研究动态
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep
MarcoFiletti,Manuela...
[Not Available].
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
推进对复杂疾病的认识需要在医学领域的人工智能(AI)之外进行跨学科对话。在人类基因组计划完成20年之后,基因测序已经为基因突变相关疾病的靶向治疗提供了便利。然而,这一成就揭示了我们对生命和疾病机制的巨大认知缺口。由于复杂疾病,包括癌症、糖尿病和自身免疫性疾病的多因素性质,仍然难以捉摸。因此,更加整体性的方法将AI与多样化的科学学科结合起来变得迫切。本文强调了遗传学、分子生物学、计算生物学和临床研究之间促进合作的紧迫性,以揭示这些疾病底层复杂性。通过将各领域的专业知识和数据进行协同,我们可以在揭开复杂疾病错综复杂的网络方面取得重大进展,从而实现改善诊断、治疗和最终患者预后的目标。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Aug
NicholasPTschernia,H...
Patient-reported outcomes in CD30-directed CAR-T cells against relapsed/refractory CD30+ lymphomas.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
针对CD30的嵌合抗原受体(CAR-T)细胞已经在复发/难治性CD30+血液恶性肿瘤的患者中展现出高响应率和持久的缓解效果,尤其在传统霍奇金淋巴瘤患者中。本研究第二阶段试验结果显示,该疗法的毒副作用较低,包括细胞因子释放综合征,无神经毒性。我们收集了在接受CD30定向CAR-T细胞治疗的患者中的患者报告的结果(PRO),以评估该疗法对他们的症状体验的影响。我们收集了包括PROMIS(患者报告结果测量信息系统)全球健康和身体功能问卷以及NCI PRO-CTCAE筛选的症状问题在内的PRO,在我们的CD30定向CAR-T细胞临床试验入组患者的采购期、CAR-T细胞输注时和治疗后的不同时间点进行了收集。我们比较了采购前、输注时和输注后4周之间的PROMIS得分和整体症状负担。在28名入组患者中,有23名患者在研究期间进行了至少一次PRO测量。患者的整体症状负担、全球健康状况和心理健康以及身体功能在CAR-T细胞输注后4周时至少恢复到基线水平或以上。此外,在参加临床试验的患者中,PROMIS分数与平均健康人群相似。CD30 CAR-T细胞疗法具有良好的毒副作用特征,患者的身体功能和症状负担在输注后1个月内至少恢复到基线治疗前的健康水平。试验注册号:NCT02690545。© 作者(或其雇主) 2023。根据CC BY-NC许可进行再使用。不得进行商业再利用。由BMJ出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 02
GwennegKerdivel,Flor...
DNA hypermethylation driven by DNMT1 and DNMT3A favors tumor immune escape contributing to the aggressiveness of adrenocortical carcinoma.
Epigenetics & Chromatin
肾上腺皮质癌是肾上腺的一种罕见且侵袭性的内分泌癌症。在肾上腺皮质癌中,一种最近被描述的亚型,其特征为CpG岛甲基化表型(CIMP),被发现与尤其不良的预后相关。然而,CIMP的驱动因素尚不明确。此外,CIMP与肾上腺皮质癌患者不良临床结局之间的功能关系仍然模糊不清。在这里,我们展示了CIMP与增加的DNA甲基转移酶DNMT1和DNMT3A的表达相关联,其由基因拷贝数的增加和细胞过度增殖驱动。重要的是,我们证明了CIMP通过促进肿瘤免疫逃逸来促进肿瘤的侵袭性。这种效应可以至少部分地通过去甲基化剂5-azacytidine的治疗进行逆转。总的来说,我们的研究结果表明,联合应用去甲基化剂可能增强免疫疗法的功效,并可能成为高CIMP肾上腺皮质癌患者的一种新的治疗方法。© 2023作者。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 02
YuanlongLi,YaoKong,M...
ZEB1-mediated biogenesis of circNIPBL sustains the metastasis of bladder cancer via Wnt/β-catenin pathway.
Epigenetics & Chromatin
循环RNA (circRNAs) 以前mRNA 的背 splicing 形成环状,在膀胱癌 (BCa) 中广泛表达并影响增殖、侵袭和转移。然而,调节BCa 远处转移的circRNA 生物发生机制仍未被探索。通过运用BCa 与正常邻近组织之间的RNA测序数据来鉴定差异表达的circRNA。通过一系列的生化实验来研究circNIPBL 在BCa中的功能。在一组更大的BCa组织上检测circNIPBL的临床意义。本研究中,我们鉴定出了一个新的circRNA (hsa_circ_0001472),circNIPBL,在BCa患者中显著上调,并且对患者的不良预后有巨大影响。在功能上,circNIPBL在体内和体外促进了BCa的转移。机制上,通过直接结合miR-16-2-3p来上调Wnt5a的表达,从而激活了Wnt/β-catenin信号通路,进一步上调了ZEB1的表达,并引发了BCa的EMT。此外,我们揭示了ZEB1与NIPBL前mRNA的2-9外显子的内侧内含子相互作用,以触发circNIPBL的生物发生,形成了正反馈环。重要的是,circNIPBL的过表达显著促进BCa的远处转移,在正位膀胱癌模型中,而沉默ZEB1显著阻断了circNIPBL过表达引起的转移效应。我们的研究凸显了circNIPBL诱导的Wnt信号通路激活引发了ZEB1介导的circNIPBL生物发生,通过circNIPBL/miR-16-2-3p/Wnt5a/ZEB1轴形成了一个正反馈环,支持circNIPBL作为BCa患者的新型治疗靶点和潜在生物标志物。©2023. 作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Aug 01
MennatallahElnaggar,...
Optimizing cyclosporine A dose post allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in paediatric cancer patients.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
环孢霉素A(CSA)的剂量因药代动力学方面的患者内部和患者间的重大变异而变得复杂,这些变异受不同因素的影响。我们的目的是评估可能影响CSA剂量及其血浆水平的各种因素。本回顾性研究纳入了在埃及57357儿童肿瘤医院接受同种异体造血干细胞移植的小儿癌症患者,采用CSA作为移植物抗宿主病预防药物。CSA初始剂量为1.5毫克/千克静脉注射,每12小时一次。然后,根据药物浓度和毒副作用进行调节。使用Emit 2000环孢霉素特异性测定来评估每周2-3次的环孢霉素A血药浓度峰值。此外,还分析了可能影响环孢霉素A水平的因素,如年龄、性别、体重和抗真菌药物的使用,以确定它们对CSA血浆水平的影响。 本研究纳入了119名患者。中位年龄为10岁;其中43%的患者使用伏立康唑作为预防性抗真菌药物。多元分析显示,女性患者、年龄>9岁或使用伏立康唑的患者需要较低的初始CSA剂量才能达到目标水平。在年龄>9岁、并使用伏立康唑的患者中,使用1.5毫克/千克静脉注射每12小时一次的剂量可达到所期望的血浆浓度水平的概率较高(93%)。而对于年龄≤9岁且不使用伏立康唑的患者,需要>1.5毫克/千克静脉注射每12小时一次的剂量,以达到预期水平的概率为89%。 该研究表明,初始CSA剂量应考虑患者的年龄和抗真菌药物的使用。年龄>9岁和/或使用伏立康唑的患者可能需要较低的初始CSA剂量,并可从1.5毫克/千克静脉注射每12小时一次开始。
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GENOME BIOLOGY
2023 Aug 01
FranciscoAvilaCobos,...
Effective methods for bulk RNA-seq deconvolution using scnRNA-seq transcriptomes.
GENOME BIOLOGY
单细胞和单核RNA测序(scRNA-seq和snRNA-seq,简称scnRNA-seq)等单细胞分辨率的RNA分析技术可以帮助表征组织的组成并揭示对健康和疾病组织中关键功能产生影响的细胞。然而,由于高昂的成本和严格的样本收集要求,使用这些技术在操作上具有挑战性。利用scnRNA-seq确定的细胞类型进行组分推断的计算解卷积方法可以扩展scnRNA-seq的应用,但其效果仍存在争议。我们首次对已知或使用scnRNA-seq预估组成的数据集进行了解卷积方法的系统评估。我们的分析揭示了scnRNA-seq 10X Genomics测序的共同偏差,并突显了准确和适当控制的数据预处理以及方法选择和优化的重要性。此外,我们的结果表明,联合RNA测序和scnRNA-seq的配置可以提高scnRNA-seq预处理和使用它们的解卷积方法的准确性。事实上,我们提出的方法——Single-cell RNA Quantity Informed Deconvolution(SQUID),结合了RNA测序转换和减阻最小二乘解卷积方法,在预测细胞混合物和组织样本的组成方面一直优于其他方法。我们展示了使用SQUID分析联合RNA测序和scnRNA-seq的配置可以产生准确的细胞类型丰度估计,并且这种准确性改进对于在儿童急性髓系白血病和神经母细胞瘤数据集中识别与结果相关的癌细胞亚克隆是必要的。这些结果表明,在生命科学中,解卷积准确性的提高对于其应用至关重要。 ©2023。作者(们)。
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CLEVELAND CLINIC JOURNAL OF MEDICINE
2023 Aug 01
EllenLFerraro,Rebecc...
Hoarseness: When to observe and when to refer.
CLEVELAND CLINIC JOURNAL OF MEDICINE
嗓音嘶哑和发音困难这两个术语可以互换使用,都用于描述影响三分之一患者的改变过的发音质量类型。虽然嗓音嘶哑可能是由反流或病毒性喉炎等良性疾病引起的,但它可能预示着良性或恶性声带病理。重要的是,医护人员要知道如何评估、治疗以及何时通过喉镜进行直接观察的患者转诊。在本文中,我们将回顾基本的喉部解剖学和功能,讨论声带病理的症状,以及美国耳鼻喉头颈外科学会关于发音困难的诊断和治疗的当前指南,包括患者转诊。版权所有 © 2023 克利夫兰诊所基金会。保留所有权利。
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JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY
2023 Aug 02
Huan-RongLan,You-NiZ...
Multifunctional nanocarriers for targeted drug delivery and diagnostic applications of lymph nodes metastasis: a review of recent trends and future perspectives.
JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY
癌细胞的淋巴结转移是各种肿瘤形式中常见的现象,对癌症治疗构成巨大挑战。这一过程对疾病的发展至关重要,通常与不良预后密切相关。超过90%的癌细胞通过淋巴结移动,使其成为癌细胞传播的重要途径。淋巴结转移显著影响癌症患者的预后,同时也影响治疗选择。针对淋巴结转移的治疗对传统的药物输送技术提出了诸多困难。在不损伤健康器官和造成意外后果的前提下,有选择地靶向淋巴结中的癌细胞仍然十分困难。此外,药物的全身输送受到淋巴管流速缓慢的阻碍。化学治疗药物的溶解度和稳定性不佳,当口服时其有效性进一步降低。此外,包围淋巴结肿瘤的细胞外基质非常广泛,这使得传统的药物输送系统很难达到癌细胞。为了克服这些障碍,纳米载体的发展成为了精确输送药物到淋巴结的方法引起了广泛关注。大多数固体肿瘤最初通过淋巴系统扩散,因此有效地给这些组织提供药物治疗至关重要。纳米载体具有多种优势,包括能够通过血脑屏障和细胞膜达到淋巴系统的能力。由于纳米载体的物理化学特性,例如较高的表面积与体积比,可以封装高剂量的药物。此外,配基、抗体、聚合物或生物分子可以附着在纳米载体表面,改变其特性,从而实现对淋巴结上皮细胞的靶向输送。利用纳米载体进行药物输送可以最大化靶向效应和相关的不良反应,同时提高药物输送到目标部位的效果。需要在这一领域进行更多的研究和开发,以优化纳米载体设计,提高靶向能力,并扩大临床应用,以改善癌症护理。© 2023. 作者。
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JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY
2023 Aug 01
YanfengDai,XiangYu,Y...
Effective treatment of metastatic sentinel lymph nodes by dual-targeting melittin nanoparticles.
JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY
前哨淋巴结(SLN)转移是乳腺癌远处转移的重要促进因素。因此,对患者分期和预后而言,及时的诊断和精确的治疗至关重要。然而,同时诊断转移和实施成像引导下的SLN治疗是具有挑战性的。在这里,我们报道了一种负载蜂毒素和透明质酸(HA)结合的高密度脂蛋白(HDL)类磷脂支架纳米颗粒(MLT-HA-HPPS),其双重靶向乳腺癌及其SLN,并在LN转移模型中有效抑制SLN转移。蜂毒素肽通过静电相互作用成功加载到HA-HPPS上,而MLT-HA-HPPS对乳腺癌4T1细胞具有有效的细胞毒性。此外,通过近红外荧光成像监测MLT-HA-HPPS从原发肿瘤进入SLN的有效传递,这对于转移性SLN的预后和治疗非常有益。经过癌旁给药后,MLT-HA-HPPS可以有效抑制原发肿瘤的生长,其抑制率相对于PBS处理对照组和HA-HPPS组分别为81.3%和76.5%。更重要的是,MLT-HA-HPPS能够有效抑制转移性SLN的生长,相对于PBS、HA-HPPS和蜂毒素处理的小鼠,其SLN重量减少了大约78.0%、79.1%和64.2%。综上所述,MLT-HA-HPPS可能提供一种鼓舞人心的SLN药物传递策略,用于抑制原发肿瘤进展和预防乳腺癌SLN转移。© 2023.作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 02
JoseAViteri,DavidJSc...
Motor neurons within a network use cell-type specific feedback mechanisms to constrain relationships among ion channel mRNAs.
Cellular & Molecular Immunology
最近,存在性被提出作为连续爆发神经元用来调节稳定输出的离子通道mRNA关系的主要反馈机制。然而,某些神经元类型只在间歇性活动期间存在,并且可能需要诱导和限制不同活动状态下适当离子通道配置的其他机制。为了解决这个问题,我们使用了甲壳动物美洲大螯虾胃运动神经节中的腹胃部舌骨膨大肌(PD;持续激活)和侧胃(LG;短暂激活)神经元。我们通过实验性刺激到神经节的下行输入来释放已知能够引发LG神经元活动状态的神经调节物质,并在活跃和沉默的LG神经元中量化了11个电压门控离子通道的mRNA丰度和成对关系。相同的刺激对PD活动并没有引起显著改变。LG的激活上调了离子通道mRNA和正相关的离子通道mRNA关系的数量。相反,这种刺激并没有引发PD细胞离子通道mRNA丰度和关系的主要变化,表明它们的持续活动足以在改变的调节条件下维持离子通道mRNA关系。此外,我们发现由LG的活动状态诱导的离子通道mRNA相关性受到活动和神经调节物依赖的反馈机制的影响。有趣的是,PD中的一些相同相关性通过不同的机制保持,这表明这些运动网络利用不同的反馈机制来协调不同神经元类型间相同的mRNA关系。
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