研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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International Journal of Biological Sciences
2023
YunhongXu,JunLi,Kuik...
FIBP interacts with transcription factor STAT3 to induce EME1 expression and drive radioresistance in lung adenocarcinoma.
International Journal of Biological Sciences
肺腺癌放疗过程中癌细胞不可避免地会发展出放射抗性,然而相关机制尚未完全阐明。在本研究中,我们发现肺腺癌组织中FIBP蛋白的表达上调,并与不良的总体生存率相关。功能上,我们发现FIBP的缺乏抑制了体外和体内的肺腺癌进展和放疗抗性。此外,我们揭示了FIBP与STAT3的相互作用,增强其转录活性,从而诱导下游靶基因EME1的表达。重要的是,我们证明了FIBP的生物学效应在肺腺癌中部分依赖于EME1。我们的工作揭示了FIBP通过调控STAT3/EME1轴来推动肺癌的进展和放疗抗性,表明靶向FIBP可能是肺腺癌放疗的一种新型干预策略。© 作者。
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International Journal of Biological Sciences
2023
EunjiKim,LailyRahmaw...
Protection of c-Fos from autophagic degradation by PRMT1-mediated methylation fosters gastric tumorigenesis.
International Journal of Biological Sciences
AP-1和PRMT1是细胞进程中至关重要的分子,但是这些蛋白质在细胞功能上的相互作用还不太清楚。胃癌是全球一种恶性疾病。对胃肿瘤发生机制的深入了解仍然是模糊的。在这项研究中,我们发现PRMT1直接与c-Fos相互作用,增强AP-1的激活。PRMT1介导的c-Fos的精氨酸甲基化(单甲基化和双甲基化)协同增强了c-Fos介导的AP-1活性,因此增加了c-Fos蛋白的稳定性。与此发现一致,PRMT1敲降降低了c-Fos蛋白水平。我们发现c-Fos蛋白经历自噬降解,并发现PRMT1介导的R287甲基化保护c-Fos免受自噬体降解的影响,并与胃肿瘤的临床病理学变量和预后相关。综上所述,我们的数据表明PRMT1介导的c-Fos蛋白稳定促进了胃肿瘤的发生。我们认为针对这种修饰可能构成胃癌的新治疗策略。© 作者(们)。
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International Journal of Biological Sciences
2023
ChengpengGui,Jinhuan...
Therapeutic implications for localized prostate cancer by multiomics analyses of the ageing microenvironment landscape.
International Journal of Biological Sciences
背景:许多研究已经证实了人类衰老与恶性肿瘤(特别是前列腺癌)进展之间的关联。然而,据我们所知,还没有研究全面阐明前列腺癌中衰老微环境(AME)的复杂特征。方法:采用NMF算法确定AME的调控模式。然后构建了一种衰老微环境指数(AMI),具有出色的预后和免疫疗法预测能力,并通过空间转录组学进行了临床相关性调查。此外,使用癌症药物敏感性基因组学(GDSC)、连通性图(CMap)和CellMiner数据库分析了前列腺癌患者的药物反应。最后,采用体外和体内实验研究了AME。结果:在813名前列腺癌患者中确定了三种不同的AME调控模式,与不同的临床预后和生理途径相关。基于AMI,前列腺癌患者被分为高分和低分亚组。较高的AMI分数与更多的免疫细胞浸润、生化复发率(BCR)更高以及前列腺癌对免疫疗法、抗雄激素治疗和化疗的反应更差显著相关。此外,我们发现比卡鲁胺和恶椴酚的组合能够抑制前列腺癌的肿瘤生长。此外,作为AMI的主要成分,COL1A1和BGLAP充当了癌基因的角色,并通过体内和体外实验进行了验证。结论:AME调控与TME的多样性和复杂性显著相关。对AME调控模式的定量评估可能为前列腺癌的个体化治疗提供有希望的新型分子标志物。©作者。
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International Journal of Biological Sciences
2023
XiukunHou,MengranTia...
PARP inhibitor shuts down the global translation of thyroid cancer through promoting Pol II binding to DIMT1 pause.
International Journal of Biological Sciences
甲状腺癌已成为最常见的内分泌相关恶性肿瘤。目前,越来越多的证据支持扩展PARP抑制剂在BRCA突变癌症之外的临床策略的效益。然而,PARP抑制剂在甲状腺癌中的功能和分子机制尚未完全理解。在这里,一方面,我们发现niraparib促进了甲状腺癌中DNA损伤的积累。另一方面,我们指出niraparib通过促进依赖于PAR的方式抑制DIMT1的转录,随后导致甲状腺癌中全局翻译抑制。同时,我们发现niraparib通过抑制p65的PARylation激活了NF-κB信号通路,从而通过E3泛素连接酶RNF146降低其泛素化和降解水平。此外,博泰泽米布(一种小分子抑制剂)能够显著增强niraparib在甲状腺癌中的抗肿瘤效应,无论是体外还是体内。我们的发现为BRCA突变癌细胞中PARP抑制剂的疗效提供了机制支持。©作者。
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International Journal of Biological Sciences
2023
QiFeng,YangYang,Kaid...
Broadening horizons: the multifaceted functions of ferroptosis in kidney diseases.
International Journal of Biological Sciences
铁死亡(Ferroptosis)是一种依赖铁离子的编程细胞死亡方式,其特征为铁离子过载、活性氧(ROS)积累和脂质过氧化。越来越多的观点认为铁稳态失衡和脂质代谢紊乱通过触发铁死亡在各种肾脏疾病中导致组织或器官损伤。目前,与铁死亡有关的关键调控因子和复杂的网络机制已经得到深入研究,然而,其在肾脏疾病发生和进展中的作用尚未完全揭示。在此,我们旨在讨论与铁死亡相关的特征、关键调控因子和复杂的网络机制,探索细胞器在铁死亡中的新兴作用,总结其药理学进展,并系统地总结铁死亡与肾脏疾病(包括肾细胞癌、急性肾损伤、糖尿病肾病、常染色体显性多囊肾病、肾纤维化、狼疮性肾炎及IgA肾病)之间的最新研究进展。此外,我们进一步总结了通过靶向铁死亡的潜在治疗策略,以预防和治疗肾脏疾病,并期望本文能为深入探究铁死亡在肾相关疾病发病机制中的作用提供启示。© 作者。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
2023 Aug 08
SigveNakken,Sveinung...
Comprehensive interrogation of gene lists from genome-scale cancer screens with oncoEnrichR.
INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
癌症中的基因组规模筛选实验会产生长长的候选基因列表,需要进行深入解读以获得生物学的洞察力,并为后续研究进行优先排序。解读基因列表通常是一个耗时且需要大量工作的过程,在这个过程中,实验生物学家通常会结合来自各种生物信息学资源的结果,以试图描绘和理解癌症的相关性。为了简化和加强这一努力的支持,我们开发了oncoEnrichR,这是一个灵活的生物信息学工具,允许癌症研究人员全面地探究给定基因列表与癌症相关性的多个方面。oncoEnrichR通过整合与癌症特异相关的大量先验知识,包括排名的基因-肿瘤类型关联、受文献支持的原癌基因和肿瘤抑制基因的注释、靶标可药性数据、调控相互作用、合成致死性预测,以及对肿瘤类型的预后相关、基因异常和共表达模式。该软件的主要输出是结构化和用户友好的分析报告,其中明确记录了所有底层数据资源的版本,后者是可复现科学的关键组成部分。我们通过对蛋白质组学和CRISPR筛选的两个候选列表的深入分析证明了oncoEnrichR的实用性。oncoEnrichR作为一个基于Galaxy平台(https://oncotools.elixir.no)提供的网络服务,可以免费获取,也可以作为一个独立的R包(https://github.com/sigven/oncoEnrichR)进行访问。© 2023 The Authors. International Journal of Cancer published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of UICC.
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INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
2023 Aug 09
SteffiTreitschke,Kat...
Ex vivo expansion of lung cancer-derived disseminated cancer cells from lymph nodes identifies cells associated with metastatic progression.
INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
肺癌的明显侵袭性的细胞基础尚不清楚,但很可能与转移性癌细胞(DCCs)的功能或分子特征有关。上皮癌细胞的DCCs主要通过针对细胞角蛋白或EpCAM等组织发生标志物的抗体检测得到。有人认为,标志物阴性的转移性创始细胞可能会逃避检测。因此,我们利用体外球体形成进行候选转移创始者的功能检测。我们从131例肺癌患者的199个淋巴结样本中制备细胞悬液,并将其放入非附着的细胞培养中。球体形成与使用EpCAM免疫细胞学检测DCCs以及显著较差的预后相关。球体形成的预后影响与EpCAM阳性DCCs的数量较多和扩展球体的异常基因型密切相关。我们还注意到,在没有淋巴扩散证据的患者中也有球体形成,然而这些球体的特征基因(与EpCAM阳性样本的球体相关)表达不频繁,并且既没有典型的肺癌突变(KRAS,TP53,ERBB1),也没有拷贝数变异,但可能与在根治手术后的5年以上的疾病进展有关。我们得出结论,EpCAM可以识别与疾病进展相关的DCCs,并且可以扩展此类细胞用于模型生成,还需进一步研究以阐明罕见的EpCAM阴性球体形成细胞的功能和预后作用。© 2023 The Authors. International Journal of Cancer published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of UICC.
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INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
2023 Aug 09
ThanhTHoang,JeremyMS...
Fetal growth and pediatric cancer: A pan-cancer analysis in 7000 cases and 37 000 controls.
INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
出生体重是某些儿科癌症的确立危险因素,但却与妊娠年龄和性别有关。此外,婴儿性别、诊断年龄、母亲种族/族裔和母亲国籍状况对关联可能有不同影响并不清楚。我们研究了1995年至2011年在德克萨斯州癌症登记处注册的一系列儿科肿瘤与孕周大小之间的关联。我们分析了高达7547例病例和37,735例对照组。采用 Logistic 回归进行了分析。体重过小 (SGA) 和体重过大 (LGA) 与多种肿瘤明显相关。SGA 与肝肿瘤呈正相关(aOR = 1.76,95% CI:1.13,2.74)。相反,Hodgkin淋巴瘤 (aOR = 0.41,95% CI:0.19,0.87) 和软组织肉瘤 (aOR = 0.65,95% CI:0.43,0.97) 与体重过小呈负相关。LGA 与急性淋巴细胞白血病 (aOR = 1.37,95% CI:1.19,1.57),Burkitt淋巴瘤 (aOR = 1.90,95% CI:1.05,3.45) 和生殖细胞瘤 (aOR = 1.55, 95% CI: 1.08, 2.23) 相关。当按婴儿性别分层分析时,结果没有差异。LGA 与白血病的关联在被诊断 1 至 5 和 6 至 10 岁时最强烈。按母亲种族/族裔分层分析时, LGA 与神经母细胞瘤和肾肿瘤的关联在母亲自称为非拉丁裔黑人的儿童中最强烈。在拉丁裔女性中,与墨西哥出生的妇女相关的LGA与白血病、中枢神经系统肿瘤、神经母细胞瘤和肾肿瘤的关联比美国出生的妇女的儿童更强(aOR 范围:1.61-2.25 vs 1.12-1.27)。孕周大小与多种儿科肿瘤相关。关联可能会因年龄诊断,母亲种族/族裔和国籍而有所不同。© 2023 UICC.
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Int J Biol Macromol
2023 Aug 08
Yu-WeiYen,Yi-LinLee,...
Fucoidan/chitosan layered PLGA nanoparticles with melatonin loading for inducing intestinal absorption and addressing triple-negative breast cancer progression.
Int J Biol Macromol
褪黑激素和海藻酸钠是天然的活性化合物,据报道它们对接受癌症治疗的患者具有治疗效益。然而,这两种化合物都面临着重大挑战,包括在胃肠道中的物理、化学和生物代谢,这限制了它们在肿瘤部位达到治疗浓度的能力。此外,褪黑激素和海藻酸钠在体内作为辅助剂的效果受到通过消化系统给药途径和其在肿瘤终点的积累的影响。在本研究中,我们开发了一种口服纳米颗粒剂MNPs@C@F,它由修饰了壳聚糖的PLGA纳米颗粒组成,以促进肠道微褶皱细胞经皮转运,将褪黑激素和海藻酸钠传递到肿瘤中。实验结果表明,经阿霉素治疗后,肿瘤中的褪黑激素和海藻酸钠可以通过减少P-gp、Twist、HIF-1α和抗炎免疫细胞的表达,以及增加细胞毒性T细胞群体而调节肿瘤微环境。这导致了化疗药物的敏感性增加、远处器官的转移抑制和免疫性细胞死亡的促进。本研究证明了一种有利的褪黑激素和海藻酸钠共运输系统,能够直接减少三阴性乳腺癌的药物抗性和转移。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 发布。
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Int J Biol Macromol
2023 Aug 08
GauthamDevendrapandi...
Direct sunlight induced room temperature synthesis of anticancer and catalytic silver nanoparticles by shrimp shell waste derived chitosan.
Int J Biol Macromol
海洋废弃物来源的壳聚糖(CS)用于合成纳米材料被认为是一种有效的生物废物管理和回收功能性产品的途径之一。在此,我们光化学合成了CS包覆的银纳米颗粒(Ag NPs-CS),具有潜在的抗癌和染料污染物吸附性能。为了获得CS,对虾壳废弃物经历了一系列的标准脱矿物质、去蛋白化和脱乙酰化过程。电子吸收峰(400 nm)表示Ag NPs表面等离子共振以及与CS相关的红外峰(3364 cm-1为OH/NH2,2932 cm-1为CH,1647 cm-1为-CO)证实了CS-Ag NPs的形成。Ag NPs-CS对人类肺腺癌细胞株(A549)显示出抗癌活性,最大细胞死亡浓度为20 μg/mL,分别为20%和52%。水溶性Ag NPs-CS(100 μg/mL)将混合染料目标溶液(25 mg/mL,含等体积阳离子染料亚甲基蓝和罗丹明B以及阴离子染料甲基橙)降解≥95%。因此,这些结果表明虾壳废弃物来源的CS可以用于合成具有潜在生物医学和环境应用的CS-Ag NPs。 版权所有 © 2023。Elsevier B.V.出版。
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