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肿瘤
Stem Cell Research & Therapy
2023 Jul 13
CassandraSPrather,Ja...
The Yield, Safety, and Cost-effectiveness of Decreasing Repeat Blood Cultures Beyond 48 Hours in a Pediatric Hematology-Oncology Unit.
Stem Cell Research & Therapy
有关住院儿童癌症患者何时应进行重复血液培养（BCxs）的明确建议是必要的。我们回顾了Riley儿童医院血液肿瘤科病房自2015年1月至2021年2月间获取的所有BCx，不论患者入院原因或中性粒细胞缺乏状态如何。排除了在初始培养后48小时内出现阳性BCx、有干细胞移植史或入住重症监护病房的患者。对于在初始BCx后48小时之后抽取的新阳性BCx的患者的病历进行了回顾。在超过48小时后的BCx中，7个（1.2%）住院期间出现了新病原体或被视为病原体的共生菌培养。当新的阳性BCx被获取时，所有患有新的真菌病原体的患者在血液动力学不稳定或发生复发性发热。23个（4.0%）住院期间出现了超过48小时的污染培养，1362个超过48小时的BCx中有74个（5.4%）被污染，导致额外的住院费用增加了210,519美元。总而言之，在初始培养结果为阴性的血液肿瘤科小儿患者中，超过48小时的重复BCx收益较低且费用高昂。对于血液动力学和临床稳定的患者，在连续48小时的阴性培养后可以安全和经济地停止进行重复BCx。版权所有 © 2023 Wolters Kluwer Health，Inc. 保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 01
JieZhong,YanSun,Siji...
The impact of the Hedgehog signal pathway on the tumor immune microenvironment of gastric adenocarcinoma by integrated analysis of scRNA-seq and RNA-seq datasets.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
Hedgehog信号通路是一种高度保守的途径，用于调节细胞生长和增殖，在胃腺癌（STAD）和其他癌症类型中发挥着重要作用。然而，先前的研究主要以mRNA或体外细胞培养为基础。结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据进行整合将更加有说服力，因为它是一种更精确的基因组研究方法。本研究调查了Hedgehog信号通路的表达谱、遗传变异和活性在STAD的scRNA-seq和RNA-seq数据集中。通过cell-chat算法确定了癌细胞与成纤维细胞之间的通信，并构建了Hedgehog相关基因签名以预测STAD的生存情况。根据签名的中位数，将患者分为高风险组和低风险组。进一步分析了两组之间的生存结果、肿瘤免疫微环境（TIME）和药物敏感性的差异，旨在指导STAD患者化疗和免疫治疗的使用。Hedgehog信号通路在STAD中超活化。GAS1、GLI1和SCEBU2被认为是STAD预后签名中的枢纽基因，并被视为引发不良生存结果的强有力风险因素。高风险组患者表现出耗竭的TIME模式，并对分子靶向药物的敏感性较低。本研究描述了Hedgehog途径对STAD的生存结果、TIME和药物敏感性的影响，并为STAD的治疗提供了新的见解。© 2023. 作者，独家许可给Springer-Verlag GmbH Germany，Springer Nature的一部分。
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Journal of Extracellular Vesicles
2023 Aug
YéFan,CédricPionneau...
Differential proteomics argues against a general role for CD9, CD81 or CD63 in the sorting of proteins into extracellular vesicles.
Journal of Extracellular Vesicles
Tetraspanin CD9、CD81和CD63是细胞外囊泡（EVs）的主要组成部分。然而，它们对EVs成分的影响尚未进行充分的研究。在MCF7乳腺癌细胞系中，CD63主要存在于胞内，符合预期。相比之下，CD9和CD81在质膜上强烈共定位，尽管不同的位置具有不同的比例，这可能解释了CD81在EVs中更高的富集度。通过定量质谱分析，这些四跨膜蛋白对EVs的蛋白质组成几乎没有影响。我们还分析了CD9和CD81的共同敲除对细胞的影响，因为这两种四跨膜蛋白在多种细胞过程中发挥类似的作用，并且直接与两个Ig结构域蛋白CD9P-1/EWI-F/PTGFRN和EWI-2/IGSF8结合。在CD9和CD81双缺失细胞的EVs中，这两个蛋白是唯一明显减少的。在EWI-2的情况下，主要是由于细胞表达水平下降引起的。总之，本研究表明，常用作EV蛋白标记物的CD9、CD81和CD63在决定MCF7细胞释放的EVs的蛋白质组成中起到边缘作用，并突出了CD9和CD81调控CD9P-1和EWI-2的表达水平和/或转运的机制。© 2023 The Authors. Journal of Extracellular Vesicles由Wiley Periodicals, LLC代表国际细胞外囊泡学会发布。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug 01
RupaliMohite,GauravD...
Elucidation of the Role of the Epigenetic Regulatory Mechanisms of PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathway in Human Malignancies.
Epigenetics & Chromatin
PI3K/Akt/mTOR通路调节细胞生长、增殖、代谢和运动。此外，重要研究表明，与该通路相关的基因在人类癌症中频繁活化。观察及计算建模已在临床试验中对PI3K/Akt/mTOR通路抑制剂进行研究。观察到来自临床研究和多种抑制剂的有效性和安全性证据已获得了FDA批准。在本综述文章中，我们重点关注PI3K/Akt/mTOR信号通路在癌症中过度活化的过程，并提供了PI3K/Akt/mTOR抑制剂作为单一药物或不同剂量药物组合对不同类型癌症的概述。此外，本文讨论了PI3K/Akt/mTOR信号通路的生物学功能和激活，以及其在癌症发展中的作用。另外，我们讨论了PI3K/Akt/mTOR抑制剂开发中的潜在挑战和相应的预测反应和耐药性生物标志物。本文重点关注使用PI3K/Akt/mTOR通路来靶向特定分子的最新突破。版权所有© Bentham Science Publishers，请发送任何查询至epub@benthamscience.net。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Jul 31
YangyangBai,RuitingC...
Evaluation of therapeutic mechanism of Hedyotis diffusa Willd (HDW)‒Scutellaria barbata (SB) in clear cell renal cell carcinoma via single-cell RNA sequencing and network pharmacology.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
本研究旨在结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）与网络药理学，探讨川产白花蛇舌草（HDW）和鸭距草（SB）在结直肠癌（ccRCC）中的治疗机制。通过中药系统药理学数据库和分析平台获取了HDW-SB的活性成分和潜在分子靶点。从基因表达组学数据库Gene Expression Omnibus取得了基因表达数据（GSE53757）。通过蛋白质相互作用网络确定了HDW-SB在对抗ccRCC时的核心基因，并通过分子复合物检测进一步分析了这些基因。分析了这些基因在ccRCC的诊断和免疫浸润中的作用。利用单细胞RNA测序数据（GSE121638）和分子对接验证了这些核心基因的临床意义。蛋白质相互作用网络分析后，鉴定出HDW-SB与ccRCC相对抗的29个核心基因。除了CENPE外，所有核心基因在肿瘤组织中的表达均有显著差异，并更准确地诊断了ccRCC。根据单细胞RNA测序数据集，定义了15个细胞簇，并根据标记基因将这些簇注释为6个细胞类型。核心基因中的TYMS和KIAA0101在NK细胞中高表达。从化合物-靶点相互作用网络中发现，黄酮、黄酮醇和黄芩素等三种活性化合物靶向TYMS和KIAA0101。鉴定出HDW-SB与ccRCC相对抗的29个核心基因，并在诊断和预后方面表现出良好性能。而且，在这些核心基因与HDW-SB的主要成分进行对接时，TYMS和KIAA0101通过NK细胞发挥了抗ccRCC的作用。Copyright© Bentham Science Publishers;若有任何疑问，请发送邮件至epub@benthamscience.net。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Aug 01
AtefeRahmati,Alireza...
Non-coding RNAs in leukemia drug resistance: new perspectives on molecular mechanisms and signaling pathways.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
正如几乎所有癌症类型一样，白血病需要及时诊断才能有效治愈。药物外流、减弱药物摄取、改变药物代谢以及表观遗传改变是导致药物耐药性发展的关键机制之一。所有这些机制都由上调和下调因子协调，其中非编码RNAs（ncRNAs）大多数情况下不编码特定蛋白质；尽管如此，其中一些被发现具有编码蛋白质的潜力。尽管如此，ncRNAs主要以调节生理过程以及与之相关的病理过程（如细胞增殖、凋亡和免疫反应）而闻名。具体而言，在白血病化疗耐药的情况下，已经认识到ncRNAs在调控耐药性的发生和发展中起着关键作用。在这里，我们对ncRNAs在白血病耐药性发展中对分子机制和信号通路的影响进行了全面回顾。© 2023. The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 01
RanLi,YingjiaoZhao,T...
Nano-drug delivery system targeting FAP for the combined treatment of oral leukoplakia.
Cellular & Molecular Immunology
口腔白斑（OLK）因其潜在的恶性转化风险而受到广泛关注。研究表明，当药物治疗与光热疗法（PTT）结合时，不仅可以增强药物的细胞毒性，还可以利用热能杀死病变细胞，因此我们可以将药物治疗与PTT结合以增强对OLK的治疗效果。然而，由于缺乏靶向性，成纤维细胞活化蛋白（FAP）已成为OLK联合治疗的一个有吸引力的靶标。在本研究中，我们利用负载有FAP靶向肽（F-TP）和Celecoxib（CXB）的NGO-PEG构建了一个纳米药物传递系统CGPF，以靶向表达FAP较高的OLK，并通过体外和体内实验证实了CGPF的生物相容性和治疗效果。总体而言，本研究提出的新型纳米药物传递系统CGPF对于OLK的联合治疗具有非常显著的潜力。© 2023. 控释学会（CRS）。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 01
MarcoZuccolo,GiuliaO...
Synthesis of N-oxyamide analogues of protein kinase B (Akt) targeting anionic glycoglycerolipids and their antiproliferative activity on human ovarian carcinoma cells.
Cellular & Molecular Immunology
基于2-0-β-D-葡萄糖甘油基的具有生物活性的阴离子糖甘油脂的N-活化酰胺衍生物已经高效制备。然而，在N-活化酰胺基团的存在下，葡萄糖单元的羟基氧化步骤似乎是一个困难的任务，然而通过采用化学酶蓝酶/TEMPO程序，首次可以方便地实现。所得的N-活化酰胺显示出较高的抑制卵巢癌IGROV-1细胞在无血清培养基中的增殖，与对应的生物活性酯类类似。稳定性和血清结合研究表明，化合物在完整培养基中观察到的活性降低可能主要是由于血清蛋白的结合效应，而不是葡萄糖甘油脂酰基链的水解降解。此外，在无血清条件下的细胞研究结果表明，N-活化酰胺基团可以独立于阴离子羧基的存在增加糖甘油脂的抗增殖活性。除了IGROV-1之外的其他细胞系的细胞研究也支持这一系列化合物对Akt高活化肿瘤细胞具有一定程度的选择性。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Aug 01
YouchaoWang,PatrickS...
Towards Ruthenium(II)-Rhenium(I) Binuclear Complexes as Photosensitizers for Photodynamic Therapy.
Cellular & Molecular Immunology
寻找新型基于金属的光敏剂（photosensitizers，简称PSs）用于抗癌光动力疗法（photodynamic therapy，简称PDT）是一个快速发展的研究领域。鉴于多金属配合物作为PDT PSs具有很高的潜力，本研究旨在将一种已知的铼（Re）一车烯基配合物的光物理性质与一种钌（Ru）二聚吡啶配合物相结合，以制备一种能够作为抗癌PDT PSs的钌铼双核配合物。在这里，我们介绍了这种体系的合成和表征，并讨论了其在水溶液中的稳定性。此外，我们制备的其中一种定位于线粒体的配合物发现对两种癌细胞具有一定的选择性：人肺癌A549和人结直肠腺癌HT29，与非癌变视网膜色素上皮RPE1细胞相比，有有趣的光指数（photo-index，简称PI）值分别为135.1和256.4，对应的数值分别为22.4。© 2023年 Wiley-VCH GmbH。
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Briefings in Functional Genomics
2023 Jul 31
JingLi,HaiyanLiu,Wei...
Predicting gastric cancer tumor mutational burden from histopathological images using multimodal deep learning.
Briefings in Functional Genomics
肿瘤突变负荷（TMB）是选择可能从免疫检查点抑制剂治疗中受益的患者的重要预测生物标志物。全外显子测序是一种常用的TMB测量方法，然而，其临床应用受到高昂的成本和耗时的湿实验和生物信息学分析的限制。为了解决这个挑战，我们从癌症基因组图谱中下载了326例胃癌患者的多模态数据，包括组织病理学图像、临床数据和各种分子数据。利用这些数据，我们进行了全面分析，研究了TMB、临床因素、基因表达和从血红素和伊红染色图像中提取的图像特征之间的关系。我们进一步探索了利用基于残差网络（Resnet）的深度学习算法进行组织病理学图像分析来预测TMB水平的可行性。此外，我们开发了一种多模态融合深度学习模型，将组织病理学图像与组学数据相结合，以预测TMB水平。我们利用不同的TMB阈值评估了我们的模型与各种最先进方法的性能，并获得了令人满意的结果。具体而言，我们的组织病理学图像分析模型达到了0.749的曲线下面积（AUC）。值得注意的是，多模态融合模型在AUC最高达到0.971的情况下明显优于仅依赖组织病理学图像的模型。我们的发现表明，组织病理学图像可以以合理的准确性预测胃癌患者的TMB水平，而多模态深度学习可以实现更高水平的准确性。这项研究为胃癌患者TMB的预测提供了新的思路。© 作者 2023。牛津大学出版社保留所有权利。请发送电子邮件至journals.permissions@oup.com以获取权限。
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