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JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS
2024 Aug 08

RodrigoBonacin,Elain...
The reuse of electronic health records information models in the oncology domain: Studies with the bioframe framework.
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS
电子健康记录 (EHR) 信息模型(例如模板和原型)的重用可能会带来各种好处,包括更高的标准化、集成性、互操作性、提高开发 EHR 系统的生产力,并释放基于医疗记录的潜在人工智能应用程序。该文献介绍了 EHR 建模标准、知识组织系统 (KOS) 和 EHR 数据重用方面的最新进展。然而,改善 EHR 信息模型重用的方法、开发流程和框架仍然匮乏。本研究提出了一个名为BioFrame的软件工程框架,并分析了在EHR系统开发过程中如何改进EHR信息模型的重用。在开发BioFrame框架时考虑了从系统评价中确定的EHR标准和KOS,包括本体。我们使用 OpenEHR 的结构来建模模板和原型,以及它与肿瘤学领域使用的国际 KOS 的关系。我们的框架应用于儿科肿瘤学。对三份有关营养的数据输入表格和第一次儿科肿瘤咨询期间使用的一份数据输入表格进行了分析,以衡量信息模型的重用。国际 KOS 的遵守率比原始表格增加了 18%。在所分析的所有 12 个场景中,概念的重用率都有所增加,原始形式的平均重用率为 6.55%,而使用 BioFrame 的平均重用率为 17.1%,导致显着差异。我们的结果表明,由于工程流程而实现了更高的重用率结合语义工件,可以更好地遵守 EHR 标准。这揭示了开发旨在重用 EHR 信息模型的新方法和框架的潜力。需要进行更多研究来评估 EHR 信息模型的重用对互操作性、EHR 数据重用和数据质量的影响,并评估其他健康领域的拟议框架。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
2024 Jul 16

MariaPSilva,LuísaTFe...
BUB1B monoallelic germline variants contribute to prostate cancer predisposition by triggering chromosomal instability.
JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
前列腺癌 (PrCa) 是男性中最常诊断出的癌症。已知的中等到高外显率基因的变异解释了不到 5% 的早发型(< 56 岁)和/或疾病家族聚集的病例。考虑到 BubR1 是有丝分裂纺锤体组装检查点的重要组成部分,我们假设单等位基因 BUB1B 变体可能足以加剧染色体不稳定 (CIN),从而可能引发(前列腺)癌变。为了揭示 BUB1B 作为新的 PrCa 易感基因,我们进行了对 462 名早发/家族性 PrCa 患者和 1,416 名符合其他遗传性癌症综合征基因检测标准的癌症患者的种系 DNA 进行了下一代靶向测序。为了探索BUB1B的泛癌作用,我们采用了硅片BubR1分子建模、体外基因编辑以及离体患者的肿瘤和外周血淋巴细胞。在 ~ 1.9%的早发/家族性 PrCa 病例和符合遗传性疾病标准的其他癌症患者的 0.6% ~ 0.6% 。我们进一步表明,BUB1B 变异会导致 BubR1 表达和/或稳定性降低,从而促进染色单体过早分离,从而引发 CIN,从而驱动对基于紫杉醇的疗法的耐药性。我们的研究表明,不同的 BUB1B 变异可能会揭示 CIN 的触发因素驱动的致癌作用,支持 BUB1B 作为(泛)癌症易感基因的作用,对遗传咨询和治疗决策具有潜在影响。© 2024。作者。
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JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
2024 Aug 11

RuteChitas,DianaRFon...
Targeted nanotherapeutics for the treatment of Helicobacter pylori infection.
JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
幽门螺杆菌感染与消化性溃疡、腺癌等胃部疾病有关。已批准的抗生素疗法仍然对 10% 至 40% 的感染患者无效,在这种情况下,靶向纳米疗法成为根除幽门螺杆菌的强大盟友。开发了与幽门螺杆菌结合分子缀合的纳米/微粒子,通过以下两种方式消除幽门螺杆菌:(i) 阻断感染的基本机制,例如对胃粘膜的粘附;或 (ii) 通过在内部释放药物来结合并杀死幽门螺杆菌。细菌或感染部位。聚糖抗原(如 Lewis B 和唾液酸-Lewis X)、果胶、凝集素、磷脂酰乙醇胺和上皮细胞膜与纳米/微粒结合,成功阻断幽门螺杆菌粘附。尿素涂层纳米粒子用于通过幽门螺杆菌 UreI 通道改善细菌内部的药物输送。此外,涂有幽门螺杆菌抗体并负载声波/光敏剂的纳米颗粒有望作为靶向声波/光动力疗法。此外,还评估了非特异性幽门螺杆菌纳米/微粒,但仅在酸性胃环境中具有活性,涂有细菌膜、细胞外聚合物质或高温要求A蛋白酶的粘合剂。在这篇综述中,将概述现有针对幽门螺杆菌的纳米疗法,并介绍和讨论它们对抗感染的合理性、潜力以及开发水平。© 2024。作者。
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INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE
2024 Jul 15

WeichenYuan,XinXu,Fa...
Trends and hot spots in research related to aqueous humor from 2014 to 2023: A bibliometric analysis.
INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE
分析房水(AH)研究的发表趋势,探讨研究热点。基于Web of Science核心合集(WOSCC)进行文献计量研究。利用 VOSviewer v. 1.6.18 创建知识图谱,可视化年度出版物数量、国家分布、国际合作、作者生产力、来源期刊和该领域的关键词。总共 4020 篇关于 AH 的同行评审论文检索范围为 2014 年至 2023 年。美国在发表论文最多的国家中稳居榜首,杜克大学成为最活跃的机构。 Stamer, WD 在该领域贡献了最多的论文。眼科研究
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INVESTIGATIVE RADIOLOGY
2024 Jul 17

GeewonLee,SeungHwanM...
Multimodal Imaging Approach for Tumor Treatment Response Evaluation in the Era of Immunotherapy.
INVESTIGATIVE RADIOLOGY
免疫疗法可能是过去十年来肺癌治疗中最显着的进步。尽管免疫治疗提供了实质性的益处,但其治疗反应与常规化疗和靶向治疗不同,并且一些患者呈现出独特的免疫治疗反应模式,无法在当前的测量标准下判断。因此,免疫治疗的反应监测可能具有挑战性,例如区分真实反应和伪反应。本综述概述了免疫治疗的各种肿瘤反应模式,并讨论了肺癌领域计算机断层扫描 (CT) 和 18F-氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描 (PET) 的量化方法。还探讨了磁共振成像 (MRI) 和非 FDG PET 示踪剂方面的新兴技术。对于免疫治疗反应,成像在解剖放射反应 (CT/MRI) 和分子变化 (PET 成像) 中都至关重要。使用 CT 和 PET 评估治疗反应时必须考虑多个方面。最后,我们介绍了整合成像和非成像数据的多模式方法,并讨论了评估和预测肺癌对免疫治疗反应的未来方向。版权所有 © 2024 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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INVESTIGATIVE RADIOLOGY
2024 Jul 25

JPeterMarquardt,PEri...
Subcutaneous and Visceral Adipose Tissue Reference Values From the Framingham Heart Study Thoracic and Abdominal CT.
INVESTIGATIVE RADIOLOGY
计算机断层扫描 (CT) 可捕获皮下和内脏(SAT 和 VAT)脂肪组织室的数量、密度和分布。这些指标可能会随着年龄和性别而变化。该研究旨在为胸部 CT 上的 SAT 以及腹部 CT 上的 SAT 和 VAT 提供年龄、性别和椎骨水平的特定参考值。这项观察性研究的二次分析描述了 SAT弗雷明汉心脏研究的参与者在 2002 年至 2011 年间至少接受过 2 次 CT 检查中的 1 次,但没有已知的癌症诊断结果。我们使用之前经过验证的机器学习辅助流程和严格的质量保证将 SAT 细分为第五、第八、第十胸椎(T5、T8、T10)以及第三腰椎(L3)的 SAT 和 VAT。对于每个指标,我们测量了横截面积 (cm2) 和平均衰减(亨斯菲尔德单位 [HU]),并计算了指数(面积/高度2) (cm2/m2) 和规格(衰减 × 指数) (HU × cm2/m2) 。我们按年龄和性别总结了身体成分指标,并建模了性别、年龄和椎骨水平特定的参考曲线。我们纳入了 3730 名弗雷明汉心脏研究参与者的 3797 次扫描中最多 4 个椎骨水平的 14,898 个单水平测量值(1889 年)。 51%] 男性,平均[标准差]年龄为 55.6 ± 10.6 岁;范围为 38-81 岁)。平均增值税指数随着年龄的增长而增加,在 <45 岁年龄组中,男性为 65 (cm2/m2),女性为 29 (cm2/m2),而男性为 99 (cm2/m2),女性为 60 (cm2/m2)。 )>75 岁年龄组的女性。 SAT 随着年龄的增长不太明显,导致 VAT/SAT 比率随着年龄的增长而增加。免费的 R 包和在线交互式视觉网络界面允许访问参考值。本研究为 T5、T8、T10 和 L3 椎骨水平的 CT 评估 SAT 建立了年龄、性别和椎骨水平特定的参考值椎骨水平 L3。版权所有 © 2024 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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INVESTIGATIVE RADIOLOGY
2024 Jul 29

ChristianRoest,Derya...
Multimodal AI Combining Clinical and Imaging Inputs Improves Prostate Cancer Detection.
INVESTIGATIVE RADIOLOGY
用于通过磁共振成像 (MRI) 检测具有临床意义的前列腺癌 (csPCa) 的深度学习 (DL) 研究常常忽视潜在的相关临床参数,例如前列腺特异性抗原、前列腺体积和年龄。本研究探讨了临床参数和基于 MRI 的 DL 的整合,以提高 MRI 对 csPCa 的诊断准确性。我们回顾性分析了 2 个机构对疑似 csPCa (ISUP ≥2) 进行的 932 例双参数前列腺 MRI 检查。每次 MRI 扫描均由先前开发的 DL 模型自动分析,以检测和分割 csPCa 病变。提取了三组特征:所有 DL 检测到的病变的 DL 病变怀疑级别、临床参数(前列腺特异性抗原、前列腺体积、年龄)和基于 MRI 的病变体积。针对每个特征集组合训练了六个多模态人工智能 (AI) 分类器,采用早期(特征级)和后期(决策级)信息融合方法。每个模型的诊断性能均在中心 1 的 20% 数据上进行内部测试,在中心 2 数据上进行外部测试 (n = 529)。接收器操作特性比较确定了最佳特征组合和信息融合方法,并评估了多模态分析与单模态分析的优势。将最佳模型性能与使用 PI-RADS 的放射科医生进行比较。在内部,通过早期融合将 DL 怀疑水平与临床特征相结合的多模态 AI 实现了最高性能。从外部来看,仅使用临床参数(0.77 vs 0.67 曲线下面积 [AUC],P < 0.001)和 DL 怀疑水平(AUC:0.77 vs 0.70,P = 0.006),它就超过了基线。在外部数据中,早期融合优于晚期融合(AUC 0.77 vs 0.73,P = 0.005)。多模态 AI 和放射科医生评估之间没有观察到显着的性能差距(内部:0.87 vs 0.88 AUC;外部:0.77 vs 0.75 AUC,均 P > 0.05)。多模态 AI(结合 DL 怀疑水平和临床参数)优于临床和仅 MRI用于 csPCa 检测的 AI。早期信息融合增强了多中心环境中人工智能的鲁棒性。合并病变体积并不能提高诊断效果。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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INVESTIGATIVE RADIOLOGY
2024 Aug 08

HyungwooAhn
Current Status of Magnetic Resonance Imaging Use in Bladder Cancer.
INVESTIGATIVE RADIOLOGY
膀胱癌 (BC) 是一个重大的全球健康问题,每年有超过 500,000 例新发病例和 200,000 例死亡,这凸显了准确分期和有效管理的必要性。传统的诊断技术,如膀胱镜检查和经尿道切除术,是基础性的,但在准确评估浸润深度方面存在局限性。这些限制包括分期不足和程序变异的可能性,这可能会严重影响治疗决策。本综述重点关注多参数磁共振成像 (mpMRI) 在 BC 诊断和分期中的作用,特别强调膀胱成像报告和数据系统 (VI-RADS) 框架。通过提高解释一致性和诊断准确性,mpMRI 和 VI-RADS 提供肿瘤特征和浸润深度的详细可视化,同时减少对更具侵入性的传统方法的需求。这些进步不仅提高了分期准确性,而且还增强了治疗计划,强调了先进成像在不断发展的 BC 管理和积极影响患者治疗结果中的重要性。版权所有 © 2024 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF RADIATION BIOLOGY
2024 Jul 26

AleksandraMRistićFir...
In vitro validation of helium ion irradiations as a function of linear energy transfer in radioresistant human malignant cells.
INTERNATIONAL JOURNAL OF RADIATION BIOLOGY
基于对氦离子照射后扩大抗辐射细胞实验数据库的极大兴趣,HTB140、MCF-7和HTB177人类恶性细胞被暴露于具有不同线性能量转移(LET)的氦离子束。细胞沿加宽的 62 MeV/u 氦离子布拉格峰,提供 4.9、9.8、23.4 和 36.8 keV/μm 的 LET。实验设计采用 Geant4 工具包进行数值模拟。评估细胞存活率并与参考 γ 射线进行比较。 DNA双链断裂通过γ-H2AX焦点进行评估。随着LET的增加,2 Gy下的存活分数减少,而RBE(2 Gy,γ)逐渐增加。对于HTB140细胞,高于4Gy的剂量,观察到存活轻微饱和,而RBE(2Gy,γ)的增加不受影响。随着 LET 的增加,γ-H2AX 焦点的增加在照射后 0.5 小时显现出来。相同 LET 的细胞系之间的焦点数量没有显着差异。从0.5到24小时,病灶数量下降达到其残留水平。对于每个时间点,三种细胞系之间的 DNA DSB 存在微小差异。对经氦离子照射的三种细胞系(具有不同的 LET)获得的数据进行分析,揭示了高消除能力和产生大量 DNA DSB 的能力。相对于 γ 射线,介于质子和碳离子报道的之间。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF RADIATION BIOLOGY
2024 Jul 26

MichaelBBellamy,Joni...
Recommendations on statistical approaches to account for dose uncertainties in radiation epidemiologic risk models.
INTERNATIONAL JOURNAL OF RADIATION BIOLOGY
对癌症等随机辐射健康影响的流行病学研究旨在估计作为辐射剂量函数的不利影响的风险,这在很大程度上取决于对所研究的暴露组所接受的辐射剂量的估计。这些估计是基于总是具有不确定性的剂量测定,这种不确定性通常可能相当大。不采用统计方法来校正剂量测定不确定性的研究可能会产生有偏差的风险估计以及这些估计的不正确的置信区间。本文回顾了校正剂量不确定性的辐射风险回归的常用统计方法,重点介绍了一些较新的方法。我们首先描述可能发生的剂量不确定性的类型,包括部分或全部队列共享不确定值的类型,然后演示这些不确定性来源是如何在辐射剂量测定中出现的。我们简要描述了不同类型的剂量测定不确定性对风险估计的影响,然后描述了每种不确定性调整方法。每种方法都有优点和缺点,并且某些方法的适用性有限。我们描述了每种方法可以应用的不确定性类型及其优缺点。最后,我们提供总结建议并简要讨论进一步研究的建议。
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