肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING

MdHadiurRahmanKhan,R...

A Novel Poroelastography Method for High-quality Estimation of Lateral Strain, Solid Stress and Fluid Pressure In Vivo.

IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING

使用超声弹性成像评估组织的机械和传输特性需要准确估计体积应变的时空分布。由于诸如俯仰限制和横向方向上相位信息的缺乏等物理限制，横向应变估计的质量通常明显低于轴向应变估计的质量。本文开发、测试和验证了一种基于可压缩多孔介质物理学的新型横向应变估计技术。该技术被称为“基于孔隙弹性成像的超声横向应变估计”(PULSE)。 PULSE 与之前提出的横向应变估计器不同，因为它使用组织局部区域内的内部流体流动的基本物理原理作为理论基础。 PULSE 建立了轴向应变的时空变化与横向应变相应的时空变化之间的关系，有效地允许以与轴向应变估计器相当的质量来评估横向应变。我们证明，PULSE 还可用于使用超声孔隙弹性成像 (USPE) 来准确跟踪癌症中压缩引起的固体应力和流体压力。在本研究中，我们报告了 PULSE 的理论公式以及使用有限元 (FE) 和超声模拟进行的验证。与地面真实模拟相比，PULSE 生成的结果显示出小于 5% 的相对误差百分比 (PRE) 和大于 90% 的结构相似性指数 (SSIM)。实验结果用于定性评估 PULSE 的体内性能。该方法可用于克服非轴向应变成像的固有局限性并提高USPE的临床可转化性。

IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING

JingXu,KaiHuang,Lian...

RemixFormer++: A Multi-modal Transformer Model for Precision Skin Tumor Differential Diagnosis with Memory-efficient Attention.

IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING

由于不同类别的皮肤肿瘤所显示的视觉特征不明确甚至令人困惑，因此在早期准确诊断恶性皮肤肿瘤可能具有挑战性。为了提高诊断精度，可以考虑来自多个来源的所有可用临床数据，特别是临床图像、皮肤镜图像和病史。结合临床实践，我们提出了一种新颖的 Transformer 模型，名为 Remix-Former，由临床图像分支、皮肤镜图像分支和元数据分支组成。鉴于临床和皮肤镜图像固有的独特特征，每种类型都采用专门的关注策略。临床图像通过自上而下的架构进行处理，捕获局部病变细节和全局上下文信息。相反，皮肤镜图像通过两级分层编码器进行自下而上的处理，旨在精确定位细粒度的结构和纹理特征。专用元数据分支通过对相关患者数据进行编码来无缝集成非视觉信息。融合三个分支的特征大大提高了疾病分类的准确性。 RemixFormer 在四个单模态数据集（PAD-UFES-20、ISIC 2017/2018/2019）上展示了卓越的性能。与之前使用公共多模态 Derm7pt 数据集的最佳方法相比，我们的平均 F1 绝对提高了 5.3%，五种皮肤肿瘤的分类准确率提高了 1.2%。此外，使用包含 10,351 名患有 12 种最常见皮肤肿瘤的患者的大规模内部数据集，我们的方法获得了 92.6% 的总体分类准确率。通过全面的读者研究，这些有希望的结果与 191 名皮肤科医生的表现相当或更好，显然意味着我们的方法具有潜在的临床可用性。

YuanhaoYang,YongHShe...

Genome-wide assessment of shared genetic landscape of idiopathic pulmonary fibrosis and its comorbidities.

特发性肺纤维化（IPF）是一种进行性间质性肺疾病，伴有局部和全身合并症。遗传因素在 IPF 和某些相关合并症的发生中发挥着重要作用。然而，尚不确定 IPF 和这些合并症是否存在共同的遗传因素。为了弥补这一知识差距，我们对 IPF 与十种常见遗传性合并症（即体重指数 [BMI]、冠状动脉疾病 [CAD]、慢性阻塞性肺疾病 [COPD]、胃食管反流）之间的共享遗传结构进行了系统调查疾病、肺癌、重度抑郁症 [MDD]、阻塞性睡眠呼吸暂停、肺动脉高压 [PH]、中风和 2 型糖尿病），利用来自各自全基因组关联研究和多组学研究的大规模汇总数据。我们发现 IPF 与七种合并症（不包括肺癌、MDD 和 PH）之间存在显着（错误发现率 [FDR] < 0.05）和中度遗传相关性。有证据表明 IPF 对 CAD 具有部分假定的因果效应。值得注意的是，我们在肺中观察到 IPF 和 CAD 之间交叉特征的 FDR 显着遗传富集，在肝脏中观察到 IPF 和 COPD 之间交叉特征的 FDR 显着遗传富集。此外，我们还发现了 65 个 FDR 显着基因，它们在与 IPF、BMI 和 COPD 病因学相关的 20 条生物途径中过度表达，包括与炎症相关的粘蛋白基因簇。其中一些基因与治疗 IPF、CAD 和/或 COPD 的临床相关药物相关。我们的结果强调了 IPF 及其常见合并症之间普遍存在的共同遗传基础，并对 IPF 相关合并症的早期诊断、药物再利用以及 IPF 新疗法的开发具有未来影响。© 2024。作者。

HUMAN GENE THERAPY

XiaoKe,QingXie,Shuan...

Intra-Articular Delivery of an AAV-Anti-TNF-α Vector Alleviates the Progress of Arthritis in a RA Mouse Model.

HUMAN GENE THERAPY

类风湿性关节炎（RA）是一种慢性炎症性自身免疫性疾病，以关节破坏和功能障碍为特征。肿瘤坏死因子（TNF）在 RA 发病机制中发挥着关键作用。尽管 TNF 靶向药物在临床上有效，但需要频繁和长期给药，通常会导致患者依从性差和结果不佳。这项研究开发了一种基因治疗方法，使用工程腺相关病毒 (AAV) 载体将抗 TNF 药物直接递送到 RA 动物模型的关节腔中。接受这种治疗的动物表现出临床评分、炎症标志物和关节组织健康的持续改善。免疫荧光染色显示AAV载体可以转导多种细胞类型，包括T细胞、A型滑膜细胞和树突状细胞。我们的结果表明，这种基因疗法的单次给药可提供长期疗效。这表明 AAV 介导的抗 TNF 基因疗法可以长期缓解 RA 小鼠模型的临床症状并减少炎症损伤。这种创新方法提供了一种有前景的新疗法，对于治疗 RA 患者具有重要的临床前景。

Frontiers in Molecular Biosciences

CristinaSorino,Simon...

Immunotherapy in melanoma: advances, pitfalls, and future perspectives.

Frontiers in Molecular Biosciences

由于其高转移能力，皮肤黑色素瘤是最致命和最具侵袭性的皮肤癌。在过去的几十年里，随着靶向治疗和免疫治疗的出现，这类恶性肿瘤的治疗经历了一场重大革命，极大地改善了患者的生活质量和生存率。然而，由于副作用的存在和耐药机制的发展，反应率仍然不能令人满意。在这种背景下，肿瘤微环境已成为影响免疫治疗反应性和疗效的因素，对其与免疫系统相互作用的研究提供了新的有前景的临床策略。本综述通过分析积极方面和需要进一步改进的方面，对目前可用的黑色素瘤免疫治疗策略进行了简要概述。事实上，更好地了解黑色素瘤细胞免疫逃避的机制，特别关注肿瘤微环境的作用，可以为改进当前疗法和识别新的预测生物标志物提供基础。版权所有 © 2024 Sorino、Iezzi、Ciuffreda和法尔科内。

Frontiers in Molecular Biosciences

Li-HongMei,Hui-HuiGa...

Lipidomics revealed alterations in glycerophospholipid metabolism in skin squamous cell carcinoma.

Frontiers in Molecular Biosciences

皮肤鳞状细胞癌（SCC）是一种常见的恶性肿瘤，脂质代谢失调与其发病机制有关。然而，鳞状细胞癌中脂质变化的详细表征仍然有限。我们使用液相色谱-质谱法 (LC-MS) 分析了 34 名鳞状细胞癌患者和邻近健康组织（距离肿瘤边缘超过 1 厘米）的组织样本中的脂质代谢变化。。使用主成分分析（PCA）和稀疏偏最小二乘判别分析（sPLS-DA）来识别数据可视化和歧视性脂质谱。使用外部数据集（来自之前的研究，该研究使用脂质组学方法类似地探索了口腔鳞状细胞癌中的脂质谱）鉴定并进一步验证了参与鳞状细胞癌代谢的关键脂质。通过通路富集分析来阐明与这些关键脂质相关的代谢途径。通过比较SCC和健康组织，鉴定出八种脂质，包括PI（16:0/22:4）、PI（18:1/20:4）、PE (16:0/20:4)、PE(16:0/22:5)、PE(16:0/22:6)、PE(18:1/20:3)、PC(18:1/20) :2) 和 PC(18:2/20:2)，经独立数据集证实。所有这些脂质在鳞状细胞癌肿瘤组织中均上调。通路富集分析揭示了甘油磷脂代谢通路的显着改变，特别是影响二酰基甘油磷酸胆碱、甘油磷酸乙醇胺和甘油磷酸肌醇的代谢。我们的研究结果表明，甘油磷脂代谢失调在鳞状细胞癌的发生中起着关键作用。版权所有 © 2024 Mei, Gan, Wang, Xu 、叶和杨。

Frontiers in Molecular Biosciences

Tian-QiLi,YanLiu,Cho...

Saikosaponin A attenuates osteoclastogenesis and bone loss by inducing ferroptosis.

Frontiers in Molecular Biosciences

为了减轻骨质流失，目前大多数药物都针对破骨细胞。 Saikosaponin A (Ssa) 是一种从柴胡 (Bupleurum falcatum) 中提取的三萜皂苷，具有免疫调节、神经调节、抗病毒、抗癌、抗惊厥、抗炎和抗增殖作用。最近，骨稳态的调节被证明涉及铁死亡。在此，我们的目的是确定Ssa对破骨细胞生成和分化的抑制作用、是否涉及铁死亡及其潜在机制。进行抗酒石酸酸性磷酸酶 (TRAP) 染色、F-肌动蛋白染色和凹坑形成测定，以证实 Ssa 介导的体外 RANKL 诱导的破骨细胞生成抑制。通过铁定量、FerroOrange 染色、二氯二氢荧光素二乙酸酯、MitoSOX、丙二醛、谷胱甘肽和硼二吡咯亚甲基 581/591 C11 测定来测量，Ssa 可以通过促进脂质过氧化来促进破骨细胞铁死亡并增加线粒体损伤。通路分析显示Ssa可通过抑制Nrf2/SCL7A11/GPX4轴促进破骨细胞铁死亡。值得注意的是，我们发现铁死亡抑制剂ferrostatin-1和Nrf2激活剂叔丁基氢醌逆转了Ssa对RANKL诱导的破骨细胞生成的抑制作用。在体内，微型计算机断层扫描、苏木精和伊红染色、TRAP染色、酶联免疫吸附测定和免疫荧光证实，在脂多糖诱导的牙周炎大鼠中，Ssa治疗可剂量依赖性地减少牙槽骨吸收。结果表明 Ssa 是一种很有前景的治疗溶骨性疾病的药物。版权所有 © 2024 Li、Liu、Feng、Bai、Wang、Zhang 和 Wang。

Frontiers in Molecular Biosciences

ShiliangChen,YiJiang...

Epigenetic clocks and gliomas: unveiling the molecular interactions between aging and tumor development.

Frontiers in Molecular Biosciences

神经胶质瘤是最常见和最具侵袭性的原发性脑肿瘤，代表了起源于神经胶质细胞的多种恶性肿瘤。这些肿瘤是脑肿瘤相关发病率和死亡率的重要组成部分，与亚洲和非洲相比，北美和欧洲的发病率更高。遗传倾向和环境因素，特别是电离辐射，严重影响神经胶质瘤的风险。表观遗传学，特别是 DNA 甲基化，在神经胶质瘤研究中发挥着关键作用，IDH 突变神经胶质瘤表现出异常的甲基化模式，有助于肿瘤发生。表观遗传时钟是基于 DNA 甲基化模式预测生物年龄的生物标记，揭示了对衰老和肿瘤发展的重要见解。最近的研究表明，神经胶质瘤的表观遗传老化加速，与癌症风险增加和预后较差相关。本文探讨了表观遗传时钟的机制、其生物学意义及其在神经胶质瘤研究中的应用。此外，还讨论了表观遗传时钟在诊断、预测和治疗神经胶质瘤中的临床意义。将表观遗传时钟数据整合到个性化医疗方法中有望增强神经胶质瘤治疗的治疗策略和患者结果。版权所有 © 2024 Chen、Jiang、Wang、Tong、He、Lu 和 Zhang。

Frontiers in Molecular Biosciences

BixuanRen,XiaoqingLi...

Exosomes: a significant medium for regulating drug resistance through cargo delivery.

Frontiers in Molecular Biosciences

外泌体是直径为 30-150 nm 的小型脂质纳米囊泡。它们存在于所有体液中，并由大多数细胞通过胞吐作用主动分泌。外泌体在细胞间通讯中发挥着重要作用，并作为调节各种生理和病理过程（例如肿瘤耐药性的出现）的重要分子载体。肿瘤相关外泌体通过外泌体释放多药耐药蛋白和miRNA等物质，将耐药性转移到其他肿瘤细胞。这些物质改变细胞表型，使其对药物产生耐药性。肿瘤相关外泌体还在影响免疫细胞和基质细胞等其他细胞的耐药性方面发挥着作用。外泌体改变这些细胞的行为和功能，帮助肿瘤细胞逃避免疫监视并形成肿瘤生态位。此外，外泌体还输出杀肿瘤药物、中和抗体药物等物质，帮助肿瘤细胞抵抗药物治疗。在这篇综述中，我们总结了外泌体通过在肿瘤微环境 (TME) 中递送货物来促进耐药性的机制。版权所有 © 2024 Ren、Li、Zhang、Tai 和 Yu。

HUMAN MOLECULAR GENETICS

XiaoxuDing,XueyanZha...

ETV4/NSUN2 Axis modulates aerobic glycolysis and malignancy in HSCC.

HUMAN MOLECULAR GENETICS

这项研究深入探讨了下咽鳞状细胞癌 (HSCC) 的分子复杂性，特别关注 ETS 易位变体 4 (ETV4) 在有氧糖酵解中发挥的关键作用。目的是发现HSCC早期诊断和治疗的新靶点。严格检查了 HSCC 组织中的 ETV4 表达，揭示了其与患者生存的关系。通过综合实验，我们证明ETV4激活促进HSCC细胞增殖和侵袭，同时抑制细胞凋亡。此外，体内实验证实了ETV4激活的促肿瘤作用。该研究阐明了 ETV4 与 NSUN2 启动子的结合及其对 PKM2 表达的影响，从而调节 HSCC 中的糖酵解和细胞功能。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。版权所有。如需权限，请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com。