯维尔和埃默拉尔德等热点地区,相关系数分别为0.900、0.960、0.897和0.913。根据基于现场的综合局部和全局解释模型结果,先前滞后的UVI和太阳天顶角是影响因素。EJH-X-DNN模型的预测受到臭氧效应、云情况和降水等因素的强烈影响。 UVI预测系统以其卓越性和熟练解释的能力,再次证实了提供实时紫外线警报以减轻皮肤和眼部健康并发症风险、降低医疗费用并为户外暴露政策做出贡献的好处。 版权所有 © 2023 作者。由Elsevier B.V.出版。保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023
JuyiLi,ChengzhiHe,Ji...
Identification of a novel CNV at the APC gene in a Chinese family with familial adenomatous polyposis.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
引言:家族性腺瘤性息肉病(FAP)是第二常见的遗传性结直肠癌(CRC)易感病,其原因是由腺瘤性息肉病大肠杆菌(APC)基因的生殖细胞突变所引起。本研究分析了两个FAP家族的分子缺陷和临床表现,并提出了适合不同家族突变携带者的个体预防策略。方法和结果:通过全外显子测序确定了这两个家族中的致病基因突变,并通过Sanger测序或定量聚合酶链反应(qPCR)进行了验证。APC基因中的一种新型(GRCh37:Chr5:112145676-112174368,del,28,692bp)和已知的一种(c.C847T:p.R283X)突变根据测序数据和家族成员的肿瘤发生模式,被确认为FAP的致病突变。这两种突变导致了翻译过程的过早终止信号,从而合成了缺失或破坏的蛋白质产物。结论:我们的发现扩展了中国人口中腺瘤性息肉病大肠杆菌(APC)基因的已知生殖细胞突变谱。这再次证实了FAP中基因测试的重要性。针对具有APC表达缺陷的患癌家族的个体化治疗,需要进行遗传咨询和定期随访。还需要进一步研究基于突变类型的FAP的安全有效的化疗和免疫疗法的开发。版权所有© 2023 Li、He、Gong、Wang、Liu、Deng和Zhu。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023
YanghaoWang,GuoyuLi,...
Multi-omics analysis of LAMB3 as a potential immunological and biomarker in pan-cancer.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
Laminin亚单位β3(LAMB3)是一个转录因子,参与laminin的编码。它通过调控各个靶基因和信号通路,在细胞增殖、粘附和转移等方面起着重要作用。然而,在人类全癌症免疫学和预后中,LAMB3的作用仍然不明确。本研究利用TCGA、GTEx、CCLE和HPA数据库分析了LAMB mRNA和蛋白表达。利用TISIDB数据库研究了LAMB3在人类癌症的各种免疫和分子亚型中的表达情况。利用Kaplan-Meier和Cox回归分析研究了LAMB3在不同癌症和临床亚型中的预后意义。利用TCGA数据库研究了LAMB3表达与各种免疫细胞浸润、免疫检查点、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和DNA甲基化之间的关系。收集了4种肺癌细胞系和8例肺癌病例的临床样本,确认了LAMB3在肺癌中的mRNA表达。在17种癌症中,LAMB3的mRNA表达具有良好的诊断和预后价值,共有22种癌症。Cox回归和Nomogram分析显示,LAMB3是15种癌症的独立风险因素。根据GO、KEGG和GSEA结果,LAMB3参与了多种肿瘤发生和免疫相关的信号通路。LAMB3的表达与33种癌症类型的TMB相关,与32种癌症类型的MSI相关,而在肺癌中,LAMB3的表达与免疫细胞浸润密切相关,并与所有七个甲基化的CpG岛呈负相关。细胞实验证明,LAMB3促进肿瘤细胞的恶性行为。初步的机制探索揭示了LAMB3与PD-L1、CTLA4、细胞干性基因CD133和β-连环蛋白相关的信号通路的密切关联。根据这些发现,LAMB3可能是免疫治疗和肿瘤预后的潜在治疗靶点。我们的发现揭示了LAMB3在不同癌症类型中的重要作用。版权所有 © 2023 王、李、王、王、王、罗、赵、李和边。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 14
NoritakaMatsuda,Nori...
Clinical course and prognosis of patients with hepatocellular carcinoma and haemophilia.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
虽然众所周知,血友病患者患原发性肝癌(HCC)的年龄比没有此病的患者更低,但关于HCC的临床过程和预后的报道很少。我们的目标是调查HCC和血友病患者的临床过程和预后。我们收纳了在2003年至2021年间最初诊断为HCC的22名血友病患者,并对他们的临床进程和预后进行了回顾性分析。将结果与全国24个HCC病例的随访调查进行比较。所有22名病人均为男性,其中20名病人患有血友病A,2名患者患有血友病B。平均诊断年龄为63岁(范围为45-78岁),低于全国调查报告的平均年龄72岁。最大肿瘤的平均直径为30毫米(范围为11-70毫米),18个肿瘤(82%)在初始诊断时是单发的。所有病例均接受了HCC的标准治疗。进行了61例经动脉化学栓塞治疗、28例射频消融、10例部分切除术和2例放射治疗,并在治疗过程中给了5例病人分子靶向药物治疗。没有与HCC治疗并发症相关的死亡事件。初始治疗后的中位生存时间为6.4年(范围为0.9-18.7年),与全国调查中的中位生存时间5.8年相差不大。HCC的标准治疗能够改善HCC和血友病患者的预后。Copyright © 2023 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 14
MartinCSWong,JunjieH...
Risk prediction of bladder cancer among diabetes patients: a derivation and validation study.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
本研究旨在设计和验证一种临床评分系统,用于预测糖尿病患者膀胱癌的风险,以指导紧急膀胱镜检查评估。从中国人群(2009-2018年)的大型数据库中选择接受膀胱镜检查的糖尿病患者作为研究对象。我们从所有病人中随机抽样形成一个建模队列。使用独立危险因素的调整后的比值比(aORs)设计了一个包含0到5分的风险评分系统,0-2分为“平均风险”(AR),3-5分为“高风险”(HR)。共选取5905名糖尿病患者,其中包括123名膀胱癌患者。建模队列(n=4174)和验证队列(n=1731)的患病率分别为2.2%和1.8%。根据构建的评分系统,建模队列中79.6%的患者被分类为AR组,20.4%的患者被分类为HR组。AR组和HR组的患病率分别为1.57%和4.58%。风险评分包括年龄(18-70岁:0分;>70岁:2分)、男性(1分)、现在或曾经吸烟(1分)、糖尿病持续时间(≥10年:1分)。HR组的患者与AR组相比,患膀胱癌的比例增加3.26倍(95% CI=1.65 to 6.44, p=0.025)。协调统计值为0.72,表明风险评分具备良好的判别能力,可用于筛选高风险个体,提前考虑膀胱镜检查。该风险预测算法可帮助确定膀胱镜检查的紧急程度,从而更有效地利用资源,有助于早期发现确定要转诊的膀胱癌患者。本文受版权保护,版权所有。
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