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MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION
2022 Sep 29

TetsuyaMizutani,Mako...
Inhibition of YAP/TAZ-TEAD activity induces cytotrophoblast differentiation into syncytiotrophoblast in human trophoblast.
MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION
在胎盘形成过程中,胎盘细胞核合体滋养层细胞(CT细胞)分化成细胞质合体滋养层细胞(ST细胞)和绒外滋养层细胞(EVT细胞)。在胎盘中,通过转录复合物Yes-相关蛋白(YAP)/带有PDZ结合基序的转录增强因子(TAZ)-TEA结构域转录因子(TEAD)(YAP/TAZ-TEAD)活性,通过Hippo信号通路调节各种基因的表达。YAP/TAZ-TEAD活性受多种因素和信号的控制,如cAMP信号。cAMP信号被认为参与调节滋养层功能,但仍未完全了解。在这里,我们展示了人绒毛膜癌细胞系(BeWo细胞)中的cAMP刺激改变了YAP/TAZ-TEAD的表达和活性。YAP/TAZ-TEAD活性的抑制在未经cAMP刺激的情况下诱导了ST特异基因的表达,并且构成性活跃的YAP转导,即YAP-5SA,以TEAD依赖方式导致8Br-cAMP诱导的ST特异基因表达的抑制。我们还使用人胎盘干细胞(TS细胞)研究了YAP/TAZ-TEAD在维持CT细胞及其分化为ST和EVT细胞中的作用。YAP/TAZ-TEAD活性参与维持TS细胞的干性。诱导或抑制YAP/TAZ-TEAD活性会导致ST特异基因表达的显著变化。使用自发分化为类似ST的细胞的原始CT细胞研究了YAP-5SA转导的效应,并发现ST特异基因的表达被抑制。这些结果表明,在CT细胞分化为ST细胞的过程中,无论是否经过cAMP刺激,抑制YAP/TAZ-TEAD活性是必不可少的。© The Author(s) 2022. Published by Oxford University Press on behalf of European Society of Human Reproduction and Embryology. All rights reserved. For permissions, please email: journals.permissions@oup.com.
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MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION
2023 Feb 23

HarrietCFitzgerald,A...
Basolateral secretions of human endometrial epithelial organoids impact stromal cell decidualization.
MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION
子宫腺和它们所分泌的物质,影响子宫的受精卵着床、基质细胞间皮化及胎盘发育等过程。月经周期中对腺体功能的变化主要受雌激素(E2)和孕激素(P4)的调控,同时也受到来自基质外源性因素的影响。利用人类子宫内膜上皮器官体系,转录组和蛋白质组分析确定了器官体系对于甾体激素和PGE2前列腺素的不同反应。值得注意的是,P4和PGE2调节了器官体系腺体细胞末端的蛋白质分泌,特别是卵巢素Cystatin C(CST3)、血清素成员A 3(SERPINA3)和Stanniocalcin 1(STC1)。其中,CST3对于甾体激素和PGE2在体外的基质细胞间皮化反应产生了抑制作用,但SERPINA3和STC1则没有。这些研究结果表明了子宫腺体分泌的因素会影响基质细胞的间皮化作用,对于女性的怀孕及生育能力具有重要的意义。©作者(S)2023年。由牛津大学出版社代表欧洲人类生殖和胚胎学协会出版。版权所有。如需授权,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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Molecular Informatics
2022 Nov 21

ÜlküÜnsal,AliCüvitoğ...
NMSDR: Drug repurposing approach based on transcriptome data and network module similarity.
Molecular Informatics
计算药物再利用的目的是通过分析市场上已批准的药物来发现新的治疗方案。该研究提出了一种基于网络理论的药物再利用方法,提出了先前批准的化合物,可以通过改变致病蛋白的表达谱来实现。该提出的方法的新颖之处在于探索疾病致病网络和化合物特异性交互网络之间的模块相似性;因此,这种关联导致更加现实地对分子细胞响应进行系统生物学水平的建模。通过考虑网络间的所有蛋白质对,通过计算疾病网络和每个化合物特异性网络的最短路径相似度来计算疾病网络和每个化合物特异性网络之间的重叠。更高的相似性得分表示化合物的潜力显著。该方法已经在乳腺癌和肺癌方面得到了验证。当所有化合物按其归一化相似分数排序时,分别建议36种和16种药物作为乳腺癌和肺癌的新候选药物。有关候选化合物的文献调查显示,我们的一些预测已在治疗两种癌症类型的II / III期试验中得到了临床研究。总之,所提出的方法通过在网络级别的数据表示中建模生物化学细胞反应,提供了有希望的初步结果。© 2023 Wiley-VCH GmbH.
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MOLECULAR CELL
2023 Jan 31

MartinGolkowski,Andr...
Multiplexed kinase interactome profiling quantifies cellular network activity and plasticity.
MOLECULAR CELL
蛋白质相互作用(PPI)网络的动态变化是所有生理细胞功能的基础并推动着严重的人类疾病。因此,对PPI网络进行配置能够提供关键的疾病机制洞见并确定新的药物靶点。激酶是许多PPI网络中的调节节点;但是,缺乏系统研究激酶相互作用组学动态的简单方法。我们描述了kinobead竞争和相关分析(kiCCA),这是一种基于定量质谱的化学蛋白质组学方法,可以快速高度多重化的配置内源性激酶相互作用组学。使用kiCCA,在18个不同的癌症细胞系中鉴定了238种激酶的1,154个PPI,并量化了与癌症类型、可塑性和信号状态相关的依赖于上下文的激酶相互作用组学变化,从而组装了一个广泛的细胞信号研究的知识库。我们发现了药物靶点候选者,包括促进癌细胞上皮间充质可塑性和药物耐受性的内吞适配器相关激酶(AAK1)复合物。我们的数据证明了激酶相互作用组学动态对于健康和疾病细胞信号的重要性。版权所有 © 2023 Elsevier Inc.。保留所有权利。
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MOLECULAR ASPECTS OF MEDICINE
2022 Dec

NataliaĆwilichowska,...
Diagnostic and therapeutic potential of protease inhibition.
MOLECULAR ASPECTS OF MEDICINE
蛋白酶是一种水解蛋白质和肽键的酶,因此它们控制几乎所有的生物过程。我们对蛋白酶功能的理解已经从非选择性的消化酶发展到高度专业化的分子剪刀,通过有限水解调控复杂的信号网络。蛋白酶的催化活性在多个层面上被严密地调节,从基因表达、运输和成熟到翻译后修饰。但是,当这种微妙的平衡被打破时,许多疾病就会产生,包括癌症、炎症性疾病、糖尿病和神经退行性疾病。对蛋白酶在病理生理学中的作用的新认识表明,这些酶代表了开发治疗性抑制剂和化学探针以可视化其冗余活性的优秀的分子靶点。最近,已经开发了许多平台技术来鉴定和优化蛋白酶底物和抑制剂,并以此为基础进一步开发化学探针和治疗药物。由于取得了巨大的成功,蛋白酶在治疗和诊断方面的临床潜力正在迅速增长,而且远未全部探索。因此,可以选择性地靶向异常的蛋白酶活性的小分子正在疾病细胞中出现。在本综述中,我们描述了蛋白酶药物设计以及小分子活性基探针的现代趋势,以在临床环境中可视化选择的蛋白酶。 版权所有©2022作者。由安徽省教育厅资助。 上海中医药大学.
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MOLECULAR ASPECTS OF MEDICINE
2022 Nov 28

DanielleJBeetler,Dam...
Extracellular vesicles as personalized medicine.
MOLECULAR ASPECTS OF MEDICINE
细胞外囊泡(EVs)由身体中所有细胞释放,形成了一个重要的细胞间交流网络,对健康和疾病的贡献至关重要。EVs的内容是细胞来源特异性的,将在受体细胞中引起不同的信号反应。EVs的特异性以及它们在液体活检中易于获取的液体空间中的积累使它们成为潜在疾病生物标记物和治疗药物。EVs作为有利(治疗)或不利(病理)的信使的二元性是上下文相关的,仍需在稳态和各种疾病状态下充分确定。本综述介绍了EVs作为生物标志物、药物传递载体和再生治疗的应用,重点介绍了涉及病毒感染、癌症和神经系统疾病的例子。越来越多的证据表明,基于个体病人和疾病特征提供个性化治疗的兴趣不断增长。由于EVs的多样性和多功能性,越来越多的证据表明EV生物标志物和治疗方法是个性化医学理想的选择。
版权所有 © 2022 The Authors. 由Elsevier Ltd.出版。保留所有权利。
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MOLECULAR ASPECTS OF MEDICINE
2022 Dec 27

MarissaNRusso,Lauren...
Extracellular vesicles in the glioblastoma microenvironment: A diagnostic and therapeutic perspective.
MOLECULAR ASPECTS OF MEDICINE
恶性胶质瘤(GBM)是胶质瘤中最恶性的形式,也是成人最常见和致命的原发性脑肿瘤。传统的癌症治疗对GBM效果有限。GBM细胞响应并适应周围被称为肿瘤微环境(TME)的脑实质来促进肿瘤保存。在特定的TME中,有三种特别令人感兴趣的GBM生物学:基质细胞周围区、室管膜下神经生源性区和免疫微环境。GBM细胞和TME细胞呈相互反馈,导致肿瘤维持。这些细胞之间进行通信的一种方式是通过细胞外囊泡。这些囊泡包括有能力携带恶性和非恶性载荷的外泌体和微囊泡,例如miRNA、RNA、蛋白质、脂类和DNA。在本综述中,我们将讨论细胞外囊泡这一兴起的话题,以及它们作为GBM诊断和可靶向载体的新颖性。版权所有©2022 Elsevier Ltd.
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MINERVA MEDICA
2022 Apr

FabrizioTabbò,MarcoD...
Strengths and pitfalls of brigatinib in non-small cell lung cancer patients' management.
MINERVA MEDICA
晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者的治疗方式在过去的10年中发生了巨大的变化,这主要得益于多种靶向肿瘤驱动基因的酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的出现和发展。其中,携带导致3-5%所有晚期NSCLC的间变性淋巴瘤激酶(ALK)易位的患者,其临床结果得到了显著的改善,将5年的生命预期从不到5%增加到50%。事实上,多种ALK抑制剂(ALKi)已进入ALK +患者的治疗算法,扩大了他们的治疗选择机会。值得注意的是,在不久的将来,我们可以利用多达6种不同分子的一线治疗方法(克唑替尼,赛松尼,阿来替尼,布里加替尼,加上恩沙替尼和洛拉替尼)。在可用的ALKi中,第二代(2G)抑制剂布里加替尼在这种情况下表现出显著的活性,同时还可以治疗中枢神经系统(CNS)疾病,并具有良好的安全性,支持其作为一线治疗在 ALTA-1L试验结果的基础上批准。布里加替尼具有独特的酶靶点配置,是ALK靶向旅程中的有价值的机会,尽管需要平衡其安全性。这些患者的治疗选择丰富,提出了重要的问题。在没有直接效果比较的情况下,很难定义最佳方法,并且更难确定正确的管理顺序,以便为ALK +肺癌患者提供最佳治疗机会。在如此多样化的选择中,我们回顾了布里加替尼的临床前和临床疗效数据,以及其药理和安全性,以及在ALK + NSCLC情况下的实际和潜在的未来应用。通过创建与其他可用2G ALKi的间接比较的虚假练习,我们希望总结出选择正确时间的最佳药物所需的知识。此外,我们还回顾了可用的分子耐药机制数据和推测的治疗应用程序,例如ROS1 + NSCLC患者或进展至奥西替尼的EGFR +患者。
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MINERVA MEDICA
2022 Jun

Namood-ESahar,Javeri...
Dysregulated expression of suppressor loop of circadian rhythm genes in colorectal cancer pathogenesis.
MINERVA MEDICA
结直肠癌(CRC)是一种异质性疾病,WNT和TGFβ介导的致癌途径的激活在该病理中经常发生。然而,迄今为止,关于昼夜节律时钟与CRC病因和分层的关联的报道有限。本研究旨在评估独立的CRC队列中重要昼夜节律标记物PER2、PER3和NR1D1的表达及其与CRC相关途径的关联。利用现有的GEO(GSE39582)和TCGA数据集进行基因表达分析。采用定量实时聚合酶链反应法量化PER2、PER3和NR1D1在FFPE(福尔马林固定石蜡嵌入)CRC组织样本中的表达水平。此外,还评估了WNT和TGFβ途径激活的肿瘤中昼夜节律标记物的富集。在GEO(P<0.0001)和TCGA结肠和直肠腺癌数据集(P<0.05)中,肿瘤与对照样本中PER3的显著下调。GEO数据集分析表明,结肠腺癌中PER2和NR1D1显著上调(P<0.01),并在FFPE验证队列中通过qRT-PCR在CRC肿瘤样本与对照组中得到确认。结肠腺癌中NR1D1的高表达与不良预后有关。相反,PER3在肿瘤中显著下调(P<0.001),并与高级CRC肿瘤相比低级肿瘤有关。WNT途径激活的肿瘤PER3显著降低,PER2略微上调(<0.0001)。有趣的是,PER3和NR1D1的差异表达与TGFβ1表达的肿瘤显著相关(P<0.0001)。此外,MYC扩增的肿瘤PER3水平下降。因此,CRC中PER3的低表达和NR1D1高表达患者的不良生存揭示了昼夜节律抑制循环中的基因在CRC中的失调,因此指出分离癌症中昼夜节律通路的重要性。
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MINERVA MEDICA
2022 Oct 18

SafouraSheikhRezaei,...
Risk stratification and long-term outcome of patients receiving in-hospital medical emergency team critical care: experience from Austria's largest medical center.
MINERVA MEDICA
我们旨在研究有或没有院内心脏停跳 (IHCA) 的医疗急救小组 (MET) 会诊住院患者长期生存的预测因素,该研究在奥地利最大的医疗中心回顾性分析了在 2014 年 1 月至 2020 年 3 月期间需要 MET 干预的患者数据。总共分析了 708 次 MET 呼叫。最短随访时间为 7 个月,最长为 6.2 年。主要的 MET 指征是循环衰竭 (63%),其次是呼吸衰竭 (27.1%) 和出血事件 (3.5%)。425 (60%) 患者经历了 IHCA 及随后的心肺复苏术 (CPR)。其中,274 (64%) 患者恢复自主循环 (ROSC),221 (52%) 存活了前 24 小时 (中位生存期:146 天),22.1% 存活了第一年。在调整潜在混杂因素后,年龄 (p<0.001)、ROSC 时间 (p<0.001)、非可电击性心律失常 (p=0.041)、慢性肾脏疾病 (CKD, p=0.041)、峰值乳酸水平 (p<0.001) 和 C-反应蛋白 (p=0.001) 与 IHCA 患者长期全因死亡率相关。 被减少到 IHCA 之外的原因的 283 次 MET 呼叫 (40%) 与更好的 24 小时 (93%) 和一年存活率 (61.8%) 相关。除年龄 (p<0.001) 外,MET 患者未出现 IHCA 与死亡率相关的主要危险因素包括合并疾病,如慢性阻塞性肺部疾病 (COPD, p=0.008)、CKD (p=0.001)、肺动脉高压/慢性血栓性肺动脉高压 (PH/CTEPH, p=0.024) 和癌症 (p=0.040)。触发 MET 呼叫的患者有更高的死亡率,特别是那些有 IHCA 的患者。死亡率的预测因素包括年龄、合并疾病和与心脏骤停相关的参数。更好地表征 MET 呼叫人群及其结果可能有助于改进临床决策。
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