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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 14
EilidhFummey,PauNava...
Estimating cancer risk in carriers of Lynch syndrome variants in UK Biobank.
GENES & DEVELOPMENT
背景林奇综合征 (LS) 是一种遗传性癌症易感综合征,由影响 DNA 错配修复 (MMR) 基因 MLH1、MSH2、MSH6 和 PMS2 的遗传变异引起。LS 的癌症风险是根据个人或家族癌症史确定的个体队列来估计的,其中使用全外显子组序列在 454-756 名英国生物银行 (UKB) 参与者中鉴定出 830 个由 InSiGHT 分类的致病性或可能致病性 (path_MMR) MMR 基因变异携带者。 Nelson-Aalen 生存分析用于估计结直肠癌、子宫内膜癌和乳腺癌 (BC) 的累积发病率。与非携带者相比,path_MMR 携带者到 70 岁时结直肠癌和子宫内膜癌 (EC) 的累积发病率升高(结直肠癌:11.8) %(95% 置信区间 (CI):9.5% 至 14.6%)对比 1.7%(95% CI:1.6% 至 1.7%),子宫内膜:13.4%(95% CI:10.2% 至 17.6%)对比 1.0%( 95% CI:0.9% 至 1.0%)),但这种增加的幅度因基因而异。与非携带者相比,path_MMR 携带者在 70 岁时的累积 BC 发病率并未升高(8.9%(95% CI:6.3% 至 12.4%)与 7.5%(95% CI:7.4% 至 7.6%))。 UKB 的累积癌症发病率估计与前瞻性林奇综合征数据库中所有基因和癌症的估计相似,但没有证据表明 UKB 致病性 PMS2 变异携带者的 EC 风险升高。这些结果支持提供任何路径_MMR 的偶然识别携带者监测以管理结直肠癌风险。顺便说一句,已确定的 MLH1、MSH2 和 MSH6 致病变异携带者也将受益于降低 EC 风险的干预措施。结果表明 BC 不是 LS 相关癌症。© 作者(或其雇主)2024。CC BY 允许重复使用。由英国医学杂志出版。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 15
ToshinoriAndo,KentoO...
YAP/TAZ interacts with RBM39 to confer resistance against indisulam.
GENES & DEVELOPMENT
Hippo 通路及其下游效应子,即具有 PDZ 结合基序的 Yes 相关蛋白/转录共激活子 (YAP/TAZ),对于细胞生长和器官发育至关重要。新出现的证据表明,Hippo 通路和 YAP/TAZ 经常因实体癌(包括头颈鳞状细胞癌 (HNSCC))中的多种基因改变而失调;然而,YAP/TAZ-核相互作用组仍不清楚。 RNA 结合基序蛋白 39 (RBM39) 增强多种转录因子的转录活性,并调节 mRNA 剪接。 Indisulam 降解 RBM39 诱导选择性剪接,导致细胞死亡。然而,indisulam 的临床试验未能显示其有效性。因此,迫切需要阐明剪接抑制剂的耐药机制。在本研究中,我们通过蛋白质组分析将 RBM39 鉴定为一种新型 YAP/TAZ 相互作用分子。 RBM39 促进 YAP/TAZ 转录活性。我们进一步阐明,indisulam 减少 RBM39/YAP/TAZ 介导的整合素或胶原表达,从而使对细胞存活重要的粘着斑激酶 (FAK) 失活。此外,indisulam 还诱导细胞周期或 DNA 代谢相关基因的选择性剪接。 YAP/TAZ 过度激活延迟了 indisulam 诱导的 RBM39 降解,从而恢复了整合素/胶原表达以激活 FAK 和选择性剪接,从而在体外和体内赋予对 indisulam 的抗性。我们的研究结果可能有助于开发一种关注 YAP/TAZ/RBM39 相互作用的新型癌症疗法。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 14
SaskiaGrabe,BharathA...
Quantification of circadian rhythms in mammalian lung tissue snapshot data.
GENES & DEVELOPMENT
健康的哺乳动物细胞具有生物钟,这是一个基因调控网络,使它们能够将其生理过程安排在一天中的最佳时间。当健康细胞转变为癌细胞时,生物钟常常会受到癌症的特别干扰,因此从癌症的基因表达数据中提取昼夜节律特征引起了人们的兴趣。这是具有挑战性的,因为癌症的临床基因表达样本是快照状的,并且最好使用基因表达时间序列来检查生物钟。在这项研究中,我们获得了小鼠和狒狒肺组织的公共基因表达时间序列数据中交叉的昼夜节律基因列表。我们的昼夜节律基因列表基于昼夜节律基因的基因表达水平的相关性,这与它们之间的相位差密切相关。结合不同年龄的昼夜物种的昼夜节律基因表达模式,提供了在健康和癌性人类肺组织中也很重要的昼夜节律基因。我们通过基于 PCA 的小鼠和狒狒样本的昼夜节律时间重建来测试基因列表中生物钟的表示质量。然后,我们为人体肺组织样本分配了潜在的昼夜节律时间,并在健康的人体肺组织中发现了完整的生物钟,但在邻近的癌性肺组织中发现了一个改变的、微弱的生物钟。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 15
YifengZheng,Guoqiang...
Mapping alternative splicing events in colorectal cancer.
GENES & DEVELOPMENT
尽管基因的异常剪接事件与结直肠癌(CRC)的发生和进展密切相关,但异常剪接事件的定位,特别是选择性剪接(AS)事件类型及其潜在影响仍处于研究阶段。在本研究中,我们分析了公共 RNA-seq 数据库 (GSE138202),并与健康个体相比,在 CRC 患者中确定了 14,314 个显着的 AS 事件。大多数参与CRC发生的关键基因(例如癌基因)具有不同的AS事件类型。此外,结果表明某些 AS 事件可能在参与剪接因子和 microRNA 的关键基因的功能中发挥重要作用。此外,我们观察到CRC中的癌基因CDK4倾向于发生外显子2跳跃AS事件,导致蛋白表达更倾向于与CCND1形成复合物,从而抑制细胞周期并削弱细胞增殖,同时增强细胞迁移能力。这些发现不仅为AS调节CRC的机制提供了新的见解,而且为CRC的靶向剪接治疗提供了理论基础。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 15
QingYu,ChunhuaQu,Jin...
ESF1 and MIPEP proteins promote estrogen receptor-positive breast cancer proliferation and are associated with patient prognosis.
GENES & DEVELOPMENT
雌激素受体阳性(ER)乳腺癌占所有乳腺癌的三分之二,其早期和晚期复发仍然威胁着患者的长期生存和生活质量。寻找候选肿瘤抗原和潜在的治疗靶点对于解决这些未满足的需求至关重要。采用相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白质组分析的同量异位标签来识别ER 乳腺癌和相应的邻近正常组织之间的差异表达蛋白(DEP)。通过生物信息学分析筛选候选DEP,并通过免疫组织化学(IHC)染色和蛋白质印迹证实其表达。进行了一系列体外实验,包括伤口愈合测定、集落形成和细胞周期测定,以揭示所选 DEP 的功能。并进一步分析其临床意义。共发现369个DEP(倍数变化 ≥ 2.0或≤ 0.66,P < 0.05)。与正常组织相比,ER 乳腺癌中有358个蛋白上调,11个蛋白下调。 GO和KEGG富集分析表明DEPs与RNA调控和代谢途径密切相关。 STRING分析发现ESF1和MIPEP是乳腺癌的核心基因,IHC染色和蛋白质印迹证实了其表达增加。敲除 ESF1 和 MIPEP 可抑制集落形成并增加细胞凋亡。此外,敲低 ESF1 会抑制伤口愈合,但不会抑制 MIPEP。此外,ESF1和MIPEP表达与患者预后呈负相关。ESF1和MIPEP的上调促进ER 乳腺癌增殖,这可能为新疗法的开发提供新靶标。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Jul 13
MichelleChan,GaneshR...
Racial and ethnic disparities in access to total neoadjuvant therapy for rectal cancer.
Disease Models & Mechanisms
完全新辅助治疗彻底改变了局部晚期直肠癌的治疗,并迅速成为新的护理标准。然而,来自所有种族和族裔群体的患者是否都能平等地获得这些潜在的益处仍然未知。我们使用加州癌症登记处,确定了 2010 年至 2020 年在加州诊断出患有局部晚期直肠癌并接受新辅助化疗和放疗的所有成年人。我们使用逻辑回归来估计每个种族和民族群体接受总体新辅助治疗相对于传统放化疗的预测概率,并使用时间-种族交互作用来评估随着时间的推移获得总体新辅助治疗的趋势。我们还使用 Kaplan-Meier 图和 Cox 比例风险模型比较了不同种族和民族的生存率以及总新辅助治疗状态。总共有 6,856 名患者符合纳入标准。总体而言,2010 年有 36.6% 的患者接受了全面新辅助治疗,而 2020 年为 66.3%。拉丁裔患者接受全面新辅助治疗的可能性明显低于非拉丁裔白人患者;然而,随着时间的推移,不同种族和族裔群体的新辅助治疗总量增长率没有差异。与非拉丁裔白人患者相比,非拉丁裔黑人患者的风险调整生存期似乎较低,尽管接受全面新辅助治疗的患者并非如此。随着时间的推移,在加利福尼亚州,接受全面新辅助治疗的机会显着增加,但比率没有明显差异种族和族裔群体之间的增长。我们没有发现证据表明接受新辅助治疗的患者的生存率存在种族或民族差异,这表明增加获得高质量癌症护理的机会也可能改善健康公平。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 03
MartinJoseBarrio,Nik...
Pre-operative thyroglobulin measurement for thyroid cancer risk of recurrence and response to therapy.
DIABETES & METABOLISM
甲状腺癌总体预后良好,但尚无术前生化标记物被证明可以区分低风险和高风险疾病或预测对治疗的反应。我们回顾性回顾了 2006 年至 2022 年期间因甲状腺癌接受甲状腺手术的 162 名患者。术前测量了甲状腺球蛋白水平(Tg)。我们根据 ATA 指南对治疗的反应,将患者细分为低、中、高风险甲状腺癌。我们发现,随着术前 Tg 水平的升高,患者更有可能患有高风险疾病(p < 0.01)。我们发现原发肿瘤大小和高风险组织学与术前 Tg 之间存在线性相关性 (p < 0.01)。术前 Tg 水平与初次手术治疗后的治疗反应显着相关。具体来说,随着术前 Tg 的增加,患者获得良好缓解的可能性较小 (p < 0.01)。我们的回顾性分析表明,术前 Tg 与 ATA 结构性复发风险和治疗反应显着相关,并且可能有潜力指导初始治疗和后续管理。由爱思唯尔公司出版。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 14
AbdikarimHusseinMoha...
Clinical characteristics and factors associated with survival rate of patients with non-muscle invasive bladder cancer attending at a Tertiary Hospital in Somalia.
DIABETES & METABOLISM
包括索马里在内的撒哈拉以南非洲国家 (SSA) 报道了一些关于非肌层浸润性膀胱癌 (NMIBC) 流行病学和危险因素的研究,但非洲关于 NMIBC 治疗的文献很少。本研究旨在评估 NMIBC 患者的临床组织病理学特征以及与生存率相关的因素。这项为期六年的队列研究纳入了 196 名 NMIBC 患者。回顾了这些患者的临床和组织病理学特征以及预测癌症特异性生存的因素。患者平均年龄为59.01±11.50岁,男女比例为2.8:1。尿路上皮癌(UC)是最常见的病理类型,占90.8%; Ta LG 和 T1HG 是最常见的组织病理学肿瘤分期和分级(n = 90, 45.9%,vs. n = 56, 28.6%)。平均肿瘤大小为 4.72±2.81 cm。癌症特异性死亡率(CSM)为13.3%。年龄[2.252(2.310-2.943),p < 0.001],性别[1.031(0.981-1.1.242),p < 0.001],肿瘤分期和分级[4.902(3.607-5.614),p < 0.001],肿瘤位置[ 1.135(0.806-1.172),p < 0.001],数量[0.510(0.410-0.920),p = 0.03],肿瘤大小[1.523(0.936-1.541),p < 0.001],使用膀胱内化疗或卡介苗[2.810 ( 1.972-4.381),p< 0.001]、术前肾积水分级[1.517(1.172-2.154),p< 0.001]和随访依从性[3.376(2.633-5.018),p< 0.001]均与CSM相关。 5年总生存率为57.1%,心血管疾病是死亡的主要原因(n = 34),其次是糖尿病(n = 28)。我们的研究结果显示,UC是最常见的病理亚型,尽管不到40种我们 % 的患者接受膀胱内辅助治疗,这对于最大限度地减少疾病发病率和死亡率至关重要。改善泌尿肿瘤护理的举措包括肿瘤学和基本癌症治疗的亚专业培训、更好地获得泌尿科服务和癌症筛查计划。该国最佳管理计划和护理所需。© 2024。作者。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 15
MiguelSaraiva,Raquel...
ACTH-producing adrenocortical carcinoma: an exceedingly rare diagnosis.
DIABETES & METABOLISM
肾上腺皮质癌是一种非常罕见的内分泌疾病,预后不良,并且经常与 ACTH 无关的库欣综合征相关。尽管患有肾上腺皮质癌,我们的患者令人惊讶地患有 ACTH 依赖性库欣综合征。一名 26 岁女性出现库欣综合征和腹部肿块。影像学研究显示肾上腺肿块符合高度恶性肿瘤。实验室检查显示皮质醇增多症、雄激素过多症和低钾血症,但变肾上腺素水平正常。出乎意料的是,她的ACTH水平显着升高。肿瘤样本的病理分析得出了 ACTH 免疫阳性的肾上腺皮质癌的结论。我们的患者患有异位产生 ACTH 的肾上腺皮质癌。该病例强调,医生在评估罕见内分泌恶性肿瘤病例时应采取宽广的胸怀。© 2024。作者。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 15
XiongfengZeng,ZhenLi...
Assessment of glycemic susceptibility across multiple urological and reproductive disorders.
DIABETES & METABOLISM
使用孟德尔随机化 (MR) 方法测试三种泌尿系统癌症和八种泌尿系统/生殖疾病的血糖敏感性。应用双样本 MR 来研究三种血糖特征(II 型糖尿病、空腹血糖和糖化血红蛋白)的因果作用。 HbA1c)) 十一种泌尿/生殖疾病(肾癌、膀胱癌、前列腺癌、肾/输尿管结石、尿失禁、良性前列腺增生、勃起功能障碍、女性不孕症、男性不育症、精子异常和多囊卵巢综合征)。我们进行了进一步的多变量 MR (MVMR) 和中介分析来调查相关性。在所有 11 种疾病中,II 型糖尿病与勃起功能障碍呈正相关,这在两个队列中都是稳定的[比值比 (OR):1.59,95% 置信度区间 (CI):1.15-2.20,FinnGen Biobank 的 P = 0.005,OR:1.14,95% CI:1.08-1.21,其他队列的 P < 0.001]。此外,II型糖尿病与男性不育呈负相关(OR:0.57,95%CI:0.39-0.84,P = 0.005)。此外,所有三个血糖特征均被观察到与多囊卵巢综合征呈正相关(OR:2.36,95%CI:1.16-4.76,每mmol/L空腹血糖P = 0.017;OR:3.04,95%CI:1.10 HbA1c 百分比为 -8.39,P = 0.032;OR:1.21,95% CI:1.00-1.46,II 型糖尿病 P = 0.046)。中介分析证实了II型糖尿病对这些疾病的影响。勃起功能障碍、男性不育症和多囊卵巢综合征存在血糖易感性。我们无法得出其他泌尿系统/生殖疾病中稳定的血糖敏感性的结论。© 2024。作者。
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