肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

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肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

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眼部黑色素瘤

YinnanChen,QuanpengQ...

Extrachromosomal circular DNA in colorectal cancer: biogenesis, function and potential as therapeutic target.

超染色体环形DNA（ecDNA）自其发现半个多世纪以来重新引起了人们的关注，成为肿瘤进化的重要推动因素。 ecDNA在许多类型的癌症中高度普遍，包括结直肠癌（CRC），这是全球最致命的癌症之一。 ecDNA在CRC中独立于典型染色体改变的调节癌基因表达，肿瘤内异质性和治疗耐药性方面发挥着至关重要的作用。此外，ecDNA的存在与患者的预后有关，因为基于ecDNA的癌基因扩增会对临床结果产生不利影响。最近对ecDNA的理解给CRC的发病机制增加了额外的复杂性。在本综述中，我们将讨论在CRC中ecDNA产生机制和独特特征的当前认识。此外，我们将研究ecDNA如何介导癌基因过度表达，基因调控和与主动染色质的拓扑相互作用，从而促进遗传异质性，加速CRC恶性化并增加快速适应治疗耐药性。最后，我们将讨论ecDNA在CRC中的潜在诊断和治疗意义。 ©2023作者（们）。

OBSTETRICS AND GYNECOLOGY

NicolòBizzarri,Lukáš...

Association of Hospital Surgical Volume With Survival in Early-Stage Cervical Cancer Treated With Radical Hysterectomy.

OBSTETRICS AND GYNECOLOGY

评估每个中心每年进行根治性子宫切除术次数与无病生存和总生存的联系。我们对先前包括在宫颈癌监测协作研究中的患者进行了国际性、多中心、回顾性研究。包括国际妇产科联合会（FIGO）2009年IB1-IIA1期宫颈癌，在根治性子宫切除术中，最后组织学显示淋巴结为阴性的个体。患者在妇科肿瘤转诊中心治疗，遵循最新的国家和国际指南。使用未经调整的Cox比例危险模型来确定手术量的最佳截止值，其中无病生存为结果，并定义为最小化组之间无病生存分割的P值的值。使用倾向得分匹配在基线创建统计相似的队列。共纳入2,157名患者。手术量的两个最显着截止值在七和17次手术中被确定，将整个队列分为低、中、高三个手术量中心。倾向得分匹配后，分析了1,238名患者-619名（50.0％）在高手术量组，523名（42.2％）在中等手术量组，96名（7.8％）在低手术量组。在高手术量机构接受手术的患者的5年无病生存率比在低手术量中心接受手术的患者逐渐变好（92.3％vs 88.9％vs 83.8％，P = 0.029）。5年总生存无差异（95.9％vs 97.2％vs 95.2％，P = 0.70）。Cox多变量回归分析显示，FIGO分期大于IB1、淋巴血管侵犯存在、分级大于1、肿瘤直径大于20 mm、微创手术方法、非鳞状细胞癌组织学和低手术量中心代表了独立的复发风险因素。中心的外科手术量代表了影响无病生存的独立预后因素。每个中心每年进行的根治性子宫切除术次数的增加与改善无病生存相关。版权所有©2022年美国妇产科医师学院。由Wolters Kluwer Health, Inc.出版。保留所有权利。

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

ZheHan,MartinAndrš,B...

The importance of nuclear RAGE-Mcm2 axis in diabetes or cancer-associated replication stress.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

DNA复制缺陷的高频率与糖尿病和癌症有关。然而，将这些核扰动与器官并发症的发病或进展联系起来的数据仍未经过探索。在这里，我们报告了先前认为是细胞外受体的AGE (高级糖基化终产物受体)，在代谢应激时定位到损伤的叉中。在那里，它与稳定微染色体维护(Mcm2-7)复合物相互作用。因此，RAGE缺陷会导致减缓叉前进，过早的叉坍塌，对复制压力剂的过敏性和细胞存活能力的降低，而这些可以通过重构RAGE来逆转。这可以通过53BP1/OPT结构域的表达和微核的存在、纤毛区过早丢失的增加、管型巨核增生的发生率增加，最后是间质纤维化的表现。更重要的是，RAGE-Mcm2轴在人类活检和糖尿病性肾病和癌症的小鼠模型中表达微核的细胞中被选择性地破坏。因此，在体外和人类疾病中，功能性的RAGE-Mcm2/7轴对于处理复制压力至关重要。©作者2023年。由牛津大学出版社代表核酸研究出版。

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

SaumyaMDeSilva,Alish...

PBRM1 bromodomains associate with RNA to facilitate chromatin association.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

PBRM1是PBAF染色质重塑复合物的一个亚单位，该亚单位在清除细胞肾细胞癌患者中发生变异的比例为40-50%。它被认为主要作为PBAF复合物的染色质结合亚单位发挥作用，但其分子机制尚不完全清楚。PBRM1含有六个串联的溴域，这些溴域已被证明在结合乙酰化的组蛋白H3赖氨酸14（H3K14ac）的核小体中起到协同作用。在这里，我们证明了PBRM1的第二个和第四个溴域也能够结合核酸，特异性地与双链RNA元素结合。破坏RNA结合口袋被发现会影响PBRM1的染色质结合并抑制PBRM1介导的细胞生长效应。©作者（们）2023年。由牛津大学出版社代表核酸研究出版。

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

UkjinKwon,Hsin-HoHua...

Incoherent merger network for robust ratiometric gene expression response.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

比例响应输出与两个输入值的大小比例成正比。比例计算在自然界中已被观察到，并且在智能益生菌和组织细胞发展中也需要。在这里，我们利用不一致合并网络在大肠杆菌中实现了比例基因表达响应。在该网络中，一个输入分子激活了输出蛋白的表达，而另一个分子激活了一个增强输出降解的中间蛋白。当降解速率为一阶且比稀释速率更快时，输出响应在广泛的输入分子水平比例范围内呈线性，并且R2接近1.响应灵敏度可以通过改变输出的翻译速率来定量调节。此外，比例响应对影响基因表达的细胞组分的全局扰动具有鲁棒性，因为此类扰动通过不一致的前馈回路对输出产生影响。这项工作展示了一种新的分子信号处理机制，适用于对细胞内环境具有鲁棒性的多重感知和响应电路。© 作者（2023）。由牛津大学出版社代表核酸研究出版。

NMR IN BIOMEDICINE

ChaoZou,YinghengRuan...

A new deuterium-labeled compound [2,3,4,6,6'-2 H5 ]-D-glucose for deuterium magnetic resonance metabolic imaging.

NMR IN BIOMEDICINE

重氢（2 H）磁共振成像是一种新兴方法，可非侵入性地研究体内葡萄糖代谢，对于理解病因和监测诸如肿瘤、糖尿病和神经退行性疾病等许多疾病的进展非常重要。然而，2 H标记葡萄糖的合成成本昂贵，因为原材料昂贵且需要极端反应条件，使得2 H标记的葡萄糖相当昂贵且难以承受临床使用。在本研究中，我们提出一种新的重氘化合物-[2,3,4,6,6'-2 H5 ]-D-葡萄糖，其生产成本降低约10倍。合成路线使用更便宜的原材料甲基-α-D-葡萄糖苷，依赖于温和的反应条件（80°C），并具有更高的重氘标记效率。磁共振光谱（MRS）和质谱实验证实化合物的成功重氘标记。动物研究证明，通过超高场系统上的2 H-MRS定量下游代谢产物，该底物可描述胶质瘤大鼠模型的糖酵解代谢。在动物研究中，对比了[2,3,4,6,6'-2 H5 ]-D-葡萄糖和商业[6,6'-2 H2 ]-D-葡萄糖的葡萄糖代谢特性。这种成本效益的化合物将有助于促进重氢磁共振成像的临床转化，并使这种强大的代谢成像模态广泛应用于基础研究和临床应用。©2022 John Wiley & Sons Ltd.

NMR IN BIOMEDICINE

ShaoweiBo,JuliaStabi...

Exploring the potential of the novel imidazole-4,5-dicarboxyamide chemical exchange saturation transfer scaffold for pH and perfusion imaging.

NMR IN BIOMEDICINE

在这里，我们描述和评估了14种新合成的咪唑-4,5-二羧酰胺（I45DCs）在pH和灌注成像中的潜力。这些芳香化合物中有很多具有较大的活性质子化学位移（高达从水7.7 ppm）由于它们的分子内氢键和第二个活性质子，以允许化学交换饱和转移（CEST）信号比基础的pH测量。我们发现对于一系列的取代产生的对比度强，可根据这些取代来调整CEST信号比与pH图之间的拐点，以生成无浓度依赖的pH图。这些I45DC CEST剂在肿瘤和肾pH映射中具有优势，不仅在临床前和初步人体研究中，而且随着CEST MRI与外源性对比剂结合的能力能够检测肾脏的功能性变化，我们评估了我们表现最好的阴离子化合物（I45DC-diGlu）在单侧尿路梗阻小鼠模型上，并观察到梗阻肾脏的对比度摄取较低，而非梗阻肾脏则显示pH约为6.5，而梗阻肾脏的pH升高且pH值范围增加。基于此，我们得出结论，I45DC具有出色的成像特性，并具有在各种医学成像应用，尤其是肾脏成像方面的前景。 ©2022 John Wiley＆ Sons Ltd.

NMR IN BIOMEDICINE

NienkeDSijtsema,Stev...

Multidelay pseudocontinuous arterial spin labeling to measure blood flow in the head and neck.

NMR IN BIOMEDICINE

灌注MRI可用于评估、预测和监测头颈癌患者中危及器官的放射性毒性。动脉自旋标记（ASL）可能是对传统灌注MRI的有吸引力的替代方法，不需要使用对比剂。然而，目前对于ASL在头颈区健康组织中的性能和特性还知之甚少。因此，本研究的目的是优化并评估多延迟假连续ASL（pCASL）在头颈区的应用，探索血流（BF）、通过时间和BF定量所需的T1值的名义值和测量重复性。20名健康志愿者参与了四次多延迟pCASL扫描。感兴趣的区域包括腮腺、颌下腺、扁桃体和小脑（作为参照）。BF的名义值是志愿者每次重复的平均值，计算了BF的重复性系数和受试者内重复性系数（wCV）。研究了T1（地图与队列平均值）和通过时间校正对BF的影响。腮腺的平均BF（± SE）为55.7±3.1 ml/100 g/min，颌下腺为41.2±2.8 ml/100 g/min，扁桃体为32.3±2.2 ml/100 g/min。腮腺的重复性最好（wCV=13.3%-16.1%），其次是颌下腺和扁桃体（wCV=20.0%-24.6%）。平均而言，T1和通过时间校正对BF的影响有限，尽管在个体采集中存在显著偏差。总之，我们证明了使用多延迟pCASL在头颈区进行BF测量的可行性，并报告了头颈区各种组织中的名义BF值、BF重复性、T1和通过时间的影响。©2023年由约翰·威利及其子公司出版发行的《NMR in Biomedicine》。

NMR IN BIOMEDICINE

ElenaVinogradov,Joch...

CEST-MRI for body oncologic imaging: are we there yet?

NMR IN BIOMEDICINE

化学交换饱和转移（CEST）MRI已经被认可为分子成像和定量生物标志物库中的有价值的补充，尤其是用于脑肿瘤的特征分析。越来越多地有兴趣将CEST-MRI用于脑外的应用。然而，它在肿瘤学领域普及的速度远远落后于神经肿瘤领域。CEST-MRI在非神经学应用中的缓慢迁移反映了对躯干成像的成像技术挑战。在这篇综述中，我们讨论了CEST-MRI在乳腺和躯干（即身体成像）肿瘤病情的应用，强调了挑战和可能的解决方案。尽管数据仍然有限，但报道的研究表明CEST信号与重要的组织学标记有关，例如肿瘤分级、受体状态和增殖指数，其中一些常常与预后和治疗反应有关。然而，仍然需要进一步的技术发展，使CEST成为身体成像的可靠临床应用，并确定其作为预测和预后生物标志物的作用。© 2023 John Wiley & Sons, Ltd.

New Biotechnology

PetrosTakousis,Aliso...

A standardised methodology for the extraction and quantification of cell-free DNA in cerebrospinal fluid and application to evaluation of Alzheimer's disease and brain cancers.

New Biotechnology

脑脊液（CSF）是一系列神经病症的诊断生物标志物来源。细胞外DNA（cfDNA）可在CSF中检测到，神经退行性疾病研究中报告了细胞外线粒体DNA浓度的差异，包括阿尔茨海默病（AD）。然而，对于CSF中的cfDNA，预分析步骤的影响尚未研究，并且没有标准化的方法用于总cfDNA（核基因组或线粒体源基因目标的副本数）的定量。本研究评估了四种提取方法的适用性：QIAamp循环核酸（Qiagen）、Quick-cfDNA血清和血浆（Zymo）、NucleoSnap® DNA血浆（Macherey-Nagel）和Plasma / Serume 细胞DNA纯化Mini（Norgen）套件，用于从对照组和AD痴呆症患者的CSF中提取cfDNA，利用峰内控制提取效率与片段大小。其中一种最佳提取方法应用于比较对照组、AD痴呆和原发性和继发性脑肿瘤患者的CSF中cfDNA的浓度。基于内标回收的提取效率在所有三组中都相似，而内源性线粒体和核基因组来源的cfDNA在癌症患者的CSF中显著高于对照组和AD组，后者通常含有＜100基因组拷贝/ mL。本研究表明，测量低浓度核基因组和线粒体基因靶标在CSF中是可行的，提取产量的标准化可以帮助控制影响生物标志物测量的分析前变异性。版权所有©2022年作者。由Elsevier B.V.出版。保留所有权利。