撤回声明：“下调长链非编码RNA LINC00313通过抑制ALX4甲基化抑制退化成纤维细胞的转化、侵袭和迁移”，作者为Xingzhi Zhao和Xinhua Hu，发表于2019年细胞生理学杂志20992-21004年。以上文章于2019年5月15日在线发表在Wiley Online Library（https://doi.org/10.1002/jcp.28703），经过作者、该杂志的主编Prof Dr Gregg Fields和Wiley Periodicals LLC的协议，已被撤回。撤回原因是作者指出在研究过程中出现了无意中的错误，实验结果无法被验证。基于第三方的指控，调查揭示了在不同的科学背景下，实验数据的重复和图像元素已经发表在其他地方。因此，本文的结论被认为是无效的。© 2023 Wiley Periodicals LLC。

乳腺癌的转移通常导致大多数临床患者死亡。因此，在乳腺癌的早期阶段诊断转移对于改善预后至关重要。我们观察到，Dicer蛋白在高侵袭性乳腺癌细胞中明显降低，通常与不良临床结果相关。因此，我们的目标是阐明Dicer在乳腺癌中的分子调节机制，以提供一种新的治疗靶点。在本研究中，我们发现Dicer表达与转移和侵袭相关，但不影响乳腺癌细胞的稳定性。重要的是，我们确定了Dicer蛋白降解的调节机制，即伴随体介导的自噬（CMA）介导的降解，这是减少Dicer蛋白表达并导致癌症转移的主要机制。我们发现，热休克同源物71-kDa蛋白（Hsc70），作为CMA相关因子，与Dicer上的CMA靶向基序I333A/K334A交互，通过CMA促进降解。总之，我们的发现提示Dicer与癌症转移高度相关，揭示了CMA介导Dicer降解在乳腺癌中的促进肿瘤作用。©2023 Wiley Periodicals LLC。

肥胖是乳腺癌形成的公认风险因素，与升高的死亡率和不良预后有关。肥胖介导的炎症微环境有利于肿瘤的恶性进展。但是，详细的分子机制仍需进一步明确。我们发现，饮食诱导肥胖的小鼠乳腺癌细胞展示出增加的生长、侵袭和干性能力。转录组分析揭示，肥胖相关乳腺癌细胞中白细胞介素33 (IL33) 信号通路相关基因的表达升高。重要的是，IL33表达与是/否相关蛋白 (YAP) 签名显著相关，且IL33受YAP转录调控。抑制IL33可减少肿瘤的迁移和侵袭，而加入IL33则激活核因子 (NF)-κB信号通路并恢复在YAP沉默细胞中的肿瘤活动性。此外，抑制YAP可减弱伴随肥胖的免疫抑制并伴随着IL33表达的减弱。临床分析表明，IL33表达与巨噬细胞和调节性T细胞浸润明显相关。这些发现揭示了YAP/IL33轴在促进肥胖相关乳腺癌恶性进展和免疫抑制中的关键作用。 © 2023 Wiley Periodicals LLC.

直肠癌在磁共振成像(MR)图像中的分割可以帮助医生确定直肠癌的程度和严重程度，因此直肠肿瘤的分割对于改善直肠癌诊断的准确性至关重要。然而，由于直肠肿瘤的形状存在显著的变异性，并且肿瘤和周围组织难以区分，因此准确地分割直肠癌的区域仍然是一项具有挑战性的任务。此外，在直肠肿瘤分割的早期研究中，大多数深度学习方法都基于卷积神经网络(CNN)，传统的CNN具有较小的感受野，只能捕获局部信息而忽略图像的全局信息。然而，全局信息在直肠肿瘤分割中发挥着至关重要的作用，因此传统的基于CNN的方法通常无法实现令人满意的分割结果。在本文中，我们提出了一个编码器-解码器网络，名为“双并行网络(DuPNet)”，它融合了转换器和传统的CNN，以捕获全局和局部信息。同时，为了在编码器和解码器之间的跳过连接中捕获不同尺度的特征，并避免精度损失和参数减少，我们设计了一个特征自适应块(FAB)。此外，为了有效利用直肠肿瘤形状的先验信息，我们设计了一个高斯混合先验，并将其嵌入到转换器的自注意机制中，从而实现了稳健的特征表示和准确的分割结果。我们进行了广泛的消融实验证明了我们提出的双并行编码器、FAB和高斯混合先验在山西省癌症医院数据集上的有效性。在与最先进的方法的实验比较中，我们的方法在测试集上实现了89.34%的平均交叉点联合(MIoU)。此外，我们评估了我们的方法在新华医院数据集上的泛化能力，有希望的结果验证了我们方法的优越性。版权所有 © 2023 Elsevier Inc.。保留所有权利。

临床试验对新药研发过程至关重要。由于临床试验需要大量时间和金钱的投入，试验设计者在设计试验前仔细调查试验环境至关重要。我们利用ClinicalTrials.gov的试验文档来了解成功和不成功的癌症药物试验的共同特点，以提供关于要学习和避免什么的见解。在这项研究中，我们首先将癌症药物试验在计算机中分类为成功和不成功的案例，然后利用自然语言处理从试验文档中提取符合条件的标准信息。为了提供可解释且可能可修改的新试验设计建议，我们使用对比挖掘法来发现在成功（完成并进入下一阶段）和不成功（暂停、撤回或终止）组之间的流行度差异显著的高度对比模式。我们的方法识别出了由九种主要癌症的药物类别、符合条件的标准、研究组织和研究设计的组合构成的对比模式。除了对挖掘出的对比模式进行定性验证的文献综述外，我们还发现，基于前200个对比模式作为特征表示的对比模式分类器，在我们的实验中可以实现约80%的F1分数，覆盖了十种癌症中的八种。总之，与ClinicalTrials.gov的现代化努力保持一致，我们的研究表明，了解成功和不成功的癌症试验的对比特征可能为试验研究员的决策过程提供见解，从而促进改善癌症药物试验的设计。版权所有©2023作者。 Elsevier Inc.保留所有权利。

报道Rab37介导的组织金属蛋白酶抑制因子1（TIMP1）的胞外分泌，TIMP1是一种炎症细胞因子，并受血清耗竭条件的影响，可抑制肺癌细胞转移。此外，饥饿也是自噬活性的一种刺激。我们在此揭示饥饿激活Rab37并诱导自噬的过程。我们采用过表达/敲低系统来确定自噬和Rab37在体内外的关系。自噬活性通过免疫印迹、透射电镜、自噬体净化和共聚焦显微镜下的免疫荧光法进行检测。采用肺到肺转移小鼠模型来阐明自噬和Rab37在肺癌中的作用。分析了临床肺癌患者标本和在线大型数据库。 我们首先证明活性Rab37可以增加LC3-II蛋白水平（自噬体标记物）和TIMP1分泌。因此，Rab37基因表达的沉默减轻了Rab37和LC3-II水平以及TIMP1分泌，并且在此类条件下，诱导自噬不能增加TIMP1的胞外分泌。此外，在低活性Rab37（Q89L）携带的肺癌细胞中沉默Atg5或Atg7基因会导致自噬活性和TIMP1分泌的降低。在肺到肺转移小鼠模型中，amiodarone诱导的自噬伴随TIMP1表达的增加，导致肿瘤结节和癌细胞转移的减少。沉默Atg5或Atg7基因会逆转这些现象。值得注意的是，单独增加自噬活性在Rab37或Sec22b沉默条件下对TIMP1的分泌没有影响。我们进一步检测了LC3与Rab37或TIMP1的共定位，鉴定了携带活性Rab37基因的肺癌细胞中的Rab37和Sec22b蛋白质在纯化的自噬体中的存在，并确认这些蛋白质参与TIMP1的分泌。我们发现，在肿瘤中的自噬活性显著低于非肿瘤部分，并与整体肺癌患者的生存率有关。 我们首次报道了自噬在Rab37依赖的方式中促进TIMP1分泌和肺癌细胞转移的作用，这一现象在肺到肺小鼠模型中也得到了证实。©2022.作者（们）。

顺铂基化疗是膀胱癌治疗的一线疗法。但是，顺铂诱导了与NF-κB和癌性消瘦相关的肌肉消耗。HOTAIR是一个致癌性长链非编码RNA（lncRNA），在不同癌症中促进癌症进展。HOTAIR与NF-κB之间的相互作用已有文献证明。前胸腺素α（ProT）在癌症进展和炎症中起重要作用。然而，HOTAIR、ProT和顺铂诱导的癌性消瘦之间的潜在联系尚未探索。在这里，我们调查了HOTAIR在顺铂诱导的癌性消瘦中的贡献，并分析了涉及表皮生长因子受体（EGFR）、ProT、NF-κB和HOTAIR的潜在信号级联。使用RT-qPCR检测了膀胱癌患者和膀胱癌细胞系的肿瘤组织中ProT和HOTAIR转录本的表达及其相关性。然后，通过免疫印迹分析人膀胱癌细胞中的磷酸化EGFR、EGFR、磷酸化NF-κB和NF-κB水平，治疗顺铂。还通过RT-qPCR评估顺铂处理的细胞中HOTAIR的表达。利用药物抑制剂和过表达和敲低方法解密信号通路。小鼠C2C12肌细胞生长（in vitro）用作肌肉萎缩模型。同种小鼠MBT-2膀胱肿瘤用于研究小鼠Hotair在顺铂诱导的癌性消瘦中的作用。ProT和HOTAIR的表达在膀胱肿瘤中高于正常相邻组织。在临床膀胱癌肿瘤和膀胱癌细胞系中，ProT和HOTAIR表达呈正相关。顺铂治疗增加了膀胱癌细胞中EGFR和NF-κB的活化，并上调了ProT和HOTAIR的表达。ProT过表达增加，ProT敲低减少HOTAIR的表达。值得注意的是，EGFR抑制剂或ProT敲低消除了顺铂诱导的HOTAIR上调。NF-κB抑制剂降低了ProT诱导的HOTAIR过表达。HOTAIR过表达增强，而敲低减少了细胞增殖、癌症相关的促炎性细胞因子表达和肌肉萎缩。在承受顺铂治疗的Hotair敲低膀胱肿瘤的小鼠中，消瘦相关症状得到缓解。我们第一次证明了HOTAIR的重要作用，并确定了EGFR-ProT-NF-κB-HOTAIR信号轴在顺铂诱导的膀胱癌和可能的其他癌症中的缓解中的参与。我们的研究结果为该疾病提供了治疗靶点。 © 2022. 作者（S）。

在内皮细胞中，磷脂酶C (PLC) β1 激活的 Ca2+ 是控制血管生成信号通路的关键第二信使。PLCβ1 通过与称为转枝结合因子 X (TRAX) 的细胞内蛋白结合而失活。本研究证明了 Globo H 鞘氨醇脂 (GHCer) 与 TRAX 之间的特异性相互作用，从而突出通过 PLCβ1 激活控制血管生成的新方法。采用酶联免疫吸附法 (ELISA) 和 Biacore 分析 Globo 系列糖脂 (GSL)，包括 GHCer 和分期胚胎抗原-3 鞘氨醇脂 (SSEA3Cer)，它们与 TRAX 的结合。评估人脐静脉内皮细胞 (HUVECs) 中 GSL 的血管生成作用。采用分子动力学 (MD) 模拟研究 GSL 的构象及其与 TRAX 的分子相互作用。采用激光共聚焦显微镜的荧光共振能量转移 (FRET) 分析 HUVECs，并用于验证从 TRAX 中释放出的 PLCβ1。此外，通过在小鼠的皮下植入 Matrigel 塞子进行体内实验确认了含有 GHCer 的胞外囊泡 (EVs) 的血管生成活性。 ELISA 和 Biacore 分析的结果显示，重组 TRAX 与合成 GHCer 之间的稳定复合物的 KD 值为 40.9 nM。相反，缺少 GHCer 终端富糖残基的 SSEA3Cer 的结合亲和力降低了约 1000 倍。这些结果与它们在 HUVECs 中的血管生成作用一致。MD 模拟表明，TRAX 与 GHCer 的糖基部分在氨基酸 Q223、Q219、L142、S141 和 E216 处相互作用。在平衡时，稳定的复合物维持了 4.6 ± 1.3 个氢键。Q223A 和 Q219A 双重突变的 TRAX 在 MD 模拟和 Biacore 实验中失去了与 GHCer 相互作用的能力。将 GHCer 终端富糖残基去除成为 SSEA3Cer，进而导致在 MD 模拟中 H-键数目减少到 1.2 ± 1.0。这种特定的氢键是由富糖残基的存在或缺失而影响整个糖基构象的构象变化所导致的。此外，ELISA、Biacore 和细胞内 FRET 实验证实了 GHCer 与 PLCβ1 之间竞争 TRAX 结合的情况。此外，Matrigel 塞子实验表明，在含有肿瘤分泌的 EVs 或合成 GHCer 的塞子中，血管形成非常强，但在含有 SSEA3Cer 的塞子中则没有。FRET 分析还表明，来自 EVs 的 GHCer 扰乱了 TRAX 和 PLCβ1 在细胞中的共定位。 总的来说， GHCer 中的富糖残基决定了其与 TRAX 结合的糖基构象，从而释放 TRAX 隔离的 PLCβ1，在内皮细胞中引起 Ca2+ 动员，增强了肿瘤微环境中的血管生成。©2022。作者。

卵巢癌由于诊断晚和缺乏有效的有针对性治疗而成为妇科癌症中死亡率最高的一种。虽然癌细胞和其微环境之间相互作用的研究正在兴起，但卵巢癌如何触发信号与免疫细胞协同以促进转移仍然不为人们所知。本研究使用低侵袭性和高侵袭性卵巢癌细胞的微阵列和生物信息学分析揭示了多功能的基质蛋白periostin（POSTN）在高侵袭性细胞中表达升高。我们进行了无定形基质独立实验、蛋白质印迹、RNA干扰、共聚焦分析和中和抗体处理，以分析POSTN对肿瘤促进的影响和探索其潜在机制。我们进行了趋化性、流式细胞术和细胞因子阵列分析以分析POSTN在癌相关成纤维细胞（CAF）和巨噬细胞调控中的参与情况。我们使用Oncomine，商业卵巢癌cDNA和中国医科大学医院患者队列分析POSTN表达水平与临床特征之间的相关性。我们使用小鼠异种移植模型研究了POSTN对转移的影响。发现高侵袭性卵巢癌细胞中POSTN的表达升高。POSTN与整合素β3和整合素β5共定位重要，这对POSTN介导的ERK和NF-κB的活化至关重要。POSTN的外源表达增强了癌细胞的迁移和入侵（体外），同时降低了肿瘤的生长和转移（体内）。POSTN通过一种自分泌作用作用于癌细胞，激发肿瘤吸引和动员细胞因子，包括MIP-1β，MCP-1，TNFα和RANTES，从而增加了THP-1单核细胞的趋化性并导致它们向M2型巨噬细胞的极化（体外）。POSTN能够诱导卵巢癌细胞表达TGF-β2，以促进脂肪来源的基质细胞激活成α平滑肌肌动蛋白和成纤维细胞激活蛋白α表达的CAF样细胞。一致地，从POSTN过度表达的SKOV3衍生的转移性肿瘤中观察到了增加的CAF。在临床相关性方面，我们发现POSTN的表达与晚期疾病和患者总生存率不良呈正相关。本研究揭示了POSTN-整合素-NF-κB介导的信号传导及其参与增强M2型巨噬细胞和CAF的生长，这可能潜在地参与促进肿瘤生长。我们的结果表明，POSTN可以成为一个有用的预后标志和潜在的治疗靶点。© 2022. The Author(s).

过去十年间，对肿瘤微环境（TME）的广泛研究已经改变了癌症被视为以肿瘤细胞为中心的疾病的看法。肿瘤微环境尤其是所谓的“种子和土壤”理论已经成为癌症发展和治疗抗性的关键因素。TME主要包括肿瘤细胞、成纤维细胞等基质细胞、免疫细胞和其他非细胞组分。在TME中，这些成分之间的密切交流主要决定了肿瘤的命运。基质的关键作用尤其在肿瘤相关成纤维细胞（CAFs），其是TME中最常见的成分，已在肿瘤发生、进展、治疗反应和免疫方面发挥了重要作用。更好地理解 TME 的功能可以为肿瘤治疗提供新方向。在本次评论中，我们总结了对致瘤因素，尤其是 CAF 在癌症进展、耐药性和肿瘤免疫中新兴的认识，并侧重于它们在表观遗传调节中的功能。此外，将进一步讨论表观遗传调节在重塑TME中的重要性，以及表观治疗与免疫治疗之间协同作用的基本生物学原则。©2023年作者.