研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
2024 Aug 10
YunQiu,ShixianHu,Kan...
Developing a Machine-Learning Prediction Model for Infliximab Response in Crohn's Disease: Integrating Clinical Characteristics and Longitudinal Laboratory Trends.
INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
使用抗肿瘤坏死因子α(抗TNF-α)药物实现克罗恩病(CD)的长期临床缓解仍然具有挑战性。本研究旨在根据患者的临床特征建立预测模型,利用机器学习方法进行预测英夫利昔单抗 (IFX) 的长期疗效。2013 年 6 月至 2022 年 1 月期间,来自 3 个炎症性肠病 (IBD) 中心的 3 个队列包括 746 名 CD 患者。收集了基线、14 岁、30 岁和IFX 治疗后 52 周。采用三种机器学习方法来开发基于 23 个基线预测因子的预测模型。使用 SHapley Additive exPlanations (SHAP) 算法来剖析潜在的预测因子,并应用潜在类混合模型 (LCMM) 对血常规测试随着长期 IFX 治疗的纵向变化进行轨迹分析。XGBoost 模型表现出最佳长期反应者和非反应者之间的歧视。在内部训练和测试集中,该模型的 AUC 分别为 0.91(95% CI,0.86-0.95)和 0.71(95% CI,0.66-0.87)。此外,它在独立外部队列中实现了中等预测性能,AUC 为 0.68(95% CI,0.59-0.77)。 SHAP 算法揭示了与疾病相关的实验室测量结果,特别是血红蛋白 (HB)、白细胞 (WBC)、红细胞沉降率 (ESR)、白蛋白 (ALB) 和血小板 (PLT),以及诊断时的年龄和蒙特利尔分类,作为最有影响力的预测者。此外,基于动态实验室测试确定了 2 个不同的患者群,用于监测长期缓解情况。建立的预测模型在区分 IFX 治疗的长期反应者和无反应者方面表现出显着的区分能力。不同患者群的识别进一步强调了在 CD 管理中采用量身定制的治疗方法的必要性。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表克罗恩病出版
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INFECTION CONTROL AND HOSPITAL EPIDEMIOLOGY
2024 Aug 01
XiaoWang,SwarnVArya,...
Antibiotic practice and stewardship in the management of neutropenic fever: a survey of US institutions.
INFECTION CONTROL AND HOSPITAL EPIDEMIOLOGY
描述医疗机构中的中性粒细胞减少性发热管理实践。调查。代表美国境内医疗机构的美国医疗保健流行病学协会研究网络 (SRN) 成员。向 SRN 代表分发了一份电子调查,其中涉及人口统计、抗菌药物等方面的问题预防、支持治疗和中性粒细胞减少性发热管理。该调查从 2022 年秋季到 2023 年春季进行。记录了完整的答复(答复率为 54.8%),受访机构约占 2021 年美国血液恶性肿瘤住院治疗的 15.7%,约占 2020 年美国骨髓移植的 ​​14.9%。大多数实体都有中性粒细胞减少性发热管理 (35, 87.5%) 和预防 (31, 77.5%) 的机构指南,一线治疗包括静脉注射抗假单胞菌抗生素(35, 87.5% 头孢菌素;5, 12.5% 青霉素;0, 0%我们观察到治疗过程决策存在显着异质性,大约一半(18,45.0%)的受访者继续使用抗生素直至中性粒细胞恢复,而其余的则在中性粒细胞恢复之前有降级标准。在经过专门的治疗课程后,对于已确定临床来源(27 名,67.5% 患有肺炎)或微生物来源(30 名,75.0% 患有菌血症)的患者,受访者更愿意在中性粒细胞恢复之前降级。 -相对于中性粒细胞恢复而言经验性抗生素的使用升级,强调需要更强有力的证据来支持和采用这种做法。没有受访者使用碳青霉烯类药物作为一线治疗,这与之前在其他国家进行的调查研究相比是有利的。
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INFECTION
2024 Jul 20
ChristinaBahrs,Chris...
Frequency and clinical significance of Herpes simplex virus type 1/2 reactivation in adult patients with mild to moderately severe community-acquired pneumonia: a multicentre cohort study.
INFECTION
本研究评估了免疫功能正常的社区获得性肺炎 (CAP) 患者单纯疱疹病毒 (HSV) 再激活的频率、临床意义和危险因素。该研究包括 2007 年至 2017 年间参加 CAPNETZ 研究的成年 CAP 患者并有残留痰样本可供分析。除了常规诊断外,还使用 ​​PCR 检测痰液和血液样本中的 HSV-1/2。使用 Fisher 精确检验或 Mann Whitney 检验比较 HSV 阳性和阴性患者的人口统计学、合并症和 CRB-65 评分。 Logistic 回归分析调查了 HSV 重新激活对改良医院康复量表 (HRS) 的影响,直至第 7 天,分为 3 类(无氧疗、氧疗、入住 ICU 或死亡)。 在 245 名患者中,HSV-1 和 HSV- 2 分别在 30 名患者(12.2%,95%CI 8.7-16.9)和 0 名患者中检测到。所有 HSV 阳性患者均住院治疗,CRB-65 严重程度评分为 0-2,并在第一个 28 天存活。与 HSV 阴性组相比,HSV 阳性组患者的中位年龄(70.5 岁对 66 岁)较高,且肿瘤合并症发生率较高(16.7% 对 8.8%)。两组之间共同病原体的分布和结果参数没有显着差异。在多变量逻辑回归模型中,年龄(AOR 1.029,p = 0.012)和CRB-65评分(AOR 1.709,p = 0.048)与较高的HRS独立相关,但HSV-1作为单一或共同病原体则不与较高的HRS独立相关。表明 HSV-1 重新激活在 CAP 中很常见,但可能与特定危险因素或复杂病程无关。© 2024。作者。
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INDIAN PEDIATRICS
2024 Aug 06
SureshDuraisamyUpadh...
Real-World Data on Childhood Relapsed Acute Lymphoblastic Leukemia: A Report on 100 Children Over two Decades From Southern India.
INDIAN PEDIATRICS
本研究旨在提供二十年来复发性急性淋巴细胞白血病 (ALL) 儿童的结果数据以及影响生存的变量。回顾性研究包括 2002 年 3 月至 2021 年 3 月期间在我们中心诊断和治疗并复发的儿童。总共包括 100 名儿童(64 名男孩,36 名女孩); 80 人患有 B-ALL,20 人患有 T-ALL。 50 名儿童出现过早复发,25 名儿童出现早期和晚期复发。复发部位为骨髓 57 例,孤立中枢神经系统 (CNS) 10 例,孤立睾丸 1 例,骨髓和 CNS 联合复发 32 例。 36个家庭选择了最好的支持性护理;其中 23 人很早就复发了。在诱导化疗后病情缓解的 35 例患者中,32 例(91%)接受了造血干细胞移植(HSCT); 17/32 (53%) 还活着并且没有疾病。总生存期 (OS) 为 19 岁 (19%),中位随访时间为 23.5 个月,基于可测量疾病风险 (MRD) 的风险分层后生存期显着改善(4% vs 35%,P = 0.02)。极早期、早期和晚期复发的 OS 分别为 8%、28% 和 32% (P = 0.018),骨髓、联合和孤立 CNS 复发的 OS 分别为 15%、12.5% 和 50% (P = 0.008) ). 复发性 ALL 仍然是一个挑战,接受 HSCT 的患者的 OS 分别为 19% 和 53%。复发后遗弃的现象仍然普遍存在,我们需要整合社会支持来提供护理和最佳治疗。
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INDIAN JOURNAL OF PEDIATRICS
2024 Aug 05
KaushalKulkarni,Sand...
Management and Outcomes of Children with Malignant Germ Cell Tumor.
INDIAN JOURNAL OF PEDIATRICS
旨在评估资源匮乏国家主要在三级护理中心接受治疗的儿童颅外恶性生殖细胞肿瘤 (MGCT) 的临床病理特征、治疗和结果。前瞻性维护的 14 岁以下儿童接受治疗的数据对 1994 年 5 月至 2023 年 1 月的颅外 MGCT 患者特征、管理、无事件生存期 (EFS) 和总生存期 (OS) 以及影响生存的因素进行了分析。事件定义为死亡、复发和进展。进行多变量逻辑回归分析以确定独立预测不良结果的因素。纳入了 177 名儿童(37% 男性),发病时中位 (IQR) 年龄为 30 个月(范围 2-168 个月)。该队列由 87 例 (49%) 性腺外病例和 90 例 (51%) 性腺病例组成。 48 例 (27%) 患者就诊时疾病已发生转移,其中肺部是最常见的部位。 119 例(67%)接受了新辅助化疗(NACT),最终 162/177 例(92%)接受了原发肿瘤切除术。内胚窦肿瘤 (EST) 是 141 名儿童 (73%) 中最常见的组织学亚型。 22 名 (12%) 患者死亡,5 年 OS 为 84.7% (95% CI 78.3-91.1)。 25 名患者出现复发,另外 5 名患者出现进展,5 年 EFS 为 69.9%(95% CI 62.5-77.3)。 III 期 (p = 0.05)、IV 期 (p = 0.006) 和性腺外部位 (p = 0.05) 与较差的 EFS 显着相关。患有 MGCT 的儿童具有良好的结果,5 年 OS 为 84.7%,EFS 为69.9%。 III 期和 IV 期疾病以及性腺外部位是不良结果的独立预测因素。© 2024。作者获得 K C Chaudhuri 博士基金会的独家许可。
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IMMUNITY
2024 Jul 25
HannahLErickson,Sach...
Cancer stem cells release interleukin-33 within large oncosomes to promote immunosuppressive differentiation of macrophage precursors.
IMMUNITY
在鳞状细胞癌 (SCC) 中,巨噬细胞对白细胞介素 (IL)-33 作出反应,形成富含 TGF-β 的基质微环境,维持癌症干细胞 (CSC),部分通过激活 NRF2 抗氧化程序来逃避化疗诱导的细胞凋亡。在这里,我们研究了源自 CSC 的 IL-33 如何促进免疫抑制微环境的发展。具有高 NRF2 活性的 CSC 将核 IL-33 重新分配到细胞质,并作为大肿瘤体 (LO) 的货物释放 IL-33。从机制上讲,NRF2 增加了脂质扰乱酶 ATG9B 的表达,从而在 LO 表面暴露出“吃我”信号,导致膜联蛋白 A1 (ANXA1) 加载。这些 LO 促进 AXNA1 受体骨髓前体分化为免疫抑制性巨噬细胞。阻断 ATG9B 的扰乱酶活性或消耗 ANXA1 可减少巨噬细胞的数量并阻碍肿瘤进展。因此,IL-33 通过 LO 从活 CSC 中释放,以促进替代激活的巨噬细胞的分化,与炎症和组织修复的其他情况具有潜在相关性。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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IMMUNITY
2024 Aug 02
ChristopherMJackson,...
The cytokine Meteorin-like inhibits anti-tumor CD8+ T cell responses by disrupting mitochondrial function.
IMMUNITY
肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)功能低下会导致晚期癌症的进展,并且是免疫治疗的常见目标。新出现的证据表明,在强直刺激期间,代谢不足会导致 T 细胞功能减退,但在这种情况下启动代谢重编程的信号在很大程度上尚不清楚。在这里,我们发现镍纹蛋白样 (METRNL) 是一种由肿瘤微环境 (TME) 中的免疫细胞分泌的代谢活性细胞因子,可诱导 CD8 T 细胞的生物能衰竭。 METRNL 由 CD8 T 细胞在重复刺激过程中分泌,并通过自分泌和旁分泌信号传导发挥作用。从机制上讲,METRNL 增加了 E2F 过氧化物酶体增殖物激活受体 δ (PPARδ) 活性,导致线粒体去极化和氧化磷酸化减少,从而引发补偿性生物能向糖酵解的转变。 Metrnl 消融或下调可改善 CD8 T 细胞的代谢适应性,并增强多种肿瘤模型中的肿瘤控制,证明了靶向 METRNL-E2F-PPARδ 途径支持 CD8 TIL 生物能适应性的转化潜力。版权所有 © 2024 Elsevier Inc.。预订的。
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IMMUNITY
2024 Jul 30
KenjiIchiyama,JiaLon...
Transcription factor Ikzf1 associates with Foxp3 to repress gene expression in Treg cells and limit autoimmunity and anti-tumor immunity.
IMMUNITY
调节性T(Treg)细胞的主转录因子叉头盒蛋白P3(Foxp3)通过靶向某些基因进行激活或抑制来控制Treg细胞功能,但其在不同条件下介导这种激活或抑制的具体机制仍不清楚。我们发现 Ikzf1 通过其外显子 5 (IkE5) 与 Foxp3 结合,并且 IkE5 缺陷的 Treg 细胞高度表达基因,否则这些基因在 T 细胞受体刺激(包括 Ifng)时会被 Foxp3 抑制。 Treg特异性IkE5缺失导致干扰素γ(IFN-γ)过度产生,从而破坏Foxp3表达的稳定性并损害Treg抑制功能,导致全身性自身免疫性疾病和强大的抗肿瘤免疫力。 Pomalidomide 可降解 IKZF1 和 IKZF3,诱导人 Treg 细胞中 IFN-γ 过量产生。从机制上讲,Foxp3-Ikzf1-Ikzf3 复合物与表观遗传共激活因子(例如 p300)竞争,通过染色质重塑与靶基因位点结合。因此,Ikzf1 与 Foxp3 的关联对于 Foxp3 的基因抑制功能至关重要,并且可用于治疗自身免疫性疾病和癌症。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2024 Jul 31
DoanhCBui,BoramSong,...
Spatially-constrained and -unconstrained bi-graph interaction network for multi-organ pathology image classification.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
在计算病理学中,图表已被证明在病理图像分析中很有前景。存在多种可以发现病理图像的不同特征的图结构。然而,不同图结构之间的组合和相互作用尚未得到充分研究和用于病理图像分析。在这项研究中,我们提出了一种并行的双图神经网络,称为 SCUBa-Net,配备图卷积网络和 Transformer,将病理图像处理为两个不同的图,包括空间约束图和空间约束图。无约束图。为了高效且有效的图学习,我们引入了两个图间交互块和一个图内交互块。图间交互块学习每个图中的节点到节点的交互。图内交互块在收集和总结整个图中信息的虚拟节点的帮助下学习全局和局部级别的图到图交互。 SCUBa-Net 在四个多器官数据集上进行了系统评估,包括结直肠癌、前列腺癌、胃癌和膀胱癌。实验结果证明了 SCUBa-Net 与最先进的卷积神经网络、Transformer 和图神经网络相比的有效性。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2024 Aug 02
BoahKim,YanZhuang,Te...
OTMorph: Unsupervised Multi-domain Abdominal Medical Image Registration Using Neural Optimal Transport.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
变形图像配准是分析医学图像的基本过程之一。特别是,在诊断肝癌和淋巴瘤等腹部疾病时,经常使用从不同模式或不同成像协议扫描的多域图像。然而,由于扫描时间、患者呼吸、运动等原因,它们并没有对齐。尽管最近基于学习的方法可以高性能地实时提供变形,但使用深度学习的多域腹部图像配准仍然具有挑战性,因为图像不同领域具有不同的特征,例如图像对比度和强度范围。为了解决这个问题,本文提出了一种使用神经最优传输的新型无监督多域图像配准框架,称为 OTMorph。当移动和固定体积作为输入时,我们提出的模型的传输模块学习最佳传输计划以将数据分布从移动体积映射到固定体积并估计域传输体积。随后,采用传输体积的配准模块可以有效地估计变形场,从而提高变形性能。使用多模态和多参数腹部医学图像进行多域图像配准的实验结果表明,该方法通过域传输图像提供了优异的变形配准,从而减轻了输入图像之间的域间隙。此外,我们甚至在分布外数据上也取得了改进,这表明我们的模型对于各种医学图像的配准具有卓越的通用性。我们的源代码可在 https://github.com/boahK/OTMorph 获取。
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