研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 12
YulinJin,RongguoLu,F...
DNA methylation analysis in plasma for early diagnosis in lung adenocarcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
肺腺癌(LUAD)是最常见的肺癌类型。 SHOX2和RASSF1A甲基化已被确定为肺癌诊断和预后的重要生物标志物。支气管肺泡灌洗液(BALF)在诊断肺部疾病方面表现出良好的特异性和敏感性,但其获取具有挑战性,可能会给患者带来不适。临床上,血浆样本比BALF更方便获取;然而,同时检测血浆中SHOX2和RASSF1A甲基化的研究很少。本研究旨在使用血浆样本评估 SHOX2 和 RASSF1A 联合启动子甲基化检测对早期 LUAD 的诊断价值。 BALF 和血液样本取自 36 名早期 LUAD 患者,对照组包括 19 名非肿瘤患者个人。采用人SHOX2和RASSF1A基因甲基化试剂盒评估所有受试者SHOX2和RASSF1A启动子甲基化水平。血浆中SHOX2和RASSF1A甲基化检出率为61.11%,略低于BALF(66.7%)。卡方检验显示BALF与血浆甲基化率差异无统计学意义(P>0.05)。血液的受试者工作特征 (ROC) 曲线下面积为 0.806(95% CI,0.677 至 0.900),而 BALF 为 0.781(95% CI,0.649 至 0.881)。此外,我们还分析了血浆中SHOX2和RASSF1A甲基化水平与性别、年龄、肿瘤分化、病理分类和其他临床病理变量的相关性;然而,没有观察到显着的相关性。通过使用血浆替代 BALF 样本,测量 SHOX2 和 RASSF1A 甲基化以实现 LUAD 的早期诊断,具有高灵敏度和特异性。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 12
MaolinChen,ChengbinZ...
Construction of prognostic markers for pancreatic adenocarcinoma based on mitochondrial fusion-related genes.
GENES & DEVELOPMENT
胰腺癌(PAAD)的早期检测仍然是一个紧迫的临床问题。关于 PAAD 中线粒体融合相关基因的临床预后价值的信息仍然有限。在本研究中,我们研究了 PAAD 的线粒体融合相关基因,以建立用于 PAAD 早期诊断和预后的最佳特征板。癌症基因组图谱数据库用于整合 PAAD 患者的每千碱基百万片段数据和相关临床数据。采用最小绝对收缩和选择算子回归、cox回归、操作特征曲线以及cBioPortal数据库来评估模型性能,评估预后能力和敏感性。通过 CIBERSORT、QUANTISEQ 和 EPIC 比较免疫浸润水平。通过癌症数据库中的药物敏感性基因组学和“pRRophetic”R 软件包比较不同风险组之间的化疗敏感性。最后共有4个基因纳入多元Cox回归分析。风险预测签名构建为:(0.5438 × BAK1)  (-1.0259 × MIGA2)  (1.1140 × PARL)  (-0.4300 × PLD6)。这4个基因的曲线下面积为0.89。 Cox回归分析表明该特征是一个独立的预后指标(P < .001,风险比[HR] = 1.870,95% CI = 1.568-2.232)。使用3种算法观察2个风险组中不同水平的免疫细胞浸润,包括肿瘤突变负荷(P = .0063)、肿瘤微环境评分(P = .01)以及肿瘤免疫功能障碍和排除评分(P = .01)。 0012)。化疗敏感性分析还显示,5-氟尿嘧啶 (P = .0127)、顺铂 (P = .0099)、多西他赛 (P < .0001)、吉西他滨 (P = .0047) 和紫杉​​醇的半最大抑制浓度(P < .0001)在高危组中较低,表明高危组患者对化疗的敏感性较高。总之,我们建立了一个由 4 个线粒体融合相关基因组成的基因签名板,以促进 PAAD 的早期诊断和预后预测。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 12
JichunMa,HongchangZh...
Application of m6A regulators to predict transformation from myelodysplastic syndrome to acute myeloid leukemia via machine learning.
GENES & DEVELOPMENT
骨髓增生异常综合征 (MDS) 经常转化为急性髓系白血病 (AML)。预测其转变的风险将有助于制定治疗计划。 N6-甲基腺苷(m6A)调节因子的表达水平在AML、MDS和MDS转化为AML的患者中存在差异。基于全部26个m6A或主要差异表达的m6A调节基因建立了7种机器学习算法,试图建立区分AML和MDS的风险评估方法,并预测MDS向AML的转化。在 m6A 调节器集合中,支持向量机 (SVM) 和神经网络 (NNK) 模型能够最好地区分 AML 或 MDS 与对照,ROC 曲线下面积 (AUROC) 分别为 0.966 和 0.785。 SVM 模型能够最好地区分 MDS 和 AML,其 AUROC 0.943、敏感性 0.862、特异性 0.864 和准确性 0.864。在差异表达基因集中,SVM 和逻辑回归 (LR) 模型能够最好地将 AML 或 MDS 与对照区分开来,AUROC 分别为 0.945 和 0.801。随机森林 (RF) 模型能够最好地区分 MDS 和 AML,其 AUROC 0.928、敏感性 0.725、特异性 0.898 和准确性 0.818。对于 MDS 转化为 AML 的预测能力,SVM 模型在 m6A 调节因子集合中表现出最佳预测,AUROC 0.781,准确度 0.740。 LR 模型显示了差异表达 m6A 调节器组中的最佳预测,AUROC 0.820,准确度 0.760。所有结果表明,m6A 监管机构建立的机器学习模型可用于区分 AML 或 MDS 与对照,区分 AML 与 MDS,并预测 MDS 向 AML 的转变。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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Disease Models & Mechanisms
2024 Jul 12
NickRLove,ClaireWill...
Melanoma progression and prognostic models drawn from single-cell, spatial maps of benign and malignant tumors.
Disease Models & Mechanisms
黑色素瘤的临床结果源于肿瘤及其微环境中运作的不完全了解的遗传机制。在这里,我们在源自患者的档案肿瘤中使用基于单细胞 RNA 的空间分子成像 (RNA-SMI),以揭示恶性肿瘤进展和预后的临床相关标志物。我们检查了良性和恶性黑素细胞肿瘤(包括黑素细胞痣以及原发性侵袭性和转移性黑素瘤)内 203,472 个细胞的空间基因表达。算法细胞聚类与肿瘤内比较二维分析相结合,可视化了与细胞增殖、代谢和恶性肿瘤相关的协同空间基因特征,并通过蛋白质表达进行了验证。转移生态位包括 CDK2 和 FABP5 的上调,通过 Cox 回归分析独立预测 473 名黑色素瘤患者的不良临床结果。更一般地说,我们的工作展示了一个应用单细胞 RNA-SMI 技术来识别与癌症进展和患者生存相关的基因调控景观的框架。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 12
KristinaAllen-Brady,...
Breast Cancer is Increased in Women with Primary Ovarian Insufficiency.
DIABETES & METABOLISM
DNA 损伤/修复基因变异与原发性卵巢功能不全 (POI) 和癌症风险相关。我们假设患有 POI 的女性和家庭成员的子集患癌症的风险会增加。使用 1995 年记录进行的基于人群的病例对照研究-2022 年。犹他州的两个主要学术医疗保健系统为该州 85% 的地区提供服务。使用 ICD 代码识别患有 POI 的女性 (n=613),并审查其准确性。使用犹他州人口数据库将亲属联系起来。使用犹他州癌症登记处确定癌症诊断。通过与人口比率进行比较来估计 POI 女性和亲属患癌症的相对风险。对一部分女性进行了全基因组测序。患有 POI 的女性乳腺癌发病率增加(OR [95%CI] 2.20 [1.30, 3.47];p=0.0023),并且卵巢癌名义上显着增加。 POI 先证者被诊断患有 POI 和癌症时分别为 36.5±4.3 岁和 59.5±12.7 岁。确定了癌症和 POI 的致病基因和候选基因变异。在这些女性的二级亲属中,患乳腺癌 (1.28 [1.08, 1.52]; p=0.0078) 和结肠癌 (1.50 [1.14, 1.94]) 的风险增加;p=0.0036)。一级亲属 (1.64 [1.18, 2.23]; p=0.0026)、二级亲属 (1.54 [1.32, 1.79]; p<0.001) 和三级亲属 (1.33 [1.20, 1.48]; p< 0.001)。数据表明 POI 和生殖系统癌症的常见遗传风险。需要工具来预测 POI 女性的癌症风险,并可能就激素替代疗法的风险提供咨询。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表内分泌学会出版。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jul
AliaAElShahawy,AwnyA...
Interleukin-10 as a marker for response to dendritic cells-dribbles immunotherapy in hepatocellular carcinoma, a mice model.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
癌症免疫疗法是癌症治疗中一种很有前途的策略,包括肝细胞癌(HCC)。本实验研究旨在评估白细胞介素 10 (IL-10) 作为生物标志物,用于监测肿瘤源性自噬体疫苗在 HCC 诱导小鼠中诱导抗肿瘤免疫的反应。该研究在 56 只 BALB/c 小鼠身上进行;分为 20 个正常细胞和 36 个用人肝癌细胞系 (HepG2) 诱导的癌症细胞。后者分为阳性对照组(n=6)和治疗组(n=30),治疗组又分为 3 个亚组:(A)仅用树突状细胞(DC)疫苗治疗,(B)用仅命名为 Dribbles 的疫苗,(C) 用 DC 加 Dribbles 进行处理。免疫治疗后评估血清IL-10。 DC加Dribbles疫苗接种的小鼠肿瘤体积缩小的平均百分比显着优于DC和Dribbles组(分别为p=0.013和p=0.043)。不同免疫治疗组之间IL-10水平存在统计学显着差异(p=0.0003)。阳性对照组的平均IL-10水平为19.50 pg/ml,Dri​​bbles组为13 pg/ml,DC组为10 pg/ml,DC加Dribbles组为3.50 pg/ml。我们得出的结论是,DC-Dribbles 疫苗在减少 HCC 发展和提高生存率方面比单独使用 Dribbles 或单独使用 DC 具有显着的功效。 IL-10 是免疫治疗后反应的预测生物标志物。版权所有 © 埃及免疫学家协会。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jul 12
MubinTarannum,Khanhl...
CAR memory-like NK cells targeting the membrane proximal domain of mesothelin demonstrate promising activity in ovarian cancer.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
上皮性卵巢癌(EOC)仍然是最致命的妇科癌症之一。细胞因子诱导的记忆样 (CIML) 自然杀伤 (NK) 细胞在临床前和早期临床试验中显示出有希望的结果。在当前的研究中,CIML NK细胞对一组EOC细胞系表现出优异的抗肿瘤反应,增加了激活受体的表达,上调参与细胞周期/增殖的基因以及下调抑制/抑制基因。用靶向间皮素 (MSLN) 近膜结构域的嵌合抗原受体 (CAR) 转导的 CIML NK 细胞进一步改善了针对表达 MSLN 的 EOC 细胞和患者来源的异种移植肿瘤细胞的抗肿瘤反应。 CIML NK 细胞的 CAR 武装大大减少了患者来源的腹水中的功能障碍,其中与代谢改变和强直信号传导相关的转录组变化是潜在的机制。最后,MSLN-CAR CIML NK 细胞的过继转移在异种移植小鼠中表现出显着的肿瘤生长抑制作用并防止转移扩散,支持其作为 EOC 有效治疗策略的潜力。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jul 12
WeiFeng,XixiDu,Yuxin...
Enhancing treatment of lumbar disc herniation with Erxian decoction and auricular acupoint pressure: A randomized controlled trial.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
腰椎间盘突出症(LDH)的发病率逐年上升,且有年轻化趋势。本研究旨在探讨二仙汤联合耳穴贴压疗法治疗LDH的临床疗效。我们的目标是提供支持将中医康复技术纳入临床的证据。这项随机对照试验招募了 102 名诊断为 LDH 的患者,并将他们分为对照组和干预组。对照组接受为期2周的康复治疗,干预组在对照组基础上加用二仙汤联合耳穴贴压治疗。主要结果指标包括 3 个量表 - 视觉模拟量表 (VAS)、日本骨科协会 (JOA) 和 Oswestry 残疾指数 - 以及 3 个炎症标记物:C 反应蛋白 (CRP)、白细胞介素 - 6 (IL-6)、和肿瘤坏死因子-α (TNF-α)。此外,还评估了压痛阈值和疼痛耐受阈值。对参与者在基线、治疗后 14 天和 28 天进行评估。治疗 2 周后,对照组和干预组在 VAS、JOA、ODI、CRP、IL-6、TNF-α 方面均表现出显着改善、压痛阈值和疼痛耐受阈值(P < .05)。 VAS、JOA 和 ODI 评分的这些改善在第 28 天持续存在(P < .05)。第14天时,干预组在VAS、JOA、ODI、CRP、TNF-α和压痛阈值方面均明显优于对照组(P < .05)。与传统康复治疗相比,二仙汤联合耳穴压力疗法对缓解 LDH 患者的症状有明显的效果。这种方法为管理 LDH 的未来治疗策略提供了新的视角并证实了证据。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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Stem Cell Research & Therapy
2024 Jul 12
FangHuang,ZhenweiDai...
RBM7 deficiency promotes breast cancer metastasis by coordinating MFGE8 splicing switch and NF-kB pathway.
Stem Cell Research & Therapy
众所周知,异常的选择性剪接与多种癌症的肿瘤发生密切相关。然而,由剪接事件失调驱动的乳腺癌转移的复杂机制在很大程度上仍未被探索。在这里,我们揭示了与原发灶相比,RBM7在乳腺癌的淋巴结和远处器官转移中减少,并且RBM7的低表达与乳腺癌患者的无病生存率降低相关。与乱序对照细胞相比,RBM7 耗尽的乳腺癌细胞表现出更高的肺转移潜力。 RBM7 的缺失会刺激乳腺癌细胞迁移、侵袭和血管生成。从机制上讲,RBM7 控制 MFGE8 的剪接开关,有利于 MFGE8 的主要亚型 MFGE8-L 的产生。这导致 STAT1 磷酸化减弱和细胞粘附分子改变。 MFGE8-L对乳腺癌细胞的迁移和侵袭能力产生抑制作用,而缺乏第二个F5/8 C型结构域的截短亚型MFGE8-S则具有相反的作用。此外,RBM7 负向调节 NF-κB 级联,NF-κB 抑制剂可以阻碍 RBM7 沉默引起的 HUVEC 管形成的增加。临床上,我们注意到乳腺癌组织中 RBM7 表达与 MFGE8 外显子 7 包含之间呈正相关,为对抗乳腺癌的分子靶向治疗提供了新的机制见解。© 2024,Huang,Dai,Yu 等人。
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Stem Cell Research & Therapy
2024 Jul 12
XuantongZhou,FeneGao...
Bismuth Sulfide Nanoflowers Facilitated miR339 Delivery to Overcome Stemness and Radioresistance through Ubiquitin-Specific Peptidase 8 in Esophageal Cancer.
Stem Cell Research & Therapy
尽管放射治疗对食管鳞状细胞癌(ESCC)具有卓越的疗效,但癌症干细胞(CSC)的放射抗性会导致复发、转移和治疗失败。因此,有必要开发基于CSC的疗法来增强放射治疗。基于 ESCC 队列,miR-339-5p (miR339) 参与干细胞分裂和 DNA 损伤检查点信号通路。 miR339 通过靶向 USP8 抑制 ESCC 细胞干性并增强辐射诱导的 DNA 损伤,表明它作为潜在的 CSC 调节剂和放射增敏剂。考虑到miRNA的循环周期有限和肿瘤靶向能力差,开发了基于硫化铋纳米花(Bi@PP)的多功能纳米平台,以有效递送miR339并提高放射抗性。有趣的是,Bi@PP 由于其花形结构而封装了更多的 miR339,将超过 1000 倍的 miR339 递送到细胞中,优于单独的游离 miR339。除了用作载体外,Bi@PP 还有利于动态监测体内递送的 miR339 的分布,同时抑制肿瘤生长。此外,Bi@PP/miR339 可以显着增强患者来源的异种移植模型的放疗效果。这个多功能平台结合了更高的 miRNA 负载能力、pH 响应性、缺氧缓解和 CT 成像,提供了另一种提高放射敏感性和优化 ESCC 治疗的方法。
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