研究动态
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Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials
2022 Dec 09
TommasoClemente,Vinc...
Disseminated Mycobacterium chimaera infection favoring the development of Kaposi's sarcoma: a case report.
Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials
分散性分枝杆菌Chimaera感染是心胸外科手术后出现的新兴疾病,需要对异型表现进行怀疑。我们报告了一例74岁男性患者,患有原因不明的发热、双足紫色结节和开放性心脏手术史。影像检查显示主动脉生物瓣旁存在脓肿,但感染性心内膜炎筛查结果为阴性,发热不响应抗生素治疗。皮损活检显示为HHV8相关的卡波西肉瘤,因此进行了骨髓活检,并出现HHV8定位的证据。骨髓和尿液分枝杆菌培养结果显示为M. chimaera阳性,开始特定的抗微生物治疗,7周后发热消失。在出现心脏手术史的人群中,应始终将M.chimaera感染作为原因不明的发热的可能病因进行调查,即使血液分枝杆菌培养为阴性。不能排除分散性感染在诱导免疫抑制并导致其他机会性疾病(如卡波西肉瘤)的发生中的可能作用。©2022。作者(们)。
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2022 Oct 14
XuZhang,WenwenChen,D...
Circ_0003570 Suppresses the progression of hepatocellular carcinoma through miR-182-5p/STARD13 regulatory axis.
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新兴证据显示,循环RNA在各种疾病,包括癌症的发展和进展中发挥着重要的生物学效应。我们的研究旨在分析hsa-circ_0003570在肝细胞癌(HCC)发展中的分子生物学效应。功能实验结果表明,circ_0003570的敲低可诱导HCC细胞生长、迁移和侵袭,而circ_0003570的过表达则呈现相反的效应。在体内实验中,来自circ_过表达细胞的异种移植瘤体积和重量比对照组小。进一步的研究表明,circ_0003570可能通过与miR-182-5p竞争性结合,调节下游靶基因STARD13的抑制,从而发挥作为竞争性内源RNA的功能,这些被双荧光素酶报告试验和功能恢复试验所证实。总之,circ_0003570通过调节miR-182-5p/STARD13通路抑制了HCC的发展。©2022年作者或许可方。
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2022 Sep 19
ZiyangDi,SichengZhou...
Single-cell and WGCNA uncover a prognostic model and potential oncogenes in colorectal cancer.
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结直肠癌(CRC)是全球导致肿瘤相关死亡的主要原因之一。单细胞转录组测序(scRNA-seq)可以为每个细胞提供准确的基因表达数据。本研究通过对CRC样品的scRNA-seq和批量转录组测序数据进行分析,构建了一个新的预后模型,以期深入了解CRC。CRC scRNA-seq数据从GSE161277数据库中下载,CRC批量RNA-seq数据从TCGA和GSE17537数据库中下载。使用scRNA-seq数据中的FindNeighbors和FindClusters功能对细胞进行聚类。应用CIBERSORTx检测批量RNA-seq表达矩阵中细胞群的丰度。使用表达轮廓构建TCGA-CRC基因共表达网络的WGCNA。接下来,我们使用十倍交叉检验构建模型,并使用Nomogram评估模型的独立性以进行临床应用。最后,我们通过qPCR和免疫组织化学检测未报道的模型基因的表达情况。使用克隆形成实验和原位结直肠肿瘤模型来检测未报道的模型基因的调节作用。经过质量控制后,总共包括43,851个细胞,并使用FindCluster()函数将其分类为20个细胞群。我们发现,在CRC肿瘤组织中,C1、C2、C4、C5、C15、C16和C19的丰度高,而C7、C10、C11、C13、C14和C17的丰度低。同时,生存分析结果表明,C4、C11和C13的丰度高,而C5和C14的丰度低与更好的生存相关。WGCNA结果表明,红色模块最相关于肿瘤和C14群集,其中包含615个基因。Lasso Cox回归分析发现了8个基因(PBXIP1、MPMZ、SCARA3、INA、ILK、MPP2、L1CAM和FLNA),以构建风险模型。在模型中,风险得分特征对生存预测的影响最大,表明8个基因风险模型可以更好地预测预后。qPCR和免疫组织化学分析表明,CRC组织中MPZ、SCARA3、MPP2和PBXIP1的表达水平高。功能实验结果表明,MPZ、SCARA3、MPP2和PBXIP1可以促进体外CRC细胞的克隆形成能力和体内肿瘤发生率。我们基于scRNA-seq和批量RNA-seq数据构建了一个风险模型来预测CRC患者的预后,可供临床应用。我们还确定了4个先前未报道的模型基因(MPZ、SCARA3、MPP2和PBXIP1)作为CRC的新型致癌基因。这些结果表明,该模型可能潜在用于评估预后风险和为CRC患者提供潜在治疗靶点。©2022年作者(S)
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2022 Sep 12
XianguiMeng,WeiquanL...
KDELR2-KIF20A axis facilitates bladder cancer growth and metastasis by enhancing Golgi-mediated secretion.
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膀胱癌(BCa)是一种全球致命的癌症形式,与不良预后有关。识别生长和转移的新型驱动因素具有治疗该疾病的潜力。内质网和高尔基之间的运输平衡以及由高尔基介导的基质金属蛋白酶(MMPs)的分泌被报道与肿瘤进展密切相关。然而,到目前为止,机械研究仍然有限。在这里,我们识别了KDELR2作为一种潜在的风险因素,在BCa患者中具有预后价值,特别是那些携带KDELR2扩增的患者。此外,我们发现,在生物信息学分析和功能研究基础上,KDELR2是BCa细胞增殖和肿瘤生成性的调节因素。在机械上,我们揭示了KDELR2可以调节KIF20A的表达,从而刺激MMP2、MMP9和MKI67的表达。在功能上,KDELR2和KIF20A的过表达显著促进了体外增殖、迁移和侵袭,并在体内增强了肿瘤生长,而KDELR2和KIF20A的沉默产生了相反的效应。KDELR2过度表达还在体内增强了淋巴结转移。综上所述,我们的发现阐明了KDELR2-KIF20A轴在增加高尔基介导的MMPs分泌以推动BCa肿瘤进展方面迄今尚未探索的机制。©2022。作者(们)。
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2022 Oct 25
JieMei,YunCai,RuiXu,...
Angiotensin-converting enzyme 2 identifies immuno-hot tumors suggesting angiotensin-(1-7) as a sensitizer for chemotherapy and immunotherapy in breast cancer.
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血管紧张素转化酶2(ACE2)被认为是一个肿瘤抑制因子,在大多数癌症中表达低下。目前尚未深入阐明ACE2在乳腺癌(BC)中的表达模式和作用。我们进行了系统性的泛癌症分析,基于从癌症基因组图谱(TCGA)下载的RNA测序(RNA-seq)数据,评估了ACE2的表达模式和免疫学作用。评估了ACE2表达与BC肿瘤微环境(TME)中免疫特征的相关性。估计ACE2在预测治疗反应中的作用。此外,还在BALB / c小鼠BC模型中评估了ACE2产物血管紧张素-(1-7)(Ang-1-7)对化疗和免疫治疗的药效作用。此外,收集了接受新辅助化疗的BC患者的血浆样本,并将Ang-1-7表达水平与对新辅助化疗的反应进行相关分析。 与相邻组织相比,BC组织中ACE2表达低。有趣的是,ACE2在BC中与免疫调节因子、肿瘤浸润免疫细胞(TIICs)、癌症免疫循环、免疫检查点和肿瘤突变负荷(TMB)的相关性最高。此外,ACE2水平高表明对内分泌治疗反应低,而对化疗、抗- ERBB治疗、抗血管生成治疗和免疫治疗的反应高。在小鼠模型中,Ang-1-7使小鼠BC对化疗和anti-PD-1免疫治疗敏感,显示了其显著的抗肿瘤效果。此外,高水平Ang-1-7的血浆与更好的新辅助化疗反应有关。 ACE2能够识别BC中的免疫热点肿瘤,并通过重塑TME,使其酶学产物Ang-1-7对化疗和免疫治疗敏感。 ©2022年。作者(S)。
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2022 Oct 26
HyueyunKim,JiHaChoi,...
Shrimp miR-965 transfers tumoricidal mitochondria.
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袋鼠对虾的微RNA已知可以促进肿瘤细胞凋亡,然而其具体机制尚不清楚。我们使用了能够检测细胞内部结构的层析显微镜观察了miRNA处理后的乳腺肿瘤细胞。有趣的是,我们发现线粒体通过一种名为隧道纳米管的结构迁移到相邻的肿瘤细胞中。为了重现这一过程,我们制造了一个微流控装置,将线粒体转移。我们展示了这种线粒体转移过程会将内切酶G(Endo G)释放到肿瘤细胞中,我们称之为未封闭线粒体。重要的是,单独的Endo G枯竭的线粒体没有抗肿瘤效果。此外,未封闭线粒体与亚毒性剂量的多柔比星具有协同的凋亡效应,从而减轻了心脏毒性。综上所述,我们展示了通过微流控技术进行的线粒体转移可以提供朝向肿瘤细胞死亡的潜在新策略。©2022年。作者。
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2022 Dec 02
MengqiZhu,JianpingZh...
Circadian gene CSNK1D promoted the progression of hepatocellular carcinoma by activating Wnt/β-catenin pathway via stabilizing Dishevelled Segment Polarity Protein 3.
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各种研究表明,昼夜节律与肝细胞癌(HCC)的发生和发展有关。本研究的目的是研究昼夜节律基因在HCC中的特征、预后意义和靶向价值。通过生物信息学分析,研究了癌基因组图谱肝细胞癌(TCGA-LIHC)数据库中昼夜节律基因的表达特征和预后意义,并在一组本地HCC中运用免疫组织化学、Western blotting 和实时定量PCR (RT-qPCR) 进一步探究了强有力的标志基因Casein Kinase 1 Delta(CSNK1D)的表达特征。通过细胞计数试剂盒-8(CCK8)、流式细胞术、克隆实验、Transwell实验和异位移植实验评估了CSNK1D对HCC细胞相应表型的影响。此外,通过多重分子实验验证了CSNK1D在Wnt/β-catenin信号通路中的潜在机制。 昼夜节律基因的异常表达与HCC患者的恶性临床病理特征有关。通过Cox回归和最小绝对值收缩和选择算子(LASSO)分析,开发了基于10种昼夜节律基因的标志,具有显著的预后意义。其中,显著升高的CSNK1D在本地HCC队列中被选为进一步研究的对象。沉默或过表达CSNK1D分别显著降低或增加HCC细胞的增殖、侵袭、索拉非尼抗药性、异位移植发展和上皮-间质转化(EMT)。机械上,CSNK1D通过与分叉不良分割蛋白3(DVL3)相互作用来激活Wnt/β-catenin信号通路,从而加剧HCC细胞的侵袭性。 发现昼夜节律基因CSNK1D通过促进Wnt/β-catenin通路参与了HCC的进展,提示它可能是HCC的潜在治疗靶点。© 2022. 作者(们)。
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2022 Dec 03
XiangyuLi,KaiZhao,Yu...
Genetic Analysis of Platelet-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma Reveals a Novel Prognostic Signature and Determines PRKCD as the Potential Molecular Bridge.
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肝细胞癌(HCC)属于具有代表性的致死性消化系统恶性肿瘤,由于其易于复发和早期转移的侵袭性生物学特征,HCC的综合管理目前仍然难以解决。血小板与肿瘤进展之间的密切关联已得到广泛报道,血小板相关指标也在癌症的临床实践中使用。本研究旨在调查血小板相关基因在HCC患者预后预测中的意义,以及它们在肿瘤微环境中的HCC细胞与血小板交流中的潜在作用。通过整合HCC患者的RNA-seq数据和临床病理学信息,我们基于单变量Cox分析提取了预后相关的血小板相关基因,并进一步通过Lasso Cox回归分析建立了相关的预后标志,并使用两个独立的HCC队列进行外部验证。多种生物信息学方法被用于探索不同风险组之间的潜在功能差异。并进行了体外增殖、侵袭和迁移实验,以研究血小板刺激对HCC细胞的生存力和运动性的影响,流式细胞术分析用于证明HCC细胞对血小板激活的影响。本研究发现了一种新的与血小板相关的风险模型,根据中位数风险得分将训练和测试队列中的患者分为不同的风险亚组。观察到高风险状态与恶劣预后和更差的临床病理参数密切相关。同时,免疫微环境的明显差异也表明不同的免疫状态可能是影响预后和免疫治疗反应性的潜在决定因素。此外,体外实验表明,PRKCD可作为肿瘤细胞和血小板之间的分子桥梁,参与调节肿瘤恶性表型或介导血小板激活。总之,这项研究揭示了一种新的与血小板相关的风险标志物,用于评估HCC患者的预后,并证实PRKCD是HCC细胞血小板相互作用的关键信使,并对介导血小板诱导的肿瘤进展起至关重要的作用。© 2022。作者(们)。
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2022 Dec 19
LiangSun,ZitaoLiu,Ke...
Comprehensive Analysis of Cellular Senescence-Related Genes in Prognosis, Molecular Characterization and Immunotherapy of Hepatocellular Carcinoma.
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细胞衰老是一种肿瘤抑制性反应,其中细胞周期处于永久性停滞状态,可抑制肿瘤细胞增殖。近年来,诱导细胞衰老已被证明对抗肿瘤疗法至关重要,细胞衰老与肝细胞癌的临床预后和免疫治疗之间的联系仍然未知。我们对三个细胞衰老基因集中的基因进行富集分析,筛选了在肝细胞癌中显著富集的基因集,并从中提取基因。使用与衰老相关的基因构建签名,并在蛋白质和RNA水平验证其表达。在风险组之间分析了生存、临床分期和分级、免疫浸润、免疫治疗和药物敏感性。 q-PCR和免疫组化结果显示,在正常和肿瘤组织之间的签名基因表达中存在显著差异。风险组之间观察到临床病理特征、预后和免疫浸润的显著差异。在低风险组中,表现出较好的OS和较低的TMB分数,而高风险组具有更高的免疫检查点表达,以及更低的免疫逃逸风险。此外,我们发现高风险组对索拉非尼更敏感。综上所述,使用与衰老相关的基因构建的签名可以可靠地预测患者的预后和免疫治疗疗效,为肝细胞癌的免疫系统治疗提供了新思路。©2022.作者
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2022 Dec 20
BoNing,PengHuang,Lin...
Clinical Prognostic Factors and Integrated Multi-Omics Studies Identify Potential Novel Therapeutic Targets for Pediatric Desmoid Tumor.
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腹肌瘤(DT),也称为腹肌型纤维肉瘤(DTF)或侵袭性纤维肉瘤(AF),是一种罕见的影响儿童和成人的间质瘤。它不会转移,但具有浸润性生长,高复发率甚至可能导致严重健康问题。本研究通过多组学综合研究调查了腹肌瘤的生物学。我们系统地调查了我们儿科机构98个腹外病例的临床数据,并确定了一些关键的临床预后因素。此外,我们在配对的PDT肿瘤/匹配正常组织中进行的多组学综合研究(全外显子测序、RNA测序和非靶向代谢组学分析)确定了更多新突变、潜在预后标志物和PDT的治疗靶点。观察到CTNNB1(p.T41A和p.S45F)和MUC4(p.T3775T、p.S3450S等)等顶级突变基因在40%以上的PDT患者中突变。我们还确定了一组FDA批准的药物靶点或Wnt/β-连环蛋白信号通路相关基因。综合分析确定了可能对PDT的潜在治疗至关重要的途径和关键基因/代谢物。我们还成功建立了六条原发性PDT细胞系,供未来研究使用。这些研究可能促进对PDT的新药物和治疗策略的开发。©2022。作者们。
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