肿瘤微环境（TME）中的原肿瘤和抗肿瘤网络之间存在复杂的相互作用。在肿瘤发生过程中，恶性细胞与TME的各种细胞之间的通讯对代谢重编程起到了贡献。肿瘤代谢通路的失调在TME中提供了进化上的优势，并增强了肿瘤的进展、侵袭性和转移能力。因此，了解TME内部的这些相互作用对于开发创新的癌症治疗非常重要。细胞外囊泡（EVs）作为携带各种材料（包括microRNA、蛋白质和脂质）的载体，在肿瘤细胞与非肿瘤细胞之间的通讯中起到至关重要的作用。EVs积极参与代谢重编程过程。本综述总结了近期有关肠胃癌TME中不同细胞的EVs参与代谢重编程的研究发现。此外，我们还强调了参与这一组癌症重编程过程的microRNA，并解释了外泌体中的货物所针对的异常肿瘤代谢以及新的潜在治疗方法。 Copyright © 2023 The Authors. Published by Elsevier Ltd.. All rights reserved.

本研究旨在比较在核心结合因子急性髓系白血病（CBF-AML）患者中，赫马哈林汀联合阿糖胞苷和阿格来替宁（HAA）方案与伊达鲁替宁联合阿糖胞苷（IA）方案作为首次诱导化疗的疗效。使用Cox回归模型和倾向性分数匹配（PSM）来确定与更好的缓解率和预后相关的方案。总共374例CBF-AML患者（243例RUNX1::RUXN1T1和131例CBFB::MYH11）被纳入本研究。患者首次诱导治疗接受HAA或IA方案（每组187例）。对于RUNX1::RUXN1T1携带者，多变量分析显示HAA方案与首次诱导后的较高完全缓解/缓解不归类（hazard ratio [HR] = 5.3 [95% CI 2.3, 12.2]; p < 0.001）和较好的无复发生存期（RFS）（HR = 0.5 [0.3, 0.8], p = 0.01）显著相关。PSM分析中，HAA方案在CR/CRi率上也较高（96% vs. 77%，p < 0.001），特别是对于携带野生型KIT（KITWT）（96% vs. 83%，p = 0.02）或非D816 KIT突变的患者（100% vs. 63%，p = 0.002），以及较好的RFS（p = 0.01），与IA方案相比。然而，对于CBFB::MYH11携带者，两种方案在缓解率和预后方面无差异。赫马哈林汀联合阿糖胞苷和阿格来替宁方案作为首次诱导化疗在RUNX1::RUNX1T1 AML患者中，特别是对于携带KITWT和非D816 KIT突变的患者，以及较好的RFS方面与IA方案相比表现出较高的CR/CRi率。两种方案在CBFB::MYH11携带者中的疗效无差异。© 2023. 作者，独家授权给Springer-Verlag GmbH Germany，属于Springer Nature。

三维器官结构已广泛应用作为可追踪的体外模型，用于阐明人类发育和疾病的方面。然而，人工和低通量的培养方法，以及低可重复性和几何异质性限制了器官结构研究的范围和应用。结合干细胞生物学和生物工程领域的专业知识，为解决这些限制提供了一种有希望的方法。在这里，我们使用熔融静电纺丝写入技术生成可调控的网格支架，可以引导多能干细胞自组织成图案排列的胚胎体。我们展示了网格几何结构是干细胞自组织的关键因素，通过曲率控制的组织生长，引导出发生的腔隙的位置和大小。我们报道了两种不同的方法，将获得胚胎体的网格培养到连通或空间离散型的脑器官结构。这些支架提供了一种高通量方法，用于生成、培养和分析大量器官结构，大大降低了传统器官结构培养方法所需的时间投资和人工劳动。我们预计，这种方法的发展将在引导多能干细胞培养、研究腔隙形成以及生成大量均匀器官结构进行高通量筛选方面开辟新的机会。本文受版权保护。版权所有。

细胞经常在缺乏营养条件下改变代谢策略，以支持其生存和生长。对肿瘤微环境（TME）中的代谢重编程进行表征在癌症研究和患者护理中具有新兴的重要性。然而，最近的技术只能测量代谢产物的子集，并且无法提供原位测量。计算方法，如通量平衡分析（FBA），已经发展出来，可以从批量RNA测序（RNA-seq）数据估计代谢通量，并且可能扩展到单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据。然而，目前的方法的可靠性尤其在TME表征中还不清楚。在这里，我们提出了一个计算框架METAFlux（METAbolic Flux平衡分析），从批量或单细胞转录组数据推断代谢通量。使用细胞系、癌症基因组图谱（TCGA）和从不同癌症和免疫治疗背景中获得的CAR-NK细胞疗法的单细胞RNA测序数据等大规模实验证实了METAFlux表征细胞类型之间代谢异质性和代谢相互作用的能力。© 2023. Springer Nature Limited.

白血病的一个特点是它含有多种信号转导基因的重排和非突变基因的过度表达，如转录因子。作为造血干细胞发育和红细胞生成的重要调节因子，LMO2在T细胞系中被认为是有效的致癌驱动因子，并在具有正常染色体结构的急性髓系白血病患者中被视为不良预后标志物。LDB1是由LMO2引发的转化成为T-ALL的重要因子，并增强了白血病中致癌相关蛋白的稳定性。然而，LMO2和LDB1在AML中的功能和机制仍不清楚。因此，本研究通过抑制LMO2基因观察其对NB4、Kasumi-1和K562细胞株的增殖、存活和克隆形成的影响。通过质谱和IP实验，我们的结果显示了AML细胞株中存在LMO2/LDB1蛋白复合物，与以前的研究结果一致。此外，体外和体内实验揭示了LDB1对AML细胞株的增殖和存活至关重要。通过RNA-seq和ChIP-Seq结果的分析表明，LDB1可以调节与凋亡相关的基因，包括LMO2。在缺乏LDB1的AML细胞株中，LMO2的过表达部分弥补了增殖受抑制的情况。综上所述，我们的研究发现LDB1在AML中作为一个癌基因发挥着重要作用，并强调了LMO2/LDB1复合物在AML患者的临床治疗中的潜在重要性。 © 2023. 作者（们）。

癌症成像是一个迅速发展的领域，因为发现了新的分子靶点并提供了相应的技术来高精度、高准确度和高灵敏度地检测它们。核医学是目前最广泛使用的分子成像技术，并已经拥有一个不断增长的工具箱，用于非侵入性地实现全身肿瘤的可视化、分期和治疗监测。手术室需要类似的成像功能，这导致荧光引导手术（FGS）作为一种强大的技术出现，使外科医生具备了区分肿瘤和健康组织的前所未有的能力。虽然已经采用了多种策略为FGS开发对比剂，但使用放射性药物作为模型具有显著的转化潜力，并日益得到探索。本文回顾了用于将临床使用的放射性药物转化为荧光和多模态对应物的策略。还讨论了基于放射性药物的药剂设计带来的独特的临床和临床前能力，以阐明这种方法的优势。 版权所有©2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。

固体肿瘤和转移瘤的肿瘤微环境中的巨噬细胞是异质性群体，对肿瘤发生的不同阶段起到了贡献。肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）可以从循环源的单核细胞或组织驻留巨噬细胞（TRMs）派生而来。在健康状态下，TRMs可以在大多数组织中分布，协调关键的稳态和修复功能。虽然TRM在肿瘤的发生和进展中的特定功能尚不清楚，但最近的研究表明，在小鼠和人类癌症中，TRM是TAM的重要来源，其基因签名与其正常的器官特异性TRM相近。本综述旨在突出最近对TRM作为重要的TAM亚群的作用的系统理解，并探讨这种巨噬细胞群体如何被用于治疗靶向策略的机会。 版权所有 © 2023 作者。由Elsevier Ltd.发表。保留所有权利。

近年来，深度学习通过开发强大的深度神经网络，在医学图像分割领域引起了革命性的变革。然而，这些模型往往复杂且计算需求量大，给在临床环境中实际应用带来挑战。为了解决这个问题，我们提出了一种高效的结构化知识蒸馏框架，利用强大的教师网络来帮助训练轻量级的学生网络。具体而言，我们提出了特征过滤蒸馏方法，该方法侧重于传输区域级别的语义信息，同时最小化从教师到学生网络的冗余信息传输。这种方法有效地缓解了由于内部器官特征相似而导致的分割不准确的问题。此外，我们还提出了区域图蒸馏方法，该方法利用图的高阶表达能力，使学生网络能够更好地模仿教师的结构化语义信息。为了验证我们提出的方法的有效性，我们使用各种网络模型在Synapse多器官分割和KiTS肾肿瘤分割数据集上进行了实验证明。结果表明，我们的方法显著提高了轻量级神经网络的分割性能，Dice系数提高了高达18.56%。重要的是，我们的方法在不引入额外模型参数的情况下实现了这些改进。总体而言，我们提出的知识蒸馏方法为高效的医学图像分割提供了可行的解决方案，使医学专家能够进行更准确的诊断和改善患者治疗。© 2023 Elsevier Ltd.版权所有。

长链非编码RNA（lncRNA）是一组日益扩大的顺式／反式调控RNA基因，其数量超过了蛋白编码基因。尽管被越来越多地发现，但大多数lncRNA在多样的生物条件下的功能作用尚未定义。越来越多的证据支持lncRNA在包括流感、肝炎、冠状病毒和人类免疫缺陷病毒在内的各种病毒感染的产生、调控和进展中起关键作用。因此，鉴定出具有特征性的lncRNA将有助于对它们在感染过程中的靶点和调控机制进行重点分析。为此，我们编制了2803个在各种哺乳动物细胞中被33种病毒株调控的lncRNA，并通过名为VirhostlncR（http://ciods.in/VirhostlncR/）的资源提供。VirhostlncR集成了有关每种病毒株的信息，包括感染程度、感染持续时间、宿主细胞名称和细胞类型、lncRNA表达折变以及它们的特异性鉴定方法。基于当前的数据集，我们报告了150个lncRNA的扰动，包括分化拮抗性非蛋白编码RNA（DANCR）、转移相关肺腺癌转录本1（MALAT1）、母源性表达基因3（MEG3）、核副小体总装转录本1（NEAT1）和浆细胞瘤变异易位转录1（PVT1），它们受到两种或更多病毒的干扰。通过对病毒蛋白与人类转录因子（TFs）或含有TF的蛋白复合物的相互作用进行分析，发现不同的病毒可以通过多种蛋白复合物对许多这些lncRNA进行转录调控。综上所述，我们相信当前的数据集将能够优先选择lncRNA以鉴定它们的靶点，并作为分析病毒感染中非编码RNA调控的有效平台。版权所有 © 2023. 由Elsevier公司出版。

可靠的皮肤癌诊断模型在早期筛查和医疗干预中起着重要作用。现有的计算机辅助皮肤癌分类系统采用了深度学习方法。然而，最近的研究发现它们对敌对攻击极其脆弱，敌对攻击往往会对皮肤癌诊断模型的性能产生无法察觉的扰动。为了缓解这些威胁，本文提出了一个简单、有效和资源高效的防御框架，通过对皮肤癌图像中的敌对扰动进行逆向工程。具体而言，首先建立了一个多尺度图像金字塔，以更好地保留医学成像领域的差异化结构。为了中和敌对影响，然后通过向不同尺度的皮肤图像注入各向同性高斯噪声来逐渐扩散敌对样本，将其移动到干净图像空间中。关键是，为了进一步逆向敌对噪声并抑制冗余注入的噪声，还精心设计了一种新颖的多尺度去噪机制，它从相邻尺度聚合图像信息。我们在ISIC 2019上评估了我们方法的防御效果，这是一个最大的皮肤癌多类别分类数据集。实验结果表明，所提出的方法能够成功逆转不同攻击的敌对扰动，并在防御皮肤癌诊断模型方面显著优于一些最先进的方法。 版权所有 ©2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。