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HEALTH PHYSICS
2024 Aug 05

PerpetuaUduba,LissaS...
Uranium in Drinking Water and Bladder Cancer: A Case-Control Study in Michigan.
HEALTH PHYSICS
铀天然存在于用于饮用的地下水中;然而,自然产生的浓度对健康的风险尚不确定。摄入铀后会引起放射性和化学毒性。当铀排泄到尿液中时,膀胱和肾脏会接受一定剂量的铀。在病例对照研究中调查饮用水中的铀与膀胱癌风险之间的关联。在密歇根州东南部 11 个县进行了一项基于人群的膀胱癌病例对照研究。共有411名病例和566名对照者提供了饮用水和脚趾甲样本,并回答了有关生活方式和居住史的问题。在饮用水和脚趾甲中测量了铀,并通过无条件逻辑回归模型评估了其与膀胱癌的关联。水中铀浓度中位数为0.12 μg L-1,最大值为4.99 μg L-1,脚趾甲中铀浓度中位数为0.0031 μg g-1。在调整后的回归模型中,建议对暴露于饮用水中铀上四分位数的人群(HR = 0.64,95% CI:0.43,0.96)和脚趾甲(HR 0.66;95% CI 0.45,0.96)有保护作用。 )与最低四分位的那些相比。我们的目标是调查招募时对家庭住所饮用水源的额外调整,以解决潜在的选择偏差和混淆饮用水铀(HR = 0.68,95% CI:0.44,1.05)和脚趾甲铀零值的衰减结果(HR = 0.80,95% CI:0.53,1.20)。这项病例对照研究表明,饮用水或脚趾甲中发现的铀不会增加膀胱癌的风险。版权所有 © 2024 健康物理学会。
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Plant Methods
2024 Jul 25

ZubairAhmed,Muhammad...
LC-ESI-MS/MS-based molecular networking, antioxidant, anti-glioma activity and molecular docking studies of Clematis graveolens.
Plant Methods
ClematisgravolensLindl. 是喜马拉雅地区发现的一种本土攀缘植物,当地社区使用它来治疗颈部肿瘤。这项工作的目的是检查 C.graveolens 粗提物和级分的综合代谢组学特征、抗氧化能力、体外和计算机中对 U-87 人神经胶质瘤细胞系的抗神经胶质瘤作用。液相色谱与质谱联用 (LC-MS/MS) 用于建立 C.gravolelens 的详细代谢物分析。使用MTT细胞活力测定对U-87和BHK-21进行细胞毒性评估。通过分子对接研究,还确定了已识别化合物与靶蛋白之间的抑制模式和结合相互作用,以评估体外结果。使用基于 LC-MS/MS 的全球天然产物社会 (GNPS) 分子网络分析鉴定出 27 种化合物。粗提物、乙酸乙酯组分和氯仿组分对 U-87 细胞系表现出显着的抑制活性,IC50 值分别为 112.0、138.1 和 142.7 µg/mL。乙酸乙酯馏分对 2,2'-连氮基-双 (3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸) (ABTS) 活性、2,2-二苯基-1-三硝基苯肼 (DPPH) 活性和金属螯合活性表现出显着的抑制浓度IC50 值分别为 39.50 µg/mL、32.27 µg/mL 和 53.46 µg/mL。粗提物显示最大总酚和总黄酮浓度分别为 338.7 µg GAE/mg 和 177.04 µg QE/mg。这项研究的结果表明,C.gravolens 由多种具有抗氧化和抗神经胶质瘤特性的活性植物成分组成。© 2024。作者。
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Journal of Hematology & Oncology
2024 Aug 07

KeyuLi,JunkeWang,Rui...
Overcome the challenge for intratumoral injection of STING agonist for pancreatic cancer by systemic administration.
Journal of Hematology & Oncology
由于瘤内给药的挑战,先天性激动剂尚未超越大多数肿瘤类型功效测试的临床前研究。胰腺导管腺癌 (PDAC) 具有不利的肿瘤微环境,导致 T 细胞功能障碍。先天激动剂治疗可作为 T 细胞启动机制,使 PDAC 对抗 PD-1 抗体 (a-PD-1) 治疗敏感。使用自发形成肝转移的移植小鼠模型、自发形成 PDAC 的基因工程 KPC 小鼠模型和人类患者衍生的异种移植模型,我们比较了 BMS-986301 的肝内/肿瘤内和肌肉内全身给药之间的抗肿瘤功效。下一代 STING 激动剂。流式细胞术、纳米线和细胞因子测定用于评估局部和全身免疫反应。这项研究表明,通过肌肉注射全身注射 STING 激动剂在诱导效应 T 细胞反应和抗肿瘤功效方面与瘤内注射相当。与瘤内给药相比,全身给药诱导的 T 细胞耗竭和免疫抑制信号减弱。尽管如此,STING 激动剂的瘤内治疗或全身治疗均与肿瘤浸润 T 细胞上 CTLA-4 表达增加相关。然而,a-PD-1 和抗 CTLA-4 抗体与全身 STING 激动剂的组合在 KPC 小鼠自发性 PDAC 模型中证明了抗肿瘤功效。用 PBMC 重建人类患者来源的异种移植物的小鼠胰腺和肝脏原位模型也表明,肿瘤内和肌肉内 STING 激动剂的抗肿瘤和远隔作用是相同的。总而言之,本研究支持通过全身给药治疗 PDAC 的先天激动剂的临床开发。© 2024。作者。
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GUT
2024 Jul 25

ClaudiaCampani,Sandr...
Circulating tumour DNA in patients with hepatocellular carcinoma across tumour stages and treatments.
GUT
循环肿瘤 DNA (ctDNA) 是一种有前途的癌症非侵入性生物标志物。我们的目的是评估肝细胞癌 (HCC) 患者的 ctDNA 动态。我们分析了 173 名 HCC 患者在诊断或治疗时 (n=502) 以及局部治疗后 24 小时 (n=154) 收集的 772 份血浆以及随访期间(n=116)。作为对照,分析了来自无 HCC 的慢性肝病患者的 56 份血浆。通过测序和基于液滴的数字 PCR 分析所有样品的无细胞 DNA (cfDNA) 浓度以及 TERT 启动子、CTNNB1、TP53、PIK3CA 和 NFE2L2 的突变。将结果与 232 个相应肿瘤样本进行比较。在活动性 HCC 患者中,40.2% 的 ctDNA 发生突变,而非活动性 HCC 患者中这一比例为 14.6%,对照组为 1.8%(p<0.001)。在活动性 HCC 中,我们在 TERT 启动子中发现了 27.5% 的突变,在 TP53 中发现了 21.3%,在 CTNNB1 中发现了 13.1%,在 PIK3CA 中发现了 0.4%,在 NFE2L2 中发现了 0.2%,大多数情况下与相应肿瘤中发现的突变相似。 CtDNA 突变率随着肿瘤分期的进展而增加 (p<0.001)。在 103 名接受经皮消融治疗的患者中,治疗前 ctDNA 突变的存在和数量与较高的死亡风险 (p=0.001) 和复发风险 (p<0.001) 相关。有趣的是,局部治疗 24 小时后 cfDNA 浓度和可检测突变增加。在 53 名接受全身治疗的患者中收集的 356 份血浆中,我们在 60.4% 的病例中检测到基线突变。在接受 atezolizumab-bevacizumab 治疗的患者中,ctDNA 突变的持续存在与放射学进展相关(63.6% vs 消失的 36.4%,p=0.019)。在两名接受全身治疗取得进展的患者中,我们检测到血浆中 CTNNB1 突变的发生,其中一名患者的肿瘤中存在亚克隆,而另一名患者的肿瘤中则无法检测到。ctDNA 提供了反映肿瘤生物学的动态信息。它代表了一种可用于指导 HCC 临床管理的非侵入性工具。© 作者(或其雇主)2024。禁止商业重复使用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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GUT
2024 Aug 08

XianhuaMao,XinrongZh...
Synergistic association of sodium-glucose cotransporter-2 inhibitor and metformin on liver and non-liver complications in patients with type 2 diabetes mellitus and metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease.
GUT
2 型糖尿病和代谢功能障碍相关的脂肪肝病(糖尿病 MASLD)经常共存,并使肝脏和非肝脏结果恶化,但有效的药物治疗有限。我们的目的是评估钠-葡萄糖协同转运蛋白 2 抑制剂 (SGLT-2i) 对糖尿病 MASLD 患者肝脏和非肝脏结局的长期影响。这项基于人群的队列研究从 Merative Marketscan Research 检索糖尿病 MASLD 患者数据库(2013 年 4 月和 2021 年 12 月)。活性比较剂是其他降糖药物(oGLD)。主要结局是肝脏并发症,包括肝细胞癌(HCC)和肝硬化,以及非肝脏并发症,包括心血管疾病(CVD)、慢性肾病(CKD)和非肝癌。应用倾向评分匹配并建立Cox回归模型。与oGLD相比,SGLT-2i用户患HCC(HR 0.76,95% CI 0.62至0.93)、肝硬化(HR 0.80,95% CI 0.76至0.84)的风险显着降低)、CVD(HR 0.82,95% CI 0.79至0.85)和CKD(HR 0.66,95% CI 0.62至0.70)、非肝癌(HR 0.81,95% CI 0.76至0.86)。与未服用二甲双胍和 SGLT-2i 的患者相比,二甲双胍或 SGLT-2i 使用者(HR 0.76-0.97)以及两种药物使用者(HR 0.58-0.79)的风险逐步降低。肝脏失代偿、代偿性肝硬化、主要心血管疾病、终末期肾病和特定常见癌症的风险也较低(HR 0.61-0.84)。在一项全国性队列中,SGLT-2i 用户的肝癌风险显着降低糖尿病 MASLD 患者的非肝脏并发症发生率高于 oGLD 用户。同时使用二甲双胍可进一步降低风险。© 作者(或其雇主)2024。禁止商业重复使用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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GUT
2024 Aug 09

MarioDinis-Ribeiro,S...
The road to a world-unified approach to the management of patients with gastric intestinal metaplasia: a review of current guidelines.
GUT
在过去的十年中,胃肠上皮化生 (GIM) 的治疗已由多个不同的国际循证指南解决。在这篇综述中,我们的目的是综合这些指南,为临床医生提供当前治疗 GIM 患者的建议的全球视角,并强调未来研究需要解决的证据差距。我们对文献进行了系统回顾查看 2010 年 1 月至 2023 年 2 月期间发布的针对 GIM 诊断和管理的指南和共识声明。从确定的 426 份手稿中,对 15 份指南进行了评估。关于 GIM 内窥镜监测的目的,各指南之间存在一致性,即识别常见的肿瘤病变并分期胃肿瘤前期病症。指南还同意,只有具有高风险GIM表型(例如,体扩展GIM、OLGIM III/IV期、不完全GIM亚型)、持续难治性幽门螺杆菌感染或有胃癌一级家族史的患者才应接受定期检查。间隔内窥镜监测。相比之下,低风险表型(大多数 GIM 患者)不需要监测。并非所有指南都与组织学分期系统一致。如果需要进行监测,大多数指南建议间隔 3 年,但存在一些差异。所有指南都建议根除幽门螺杆菌作为预防胃癌的唯一非内镜干预措施,而有些指南还提供了有关生活方式改变的额外建议。虽然大多数指南都提到了高质量内窥镜检查对于内窥镜监测的重要性,但除了指出应遵循系统性胃活检方案外,很少有详细说明重要指标。值得注意的是,大多数指南都评论了内窥镜检查在胃癌筛查和胃癌前病变检测中的作用,但异质性很高,实施指导有限,并且缺乏强有力的证据。尽管人群和实践存在差异,但国际指南总体上在以下方面保持一致: GIM 作为癌前病变的重要性,以及对内镜监测采用风险分层方法的必要性,以及根除幽门螺杆菌(如果存在)的必要性。关于以下方面的指南还有协调的空间:(1)哪些人群值得进行胃癌内窥镜筛查和 GIM 检测/分期指数; (2) 高质量内窥镜检查的客观指标; (3) 对组织学分期的必要性达成共识;(4) 除单独根除幽门螺杆菌外,还采用非内镜干预措施预防胃癌。需要进行强有力的研究,最好是随机试验的形式,以弥补现有的大量证据差距。© 作者(或其雇主)2024。禁止商业重复使用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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Biotechnology Journal
2024 Jul

HanoolYun,Sun-HeeKim...
Efficient generation of recombinant anti-HER2 scFv with high yield and purity using a simple method.
Biotechnology Journal
我们开发了一种在大肠杆菌中产生可溶形式的靶向人上皮生长因子受体 2 (HER2) 的单链片段变量 (scFv) 的方法。通过优化可变重域 (VH) 和可变轻域 (VL) 以及 His 标签的方向,我们鉴定出了具有最高 HER2 结合活性的 HL-His 型抗体。 1 L 培养物中 HL-His 的纯化可产生 40.7 mg,纯度 >99%。检测限确定为 2.9 ng,证明了高产量、纯度和灵敏度。此外,我们成功地用荧光染料缀合的 scFv 标记 HER2 细胞系,与 HER2 细胞系相比,观察到的信号背景比明显更高。这凸显了这些荧光 scFv 作为 HER2 乳腺癌诊断有价值的探针的潜力。值得注意的是,完整的 scFv 生产过程得到了简化,只需要 4-5 天。此外,该产品在冷冻储存后仍保持其活性,允许大规模生产和广泛的实际应用。© 2024 作者。生物技术杂志由 Wiley‐VCH GmbH 出版。
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Biotechnology Journal
2024 Jul

ChiChi,XiuwuTang,Wei...
Exosomal lncRNA USP30-AS1 activates the Wnt/β-catenin signaling pathway to promote cervical cancer progression via stabilization of β-catenin by USP30.
Biotechnology Journal
宫颈癌(CC)仍然是全球女性癌症相关死亡的主要原因。长非编码 RNA (lncRNA) 在包括 CC 在内的多种癌症中发挥着至关重要的调节作用。本研究探讨了一种新型 lncRNA USP30 反义 RNA 1 (USP30-AS1) 在 CC 肿瘤发生中的功能。我们使用 RT-qPCR 分析了 USP30-AS1 的表达,并进行了体外功能丧失测定以及体内测定,以评估 USP30-AS1 沉默对 CC 细胞生长和迁移的影响。进行了其他机制实验,包括 RNA Pull-down、RNA 免疫沉淀 (RIP) 和免疫共沉淀 (Co-IP) 测定,以阐明 USP30-AS1 影响的调节机制。我们发现 USP30-AS1 在 CC 组织和细胞中过度表达。沉默USP30-AS1可显着减少细胞增殖、迁移、侵袭和肿瘤生长。此外,发现 USP30-AS1 通过海绵 microRNA-2467-3p (miR-2467-3p) 并招募 FUS RNA 结合蛋白 (FUS) 来调节泛素特异性肽酶 30 (USP30) 的表达,从而稳定 β-catenin并激活 Wnt/β-catenin 信号通路。这些研究结果表明,USP30-AS1 通过 miR-2467-3p/FUS/USP30 轴增强 CC 细胞生长和迁移,突显其作为 CC 生物标志物的潜力。© 2024 Wiley‐VCH GmbH。
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GENOME RESEARCH
2024 Aug 07

MadalinaGiurgiu,Nadi...
Reconstructing extrachromosomal DNA structural heterogeneity from long-read sequencing data using Decoil.
GENOME RESEARCH
环状染色体外 DNA (ecDNA) 是一种癌基因扩增形式,存在于各种癌症类型中,与患者的不良预后相关。 ecDNA 结构可能很复杂,并且包含源自多个染色体位置的重排 DNA 序列。由于 ecDNA 的结构可以影响癌基因调控并可能表明其形成机制,因此以高分辨率将其与测序数据分开至关重要。尽管已经开发出在癌症基因组测序中识别和重建 ecDNA 的方法,但解析复杂的 ecDNA 结构仍然具有挑战性,特别是具有共享基因组足迹的扩增子。我们在此介绍 Decoil,这是一种计算方法,它将断点图方法与回归相结合,以重建复杂的 ecDNA,并对共存的 ecDNA 元素与长读长纳米孔测序中重叠的基因组足迹进行去卷积。对于简单和复杂的 ecDNA,在模拟长读长测序数据中,Decoil 的性能优于基于从头组装和比对的方法。将Decoil应用于全基因组测序数据发现了不同的ecDNA拓扑,并探索了神经母细胞瘤和细胞系中的ecDNA结构异质性,表明该方法可以改善癌症中的ecDNA结构分析。由冷泉港实验室出版社出版。
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GENOME RESEARCH
2024 Aug 12

EnakshiSaha,ViolaFan...
Bayesian inference of sample-specific coexpression networks.
GENOME RESEARCH
基因调控网络(GRN)是推断调节生物过程的分子之间复杂相互作用的有效工具,因此可以深入了解生物系统的驱动因素。推断共表达网络是 GRN 推断的关键要素,因为表达模式之间的相关性可能表明基因受到共同因素的共同调节。然而,估计共表达网络的方法通常会得出代表群体平均调节特性的聚合网络,因此无法完全捕获群体异质性。 BONOBO(通过同化组学数据获得的贝叶斯优化网络)是一种可扩展的贝叶斯模型,用于导出个体样本特异性共表达矩阵,该矩阵可识别个体之间分子相互作用的变化。对于每个样本,BONOBO 假设对数变换的中心基因表达呈高斯分布,并假设由数据中所有其他样本构建的样本特异性共表达矩阵呈共轭先验分布。将样本特异性基因共表达与先验分布相结合,BONOBO 产生样本特异性共表达矩阵后验分布的封闭式解,从而允许分析大型数据集。我们证明了 BONOBO 在多种情况下的实用性,包括分析酵母转录因子敲除研究中的基因调控、人类乳腺癌亚型中 miRNA-mRNA 相互作用的预后意义,以及人类甲状腺组织内基因调控的性别差异。我们发现 BONOBO 优于其他用于样本特异性共表达网络推理的方法,并提供了对生物过程驱动因素的个体差异的洞察。由冷泉港实验室出版社出版。
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