研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Jul 13
IboneLabiano,AnaEHue...
Building on the clinical applicability of ctDNA analysis in non-metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
胰腺导管腺癌是全球预后最差的实体瘤之一,辅助或新辅助治疗后复发率很高。循环肿瘤 DNA 分析被认为是一种有前景的非侵入性工具,可用于表征肿瘤基因组学和评估治疗反应。在这项研究中,通过下一代测序对手术肿瘤组织和连续血液样本进行了分析,并将其与临床和病理特征相关联。纳瓦拉大学医院治疗的 30 名可切除/交界性胰腺导管腺癌患者被纳入其中。循环肿瘤 DNA 测序鉴定出 KRAS 和 TP53 以及其他癌症相关基因的致病变异。在预后较差的患者中检测到诊断时的致病变异,并且与交界性胰腺导管腺癌患者对新辅助治疗的反应相关。诊断时较高的变异等位基因频率与较差的预后相关,并且进展时样本中变异等位基因频率的总和更大。我们的结果建立在循环肿瘤 DNA 对非转移性胰腺导管腺癌患者的潜在价值之上,通过补充组织遗传信息并作为治疗决策的非侵入性工具。需要验证性研究来证实这些发现。© 2024。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Jul 13
CSSharanya,DSasikala...
Computational screening combined with well-tempered metadynamics simulations identifies potential TMPRSS2 inhibitors.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
II 型跨膜丝氨酸蛋白酶是宿主防御病毒进入和某些癌细胞进展的有效药理学靶点。这些丝氨酸蛋白酶裂解病毒刺突蛋白,以暴露融合肽以进入细胞,这对于病毒的生命周期至关重要。 TMPRSS2 抑制剂还可以对抗利用它们进入细胞的呼吸道病毒。我们的研究结合了虚拟筛选、全原子分子动力学和良好的元动力学模拟,确定了 Vicenin-2、新橙皮苷、柚皮苷和大黄素是有前途的 TMPRSS2 拮抗剂。对于 Vicenin-2、新橙皮苷、柚皮苷和大黄素,获得的结合能分别为 - 16.3、- 15.4、- 13.6 和 - 13.8 kcal/mol。 RMSD、RMSF、PCA、DCCM 和结合自由能曲线也与这些配体在 TMPRSS2 活性位点的稳定结合相关。该研究表明,这些分子可能成为对抗未来冠状病毒和其他呼吸道病毒爆发的有前景的先导分子。© 2024。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Jul 13
SidharthaSingh,Navne...
Assessing the impact of MSH3 and MSH6 polymorphisms on lung cancer risk in North Indian patients undergoing platinum chemotherapy through molecular dynamics simulation.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
本研究调查了肺癌患者中 MSH3 和 MSH6 基因之间的关系。对肺癌患者和健康对照进行基因分型。计算优势比值并进行生存分析。 MSH6 多态性突变基因型 (TT) 患者患肺癌的风险是正常人的 1.5 倍 (p = 0.03)。对于非吸烟者来说,突变型基因型患肺癌的风险增加了三倍(p = 0.01)。接受多西紫杉醇和卡波/顺铂治疗且携带 MSH6 多态性 GT 基因型的患者报告中位生存时间缩短(4.9 个月与 9.13 个月)。 MSH3 和 MSH6 多态性参与调节肺癌风险。 MSH6 多态性与接受顺铂和多西他赛化疗的患者的高死亡率相关。© 2024。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Jul 13
LeyiCheng,YajuanRui,...
A glimpse into viral warfare: decoding the intriguing role of highly pathogenic coronavirus proteins in apoptosis regulation.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
冠状病毒采用多种生存策略,其中内源性或外源性细胞凋亡的激活最为突出,其中病毒蛋白发挥着关键作用。值得注意的是,与低致病性病毒株相比,SARS-CoV-2、SARS-CoV 和 MERS-CoV 等高致病性冠状病毒表现出更多的非结构蛋白,从而促进其通过多种途径诱导细胞凋亡的能力。此外,这些病毒蛋白善于抑制宿主免疫反应,从而增强病毒复制和持久性。这篇综述深入研究了高致病性冠状病毒与细胞凋亡之间复杂的相互作用,系统地阐明了病毒蛋白诱导细胞凋亡的分子机制。此外,它还探索了作为抗病毒药物的细胞凋亡抑制和利用诱导细胞凋亡的病毒蛋白作为治疗方式的潜在治疗途径。这些见解不仅揭示了病毒发病机制,还为癌症治疗提供了新的视角。© 2024。作者。
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Journal of Extracellular Vesicles
2024 Jul
JoëlEJBeaumont,Lydie...
Cancer EV stimulate endothelial glycolysis to fuel protein synthesis via mTOR and AMPKα activation.
Journal of Extracellular Vesicles
缺氧是实体瘤的一个常见特征,会激活癌细胞的适应机制,从而诱导治疗抵抗,并对细胞代谢产生深远影响。因此,缺氧是癌症进展的重要因素,并与不良预后相关。肿瘤微环境内细胞的代谢改变通过抑制免疫反应和诱导血管生成等方式支持肿瘤生长。最近,细胞外囊泡(EV)已成为支持癌症进展的细胞间通讯的重要介质。之前,我们证明了缺氧癌细胞衍生的 EV 的促血管生成特性。在这项研究中,我们研究了(缺氧)癌细胞衍生的 EV 如何介导其作用。我们证明,癌症衍生的 EV 通过增加 mTOR 和 AMPKα 的激活来调节受体细胞中的细胞代谢和蛋白质合成。通过代谢示踪实验,我们证明 EV 刺激内皮细胞中的葡萄糖摄取,以促进氨基酸合成,并刺激氨基酸摄取以增加蛋白质合成。尽管货物发生了变化,我们表明癌症衍生的 EV 对受体细胞的影响主要取决于产生 EV 的癌细胞类型,而不是其氧合状态。© 2024 作者。 《Journal of Extracellular Vesicles》由 Wiley periodicals LLC 代表国际细胞外囊泡学会出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 11
NaWang,Hong-QiangChe...
Benzo(a)pyrene promotes the malignant progression of malignant-transformed BEAS-2B cells by regulating YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 to inhibit ferroptosis.
Epigenetics & Chromatin
苯并[a]芘(BaP)与肺癌的发生有关,但其潜在机制尚未完全阐明。在这里,我们使用10μM BaP诱导人支气管上皮BEAS-2B细胞恶性转化,命名为BEAS-2B-T。结果表明,BaP(6.25、12.5和25μM)处理显着促进BEAS-2B-T细胞的迁移和侵袭。同时,BaP暴露抑制了BEAS-2B-T的铁死亡,铁死亡相关指标Fe2+、丙二醛(MDA)、脂质过氧化(LPO)和活性氧(ROS)显着降低。铁死亡相关分子转铁蛋白受体(TFRC)的蛋白水平显着下降,而溶质载体家族7膜11(SLC7A11)、铁蛋白重链1(FTH1)和谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)的蛋白水平显着升高。铁死亡的干预显着影响BaP诱导的BEAS-2B-T的迁移和侵袭。此外,暴露于 BaP 后,YTH N6-甲基腺苷 RNA 结合蛋白 1 (YTHDF1) 的表达显着增加。 YTHDF1 敲低通过促进铁死亡来抑制 BEAS-2B-T 迁移和侵袭。同时,Fe2+、MDA、LPO、ROS含量显着升高,TFRC显着升高,SLC7A11、FTH1、GPX4显着降低。此外,YTHDF1的过表达通过抑制铁死亡促进BEAS-2B-T迁移和侵袭。重要的是,在 BaP 暴露期间,YTHDF1 的敲低促进了铁死亡并减少了 BEAS-2B-T 的迁移和侵袭,而 YTHDF1 的过表达通过在 BaP 暴露期间抑制铁死亡来增加 BEAS-2B-T 的迁移和侵袭。 RNA免疫沉淀分析表明,YTHDF1过表达后,YTHDF1与SLC7A11和FTH1的结合显着增加。因此,我们得出结论,BaP通过YTHDF1上调SLC7A11和FTH1抑制铁死亡来促进BEAS-2B-T细胞的恶性进展。这项研究揭示了用于预防和治疗环境致癌物诱发的肺癌的新表观遗传和铁死亡标记。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 13
SajaAliAbbas,IsraaHu...
Assessment of ID family proteins expression in colorectal cancer of Iraqi patients.
Epigenetics & Chromatin
结直肠癌 (CRC) 是全球第二大死亡率和第三大常见癌症,结直肠癌是一种非常异质的疾病,肿瘤可由环境和遗传风险因素形成,包括表观遗传和遗传变异。 DNA结合蛋白(ID)抑制剂是一类螺旋-环-螺旋转录调节因子;这些蛋白质被认为是四个高度保存的转录调节因子 (ID1-4) 的家族,在与肿瘤发展相关的许多过程中发挥着重要作用。 ID 家族作为其他必需 HLH 蛋白的负显性拮抗剂,导致非功能性异二聚体的产生和转录过程的调节。120 新鲜组织和血液样本 从诊断为 HLH 的患者中收集了四十 (40) 个新鲜组织和血液样本。 CRC,从诊断为健康的患者身上采集了二十 (20) 个样本。 (qRT-PCR) 方法是一种用于定量稳态 mRNA 水平的灵敏技术,用于评估 ID (1-4) 基因的表达水平。研究结果表明组织中 ID1 的下调,且在患者和对照组的血液样本中显示 ID1 基因的上调。ID2 基因也表现出高度显着的变化,其中组织中的上调和血液样本中的下调。 ID3和ID4基因在组织和血液样本中表现出下调,其中ID3血液样本在患者和血型之间存在显着变化。由于ID家族在许多过程中的调节功能,肿瘤中IDs基因的上调或下调证明了如何对于肿瘤的发展非常重要,因此这些蛋白质可以用作 CRC 的指示剂。© 2024。作者获得 Springer Nature B.V. 的独家许可。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 13
MinChoonTan,Nickolas...
Reducing racial and ethnic disparities in cardiovascular outcomes among cancer survivors.
Epigenetics & Chromatin
分析癌症幸存者心血管结局中种族/民族差异的现有证据,确定因素并提出解决健康不平等问题的措施。现有文献表明,在诊断出原发性癌症和第二原发性癌症后,黑人人口的心血管结局更差,其中心脏毒性事件的发生率明显较高,特别是在乳腺癌幸存者中。造成这些差异的社会经济因素包括不利的健康社会决定因素、保险覆盖范围不足以及医疗保健系统内的结构性种族主义。此外,促炎症表观遗传修饰被认为是一个促成遗传变异的因素。解决这些差异需要采取多视角的方法,包括努力解决医疗保健系统内的种族差异和健康的社会决定因素,完善医疗保健政策和准入,并将历史上受到污名化的种族群体纳入临床研究。癌症幸存者心血管结局方面持续存在种族和民族差异,这是由多因素驱动的,主要与健康的社会决定因素有关。解决这些医疗保健不平等问题势在必行,必须及时采取措施,有效缩小现有差距。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 旗下子公司)的独家许可。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 12
MudassirHassan,Lütfi...
Non-genetic heterogeneity and immune subtyping in breast cancer: Implications for immunotherapy and targeted therapeutics.
Epigenetics & Chromatin
乳腺癌 (BC) 是一种复杂的多因素疾病,由促进肿瘤生长和进展的基因改变驱动。然而,最近的研究强调了非遗传因素在塑造癌症进化和影响治疗结果方面的重要性。非遗传异质性是指乳腺肿瘤内癌细胞的不同亚群,表现出不同的表型和功能特性。这些亚群可以通过各种机制产生,包括克隆进化、遗传变化、表观遗传变化和可逆表型转变。尽管遗传和表观遗传变化是乳腺癌病理学的重要点,但免疫系统在其进展中也发挥着至关重要的作用。在临床管理中,使用 BC 的组织学和分子分类。与传统技术相比,BC 的免疫学亚型近年来受到关注。免疫微环境(IME)揭示的瘤内异质性为免疫治疗研究开辟了新的机会。本系统综述的重点是非遗传变异性,以识别乳腺癌的免疫亚组并将其相互关联。这篇综述深入了解了肿瘤细胞为承受肿瘤微环境的变化和药物施加的选择性压力而采用的适应性方法。这些适应性方法包括药物靶点的改变、免疫系统逃避、生存途径的激活以及新陈代谢的改变。了解非遗传异质性对于靶向治疗的开发至关重要。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 04
ChunxueSong,FeiWu,Sh...
DNA Damage-Sensitized metal phenolic nanosynergists potentiate Low-Power phototherapy for osteosarcoma therapy.
Epigenetics & Chromatin
无创且高效的光动力疗法(PDT)有望规避传统骨肉瘤(OS)治疗的耐药性。然而,应用于OS的高功率PDT常常会诱导光热作用,导致正常细胞破裂、持续炎症和不可逆的血管损伤。尽管低功率 PDT 相对安全,但它不会因活性氧 (ROS) 产生不足而引起严重的 DNA 损伤。在此,在低功率PDT中引入了非ROS依赖性DNA损伤敏化策略,以提高OS的治疗效率,其中以低激光功率实现更高的细胞凋亡。受单宁酸 (TA) 出色的 DNA 损伤性能的启发,基于 TA 的金属酚网络 (MPN) 被设计用于封装疏水性光敏剂 (红紫素 18),以充当 DNA 损伤敏化纳米增效剂 (TCP NP)。特别是,在低功率激光照射下,TCP NPs 可以立即增强 ROS,引发线粒体功能障碍,同时上调 TA 引发的 DNA 损伤水平,增强 PDT 敏化,从而产生有效的抗肿瘤作用。此外,TCP NPs 在肿瘤中表现出长期保留,极大地有利于持续的抗肿瘤性能。总体而言,这项研究为通过增强 DNA 损伤水平来提高低功率 PDT 的敏感性提供了新的思路,并将有益于先进的 OS 治疗。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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