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Nature Reviews Nephrology
2023 Jan 26

JuanIGaraycoechea,Ca...
Pathological consequences of DNA damage in the kidney.
Nature Reviews Nephrology
逃避修复的DNA损伤可能导致发生突变,从而推动肿瘤发展。细胞对DNA损伤的反应可能会引起细胞衰老和细胞死亡,这些现象与老化有关。在肾脏中,DNA损伤已被提出与急性及慢性肾损伤以及肾细胞癌有关。肾脏对损伤DNA的化疗药物易感性已得到确认,但肾小管毛发病与DNA损伤应答之间的联系最近被报道。此外,人类遗传缺陷的DNA修复已突显出对肾脏特别有毒的DNA交联、DNA断裂和阻断转录的损伤作为损伤。小鼠的遗传工具,以及肾器官体和单细胞RNA测序技术的进步,为特定的肾细胞类型如何应对DNA损伤提供了重要的见解。新的观点是,在肾脏中,DNA损伤通过触发损伤反应和细胞增殖来影响局部微环境,以补充受损细胞,同时引起系统性反应,旨在减少暴露于基因毒性胁迫。因此,DNA损伤的病理后果对于损伤肾脏药物的肾毒性和人类DNA修复缺陷疾病中观察到的肾脏表型具有关键作用。© 2023. Springer Nature Limited.
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NATURE REVIEWS GENETICS
2022 Dec 09

ZairaSeferbekova,Art...
Spatial biology of cancer evolution.
NATURE REVIEWS GENETICS
癌症的自然历史可以通过进化视角来理解,因为癌症发展的驱动力是更适应的克隆体的突变和选择。癌症的生长和进展是涉及破坏正常组织结构、侵袭和转移的空间过程。因此,空间模式是组织学肿瘤分级和分期的一个重要组成部分,因为它们可以衡量从正常到恶性疾病的进展。此外,肿瘤细胞是肿瘤细胞及其周围环境的生态系统的一部分。一系列新的空间基因组、转录组和蛋白组技术提供了新的研究癌症进化的途径,具有极高的分子和空间细节。这些方法使得对肿瘤微环境、其中的细胞相互作用和微解剖结构进行精确的表征成为可能。结合空间基因组学,肿瘤和微环境共同进化,这有助于解释可观察到的异质性模式,并提供了新的治疗干预途径。© 2022. Springer Nature Limited.
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NATURE REVIEWS GENETICS
2023 Jan 04

DavidJuan,GabrielSan...
Current advances in primate genomics: novel approaches for understanding evolution and disease.
NATURE REVIEWS GENETICS
灵长类动物基因组学是理解人类进化和疾病基本方面的关键。然而,目前仅有不到500多种现存灵长类物种中的少数物种拥有基因多样性和功能基因组数据集。正在努力通过对灵长类进化树上的基因组、基因多态性和差异以及功能景观的表征来实现共同的努力。由此产生的数据集将使基因型与表型之间产生联系,并提供有关灵长类性状(包括人类疾病)基因遗传的新见解。在本文中,我们描述了现有的基因组组装以及遗传变异和功能基因组数据集。我们强调了一些样本获取方面的挑战。最后,我们探讨了单细胞功能基因组学和诱导多能干细胞来源的器官样品技术进步将如何促进我们理解灵长类生物学的分子基础。© 2023. Springer Nature Limited.
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NATURE REVIEWS GENETICS
2023 Jan 30

HaotianWu,ChristinaM...
Molecular mechanisms of environmental exposures and human disease.
NATURE REVIEWS GENETICS
常见复杂疾病的显著疾病风险与环境暴露和污染物有关。对环境污染物如何作用于我们的细胞引起有害的健康影响的认识,促进了我们对慢性疾病的发病机理的分子机制的认识,包括癌症、心血管疾病、神经退行性疾病和呼吸系统疾病。在这里,我们讨论环境污染物与人类基因组和表观基因组的相互作用的新兴研究。我们回顾了显示环境对基因表达通过表观遗传修饰包括DNA甲基化,组蛋白修饰和非编码RNA的证据。我们还强调了最近发现的分子过程的最新研究,这些分子过程可以通过环境产生影响,包括细胞外小囊泡、表观转录组和线粒体基因组。最后,我们还讨论了在研究环境暴露剂时面临的当前挑战——环境暴露测度问题中的累积性测量以及其如何融入未来的环境卫生研究。 ©2023 Springer Nature Limited。
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NATURE REVIEWS GENETICS
2023 Feb 03

AlexAPollen,UmutKili...
Human-specific genetics: new tools to explore the molecular and cellular basis of human evolution.
NATURE REVIEWS GENETICS
我们的祖先获得了形态、认知和代谢变化,使人类能够在多样的栖息地中定居,发展出非凡的技术,并重塑生物圈。了解这些变化的遗传、发育和分子基础,将有助于揭示我们成为人类的本质。由于存在大量低效基因变化,缺乏细胞类型水平上的发育时期现象差异的描述以及实验模型的缺乏,将人类特定的基因变化与物种差异相连接一直是一个挑战。现在,单细胞测序、遗传操作和干细胞培养等新兴方法已支持对具有人类或猿类基因背景的定义细胞类型进行描述性和功能研究。在本综述中,我们描述了从现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组测序中发现人类特有的基因变化,以及新的分子和细胞方法 - 包括细胞图谱和器官样本 - 如何使探索潜在的因果因素,这些因素是人类特有特征的基础。
© 2023. Springer Nature Limited.
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Nature Reviews Clinical Oncology
2022 Dec

AndrewChow,KarloPeri...
Clinical implications of T cell exhaustion for cancer immunotherapy.
Nature Reviews Clinical Oncology
免疫治疗是治疗癌症的一项显著临床进展。 T细胞是当前癌症免疫治疗的关键,包括免疫检查点抑制剂和移植细胞疗法。然而,癌症与T细胞耗竭有关,这是一种低功能状态,其特征是T细胞效应子功能和自我更新能力不断丧失。 “去除”肿瘤微环境中的T细胞通常被认为是免疫检查点抑制剂的关键作用机制,并且T细胞耗竭被认为是细胞免疫疗法的一条耐药途径。几项精妙的研究提供了关于调控T细胞耗竭的转录和表观遗传程序的重要见解。在这篇综述中,我们重点介绍了与T细胞耗竭免疫生物学相关的最新发现,这些发现提供了比完全不良状态更为细致的视角。我们回顾了T细胞耗竭可能是良性肿瘤控制的反应,而不仅是其原因的证据。此外,我们提出假设,在某些慢性抗原刺激的情况下,中断耗竭程序可能会损害T细胞的持久性。因此,优先考虑减轻T细胞耗竭的干预措施,包括正交细胞还原疗法和新型细胞工程策略,最终可能会产生更好的临床结果和癌症免疫疗法的最大进展。 ©2022 Springer Nature Limited.
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Nature Reviews Clinical Oncology
2022 Nov

NicoleMKuderer,Aakas...
Mitigating acute chemotherapy-associated adverse events in patients with cancer.
Nature Reviews Clinical Oncology
尽管有关新型靶向药物和免疫疗法的热情高涨,但对于大多数人类恶性肿瘤,化疗仍然是主要的治疗方法,单独使用或联合使用。然而,化疗相关不良事件(CAAEs)的负担仍然很高,而且重要的是,它与患者在多个方面,包括身体,情感和社交功能方面的相当发病率,死亡率和成本有关。 CAAEs可以直接影响患者的治疗效果,并间接增加癌症复发的风险,因为它们会削弱治疗的强度和连续性。系统地努力鉴定和批判性地总结有关CAAEs管理方法的证据仍然有限。 在这里,我们回顾了对生存,生活质量,功能和/或最佳疗法连续性具有重大影响的最常见的急性CAAEs。 我们重点关注在治疗期间发生的一些急性毒性,总结其潜在的病理生理学,多因素病因学,循证治疗,预防策略和管理建议。 我们还总结了有关风险因素,经过验证的风险评估工具和其他努力,以个性化预防和治疗急性CAAE的症状控制的可用证据,以使受益最大的患者受益最大。 最后,我们讨论正在开发中的创新症状监测和支持性护理干预,以进一步改善癌症患者的结局。© 2022 Springer Nature Limited。
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Nature Reviews Clinical Oncology
2022 Dec

ElisaAgostinetto,Jos...
Systemic therapy for early-stage breast cancer: learning from the past to build the future.
Nature Reviews Clinical Oncology
乳腺癌的治疗方法在过去一个世纪中有了显著的改进,从以手术为主的方法到包括局部和全身治疗的协同治疗方法。早期疾病的全身治疗起初只是通过辅助试验与观察或安慰剂进行比较。随后的临床试验集中于治疗的微调,队列规模、持续时间和成本显著增加,这导致过去十年内对新辅助治疗模式的兴趣越来越高。新辅助试验设计具有评估治疗对肿瘤直径的直接影响并提供关于治疗前、中和后肿瘤生物学的比较分析独特的转化研究机会的优点。当前技术使预测更好的生物标志物的确定成为(新)辅助治疗的新时代。需要紧急加强制药工业和学术界之间的合作,共享数据,建立大型生物标志物数据库以及易于科学社区访问的患者结果。在这篇综述中,我们总结了从基因组前期到基因组后期的(新)辅助试验的发展,并提供了关键性见解,说明如何设计新辅助研究,讨论需要更好的终点以及更个性化的治疗策略,包括在新治疗设置中。©2022 Springer Nature Limited。
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Nature Reviews Clinical Oncology
2022 Dec

Marie-CatherineVozen...
Towards clinical translation of FLASH radiotherapy.
Nature Reviews Clinical Oncology
放射肿瘤学的最终目标是消除肿瘤而不对非恶性组织产生毒性。快速FLASH放射疗法,即以超高剂量率的辐射(>40 Gy/s)进行治疗,成为一种辐射疗法模式,可以保持肿瘤控制的同时减少对周围非恶性组织的毒性。近年来的临床前研究表明,FLASH放射疗法可以在很短的时间内进行,实质性地扩大放射疗法的治疗窗口。这种超快的辐射传递可以减少毒性,从而提高抗肿瘤疗效,额外的好处是减少治疗时间和器官运动相关问题,最终增加接受治疗的病人数量。目前,FLASH放射疗法被认为是放射肿瘤学中最有前途的突破之一,处于技术、物理、化学和生物学的交汇处;然而,几个障碍使其临床转化变得困难,包括对生物机制更好的理解、参数的优化和技术挑战。在这个角度上,我们提供了FLASH放射疗法原理的概述,并讨论了在其临床应用的道路中所面临的挑战。© 2022. Springer Nature Limited.
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Nature Reviews Clinical Oncology
2023 Jan

KentaKawasaki,Natash...
Neuroendocrine neoplasms of the lung and gastrointestinal system: convergent biology and a path to better therapies.
Nature Reviews Clinical Oncology
神经内分泌肿瘤(NENs)可在几乎任何器官内发展,并跨越从良好分化和惰性神经内分泌肿瘤(NET)到恶性程度较高的神经内分泌癌(NEC),包括小细胞肺癌(SCLC)的谱系。这些肿瘤被认为主要来源于遍布全身的神经内分泌前体细胞,也可通过器官特异性上皮细胞类型的神经内分泌转分化而产生。因此,NENs构成了一组肿瘤类型,无论其起源的部位如何,都具有相同的基因组和表型特征,尽管存在一些器官特异性差异。建立几个这些疾病实体的代表性临床前模型,以及对人类肿瘤标本的分析,为其生物学的重要方面提供了重要见解,这对治疗具有重要意义。在本综述中,我们从临床和生物学的角度,提供了对胃肠系统和肺NENs当前的理解全面概述。研究NENs通常被分隔开来到肿瘤起源的部位,而跨领域的视角可能能够促进研究中的进展,从而加速其他领域的研究。因此,我们的目标是强调对于不同器官中出现的NENs的共性和差异的更好理解,可能更有效地为临床研究界定治疗靶点,并最终优化患者护理。 © 2022年 Springer Nature有限公司。
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