研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Journal of Translational Medicine
2024 Aug 13
SoniShaikh,HarshDhar...
The spatial distribution of intermediate fibroblasts and myeloid-derived cells dictate lymph node metastasis dynamics in oral cancer.
Journal of Translational Medicine
由于治疗方案和治疗目标有限,口腔癌带来了重大的健康挑战。我们的目的是研究牙龈颊口腔鳞状细胞癌 (GB-OSCC) 肿瘤的侵袭性边缘,从基因和细胞类型在不同距离边缘内可能导致淋巴结转移的定位角度来研究。我们收集了 23 个患者的肿瘤组织。使用数字空间转录组学切除 GB-OSCC 样本进行基因表达谱分析。我们监测了肿瘤与其微环境 (TME) 之间不同距离处的差异基因表达,并进行了解痉研究和免疫组织化学来鉴定调节 TME 的细胞和基因。我们发现肿瘤-基质界面(距离达 200 µm)肿瘤和免疫细胞之间)是 GB-OSCC 疾病进展最活跃的区域。差异最大的顶端基因,如 FN1 和 COL5A1,位于边缘的基质末端,与细胞外基质 (ECM) 的富集和免疫抑制的微环境一起,与淋巴结转移相关。中间成纤维细胞、肌细胞和中性粒细胞在肿瘤末端富集,而癌症相关成纤维细胞(CAF)在基质末端富集。中间成纤维细胞转化为 CAF 并重新定位到相邻的基质末端,在那里它们参与 FN1 介导的 ECM 调节。我们在 GB-OSCC 中生成了肿瘤-基质界面的功能组织,并鉴定了有助于淋巴结转移的空间定位基因和疾病进展。现在可以挖掘我们的数据集来发现口腔癌中合适的分子靶标。© 2024。作者。
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Journal of Translational Medicine
2024 Aug 13
VladimirBezrookove,I...
miR-876-3p is a tumor suppressor on 9p21 that is inactivated in melanoma and targets ERK.
Journal of Translational Medicine
虽然黑色素瘤通常存在 CDKN2A 所在的 9p21 缺失,但该位点是否存在其他肿瘤抑制元件的特征尚不完全。在这里,我们评估了 microRNA-876-3p (miR-876) 的表达水平和功能作用,其基因也映射到 9p21。使用定量 miRNA 逆转录酶聚合酶链反应评估了 miR-876 在人体组织和细胞系中的表达(定量RT-PCR)。 MIR876 拷贝数是在癌症基因组图谱 (TCGA) 黑色素瘤队列中确定的。评估了 miR-876 表达调节对黑色素瘤细胞集落形成、迁移、侵袭、凋亡、细胞周期进展和培养物药物敏感性以及异种移植模型中体内肿瘤生长的影响。使用 RNA 测序 (RNA-Seq) 确定了 miR-876 过表达引起的全基因组转录组变化。与痣相比,原发性黑色素瘤样品中的 miR-876 表达显着降低,与人类黑色素细胞相比,人类黑色素瘤细胞系中的 miR-876 表达显着降低。 TCGA 队列分析显示,50% 以上的黑色素瘤中存在 MIR876 缺失。 miR-876 过表达导致黑色素瘤细胞集落形成、迁移和侵袭减少,并伴有细胞周期停滞和细胞凋亡增加。瘤内注射 miR-876 显着抑制体内黑色素瘤生长。对 miR-876 处理的肿瘤进行 RNA-Seq 分析,发现数个生长促进基因下调,同时抑癌基因上调,qRT-PCR 分析证实了这一点。计算分析确定 MAPK1(或 ERK2)是 miR-876 作用的可能靶标。 miR-876 的过表达显着抑制由 MAPK1/ERK2 3' UTR 驱动的荧光素酶表达,并导致黑色素瘤细胞中 ERK 蛋白表达降低。 MAPK1/ERK2 cDNA 过表达挽救了 miR-876 对黑色素瘤集落形成的影响。 miR-876 过表达使黑色素瘤细胞对 BRAF 抑制剂维莫非尼 (vemurafenib) 治疗敏感。这些研究将 miR-876 确定为 9p21 上的独特肿瘤抑制因子,在黑色素瘤中失活,并表明 miR-876 缺失是激活 ERK 和有丝分裂原激活的额外机制黑色素瘤中的蛋白激酶(MAPK)通路。此外,他们还提出将 miR-876 过度表达与 BRAF 抑制相结合作为黑色素瘤的合理治疗策略的治疗潜力。© 2024。作者。
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Toxins
2024 Jul 07
DilaraOnan,FatemehFa...
Clinical Conditions Targeted by OnabotulinumtoxinA in Different Ways in Medicine.
Toxins
OnabotulinumtoxinA (BT-A) 因其有益作用而被用于不同的医学领域。 BT-A 是一种最初由肉毒杆菌产生的毒素,众所周知,它能够通过阻止乙酰胆碱(一种参与肌肉收缩的神经递质)的释放来暂时麻痹肌肉。文献不断报道关于潜在应用的新假设,这些假设不认为阻断神经肌肉接头处的乙酰胆碱释放是常见途径。在这篇观点文章中,我们的目的是研究 BT-A 在不同医学应用中的不同途径靶点。首先,BT-A的乙酰胆碱作用用于美容目的减少皱纹,治疗泌尿系统问题、出汗过多、颞下颌关节紊乱、肥胖、偏头痛、神经系统疾病的痉挛以及各种肌肉过度活动的情况例如颈部肌张力障碍、眼睑痉挛和特发性头部震颤。在另一个潜在途径中,谷氨酸 A、CGRP 和 P 物质可通过 BT-A 应用来抑制偏头痛、三叉神经痛、神经性疼痛和肌筋膜疼痛综合征等疾病的疼痛。另一方面,作为一种不同于乙酰胆碱和疼痛介质的机制,BT-A通过增加氧合和靶向转化生长因子-β1细胞来治疗脱发。此外,BT-A对癌细胞凋亡的作用也是已知的,并且正在开发中。文献研究显示了不同剂量、不同区域、不同医疗目的使用 BT-A 的益处,这些研究还强调,重复使用可增加长期益处。随着研究人员发现这种多功能毒素的新潜在治疗用途,BT-A 的用途不断扩大。
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Toxins
2024 Jul 11
NatalieDKing-Lyons,A...
A Novel Cytotoxic Mechanism for Triple-Negative Breast Cancer Cells Induced by the Type II Heat-Labile Enterotoxin LT-IIc through Ganglioside Ligation.
Toxins
三阴性乳腺癌 (TNBC) 占所有乳腺癌的 10-20%,具有侵袭性,具有高转移潜力,并且由于治疗选择有限,预后较差。 LT-IIc 是 ADP(核糖基化不耐热肠毒素)II 型亚家族的成员,与一组独特的细胞表面神经节苷脂受体结合,对 TNBC 细胞系具有细胞毒性,但对非转化乳腺没有细胞毒性活性上皮细胞。在这里,从切除的人类肿瘤中分离出的原代 TNBC 细胞显示出对 LT-IIc 的特异性增强的细胞毒性反应,与测试的其他肠毒素相反。 MDA-MB-231 细胞(TNBC 模型)用于评估 LT-IIc 细胞毒性的潜在机制,LT-IIc 诱导细胞内 cAMP 升高并刺激 cAMP 反应元件结合蛋白 (CREB) 信号通路。为了剖析 ADP-核糖基化、cAMP 诱导和神经节苷脂连接在细胞毒性反应中的作用,将 MDA-MB-231 细胞暴露于野生型 LT-IIc,即缺乏 ADP-IIc 的重组 B-五聚体。核糖基化 A 多肽,或具有酶失活 A1 结构域的 LT-IIc 突变体。这些实验表明,LT-IIc 的 ADP-核糖基转移酶活性对于诱导 MDA-MB-231 细胞的致死性不是必需的。相比之下,具有改变的神经节苷脂结合活性的突变体LT-IIc未能在MDA-MB-231细胞中触发细胞毒性反应。此外,神经节苷脂表达的药理抑制可保护 MDA-MB-231 细胞免受 LT-IIc 的细胞毒性作用。这些数据表明,神经节苷脂连接,而不是 cAMP 产生或 ADP-核糖基转移酶活性的诱导,对于启动 MDA-MB-231 细胞的 LT-IIc 依赖性细胞死亡至关重要。这些实验揭示了 LT-IIc 和神经节苷脂在信号转导中以前未知的特性,为 TNBC 的靶向治疗提供了潜力,这是一种迫切需要的选择。
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Toxins
2024 Jul 17
DarijaStupinPolančec...
Citrinin Provoke DNA Damage and Cell-Cycle Arrest Related to Chk2 and FANCD2 Checkpoint Proteins in Hepatocellular and Adenocarcinoma Cell Lines.
Toxins
柑橘素 (CIT) 是一种由青霉属、曲霉属和红曲霉属产生的聚酮化合物霉菌毒素,是一种在各种食品中发现的污染物,也在室内灰尘中检测到。多项研究表明,CIT 可能损害动物的肾脏、肝脏、心脏、免疫和生殖系统,其机制迄今尚未完全阐明。在这项研究中,我们研究了 CIT 对两种人类肿瘤细胞系 HepG2(肝细胞癌)和 A549(肺腺癌)的作用模式。使用MTT增殖测定法测定细胞毒性浓度。使用碱性彗星测定研究亚 IC50 浓度的基因毒性作用,并使用流式细胞术研究对细胞周期的影响。此外,通过基于细胞的 ELISA 确定了 CIT 对两种细胞周期检查点蛋白(丝氨酸/苏氨酸激酶 Chk2 和范可尼贫血 (FA) D2 组 (FANCD2))总量和磷酸化的影响。使用GraphPad Prism统计软件分析数据。 HepG2 的 CIT IC50 为 107.3 µM,A549 的 CIT IC50 >250 µM。结果表明,对 CIT 的敏感性具有细胞类型依赖性,亚 IC50 和接近 IC50 的 CIT 会诱导显着的 DNA 损伤和细胞周期停滞在 G2/M 期,这与总 Chk2 和磷酸化 Chk2 和磷酸化 Chk2 的增加有关。 HepG2 和 A549 细胞中的 FANCD2 检查点蛋白。
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npj Precision Oncology
2024 Jul 26
HeSong,XianHaoXiao,X...
Development and interpretation of a multimodal predictive model for prognosis of gastrointestinal stromal tumor.
npj Precision Oncology
胃肠间质瘤(GIST)是胃肠道(GI)中最常见的间叶源性肿瘤,被认为具有不同的恶性潜能。随着计算机科学的进步,放射组学技术和深度学习已应用于医学研究中。构建更准确、更可靠的无复发生存 (RFS) 多模式预测模型对于帮助临床决策至关重要。该研究纳入2019年至2022年在中国医科大学第一医院接受手术并病理诊断为GIST的254例患者。术前对比增强计算机断层扫描 (CE-CT) 和苏木精/伊红 (H
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npj Precision Oncology
2024 Jul 28
JiaGuo,JianguoMiao,W...
Predicting bone metastasis-free survival in non-small cell lung cancer from preoperative CT via deep learning.
npj Precision Oncology
准确预测非小细胞肺癌(NSCLC)患者完全手术切除后的无骨转移生存期(BMFS)可能有助于制定适当的随访计划。本研究的目的是建立并验证术前基于 CT 的深度学习 (DL) 特征,以预测 NSCLC 患者的 BMFS。我们对 1547 名接受完整手术切除的 NSCLC 患者进行了回顾性分析,随后在两家医院进行了至少 36 个月的监测。我们使用 3D 卷积神经网络从多参数 CT 图像构建了 DL 特征,并将该特征与临床影像因素集成,以建立深度学习临床影像特征 (DLCS)。我们使用 Harrell 一致性指数(C 指数)和时间相关的接收器操作特性来评估性能。我们还使用 DLCS 评估了不同临床阶段 NSCLC 患者骨转移 (BM) 的风险。 DL 签名成功预测了 BM,验证队列的 C 指数分别为 0.799 和 0.818。 DLCS 的性能优于 DL 签名,相应的 C 指数为 0.806 和 0.834。 1 年、2 年和 3 年的曲线下面积范围(内部验证队列)为 0.820-0.865,外部验证队列为 0.860-0.884。此外,DLCS 成功地将不同临床分期的 NSCLC 患者分为 BM 高风险组和低风险组(p<0.05)。基于 CT 的 DL 可以预测接受完全手术切除的 NSCLC 患者的 BMFS,并可能有助于评估不同临床阶段患者的 BM 风险。© 2024。作者。
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npj Precision Oncology
2024 Jul 27
HongruShen,MengYang,...
Development of a deep learning model for cancer diagnosis by inspecting cell-free DNA end-motifs.
npj Precision Oncology
通过 cfDNA 准确区分患有癌症和未患癌症的患者对于早期癌症诊断至关重要。在此,我们开发并验证了一种基于深度学习的模型,名为通过变压器进行末端基序检查(EMIT),用于通过学习 cfDNA 末端基序的特征表示来区分患有癌症和未患癌症的个体。 EMIT 是一种自我监督学习方法,对 cfDNA 末端基序的排名进行建模。我们对 4606 个样本进行了不同类型的 cfDNA 测序,以开发 EIMIT,然后评估 EMIT 在六个数据集和一个包含全基因组、全基因组亚硫酸氢盐和 5-羟甲基胞嘧啶测序的额外内部测试集上的线性投影的分类性能。 EMIT 表示的线性投影在这六个数据集中实现了接收者操作曲线下面积 (AUROC) 值的范围从 0.895 (0.835-0.955) 到 0.996 (0.994-0.997),显着优于其基线。此外,我们还表明,在进行全外显子组测序的独立测试集上,EMIT 表示的线性投影在肺癌鉴定中可以实现 0.962 (0.914-1.0) 的 AUROC。这项研究的结果表明,基于 Transformer 的深度学习模型可以从 cfDNA 末端基序中学习癌症区分表征。这种深度学习模型的表示可用于区分患有和未患有癌症的患者。© 2024。作者。
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npj Precision Oncology
2024 Jul 28
NicholasMai,Jie-FuCh...
Pathologic complete response to KEYNOTE522 and HER2-directed therapy for synchronous TNBC and HER2+ breast cancer.
npj Precision Oncology
在初次诊断时同时出现两种不同组织学的原发性乳腺癌是一种罕见的现象。在同一活检中发现这些病理上不同的群体更是罕见。在这里,我们报告了一名患者的病例,该患者被诊断患有明确界限的病理异质性三阴性乳腺癌 (TNBC) 和 HER2 乳腺癌,该患者接受了结合 Keynote-522 元素和标准 HER2 导向新辅助治疗方案的混合化学免疫治疗方案,产生了治疗效果手术时病理完全缓解,没有明显的不良事件。对组织学上不同的肿瘤群体的分子分析证实了 HER2 表达差异的分子证据,但也表明了基于突变谱的两个肿瘤群体的克隆相关性,表型差异可能是由 NF1 拷贝数改变引起的。总体而言,该病例凸显了一种罕见的组织学现象,通过结合 TNBC 和 HER2 定向新辅助疗法已成功治疗。© 2024。作者。
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npj Precision Oncology
2024 Jul 29
SandraSchwarz,Zhaora...
Peptide-stimulated T cells bypass immune checkpoint inhibitor resistance and eliminate autologous microsatellite instable colorectal cancer cells.
npj Precision Oncology
选择两例具有患者来源的细胞系、外周血和肿瘤浸润性 T 细胞的超突变结肠癌病例来详细研究免疫反应。与自体肿瘤细胞共培养的 T 细胞仅显示低水平的促炎细胞因子,并且在肿瘤识别。同样,用免疫检查点抑制剂(ICI)进行共培养物的治疗并不能增强抗肿瘤免疫反应。由于在肿瘤细胞中检测到蛋白酶抑制剂 9 (PI-9),因此在 T 细胞细胞毒性测试中除了 ICI 之外还使用了特异性抑制剂 (PI-9i)。然而,只有用肿瘤特异性肽(隐性和新抗原)进行预刺激才能显着增加 T 细胞对肿瘤细胞的识别和消除,而与 ICI 或 PI-9i 无关。我们表明,肿瘤引发的药物可以靶向 ICI 抗性肿瘤细胞T 细胞,还证明了未经肿瘤处理的外周血 T 细胞与高度耗尽的肿瘤浸润 T 细胞相比的优越性。未来的精准免疫治疗方法应包括多模式策略,以成功诱导持久的抗肿瘤免疫反应。© 2024。作者。
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