腹膜游离癌细胞会对胃癌的疾病进展和患者预后产生负面影响。本研究旨在探讨利用黄金角径向采样动态对比增强磁共振成像（GRASP DCE-MRI）预测胃癌患者腹膜游离癌细胞存在的可行性。所有入组患者连续分为分析组和分析组。验证组。对接受手术的胃癌患者进行术前磁共振成像（MRI）扫描和灌注，并采集腹腔灌洗标本进行检查。根据腹腔灌洗细胞学（PLC）结果，将患者分为灌洗液阴性组和阳性组。收集的数据包括临床和磁共振信息。构建列线图预测模型预测腹腔灌洗液阳性率，并根据验证组数据验证模型的有效性。GRASP DCE-预测的PLC阳性病例比例差异无统计学意义MR和实际PLC测试。 MR 肿瘤分期、肿瘤厚度和灌注参数 Tofts-Ketty 模型体积转移常数 (Ktrans) 是腹膜灌洗液阳性的独立预测因子。列线图模型的建模组和验证组的一致性指数（C 指数）分别为 0.785 和 0.742。GRASP DCE-MR 可以有效预测胃癌患者的腹膜游离癌细胞。使用这些预测因子构建的列线图模型可以帮助临床医生更好地预测胃癌患者中存在腹膜游离癌细胞的风险。

异常糖基化引起了生物标志物发现的极大兴趣。然而，检测能力低、聚糖结构复杂和异质性给糖蛋白检测开发带来了挑战。以触​​珠蛋白（Hp）为模型，我们开发了一个结合功能化磁性纳米颗粒和两性离子亲水相互作用液相色谱（ZIC-HILIC）的集成平台，用于高度特异性的糖肽富集，然后采用数据独立采集（DIA）策略来建立深度分析乙型肝炎病毒 (HBV, n = 5) 和肝细胞癌 (HCC, n = 5) 患者的癌症特异性 Hp 糖基化谱。 DIA 策略在血清样本中建立了最深的 Hp 糖基化景观之一（1029 个糖肽，130 个聚糖），其中包括仅在 HCC 患者中检测到的 54 种糖肽。此外，针对基于 DIA 的光谱库的单次 DIA 搜索在患者中的糖肽覆盖率优于 DDA 方法 2-3 倍。在 Hp 上的四个 N-聚糖位点（N-184、N-207、N-211、N-241）中，总聚糖类型分布显示组合岩藻糖基化-唾液酸化聚糖的检测显着增强，这是已识别的最主要的糖型在肝癌患者中。定量分析显示，48 种糖肽在 HCC 中显着富集 (p < 0.05)，其中包括 N-184 位点上的混合单唾液酸化三触角糖肽，几乎没有升高，可将 HCC 与 HBV 组区分开来（HCC/HBV 比率：2462 ± 766，p < 0.05）。总之，DIA-MS 为靶向糖蛋白组学提供了一种公正且全面的替代方案，以指导糖生物标志物的发现和验证。

背景：以顺铂（DDP）为基础的联合化疗是治疗膀胱癌（BLca）的重要方法。顺铂化疗过程中容易出现化疗耐药，是BLca患者预后不良的重要原因之一。环状 RNA (circRNA) 因其在 BLca 的发展和进步中的作用而得到广泛认可。然而，circRNA 在 BLca 的 DDP 抗性中的确切作用仍不清楚。方法：为了研究 circATIC 的特性，采用了桑格测序、琼脂糖凝胶电泳和 RNase R/Actinomycin D 处理。 RT-qPCR 检测用于评估 BLca 组织和细胞中 circRNA、miRNA 和 mRNA 的表达水平。进行功能实验以评估 circATIC 在 BLca 进展和体外化疗敏感性中的功能。采用FISH、双荧光素酶报告基因测定、TRAP、RNA消化测定、RIP和ChIRP测定等多种技术来研究PTBP1、circATIC、miR-1247-5p和RCC2之间的关系。通过原位膀胱癌模型、异种皮下肿瘤模型和异种肺转移肿瘤模型来阐明circATIC在体内BLca进展和化疗敏感性中的功能和机制。结果：在我们的研究中，我们观察到 BLca 组织和细胞以及 DDP 耐药细胞中 circATIC 表达显着增强。 circATIC表达较高的患者肿瘤直径较大，术后转移发生率较高，总生存率较低。进一步的实验表明，circATIC 可加速 BLca 细胞的生长和转移，并诱导 DDP 耐药。从机制上讲，选择性剪接酶 PTBP1 介导 circATIC 的合成。 circATIC 可以通过海绵 miR-1247-5p 或构建 circATIC/LIN28A/RCC2 RNA-蛋白三元复合物来增强 RCC2 mRNA 稳定性。最后，circATIC 促进 RCC2 表达，增强上皮间质转化 (EMT) 进程并激活 JNK 信号通路，从而增强 BLca 细胞的 DDP 耐受性。结论：我们的研究表明，circATIC 促进 BLca 进展和 DDP 耐药，并且可以作为 BLca 治疗的潜在靶标。© 作者。

代谢重编程是肿瘤的基本特征之一，可能极大地促进癌症转移。采用基于液相色谱-串联质谱的代谢组学，我们分析了射波刀立体定向放射治疗前后 12 例 NSCLC 脑转移患者的两对血清样本的代谢谱。我们评估了 144 个手术切除的 NSCLC 脑转移瘤的组织病理学结构。筛选差异代谢物并进行功能聚类和注释。代谢组学分析确定了一条富含支链氨基酸 (BCAA) 代谢的途径。病理上，生长方式坚实的腺癌脑转移倾向较高。肺腺癌组织中BCAT1蛋白水平高的患者与不良预后相关。我们发现脑 NSCLC 细胞的 BCAA 分解代谢升高，从而导致 α-KG 的消耗。这种耗竭反过来又降低了 m6A 去甲基化酶 ALKBH5 的表达和活性。因此，抑制ALKBH5参与维持间充质基因的m6A甲基化，促进NSCLC细胞上皮间质转化（EMT）的发生和脑内NSCLC细胞的增殖。 BCAA 分解代谢在 NSCLC 细胞的转移中发挥着重要作用。© 作者。

泛素化在肿瘤进展中发挥着关键的调节作用。在泛素-蛋白酶体系统（UPS）的组成部分中，泛素-蛋白质连接酶E3已成为关键分子。然而，E3 泛素连接酶的生物学功能及其在胃癌 (GC) 中协调糖酵解的潜在机制仍有待阐明。在本研究中，我们进行了全面的转录组分析，以确定 GC 中的核心 E3 泛素连接酶，然后在体外和体内广泛验证包含三部分基序的 50 (TRIM50) 的表达模式和临床意义。值得注意的是，我们发现 TRIM50 在 GC 组织中表达下调，与恶性进展和患者生存率低相关。从功能上讲，TRIM50的过表达抑制GC细胞增殖，并通过抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的M2极化间接减轻GC细胞的侵袭和迁移。从机制上讲，TRIM50 通过泛素化磷酸甘油酸激酶 1 (PGK1) 抑制糖酵解途径，从而直接抑制 GC 细胞增殖。同时，乳酸的减少导致TAMs的M2极化减弱，间接抑制GC细胞的侵袭和迁移。值得注意的是，GC 中 TRIM50 的下调是由 METTL3/YTHDF2 轴以 m6A 依赖性方式介导的。在我们的研究中，我们明确确定 TRIM50 是一种肿瘤抑制基因（TSG），通过泛素化 PGK1 有效抑制糖酵解和 GC 的恶性进展，从而为 GC 的诊断和治疗提供新的见解和有希望的靶标。© 作者）。

去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 是男性前列腺癌 (PCa) 相关死亡的主要原因，发生在雄激素剥夺疗法 (ADT) 失败后。 PIWI 相互作用 RNA (piRNA) 是许多人类癌症的重要调节因子，但它们在 CRPC 中的表达模式和作用仍然未知。在这项研究中，我们使用来自同一患者的 10 个良性前列腺组织和 9 配对的激素敏感 PCa (HSPCa) 和 CRPC 组织进行小 RNA 测序，以探索 CRPC 相关的 piRNA。与HSPCa和良性组相比，PiRNA-4447944（piR-4447944）被发现在CRPC组中高表达。功能分析显示，piR-4447944过表达赋予PCa细胞体外和体内去势抵抗能力，而使用反义RNA敲低piR-4447944可抑制CRPC细胞的增殖、迁移和侵袭。此外，强制表达piR-4447944可促进PCa细胞的体外迁移和侵袭，并减少细胞凋亡。从机制上讲，piR-4447944 与 PIWIL2 结合形成 piR-4447944/PIWIL2 复合物，并通过转录后水平的直接相互作用抑制肿瘤抑制因子 NEFH。总的来说，我们的研究表明 piR-4447944 对于前列腺肿瘤增殖细胞至关重要，并介导 PCa 的雄激素非依赖性生长，这扩展了目前对癌症生物学中 piRNA 的理解，并为 CRPC 治疗提供了潜在的方法。© 作者。

背景：肾细胞癌（RCC）常伴有静脉系统癌栓，预后极差。目前的肿瘤淋巴结转移 (TNM) 分期和 Mayo 临床分类无法正确识别偏好敏感的治疗。因此，迫切需要开发更好的精准医疗理想模型。方法：在本研究中，我们基于使用多个独立队列的新型计算框架，使用 10 种机器学习算法（101 种组合）开发了 RCC 凝固肿瘤血栓特征。结果：建立的肿瘤血栓凝血相关风险分层 (TTCRRS) 特征包含 10 个预后凝血相关基因 (CRG)。该签名可以预测公共和内部蛋白质队列的生存结果，并且与 129 个已发布的签名相比表现出较高的性能。此外，TTCRRS 特征与一些免疫景观、免疫治疗反应和化疗显着相关。此外，我们还根据 TTCRRS 特征筛选出了枢纽基因、转录因子和小化合物。同时，CYP51A1可以调节RCC的增殖和迁移特性。结论：TTCRRS 特征可以补充传统的解剖 TNM 分期系统和 Mayo 临床分层，为临床医生提供更多的治疗选择。© 作者。

肝祖细胞（HPC）具有双向分化为肝细胞和胆管上皮细胞的潜力，并构成成人肝脏中肝再生的第二道屏障。它们通常位于门静脉区域的 Hering 管中，其中各种细胞、细胞外基质、细胞因子和通讯信号共同构成 HPC 的生态位，维持细胞的稳态，维持细胞的可塑性。在各种类型的肝损伤中，不同的细胞信号流相互串扰并指向诱导型转录因子集，包括 FoxA1/2/3、YB-1、Foxl1、Sox9、HNF4α、HNF1α 和 HNF1β。这些转录因子通过与特定靶基因结合来发挥不同的功能，并且它们的产物经常相互作用，在不同的分子事件中进行多种级联调节，这对于 HPC 的稳态调节、自我更新、增殖和选择性分化至关重要。此外，转录分析发现，在转录因子失调的情况下，成人HPCs的肿瘤易感性显着增加，HPCs分化途径的初始承诺改变可能是肝内肿瘤的来源之一。 HNF4α和HNF1等相关转录因子有望成为未来肿瘤治疗的靶标。©作者。

肝细胞癌 (HCC) 是最常见和致命的肿瘤之一；然而，其致病机制在很大程度上仍不清楚。需要深入研究揭示RNA结合蛋白RALY在HCC中的表达调控机制和功能。在这里，我们将 RALY 确定为一种高表达的致癌因子，在体外和体内都会影响 HCC 细胞的增殖。 RALY Ser176 位点的 O-GlcNAc 酰化通过保护 RALY 免受 TRIM27 介导的泛素化来增强其稳定性，从而维持 RALY 蛋白的超表达。从机制上讲，RNA 免疫沉淀显示，RALY 与 USP22 信使 RNA 相互作用，增加其细胞质定位和蛋白质表达，从而促进 HCC 细胞的增殖。此外，我们开发了一种基于肽蛋白水解靶向嵌合体的新型 RALY 蛋白降解剂，名为 RALY-PROTAC，我们通过将 RALY 靶向肽与 E3 泛素连接酶招募配体泊马度胺连接来化学合成。总之，我们的研究结果证明了 O-GlcNAcylation/RALY/USP22 mRNA 轴加剧 HCC 细胞增殖的新机制。 RALY-PROTAC 作为 RALY 蛋白的降解剂，具有作为 RALY 过表达 HCC 治疗药物的潜力。© 作者。

对 HER2 靶向治疗的耐药性是 HER2 乳腺癌 (BC) 患者治疗失败的主要原因。鉴于免疫微环境在肿瘤发展中的关键作用，目前缺乏充分考虑免疫浸润的理想预后模型。在本研究中，进行 WGCNA 分析以发现免疫相关信号传导与 HER2 BC 预后之间的关系。赫赛汀耐药 BC 细胞系建立后，对耐药细胞系的转录谱和 GSE76360 队列的 RNA 测序数据进行了分析，以寻找候选基因。通过 Cox 回归、XGBoost 和 Lasso 算法对 TCGA 数据库中的 85 个 HER2 BC 样本进行分析，以概括出可信的免疫相关预后指数 (IRPI)。通过多种算法进一步分析 IRPI 特征与肿瘤微环境之间的相关性，包括单细胞 RNA 测序数据分析。 IRPI高的患者肿瘤免疫微环境受到抑制，预后较差。 IRPI 表明赫赛汀耐药 HER2 BC 中 I 型干扰素信号传导的抑制得到了验证。我们阐明了 cGAS-STING 通路的抑制是具有高 IRPI 的赫赛汀耐药 BC 免疫逃逸的关键决定因素。 STING 激动剂和 DS-8201 的组合可以作为赫赛汀耐药 HER2 BC 的新策略。© 作者。