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Frontiers in Genetics
2023

PenggangSun,XinyuWan...
Development and validation of a pyroptosis-related genes signature for risk stratification in gliomas.
Frontiers in Genetics
背景:胶质瘤是一种高度异质性的疾病,给预后预测带来了挑战。通过燃气素(GSDM)介导的程序性细胞死亡,热死亡区别于细胞肿胀和炎症因子的释放。热死亡在多种肿瘤细胞(包括胶质瘤)中发生。然而,与胶质瘤预后相关的热死亡相关基因(PRGs)的价值仍有待进一步澄清。
方法:本研究从TCGA和CGGA数据库获取了胶质瘤患者的mRNA表达谱和临床数据,并从分子签名数据库和GeneCards获得了118个PRGs。然后,进行共识聚类分析来聚类胶质瘤患者。使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)Cox回归模型建立多基因签名。通过基因敲除和Western印迹检验实现与热死亡相关基因GSDMD的功能验证。此外,通过“gsva” R包分析了两个不同风险组之间的免疫浸润状态。
结果:我们的结果表明,在TCGA队列中,大多数PRGs(82.2%)在低级别胶质瘤(LGG)和胶质母细胞瘤(GBM)之间有差异表达。在单变量Cox回归分析中,八十三个PRGs与总生存率(OS)相关。建立了一个五基因签名来将患者分为两个风险组。与低风险组的患者相比,高风险组的患者OS明显较短(p <0.001)。此外,我们发现高风险组显示出更高的免疫细胞浸润得分和免疫相关功能。风险评分是OS的独立预测因子(HR> 1,p <0.001)。此外,GSDMD的敲除降低了IL-1β和裂解的caspase-1的表达。
结论:我们的研究构建了一个新的PRGs标志,可用于预测胶质瘤患者的预后。针对热死亡可能成为胶质瘤的潜在治疗策略。版权所有©2023年Sun,Wang,Zhong,Yu,Xuan,Xu,Song,Yang,Wang,Liu,Meng和Cai。
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Frontiers in Genetics
2023

RenboTan,FeilongWang...
Neural functions in cancer: Data analyses and database construction.
Frontiers in Genetics
最近的研究揭示了神经功能可能涉及癌症发展的各个方面,作为连接微环境应激、细胞内亚系统活动和细胞生存的桥梁。揭示神经系统扮演的功能角色可以提供系统级了解癌症生物学的缺失环节。然而,现有信息高度碎片化,分散在文献和互联网数据库中,使癌症研究人员难以使用。我们对TCGA癌症组织和GTEx健康器官组织的转录组数据进行计算分析,旨在展示神经基因的功能角色可以如何推导以及它们与不同阶段的26种癌症类型的非神经功能相关联。做出了几个新发现,包括:i) 特定神经基因的表达能够预测癌症患者的预后;ii)癌症转移往往涉及特定的神经功能;iii)低生存率的癌症涉及更多神经相互作用,而高生存率的癌症则涉及更少;iv)更恶性的癌症涉及更复杂的神经功能;和v)神经功能可能被诱导起来缓解压力并帮助相关癌细胞生存。开发了一个名为NGC的数据库,用于组织这些推导的神经功能和相关性,以及从公共数据库收集的基因表达和功能注释,旨在提供一个集成的公开信息资源,使癌症研究人员能够充分利用其研究中的相关信息,并通过NGC提供的工具进行方便研究。版权 © 2023 Tan,Wang,Zhou,Huang,An和Xu。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Feb 24

FareedKhawaja,Marily...
COVID-19 Vaccination in Patients With Cancer and Recipients of Cellular Therapy.
Cellular & Molecular Immunology
COVID-19因患者体内免疫系统受损而继续不成比例地影响着癌症患者。缓解COVID-19对癌症患者的影响的策略包括接种疫苗,其已证明在一定程度上可提供保护,至少可防止严重并发症如呼吸功能衰竭和死亡,并存在一定安全性问题。在这篇叙述性评论文章中,我们讨论了目前在美国可用的COVID-19疫苗、已发表的癌症患者接种疫苗的功效和安全性的数据、目前的接种指南以及未来的方向。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Feb 24

JuliaDai,MadeleineDu...
Cutaneous T-Cell Lymphoma: Current and Emerging Therapies.
Cellular & Molecular Immunology
皮肤T细胞淋巴瘤(CTCLs)是一种临床异质性T细胞淋巴瘤,在皮肤中发生,并以其临床和病理特征为特征。本综述将重点讨论霉菌病样肿块(MF)和塞扎里综合征(SS),它们分别代表CTCL病例的60%至80%和不到10%。虽然大多数MF患者出现斑块和板块,可以通过皮肤定向治疗成功治疗,但少数患者从早期进展到晚期或经历大细胞转化。SS被定义为红皮病,淋巴结肿大和超过1000个带有脑纹核的异常T细胞/uL。它的总体生存期为2.5年。鉴于CTCL的整体罕见性,值得注意的是,针对MF / SS的治疗临床试验已经成功完成,导致FDA批准了新颖治疗方法,总体反应率逐渐增加。本综述概述了目前多学科诊断和治疗MF / SS的方法,重点是将皮肤定向治疗与新兴的靶向和调查性全身治疗结合起来。将这些抗癌疗法与皮肤护理和细菌去除相结合对于综合管理至关重要。通过使用个性化医学方法包括新的联合策略,修复T辅助1细胞因子,并避免免疫抑制剂方案,可能可以治愈MF / SS患者。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Mar 03

XiaoWang,AoshuangZou...
High expression of HILPDA is an adverse prognostic prognostic factor in hepatocellular carcinoma.
Cellular & Molecular Immunology
肝细胞癌(LIHC)是一种恶性肿瘤,起源于肝细胞或肝内胆管上皮细胞,是全球常见的恶性肿瘤之一。更好地识别肝癌生物标志物已成为当前的挑战之一。虽然在各种人类实体癌症中,低氧诱导脂滴相关蛋白(HILPDA)已被报道与肿瘤进展关联,但在肝细胞癌领域中很少报道;因此,本文利用TCGA的RNA测序数据分析HILPDA和差异表达基因(DEG)的表达。此外,通过GO / KEGG,GSEA,免疫细胞浸润分析和蛋白质相互作用网络对HILPDA相关DEG的功能富集分析进行了研究。通过Kaplan-Meier Cox回归和预后数表模型计算了HILPDA在LIHC中的临床意义。使用R软件包分析联合研究。因此,与正常样品相比,HILPDA在包括LIHC在内的各种恶性肿瘤中高度表达,并且高表达HILPDA与不良预后有关(P <0.05)。Cox回归分析显示高HILPDA是一种独立的预后因素;年龄和细胞遗传风险被包括在预测数表预后模型中。共鉴定了1294个DEGs,其中1169个基因表达上调,125个基因表达下调。总之,HILPDA的高表达是LIHC不良结局的潜在生物标志物。 版权所有© 2023作者。 Wolters Kluwer Health,Inc. 发布。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Mar 02

HaneeshJasuja,Sharad...
Interstitial fluid flow contributes to prostate cancer invasion and migration to bone: study conducted using a novel horizontal flow bioreactor.
Cellular & Molecular Immunology
前列腺癌骨转移是导致美国男性癌症相关死亡的主要原因,会对骨骼组织造成严重伤害。由于药物治疗选择有限,导致生存率低,处理晚期的前列腺癌通常具有挑战性。目前对于细胞外液流生物力学刺激对前列腺癌细胞生长和迁移影响机制的认识非常匮乏。为此,我们设计了一个新颖的生物反应器系统,以展示细胞外液流对前列腺癌细胞在转移至骨骼过程中的迁移影响。首先,我们证明高流速会通过TGF-β1信号途径诱导PC3细胞凋亡,因此,生理流速条件最有利于细胞生长。接下来,为了解细胞外液流在前列腺癌细胞迁移中的作用,我们在静态和动态条件下评估了细胞在有无骨的情况下的迁移速率。我们报告称,在静态和动态条件下,CXCR4水平没有显著变化,表明CXCR4激活不受流动条件影响,而是受骨骼的影响。骨骼上调节的CXCR4水平导致MMP-9水平增加,从而在存在骨时导致高迁移速率。此外,流动条件下αvβ3整合素水平上调,对PC3细胞的迁移速率总体有所增加。总之,本研究展示了细胞外液流在前列腺癌入侵中的潜在作用。了解细胞外液流在促进前列腺癌细胞进展中的关键作用将有助于改善晚期前列腺癌的现有疗法,并为患者提供改进的治疗选项。采用署名 CC BY 许可证。
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CANCER RESEARCH
2023 Mar 02

DanieleVFTauriello
Targeting CAFs to Improve Anti-PD-1 Checkpoint Immunotherapy.
CANCER RESEARCH
肿瘤微环境是一个复杂的生态系统,推动着癌症的进展并抑制着免疫力。虽然免疫检查点抑制剂在部分患者中表现出强大的潜力,但对抑制机制的更好理解可能会激发提高免疫治疗效果的方法。本期《癌症研究》中的一项新研究集中于针对前期胃癌模型中的癌相关成纤维细胞,旨在重新平衡抗癌免疫力并加强治疗对检查点阻滞抗体的反应,同时也探讨了多靶向酪氨酸激酶抑制剂在胃肠道癌症治疗中的潜力。请参阅Akiyama等人的相关文章,第753页。©2023美国癌症研究协会。
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CANCER RESEARCH
2023 Mar 02

SangJunYoon,JosephAC...
Comprehensive Metabolic Tracing Reveals the Origin and Catabolism of Cysteine in Mammalian Tissues and Tumors.
CANCER RESEARCH
半胱氨酸在细胞生物合成、酶催化和氧化还原代谢中发挥着重要作用。细胞内半胱氨酸库可以通过半胱氨酸的摄取或通过丝氨酸和同型半胱氨酸的新生合成来维持。在肿瘤形成期间,需要半胱氨酸来生成谷胱甘肽以应对氧化应激。虽然培养细胞已被证明对来自外源性半胱氨酸的增殖和存活高度依赖,但各种组织在体内的半胱氨酸获取和利用方式尚未得到表征。我们使用稳定同位素13C1-丝氨酸和13C6-半胱氨酸追踪全面探究了小鼠正常组织和由它们产生的癌症中的半胱氨酸代谢。在正常肝脏和胰腺中,新生半胱氨酸合成最高,而在肺组织中缺乏合成,而在肿瘤形成期间,半胱氨酸合成要么不活跃,要么被下调。相比之下,半胱氨酸的摄取和代谢成为正常组织和肿瘤的普遍特征。然而,从半胱氨酸中生成谷胱甘肽的标记在不同的肿瘤类型中有明显差异。因此,半胱氨酸是肿瘤中半胱氨酸库的主要贡献者,并且谷胱甘肽代谢在不同的肿瘤类型中具有差异。
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CANCER GENE THERAPY
2023 Jan 30

QuocManhNguyen,Pierr...
Suicide gene strategies applied in ovarian cancer studies.
CANCER GENE THERAPY
卵巢癌是发达国家妇女中最致命的妇科恶性肿瘤。尽管近年来有很多创新,但5年生存率的提高还不够,此类疾病的治疗仍然是一个挑战。事实上,大多数患者经历了复发或耐药病情,证实了创新治疗的必要性。在研究的各种策略中,基因递送技术方面近期的进展使得基因治疗,包括自杀基因策略成为治疗卵巢癌的潜在替代方案。各种自杀基因候选者能够通过酶编码、毒素或前凋亡基因将癌细胞凋亡直接促进或在临床管理期间通过前药静脉注射间接减轻器官不适。本文的目的是提供基于治疗策略的不同自杀基因概述,用于将这些转基因具体递送到恶性细胞的载体以及将这些基因与各种治疗方案结合使用。 ©2023版权所有。作者在Springer Nature America, Inc.独家许可下发布该文章。
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Experimental Hematology & Oncology
2022

HafsanHafsan,MarwanM...
Dietary Thymol Improved Growth, Body Composition, Digestive Enzyme Activities, Hematology, Immunity, Antioxidant Defense, and Resistance to Streptococcus iniae in the Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss).
Experimental Hematology & Oncology
在这项研究中,使用食物中不同水平的百里香酚(TYM)(0, 1, 1.5, 2和2.5 g/kg食物)来评估其对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)的生长、消化性能、免疫力以及对Streptococcus iniae引起的感染的抵抗力的影响。共有450条鱼(35.8 ± 4.4 g;平均值±标准差)分配到15个水槽中(每个水槽30条鱼),并被喂养TYM 60天。饲喂期结束后,与其它饲料组相比,饲喂1.5-2.5 g TYM的鱼显示出更好的生长、更高的消化酶活性和身体蛋白质含量(P < 0.05)。回归分析表明,生长参数与饲料TYM水平之间存在多项式关系。基于不同的生长参数,FCR的最佳饲料TYM水平为1.89%。与其它饲料组相比,饲喂1.5-2.5 g TYM的鱼,肝脏抗氧化酶活性(超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)和过氧化氢酶(CAT))和血液中的免疫成分(替代补体活性(C3)、总免疫球蛋白(Ig)、溶菌酶活性、细菌杀伤活性和总蛋白质)以及粘液中的乳碱性磷酸酶活性(ALP)、蛋白酶活性、溶菌酶活性、细菌杀伤活性和总蛋白质)明显提高(P < 0.05)。与其它实验组相比,饲喂2-2.5 g TYM显著降低鱼体中的丙二醛(MDA)水平(P < 0.05)。此外,使用1.5-2.5 g TYM饲料水平升调了免疫相关基因(C3,Lyz和Ig)的表达(P < 0.05)。相反,炎症基因肿瘤坏死因子(TNF-α)和白细胞介素-8(IL-8)的表达在回应2-2.5 g TYM时明显下调(P < 0.05)。饲喂TYM对鱼的血液学也产生了影响,在饲喂2-2.5 g TYM的鱼中,红细胞平均血红蛋白浓度(MCHC)、血红蛋白(Hb)、红细胞(RBC)、血细胞比容(Hct)和白细胞(WBC)的值显著增加(P < 0.05)。此外,随着TYM饲喂量的增加,平均红细胞体积(MCV)也显著下降(P < 0.05)。在受挑战的Streptococcus iniae感染后,与其它饲料组相比,饲喂2-2.5 g TYM的鱼存活率显著提高(P < 0.05)。本研究的结果表明,虹鳟饲料中的TYM可以改善鱼类的生长和免疫能力,并增加鱼类对Streptococcus iniae感染的抵抗力。本研究的结果推荐饲喂鱼类2-2.5 g TYM水平的最佳方法。Copyright © 2022 Hafsan Hafsan等。
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