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肿瘤
Burns & Trauma
2023 Dec
HongqingZhao,Jiachen...
Promotion of skin wound healing using hypoimmunogenic epidermal cell sheets.
Burns & Trauma
伤口愈合的生理过程是动态、连续且复杂的。目前，自体皮肤移植被用于治疗全厚度烧伤伤口。然而，当发生大面积烧伤时，可供移植的供体位点较少，难以满足大规模皮肤移植的需求，增加了患者死亡的风险。本研究探讨了使用新近创建的低免疫原表皮细胞片来愈合皮肤创伤的可能性。采用Lentivirus转染技术生成过表达吲哚胺2,3-二氧化酶（IDO）的角质形成细胞（KCs）。通过Western blotting和定量聚合酶链反应测定IDO水平。通过CCK-8和Transwell实验评估IDO阳性角质形成细胞的功能。在角质形成细胞诱导培养基中培养KCs和成纤维细胞（FBs）以产生表皮细胞片。将BALB/c小鼠的全厚度皮肤切除物移植表皮细胞片。使用BALB/c裸鼠异种移植模型评估IDO阳性角质形成细胞的肿瘤发生性。在第12天通过CD3和CD31免疫荧光标记的创伤组织评估T淋巴细胞浸润和毛细血管发育。通过ELISA测定IL-1和TNF-α浓度。与对照组和阴性对照组相比，IDO阳性角质形成细胞显著增强了IDO mRNA和蛋白的表达水平，以及IDO阳性角质形成细胞的培养基中吡咯酮的含量。IDO组CD8+ T细胞的凋亡显著高于对照组和阴性对照组。然而，IDO阳性角质形成细胞的增殖和迁移能力与对照组和阴性对照组没有明显差异。无论是体外培养的低免疫原表皮细胞片还是体内移植实验都表明，IDO阳性表皮细胞片可以有效促进伤口愈合，且不具有肿瘤发生性。IDO阳性表皮细胞片可能通过降低伤口组织中炎症因子（TNF和IL-1）的表达水平、减少CD3+ T淋巴细胞的浸润和增加新生毛细血管来促进伤口愈合。本研究成功构建了低免疫原表皮细胞片，并证明低免疫原表皮细胞片能够加速伤口愈合。© 2023年日本再生医学学会。Elsevier B.V.制作和托管。
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Frontiers in Cell and Developmental Biology
2023
HaotingShi,JingxuanH...
Development and validation of a copper-related gene prognostic signature in hepatocellular carcinoma.
Frontiers in Cell and Developmental Biology
引言：需要可靠的生物标志物来预测肝细胞癌（HCC）的预后。尽管最近的证据已经确认铜平衡在肿瘤生长和进展中的关键作用，但之前没有研究过与铜相关的基因（CRG）在HCC中具有预后潜力的签名。方法：为了开发和验证HCC的CRG预后签名，我们回顾性地纳入了353名患者和142名患者作为开发和验证队列。使用具有预后价值的差异表达的CRG开发了铜相关预后签名（Copper-PSHC）。采用危险比（HR）和3年随访期内的时间相关接受者操作特征曲线下面积（AUC）评估其性能。此外，通过多变量Cox回归，将Copper-PSHC与年龄、性别和癌症分期结合构建了Copper-临床相关预后签名（Copper-CPSHC）。我们进一步通过分析体细胞突变、功能富集和肿瘤微环境来探索Copper-PSHC的潜在机制。筛选了高危组的潜在药物。结果：Copper-PSHC由9个CRG构建而成。高危组患者显示明显降低的总生存期（OS）（调整HR分别为2.65 [95% CI, 1.83-3.84]和3.30 [95% CI, 1.27-8.60] ，在开发队列和验证队列中）。Copper-PSHC在开发队列和验证队列中的OS的3年AUC分别为0.74 [95% CI, 0.67-0.82]和0.71 [95% CI, 0.56-0.86] 。Copper-CPSHC在开发队列和验证队列中的OS的3年AUC分别为0.73 [95% CI, 0.66-0.80]和0.72 [95% CI, 0.56-0.87] 。高危组显示更高的肿瘤突变负荷、调节代谢过程降低、缺氧状态和浸润的基质细胞。为高危组筛选出了六种小分子药物。结论：Copper-PSHC作为一种有前途的工具，可用于识别预后差的HCC，并通过提供潜在的临床决策支持来改善疾病预后。 版权所有 © 2023 Shi，Huang，Wang，Li，Shen，Jiang，Ran，Cai，Guo，Wang和Ren。
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mSystems
2023 Aug 03
DanielaVargas-Robles...
The cervical microbiota of Hispanics living in Puerto Rico is nonoptimal regardless of HPV status.
mSystems
子宫颈阴道微生物群受宿主生理学、免疫学、生活方式和种族的影响。我们假设住在波多黎各（PR）的孕妇、非孕妇和绝经期妇女之间的子宫颈阴道微生物群会有所不同，有无人类乳头状瘤病毒（HPV）感染和宫颈癌。我们特别想确定微生物群与宫颈细胞学的差异是否相关。共招募了294名妇女，包括生育年龄非孕妇（N = 196）、孕妇（N = 37）和绝经期（N = 61）妇女。使用16S rRNA扩增子测序分析子宫颈阴道细菌，使用SPF10-LiPA对HPV进行基因分型，对宫颈细胞学进行定量分析。高危型HPV（HR-HPV，67.3%）普遍存在，包括9价HPV疫苗未涵盖的基因型。宫颈病变（34%）也很常见。子宫颈微生物群以内尔氏乳杆菌为主导。怀孕的妇女在第二和第三孕期微生物多样性和丰度与细菌性阴道病相关的微生物有所减少。绝经期妇女具有更高的α多样性，一定比例的需氧和厌氧菌群，以及较高的子宫颈阴道pH值。α多样性与子宫颈病变相关。然而，微生物群与HPV感染（HR或LR-HPV类型）之间没有显著的关联。不论妇女的生理阶段如何，波多黎各妇女的子宫颈阴道微生物群要么被乳杆菌属内尔氏乳杆菌所主导，要么是多样的微生物群落。我们推测微生物群和高危型HPV的高普及性会增加PR地区妇女患子宫颈病变的风险。
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GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
2023 Aug
ChongyangChen,JingWa...
Applications of multi-omics analysis in human diseases.
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
多组学通常指的是基因组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多个高通量筛选技术的交叉应用，这些技术在促进人类疾病研究方面起着重要作用。当前的综述大多侧重描述多组学技术的发展、数据整合以及在特定疾病中的应用，但其中很少有提供全面系统介绍的。本综述概述了多组学的现有技术分类，实验设计注意事项，重点讨论了多组学的综合分析方法，尤其是机器学习和深度学习在多组学数据整合中的应用及相应的工具，以及多组学在医学研究中的应用（如癌症、神经退行性疾病、衰老和药物靶点发现），以及相应的开源分析工具和数据库，最后讨论了多组学整合和应用在精准医学中的挑战和未来方向。随着高通量技术和数据整合算法的发展，单细胞多组学和空间多组学也成为未来疾病研究的重要方向，并进行了详细介绍。本综述将为研究人员提供重要的指导，特别是那些刚刚进入多组学医学研究领域的人士。
© 2023 The Authors. MedComm 由四川国际医学交流与推广协会（SCIMEA）和John Wiley & Sons Australia, Ltd.出版。
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Frontiers in Endocrinology
2023
YuannaLing,XiaoliXio...
The efficacy and safety in radioactive iodine refractory thyroid cancer patients treated with sorafenib.
Frontiers in Endocrinology
索拉非尼（Sorafenib）被纳入中国医疗保险，是用于放射性碘抵抗性分化型甲状腺癌（RR-DTC）的最早的靶向药物。本研究旨在进一步证明索拉非尼在南方医科大学珠江医院用于RR-DTC的临床疗效和安全性。分析了在南方医科大学珠江医院核医学科接受治疗的RR-DTC患者（2017年10月至2020年5月）的回顾性研究。评估了用药期间的治疗效果、无进展生存期（PFS）和不良反应（AEs）。
共有31名患者被纳入研究，其中26名患者进行了有效性评估，随访时间中位数为17.5个月（4.0-51.0个月）。疾病控制率（DCR）为57.7%（n=15），客观缓解率（ORR）为26.9%（n=7）。大多数疾病控制患者甲状腺球蛋白下降超过60%（p=0.004），肺转移和仅肺转移患者的ORR较佳（分别为p=0.010和0.001）。分析的26名患者的PFS为16.5个月（95%CI: 14.41-23.90个月）。在亚组分析中，女性、仅肺转移患者、手足皮肤综合征（HFS）和甲状腺球蛋白反应≥60%的患者观察到更长的PFS（分别为p=0.038、0.045、0.035和0.000），而骨转移患者的PFS较低（p=0.035）。最常见的毒副反应是HFS（93.5%），其次是腹泻（83.9%）、脱发（74.2%）。所有副作用主要为1-2级。腹泻和HFS的3-4级不良反应比例较高。
索拉非尼在RR-DTC中显示出良好的疗效，特别是在肺转移和仅肺转移患者中。索拉非尼的不良反应一般为轻度，主要不良反应为HFS。
版权所有© 2023 Ling, Xiong, Luo, Zou, Chen, Pan, Long, Feng和Ouyang。
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Frontiers in Endocrinology
2023
XiaoyingZhang,Caizhe...
Extracellular vesicles in the treatment and diagnosis of breast cancer: a status update.
Frontiers in Endocrinology
乳腺癌是妇女癌症相关死亡的主要原因之一。目前，乳腺癌的治疗受到有效靶向疗法缺乏的限制，患者常常遭受更严重的病情、转移和耐药性。胞外囊泡（EVs）由包裹复杂负载的脂质双层组成，其中包括蛋白质、核酸和代谢物。这些生物活性负载在乳腺癌的发生和进展中起到关键作用。此外，EV负载在广泛诱导增殖、血管生成、前转移微环境形成、迁移和药物耐药性方面发挥了核心作用，将乳腺细胞转化为致癌细胞和转移灶。本综述主要讨论来自乳腺癌细胞和肿瘤源性EV的负载，并侧重于增殖、转移、药物耐药性以及它们作为有效生物标志物的临床潜力。版权所有©2023张、王、于、卜、艾、汪、林和朱。
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Frontiers in Endocrinology
2023
HuiZhou,Xiao-XueLi,Y...
Prognosis prediction and comparison between pancreatic signet ring cell carcinoma and pancreatic duct adenocarcinoma: a retrospective observational study.
Frontiers in Endocrinology
胰腺粘液腺癌（PSRCC）是一种罕见且侵袭性强的癌症，主要以病例报告的形式报道。由于缺乏大规模流行病学和预后分析，PSRCC患者的预后因缺乏公认的一线治疗策略而存在很大差异。本研究旨在比较PSRCC和胰管细胞癌（PDAC），即胰腺癌最常见的亚型之间的临床特征、治疗和预后，并建立这些亚型的预测模型。通过Surveillance, Epidemiology, and End Results（SEER）数据库获取1998年至2018年的PSRCC和PDAC患者的数据。然后，通过倾向性评分匹配（PSM），Kaplan-Meier生存曲线，Cox风险回归分析和最小绝对收缩和选择运算符（LASSO）分析，评估这两组的临床、人口统计和治疗特征，以及这两组之间的差异和影响因素。随后，通过KM和ROC分析构建和验证预后模型。最后，根据这些分析结果构建一张图表，用于预测PSRCC和PDAC患者的生存结果。本研究纳入了共计84,789名患者（432例PSRCC患者和84357例PDAC患者）。研究结果显示，与PDAC患者相比，PSRCC患者更有可能为男性，年龄在58-72岁之间，肿瘤体积更大，并且较少接受化疗。倾向性评分匹配前，PSRCC组的总体生存和癌症特异性生存率显著低于PDAC组，但在倾向性评分匹配后，两组的预后没有差异。另外，淋巴结比例（LNR），阳性淋巴结的对数几率（LODDS），肿瘤大小，年龄，T分期，婚姻状况和总体分期被发现是PSRCC的独立预后因素。最后，基于这些预后因素的预测模型和图表，可以准确预测SEER数据库和外部验证数据集中患者的生存率。在相同条件下，PSRCC和PDAC患者的预后相似；然而，PSRCC患者可能更难获得更好的治疗，从而导致他们的预后较差。版权所有 © 2023 周、李、黄、王、邹、熊、刘、文和张。
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Frontiers in Endocrinology
2023
AojiaZhuang,XuetongY...
Nomogram predicting overall survival after surgical resection for retroperitoneal leiomyosarcoma patients.
Frontiers in Endocrinology
手术是治疗腹腔后肌层间平滑肌肉瘤(RLMS)的最佳方式，目前尚无RLMS手术切除后的预测模型。本研究的目标是开发一种预测RLMS患者在手术切除后的总生存率(OS)的正态图。纳入了2010年9月至2020年12月接受手术切除的患者。正态图是基于COX回归模型构建的，利用一致性指数评估了判别能力。借助校准图评估了预测的OS和实际的OS。共纳入了118例患者。所有患者的中位OS为47.8个月(95%置信区间(CI)35.9-59.7)。大多数肿瘤被完全切除(n=106，占89.8%)。法国国家癌症中心联盟(FNCLCC)分类的比例为1级、2级和3级(分别为31.4%、30.5%和38.1%)。73.7%(n=85)的患者肿瘤直径大于5厘米，23.7%(n=28)的病灶为多发性，55.1%(n=65)的患者有一个以上的器官被切除。OS正态图是基于切除器官的数量、肿瘤直径、FNCLCC分级和多灶性病灶构建的。正态图的一致性指数为0.779(95%CI, 0.659-0.898)，预测的OS与实际的OS在校准曲线中良好适合。本研究建立的正态图预测模型对于术后咨询和临床试验入组患者的选择是有帮助的。版权所有©2023 Zhuang, Yue, Tong, Zhang, He and Lu.
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Frontiers in Endocrinology
2023
LiangboWang,ChenluWe...
Identification of the enhancer RNAs related to tumorgenesis of pituitary neuroendocrine tumors.
Frontiers in Endocrinology
垂体神经内分泌瘤(PitNETs)起源于垂体腺，占所有颅内肿瘤的10%-15%。近期研究表明，增强子RNA(eRNA)在肿瘤生长中起调控作用。然而，eRNA调控PitNETs致瘤机制尚未阐明。通过使用正常垂体和PitNETs组织，鉴定差异表达的eRNAs(DEEs)。根据单个样本基因集富集分析(ssGSEA)算法，利用GSVA测定免疫基因集和癌症相关基因集。通过CIBERSORT算法计算所有样本中免疫细胞的分布。此外，通过Pearson相关分析构建关键DEEs、eRNAs靶基因、癌症相关基因集、差异表达转录因子、免疫细胞和免疫基因集的调控网络。通过CMap分析探索小分子抗PitNETs药物并通过体外和体内实验、ATAC-seq和ChIP-seq验证研究的准确性。
本研究从公共数据库中检索了134个PitNETs和107个非肿瘤垂体样本的数据，以鉴定差异表达基因。总共鉴定出1128个差异表达eRNAs(DEEs)（494个上调eRNAs和634个下调eRNAs）。随后，检验DEEs与与癌症相关和免疫相关基因标志物的相关性，建立了一个共表达调控网络，其中包括18个DEEs、50个潜在的DEEs目标基因、5个癌症标志基因集、2个差异表达转录因子、4种免疫细胞类型和4个免疫基因集。基于该网络，通过Connectivity Map分析鉴定了以下四个用于PitNETs的治疗药物：环可吡索、倍普利、氯米帕明和甲硝啶。这些药物的抑制生长效果通过体外实验得到验证。环可吡索对PitNETs具有潜在的抑制生长效果。在DEEs中，GNLY、HOXB7、MRPL33、PRDM16、TCF7和ZNF26被确定为PitNETs的潜在诊断和治疗生物标志物。
本研究揭示了eRNAs在PitNETs发生和发展中的重要影响。通过构建共表达调控网络，我们鉴定了GNLY、HOXB6、MRPL33、PRDM16、TCF7和ZNF26等相对重要的DEEs，这些DEEs被认为是PitNETs诊断和治疗的新生物标志物。本研究证实了eRNAs在PitNETs发生和发展中的作用，并发现环可吡索是垂体腺瘤的潜在治疗药物。
版权所有 © 2023 Wang, Wei, Wang, Huang, Zhang, Dai, Xue, Lin和Wu。
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OncoImmunology
2023
NanumiHan,HarukaWada...
A mechanism of IL-34-induced resistance against cytotoxic anti-cancer therapies such as radiation by X-ray and chemotherapy by Oxaliplatin.
OncoImmunology
白细胞介素34（IL-34）已知是参与肿瘤进展和治疗抵抗的因子。然而，IL-34诱导治疗抵抗的机制存在一定的限制。在这里，我们展示了IL-34诱导抗癌细胞毒性疗法（如X射线放疗和奥沙利铂化疗）抵抗的机制。本研究表明，IL-34在放疗或奥沙利铂等化疗药物治疗后通过免疫手段改变肿瘤微环境。我们使用流式细胞术和免疫荧光染色鉴定了免疫细胞的变化，这些变化在存在IL-34时上调。总体而言，这些发现表明，IL-34阻滞可能作为一种新型癌症联合治疗的可能性。© 2023 The Author(s). Published with license by Taylor & Francis Group, LLC.
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